Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9461, 481 aa
1>>>pF1KE9461 481 - 481 aa - 481 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6888+/-0.000873; mu= 17.6629+/- 0.053
mean_var=116.5598+/-25.484, 0's: 0 Z-trim(111.0): 155 B-trim: 1960 in 3/48
Lambda= 0.118795
statistics sampled from 11823 (12049) to 11823 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1 ( 481) 3293 575.4 4.6e-164
CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 ( 613) 1420 254.5 2.3e-67
CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 ( 427) 465 90.7 3.4e-18
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 459 89.7 7.1e-18
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 459 89.8 8e-18
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 417 82.5 1e-15
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 345 70.1 4.9e-12
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 333 68.0 2.1e-11
>>CCDS1420.1 GPR37L1 gene_id:9283|Hs108|chr1 (481 aa)
initn: 3293 init1: 3293 opt: 3293 Z-score: 3059.0 bits: 575.4 E(32554): 4.6e-164
Smith-Waterman score: 3293; 99.8% identity (99.8% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQYV
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CCDS14 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPL
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPGKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 YPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 FFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTLDSCIMKPSASLPESLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTLDSCIMKPSASLPESLYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 VVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCIC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 RPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTP
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 C
:
CCDS14 C
>>CCDS5792.1 GPR37 gene_id:2861|Hs108|chr7 (613 aa)
initn: 1557 init1: 686 opt: 1420 Z-score: 1322.8 bits: 254.5 E(32554): 2.3e-67
Smith-Waterman score: 1420; 51.1% identity (78.0% similar) in 405 aa overlap (81-481:215-613)
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 EEAKGVQQYVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAP
: : . : . : . : ::: :.
CCDS57 RAGKLQGSHHKPLSKTANGLAGHEGWTIALPGRALAQNGSLGEGIHEPGGPRRGNSTN--
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 GQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILA
.:....::.::.:. ::.:::.: :..:.:..::.:::.::::: :.::..: ::.::
CCDS57 -RRVRLKNPFYPLTQESYGAYAVMCLSVVIFGTGIIGNLAVMCIVCHNYYMRSISNSLLA
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 SLALWDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFH
.::.::::..:::::.:::.:.::. :: : ::. ::..::.:::::::.:::: ::::.
CCDS57 NLAFWDFLIIFFCLPLVIFHELTKKWLLEDFSCKIVPYIEVASLGVTTFTLCALCIDRFR
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280
pF1KE9 VATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGTL--DSCIM
.::.. . :: :.: :::::::::.. ::.::..: ::..: : . ::.
CCDS57 AATNVQMYYEMIENCSSTTAKLAVIWVGALLLALPEVVLRQLSKEDLGFSGRAPAERCII
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 KPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFTVTCQLVTWR-VRGPPGRKSECRA
: : .::...: :..::..::.::::::::::: :::.::.::: : .: ..:. :.
CCDS57 KISPDLPDTIYVLALTYDSARLWWYFGCYFCLPTLFTITCSLVTARKIR--KAEKACTRG
430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 SKHE-QCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVAYLSTELTRQTLDLLGLINQFSTF
.:.. : :::.: :::.::..:.:: .:::.::::.::..: ...::.:::..:.:: :
CCDS57 NKRQIQLESQMNCTVVALTILYGFCIIPENICNIVTAYMATGVSQQTMDLLNIISQFLLF
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 FKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFH
::. .:::::.:.:.:...::..:::::: ::: : . ... .::. ::. : .
CCDS57 FKSCVTPVLLFCLCKPFSRAFMECCCCCC-EECIQKSSTVTSDDNDNEYTTELELSPFST
540 550 560 570 580 590
470 480
pF1KE9 KPRESPPLLPLGTPC
:: . .:: :
CCDS57 IRREMSTFASVGTHC
600 610
>>CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 (427 aa)
initn: 465 init1: 115 opt: 465 Z-score: 440.2 bits: 90.7 E(32554): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 465; 26.2% identity (61.3% similar) in 328 aa overlap (126-435:76-388)
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 PDSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIV
.: : ... ..: ::.::: ... :.
CCDS37 SFLVTTHQPTNLVLPSNGSMHNYCPQQTKITSAFKYINTVISCTIFIVGMVGNATLLRII
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 WHSYYLKSAWNSILASLALWDFLVLFFCLPIVIFNEIT-----KQRLLGDVSCRAVPFME
... .... :...::::: :.. . . ::: .:. .. . .: :. ::..
CCDS37 YQNKCMRNGPNALIASLALGDLIYVVIDLPINVFKLLAGRWPFDHNDFGVFLCKLFPFLQ
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 VSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLW
::.:.:...::::..::.. :... .:. : ... ::. :. ::.:: . .
CCDS37 KSSVGITVLNLCALSVDRYR-AVASWSRVQGIGIPLVTAIEIVSIWILSFILAIPEAIGF
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320
pF1KE9 QLAQEPAPTMGTLD-SCIMKPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT----
.. : : .:... .... : ::... :: :: :::.:.. :
CCDS37 VMV--PFEYRGEQHKTCMLNATSKFME-------FYQDVKDWWLFGFYFCMPLVCTAIFY
230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 --VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIVVA
.::.... : : . . :.: . . .. .:: :.:..:.: .: .. :.
CCDS37 TLMTCEMLNRR-NG----SLRIALSEHLKQRREVAKTVFCLVVIFALCWFPLHLSRILKK
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430
pF1KE9 YLSTELTRQTLDLLG---LINQFS---TFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCE
. .:. .. .::. :.. .. . ... :.:. : . . . . : .: ::::
CCDS37 TVYNEMDKNRCELLSFLLLMDYIGINLATMNSCINPIALYFVSKKFKNCFQSCLCCCCYQ
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480
pF1KE9 ECGGASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC
CCDS37 SKSLMTSVPMNGTSIQWKNHDQNNHNTDRSSHKDSMN
400 410 420
>>CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (442 aa)
initn: 459 init1: 236 opt: 459 Z-score: 434.4 bits: 89.7 E(32554): 7.1e-18
Smith-Waterman score: 463; 25.6% identity (56.9% similar) in 445 aa overlap (11-435:13-405)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQ
.:..:: ::::. : .:: ..: . :
CCDS94 MQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG-------------------EERGFPPDRATPLLQ
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRL
..: . .:. . . . : : :. :. .:.: ... :
CCDS94 TAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSPPR------TISPPP----
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 QIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLAL
:.:. . :. : ... .::..::.:: ... :.... .... : ..:::::
CCDS94 -CQGPI-EIKETF--KYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLAL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 WDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATS
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CCDS94 GDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYR-AVA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGT-LDSCIMKPSAS
. ... : . .....::: :..::::: . ... :. : :...: .
CCDS94 SWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDII--TMDYKGSYLRICLLHPVQK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE9 LPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRA
.... :..:. :: :. :::::. .: .::.. .: : .
CCDS94 T-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEM----LRKKSGMQIAL--
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE9 SKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLSTELTR-------QTLDLLG
. : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : ... .: .:: .:
CCDS94 NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLLVLDYIG
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 LINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTE
::. : ... :.:. : . . . . : .: :: :
CCDS94 -INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWCQSFEEKQSLEEKQSCLKFKANDH
380 390 400 410 420
460 470 480
pF1KE9 VSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC
CCDS94 GYDNFRSSNKYSSS
430 440
>>CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (532 aa)
initn: 459 init1: 236 opt: 459 Z-score: 433.5 bits: 89.8 E(32554): 8e-18
Smith-Waterman score: 463; 25.6% identity (56.9% similar) in 445 aa overlap (11-435:103-495)
10 20 30 40
pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQ
.:..:: ::::. :
CCDS55 EALKLRSGHRTPSGAGSSMQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG----------------
80 90 100 110
50 60 70 80 90
pF1KE9 QSRSKRGTEDEEAKGVQQ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTP
.:: ..: . : ..: . .:. . . . : : :. :. .:.:
CCDS55 ---EERGFPPDRATPLLQTAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSP
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 DSGQELRGNLTGAPGQRLQIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVW
... : :.:. . :. : ... .::..::.:: ... :..
CCDS55 PR------TISPPP-----CQGPI-EIKETF--KYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIY
180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 HSYYLKSAWNSILASLALWDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGV
.. .... : ..::::: :.: . . .:: ... .... .: :. :::.. .:.:.
CCDS55 KNKCMRNGPNILIASLALGDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGI
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 TTFSLCALGIDRFHVATSTLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEP
:..:::::.:::.. :... ... : . .....::: :..::::: . ...
CCDS55 TVLSLCALSIDRYR-AVASWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDII--T
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320
pF1KE9 APTMGT-LDSCIMKPSASLPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQ
:. : :...: . .... :..:. :: :. :::::. .: .::.
CCDS55 MDYKGSYLRICLLHPVQKT-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCE
340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LVTWRVRGPPGRKSECRASKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLST
. .: : . . : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : ..
CCDS55 M----LRKKSGMQIAL--NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQN
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 ELTR-------QTLDLLGLINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECG
. .: .:: .: ::. : ... :.:. : . . . . : .: :: :
CCDS55 DPNRCELLSFLLVLDYIG-INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKSCLCCWCQSFEE
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480
pF1KE9 GASEASAANGSDNKLKTEVSSSIYFHKPRESPPLLPLGTPC
CCDS55 KQSLEEKQSCLKFKANDHGYDNFRSSNKYSSS
510 520 530
>>CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 (436 aa)
initn: 433 init1: 236 opt: 417 Z-score: 395.6 bits: 82.5 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 421; 24.9% identity (56.1% similar) in 437 aa overlap (11-427:13-397)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MRWLWPLAVSLAVILAVGLSRVSGGAPLHLGRHRAETQEQQSRSKRGTEDEEAKGVQQ
.:..:: ::::. : .:: ..: . :
CCDS45 MQPPPSLCGRALVALVLACGLSRIWG-------------------EERGFPPDRATPLLQ
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 ----YVPEEWAEYPRPIHPAGLQPTKPLVATSPNPDKDGGTPDSGQELRGNLTGAPGQRL
..: . .:. . . . : : :. :. .:.: ... : :
CCDS45 TAEIMTPPTKTLWPKGSNASLARSLAP--AEVPKGDRTAGSPPR------TISPPPCQG-
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 QIQNPLYPVTESSYSAYAIMLLALVVFAVGIVGNLSVMCIVWHSYYLKSAWNSILASLAL
:. . : ... .::..::.:: ... :.... .... : ..:::::
CCDS45 -------PIEIKETFKYINTVVSCLVFVLGIIGNSTLLRIIYKNKCMRNGPNILIASLAL
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 WDFLVLFFCLPIVIFNEITKQRLLGDVSCRAVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDRFHVATS
:.: . . .:: ... .... .: :. :::.. .:.:.:..:::::.:::.. :..
CCDS45 GDLLHIVIDIPINVYKLLAEDWPFGAEMCKLVPFIQKASVGITVLSLCALSIDRYR-AVA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 TLPKVRPIERCQSILAKLAVIWVGSMTLAVPELLLWQLAQEPAPTMGT-LDSCIMKPSAS
. ... : . .....::: :..::::: . ... :. : :...: .
CCDS45 SWSRIKGIGVPKWTAVEIVLIWVVSVVLAVPEAIGFDIIT--MDYKGSYLRICLLHPVQK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE9 LPESLYSLVMTYQNARMWWYFGCYFCLPILFT------VTCQLVTWRVRGPPGRKSECRA
.... :..:. :: :. :::::. .: .::... : : .
CCDS45 T-----AFMQFYKTAKDWWLFSFYFCLPLAITAFFYTLMTCEML----RKKSGMQIA--L
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE9 SKHEQCESQLNSTVVGLTVVYAFCTLPENVCNIV--VAYLSTELTR-------QTLDLLG
. : . . .. .:: :..:.:.: :: .. :. . : ... .: .:: .:
CCDS45 NDHLKQRREVAKTVFCLVLVFALCWLPLHLSRILKLTLYNQNDPNRCELLSFLLVLDYIG
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 LINQFSTFFKGAITPVLLLCICRPLGQAFLDCCCCCCCEECGGASEASAANGSDNKLKTE
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CCDS45 -INMAS--LNSCINPIALYLVSKRFKNCFKAGPHVGNKLVMLFSVNIECDGTVNQNPTMW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]