Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9455
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9455, 528 aa
1>>>pF1KE9455 528 - 528 aa - 528 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4433+/-0.000911; mu= 23.6401+/- 0.055
mean_var=71.7078+/-15.061, 0's: 0 Z-trim(105.5): 86 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.151458
statistics sampled from 8388 (8480) to 8388 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 3560 787.5 0
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CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 949 217.1 5.3e-56
CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 934 213.8 5.1e-55
CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 808 186.4 1.2e-46
CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 808 186.5 1.3e-46
CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 808 186.5 1.3e-46
CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 808 186.5 1.3e-46
CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 808 186.5 1.3e-46
CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 808 186.5 1.3e-46
CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 808 186.5 1.3e-46
CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 808 186.5 1.3e-46
CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 780 180.4 9.9e-45
CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 780 180.4 1e-44
CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 780 180.4 1e-44
CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 780 180.5 1e-44
CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 740 171.3 2.5e-42
CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 729 168.8 1.1e-41
CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 576 136.3 4.9e-31
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 521 123.9 1.1e-27
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 521 123.9 1.2e-27
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 390 95.0 3.5e-19
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 386 94.2 6.6e-19
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 386 94.2 6.8e-19
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 373 91.2 4.1e-18
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 370 91.3 1.7e-17
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 354 87.4 1.2e-16
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 354 87.4 1.2e-16
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 353 87.6 2.3e-16
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 346 85.6 3.4e-16
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 346 85.6 3.5e-16
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 346 85.7 3.9e-16
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 346 85.7 3.9e-16
CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 334 82.8 1.8e-15
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 327 81.6 7.5e-15
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 323 81.1 2.3e-14
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 311 78.1 8.4e-14
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 311 78.1 8.5e-14
CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 291 73.6 1.6e-12
CCDS47246.1 ADGRV1 gene_id:84059|Hs108|chr5 (6306) 291 74.4 4.5e-12
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 280 71.3 9.1e-12
CCDS77778.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 502) 271 68.8 1.7e-11
CCDS2938.1 ADGRG7 gene_id:84873|Hs108|chr3 ( 797) 271 69.0 2.3e-11
CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 262 67.1 9.5e-11
>>CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 (528 aa)
initn: 3560 init1: 3560 opt: 3560 Z-score: 4203.7 bits: 787.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3560; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLSYMENMQVSRGRSSVFSSRQLHQLEQMLLNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLSYMENMQVSRGRSSVFSSRQLHQLEQMLLNTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQFPAELTRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQFPAELTRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 ACKTRPRELRLICIYFSNTHFFKDENNSSLLNNYVLGAQLSHGHVNNLRDPVNISFWHNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ACKTRPRELRLICIYFSNTHFFKDENNSSLLNNYVLGAQLSHGHVNNLRDPVNISFWHNQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SLEGYTLTCVFWKEGARKQPWGGWSPEGCRTEQPSHSQVLCRCNHLTYFAVLMQLSPALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SLEGYTLTCVFWKEGARKQPWGGWSPEGCRTEQPSHSQVLCRCNHLTYFAVLMQLSPALV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PAELLAPLTYISLVGCSISIVASLITVLLHFHFRKQSDSLTRIHMNLHASVLLLNIAFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PAELLAPLTYISLVGCSISIVASLITVLLHFHFRKQSDSLTRIHMNLHASVLLLNIAFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SPAFAMSPVPGSACTALAAALHYALLSCLTWMAIEGFNLYLLLGRVYNIYIRRYVFKLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SPAFAMSPVPGSACTALAAALHYALLSCLTWMAIEGFNLYLLLGRVYNIYIRRYVFKLGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 LGWGAPALLVLLSLSVKSSVYGPCTIPVFDSWENGTGFQNMSICWVRSPVVHSVLVMGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGWGAPALLVLLSLSVKSSVYGPCTIPVFDSWENGTGFQNMSICWVRSPVVHSVLVMGYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 GLTSLFNLVVLAWALWTLRRLRERADAPSVRACHDTVTVLGLTVLLGTTWALAFFSFGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLTSLFNLVVLAWALWTLRRLRERADAPSVRACHDTVTVLGLTVLLGTTWALAFFSFGVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE9 LLPQLFLFTILNSLYGFFLFLWFCSQRCRSEAEAKAQIEAFSSSQTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLPQLFLFTILNSLYGFFLFLWFCSQRCRSEAEAKAQIEAFSSSQTTQ
490 500 510 520
>>CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (687 aa)
initn: 709 init1: 241 opt: 949 Z-score: 1119.0 bits: 217.1 E(32554): 5.2e-56
Smith-Waterman score: 949; 36.2% identity (64.2% similar) in 492 aa overlap (26-507:184-656)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLS-YMENMQ-VSRGRSSVFSSRQLHQLE
.::: .... : .:: :.. .:.::..::
CCDS32 AASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLE
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 QMLLNTSFPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQF
. : .. : : .... :.. ..::. .: :. . . :. . .. :..
CCDS32 SKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKLQ--------PTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEY
220 230 240 250 260
120 130 140 150 160
pF1KE9 PAELTRDAC-KTRPR----ELRLICIYFSNTHFFKDENNSSLLNNYVLGAQLSHGHVNNL
. : : .:. : : ::. . ::. .:.:.:.:..:.. ::: ... .: ::
CCDS32 SVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSSQALFQDKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANL
270 280 290 300 310 320
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 RDPVNISFWHNQSLEGYTLTCVFWKEGARKQPWGGWSPEGCRTEQPSHSQVLCRCNHLTY
.:: ..: :. . .. :: :::: : . : :: ::.: . ..:. : ::::::
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330 340 350 360 370 380
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 FAVLMQLSPALVPAELLAPLTYISLVGCSISIVASLITVLLHF-HFRKQSDSLTRIHMNL
::::: .: . : : :. .: ::: .: .: :.:. .. :: : ..::::
CCDS32 FAVLM-VSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLVTIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNL
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 HASVLLLNIAFLLSPAFAMSPVPGSACTALAAALHYALLSCLTWMAIEGFNLYLLLGRVY
.:.::. .:::: :.. ..: : : ::..::.::.::..::.::: :. .:.
CCDS32 LLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSE-AGCRASAIFLHFSLLTCLSWMGLEGYNLYRLVVEVF
450 460 470 480 490 500
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 NIYIRRYVFKLGVLGWGAPALLVLLSLSVKSSVYGPCTIPVFDSWENGTGFQNMSICWVR
. :. :..::...::: : .:: : : . ::: . : . : : :.::.:
CCDS32 GTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDNYGPIILAVHRTPE---GVIYPSMCWIR
510 520 530 540 550
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 SPVVHSVLVMGYGGLTSLFNLVVLAWALWTLRRLRERADAPSVRACHDTVTVLGLTVLLG
. .: . .: .:. :::...:: . . ::: : .. ..:.:::...::
CCDS32 DSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLR-----PHTQKWSHVLTLLGLSLVLG
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470 480 490 500 510 520
pF1KE9 TTWALAFFSF--GVFLLPQLFLFTILNSLYGFFLFLWFCSQRCRSEAEAKAQIEAFSSSQ
::: :::: :.: : :.::.:..:. ::..:.:. :.:
CCDS32 LPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSMRLQARGGPSPLKSNSDSAR
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pF1KE9 TTQ
CCDS32 LPISSGSTSSSRI
680
>>CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (692 aa)
initn: 709 init1: 241 opt: 949 Z-score: 1118.9 bits: 217.1 E(32554): 5.3e-56
Smith-Waterman score: 949; 36.2% identity (64.2% similar) in 492 aa overlap (26-507:189-661)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLS-YMENMQ-VSRGRSSVFSSRQLHQLE
.::: .... : .:: :.. .:.::..::
CCDS73 AASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLE
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 QMLLNTSFPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQF
. : .. : : .... :.. ..::. .: :. . . :. . .. :..
CCDS73 SKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKLQ--------PTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEY
220 230 240 250 260 270
120 130 140 150 160
pF1KE9 PAELTRDAC-KTRPR----ELRLICIYFSNTHFFKDENNSSLLNNYVLGAQLSHGHVNNL
. : : .:. : : ::. . ::. .:.:.:.:..:.. ::: ... .: ::
CCDS73 SVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSSQALFQDKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANL
280 290 300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 RDPVNISFWHNQSLEGYTLTCVFWKEGARKQPWGGWSPEGCRTEQPSHSQVLCRCNHLTY
.:: ..: :. . .. :: :::: : . : :: ::.: . ..:. : ::::::
CCDS73 TEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGHWSSAGCETVR-RETQTSCFCNHLTY
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230 240 250 260 270 280
pF1KE9 FAVLMQLSPALVPAELLAPLTYISLVGCSISIVASLITVLLHF-HFRKQSDSLTRIHMNL
::::: .: . : : :. .: ::: .: .: :.:. .. :: : ..::::
CCDS73 FAVLM-VSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLVTIAAYLCSRRKPRDYTIKVHMNL
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 HASVLLLNIAFLLSPAFAMSPVPGSACTALAAALHYALLSCLTWMAIEGFNLYLLLGRVY
.:.::. .:::: :.. ..: : : ::..::.::.::..::.::: :. .:.
CCDS73 LLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSE-AGCRASAIFLHFSLLTCLSWMGLEGYNLYRLVVEVF
450 460 470 480 490 500
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 NIYIRRYVFKLGVLGWGAPALLVLLSLSVKSSVYGPCTIPVFDSWENGTGFQNMSICWVR
. :. :..::...::: : .:: : : . ::: . : . : : :.::.:
CCDS73 GTYVPGYLLKLSAMGWGFPIFLVTLVALVDVDNYGPIILAVHRTPE---GVIYPSMCWIR
510 520 530 540 550 560
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 SPVVHSVLVMGYGGLTSLFNLVVLAWALWTLRRLRERADAPSVRACHDTVTVLGLTVLLG
. .: . .: .:. :::...:: . . ::: : .. ..:.:::...::
CCDS73 DSLVSYITNLGLFSLVFLFNMAMLATMVVQILRLR-----PHTQKWSHVLTLLGLSLVLG
570 580 590 600 610
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 TTWALAFFSF--GVFLLPQLFLFTILNSLYGFFLFLWFCSQRCRSEAEAKAQIEAFSSSQ
::: :::: :.: : :.::.:..:. ::..:.:. :.:
CCDS73 LPWALIFFSFASGTFQLVVLYLFSIITSFQGFLIFIWYWSMRLQARGGPSPLKSNSDSAR
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 TTQ
CCDS73 LPISSGSTSSSRI
680 690
>>CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 (693 aa)
initn: 768 init1: 241 opt: 934 Z-score: 1101.2 bits: 213.8 E(32554): 5.1e-55
Smith-Waterman score: 935; 35.7% identity (63.5% similar) in 498 aa overlap (26-507:184-662)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDHCGALFLCLCLLTLQNATTETWEELLS-YMENMQ-VSRGRSSVFSSRQLHQLE
.::: .... : .:: :.. .:.::..::
CCDS32 AASFTFSFHSPPHTAAHNASVDMCELKRDLQLLSQFLKHPQKASRRPSAAPASQQLQSLE
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 QMLLNTSFPGYNLTLQTPTIQSLAFKLSCDFSGLSLTSATLKRVPQAGGQHARGQHAMQF
. : .. : : .... :.. ..::. .: :. . . :. . .. :..
CCDS32 SKLTSVRFMGDMVSFEEDRINATVWKLQ--------PTAGLQDLHIHSRQEEEQSEIMEY
220 230 240 250 260
120 130 140 150 160
pF1KE9 PAELTRDAC-KTRPR----ELRLICIYFSNTHFFKDENNSSLLNNYVLGAQLSHGHVNNL
. : : .:. : : ::. . ::. .:.:.:.:..:.. ::: ... .: ::
CCDS32 SVLLPRTLFQRTKGRSGEAEKRLLLVDFSSQALFQDKNSSQVLGEKVLGIVVQNTKVANL
270 280 290 300 310 320
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 RDPVNISFWHNQSLEGYTLTCVFWKEGARKQPWGGWSPEGCRTEQPSHSQVLCRCNHLTY
.:: ..: :. . .. :: :::: : . : :: ::.: . ..:. : ::::::
CCDS32 TEPVVLTFQHQLQPKNVTLQCVFWVEDPTLSSPGHWSSAGCETVR-RETQTSCFCNHLTY
330 340 350 360 370 380
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 FAVLMQLSPALVPAELLAPLTYISLVGCSISIVASLITVLLHFHFR-------KQSDSLT
::::: .: . : : :. .: ::: .: .: :.:. .. : : :
CCDS32 FAVLM-VSSVEVDAVHKHYLSLLSYVGCVVSALACLVTIAAYLCSRVPLPCRRKPRDYTI
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 RIHMNLHASVLLLNIAFLLSPAFAMSPVPGSACTALAAALHYALLSCLTWMAIEGFNLYL
..:::: .:.::. .:::: :.. ..: : : ::..::.::.::..::.:::
CCDS32 KVHMNLLLAVFLLDTSFLLSEPVALTGSE-AGCRASAIFLHFSLLTCLSWMGLEGYNLYR
450 460 470 480 490 500
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