FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9450, 1584 aa
1>>>pF1KE9450 1584 - 1584 aa - 1584 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2823+/-0.00134; mu= -19.8505+/- 0.081
mean_var=718.6383+/-143.904, 0's: 0 Z-trim(115.5): 86 B-trim: 59 in 1/54
Lambda= 0.047843
statistics sampled from 16019 (16099) to 16019 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16
Scan time: 6.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 11053 779.6 0
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 3511 259.0 8.3e-68
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 1897 147.6 2.9e-34
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 1407 113.8 4.5e-24
>>CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584 aa)
initn: 11053 init1: 11053 opt: 11053 Z-score: 4144.0 bits: 779.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11053; 100.0% identity (100.0% similar) in 1584 aa overlap (1-1584:1-1584)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRGQAAAPGPVWILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAAAV
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CCDS64 MRGQAAAPGPVWILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAAAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 FPANASRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCSGPGRVRTYQFDSFLESTRTYLGVESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FPANASRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCSGPGRVRTYQFDSFLESTRTYLGVESF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DEVLRLCDPSAPLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLRPRAGPPGPTDDFSVEYLVVGNRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DEVLRLCDPSAPLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLRPRAGPPGPTDDFSVEYLVVGNRN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PSRAACQMLCRWLDACLAGSRSSHPCGIMQTPCACLGGEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PSRAACQMLCRWLDACLAGSRSSHPCGIMQTPCACLGGEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AGGPENCLTSLTQDRGGHGATGGWKLWSLWGECTRDCGGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AGGPENCLTSLTQDRGGHGATGGWKLWSLWGECTRDCGGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 GVLEEGRQCNREACGPAGRTSSRSQSLRSTDARRREELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GVLEEGRQCNREACGPAGRTSSRSQSLRSTDARRREELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 SPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQCSGPLREQRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQCSGPLREQRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 CSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKFCNIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKFCNIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ASCSQGRQQRTRECNGPSYGGAECQGHWVETRDCFLQQCPVDGKWQAWASWGSCSVTCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ASCSQGRQQRTRECNGPSYGGAECQGHWVETRDCFLQQCPVDGKWQAWASWGSCSVTCGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 GSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQRCPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQRCPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 GVSEVIQTLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNMTEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQILSNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GVSEVIQTLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNMTEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQILSNLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 AEENRDKWEEAQLAGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEENRDKWEEAQLAGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 ATDISFPMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVFSTGLTEADEASVFVVGTVLYRNLGSFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ATDISFPMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVFSTGLTEADEASVFVVGTVLYRNLGSFLA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 LQRNTTVLNSKVISVTVKPPPRSLRTPLEIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDVPSSSAPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQRNTTVLNSKVISVTVKPPPRSLRTPLEIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDVPSSSAPPQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 LGPWSWRGCRTVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADANMEKATLPSVTLIVGCGVSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGPWSWRGCRTVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADANMEKATLPSVTLIVGCGVSSL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 TLLMLVIIYVSVWRYIRSERSVILINFCLSIISSNALILIGQTQTRNKVVCTLVAAFLHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TLLMLVIIYVSVWRYIRSERSVILINFCLSIISSNALILIGQTQTRNKVVCTLVAAFLHF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 FFLSSFCWVLTEAWQSYMAVTGHLRNRLIRKRFLCLGWGLPALVVAISVGFTKAKGYSTM
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CCDS64 FFLSSFCWVLTEAWQSYMAVTGHLRNRLIRKRFLCLGWGLPALVVAISVGFTKAKGYSTM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 NYCWLSLEGGLLYAFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSKDGITDKKLKERAGASLWSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NYCWLSLEGGLLYAFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSKDGITDKKLKERAGASLWSSC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 VVLPLLALTWMSAVLAVTDRRSALFQILFAVFDSLEGFVIVMVHCILRREVQDAVKCRVV
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CCDS64 VVLPLLALTWMSAVLAVTDRRSALFQILFAVFDSLEGFVIVMVHCILRREVQDAVKCRVV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 DRQEEGNGDSGGSFQNGHAQLMTDFEKDVDLACRSVLNKDIAACRTATITGTLKRPSLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DRQEEGNGDSGGSFQNGHAQLMTDFEKDVDLACRSVLNKDIAACRTATITGTLKRPSLPE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 EEKLKLAHAKGPPTNFNSLPANVSKLHLHGSPRYPGGPLPDFPNHSLTLKRDKAPKSSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EEKLKLAHAKGPPTNFNSLPANVSKLHLHGSPRYPGGPLPDFPNHSLTLKRDKAPKSSFV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KE9 GDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILPTATATLRPKPKEEPKYSIHIDQMPQTRLIHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILPTATATLRPKPKEEPKYSIHIDQMPQTRLIHL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE9 STAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPAQPPPPPPPPPPPPQQPLPPPPNLEPAPPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 STAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPAQPPPPPPPPPPPPQQPLPPPPNLEPAPPSLG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 DPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSVSSLERRKSRYAELDFEKIMHTRKRHQDMFQDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSVSSLERRKSRYAELDFEKIMHTRKRHQDMFQDLN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE9 RKLQHAAEKDKEVLGPDSKPEKQQTPNKRPWESLRKAHGTPTWVKKELEPLQPSPLELRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RKLQHAAEKDKEVLGPDSKPEKQQTPNKRPWESLRKAHGTPTWVKKELEPLQPSPLELRS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580
pF1KE9 VEWERSGATIPLVGQDIIDLQTEV
::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VEWERSGATIPLVGQDIIDLQTEV
1570 1580
>>CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522 aa)
initn: 3556 init1: 1230 opt: 3511 Z-score: 1330.8 bits: 259.0 E(32554): 8.3e-68
Smith-Waterman score: 4863; 47.7% identity (71.8% similar) in 1588 aa overlap (43-1584:30-1522)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 ILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAAAVFPANASRCSWTL
:.:::.: ..: .:.. .:: : . :.:::
CCDS49 MKAVRNLLIYIFSTYLLVMFGFNAAQDFWCSTLVKGVIYGSYSVSEMFPKNFTNCTWTL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 RNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCSGPGRVRTYQFDSFL-ESTRTYLGVESFDEVLRLCDPSA
.:::: .:..:.: .: . ::. . . .:::: : :. . : .. ...::. .
CCDS49 ENPDPTKYSIYLKFSKKDLSCSNFSLL-AYQFDHFSHEKIKDLL--RKNHSIMQLCNSKN
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 PLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLRPRAGPPGPTDDFSV-EYLVVGNRNPSRAACQMLC
..::: .:.:.:.:: : . ::. . : :. : :.::... .::. .:..::
CCDS49 AFVFLQYDKNFIQIRRVFPTNFPGLQKK----GEEDQKSFFEFLVLNKVSPSQFGCHVLC
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KE9 RWLDACLAGSRS-SHPCGIMQTPCACLG--GEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAVAGGPENC
::..:: . . .. :::: : :.: :: : . .. . : ..: :.
CCDS49 TWLESCLKSENGRTESCGIMYTKCTCPQHLGEWG------IDDQSLILLNNVVLPLNEQT
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LTSLTQDRGGHGATGGWKLWSLWGECTRDCGGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCEGVLEEGR
:::. ::: :..: .. .:..
CCDS49 EGCLTQE--------------------------LQT-TQVC------------NLTREAK
230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 QCNREACGPAGRTSSRSQSLRSTDARRREELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEWSPWSVCS
. .: : : . .:: ::. .: . . .: :::. ..:::: ::.::
CCDS49 RPPKEEFGMMGDHTIKSQRPRSVHEKRVPQEQADAAKF---MAQTGESGVEEWSQWSTCS
250 260 270 280 290 300
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:::.: :.::: ::: :.:.:::::::.:.:::.:.:::::.:.::::::::: ::::
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310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 GFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKFCNIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACSASCSQGR
: : :::.: :::.:: :::::: . : ::::::: :::.:.:::::: ::..::.:
CCDS49 GQRTRTRSCTPPQYGGRPCEGPETHHKPCNIALCP---VDGQWQEWSSWSQCSVTCSNGT
370 380 390 400 410 420
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pF1KE9 QQRTRECNGPSYGGAECQGHWVETRDCFLQQCPVDGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRER
:::.:.:.. ..::.::.: :.:.:.:. .: ..:.:. :. :..:: .: .: .:: :
CCDS49 QQRSRQCTAAAHGGSECRGPWAESRECYNPECTANGQWNQWGHWSGCSKSCDGGWERRIR
430 440 450 460 470 480
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pF1KE9 VCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQRCPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVAAVRCPRN
.:.: . : :.: .: :.:. :::: :.::: :: . ...::.::::..: .:: :
CCDS49 TCQGAVITGQQCEGTGEEVRRCNEQRCPAPYEICPEDYLMSMVWKRTPAGDLAFNQCPLN
490 500 510 520 530 540
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pF1KE9 ATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGEGVSEVIQ
::: ::: :. .:.:.:: :.. ::.: .::..: .:::::.:: : :.:.:.: .
CCDS49 ATGTTSRRCSLSLHGVAFWEQPSFARCISNEYRHLQHSIKEHLAKGQRMLAGDGMSQVTK
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNMTEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQILSNLLAEENRDK
::....: . :.:::: ....:::.:. :.:: : :. :::: ::.:::: :::..:
CCDS49 TLLDLTQRKNFYAGDLLMSVEILRNVTDTFKRASYIPASDGVQNFFQIVSNLLDEENKEK
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 WEEAQLAGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASGA-TDISF
::.:: :.. ::....:::. ..:. : :....: .: :.: ::.::::... :::.:
CCDS49 WEDAQQIYPGSIELMQVIEDFIHIVGMGMMDFQNSYLMTGNVVASIQKLPAASVLTDINF
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVFS-TGLTEADEASVFVVGTVLYRNLGSFLALQRNT
:::: .. :::. ::::.. ::.:. .. : ::.::::.:.:::.:: .: ::
CCDS49 PMKGRKGMVDWARNSEDRVVIPKSIFTPVSSKELDESSVFVLGAVLYKNLDLILPTLRNY
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 TVLNSKVISVTVKPPPRSLRTPLEIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDVPSSSAPPQLGPWS
::.:::.: ::..: :.. . ::::.::. ::: : :.:::.. . : :: ::
CCDS49 TVINSKIIVVTIRPEPKTTDSFLEIELAHLANGTLNPYCVLWDDSKTNES-----LGTWS
790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 WRGCRTVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADANMEKATLPSVTLIVGCGVSSLTLLML
.::.:: :: .:.:::::::::::::: . ::.. :::::::: :.: :.:. :
CCDS49 TQGCKTVLTDASHTKCLCDRLSTFAILAQQPREIIMESSGTPSVTLIVGSGLSCLALITL
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 VIIYVSVWRYIRSERSVILINFCLSIISSNALILIGQTQTRNKVVCTLVAAFLHFFFLSS
...:...:::::::::.::::::::::::: :::.:::::.:: .:: ..::::::::.:
CCDS49 AVVYAALWRYIRSERSIILINFCLSIISSNILILVGQTQTHNKSICTTTTAFLHFFFLAS
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 FCWVLTEAWQSYMAVTGHLRNRLIRKRFLCLGWGLPALVVAISVGFTKAKGYSTMNYCWL
:::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::: :::::..:::.: .::::
CCDS49 FCWVLTEAWQSYMAVTGKIRTRLIRKRFLCLGWGLPALVVATSVGFTRTKGYGTDHYCWL
960 970 980 990 1000 1010
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 SLEGGLLYAFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSKDGITDKKLKERAG------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::.:::
CCDS49 SLEGGLLYAFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSRDGILDKKLKHRAGQMSEPHSGLTLK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1140 1150 1160 1170
pF1KE9 ---------------------ASLWSSCVVLPLLALTWMSAVLAVTDRRSALFQILFAVF
:::::::::::::::::::::::.::.:: :::::::::
CCDS49 CAKCGVVSTTALSATTASNAMASLWSSCVVLPLLALTWMSAVLAMTDKRSILFQILFAVF
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE9 DSLEGFVIVMVHCILRREVQDAVKCRVVDRQEEGNGDSGGSFQNGHAQLMTDFEKDVDLA
:::.:::::::::::::::::: .::. . :. :.::..:: :::::.:::::::::.:
CCDS49 DSLQGFVIVMVHCILRREVQDAFRCRLRNCQDPINADSSSSFPNGHAQIMTDFEKDVDIA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE9 CRSVLNKDIAACRTATITGTLKRPSLPEEEKLKLAHAKGPPTNFNSLPANV-SKLHLHGS
:::::.:::. ::.:::::::.: :: ..:. : .. .: ....::.:: ::. .. .
CCDS49 CRSVLHKDIGPCRAATITGTLSRISLNDDEEEKGTNPEG--LSYSTLPGNVISKVIIQ-Q
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE9 PRYPGGPLP--DFPNHSLTLKRDKAPKSSFVGDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILP
: :. .. : : . .. .. .. : .. : .. . ::. ....:...:
CCDS49 PTGLHMPMSMNELSNPCLKKENSELRRTVYLCTDDNLRGADMDIVHPQERMMESDYIVMP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE9 TATATLRPKPKEEPKYSIHIDQMPQTRLIHLSTAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPA
.... .:. ::: :..: .. .:. ::.: .. :: .. .:: . . .
CCDS49 RSSVNNQPSMKEESKMNIGMETLPHERLLHYKVNPEFNM---NPPVMDQFNMNL------
1320 1330 1340 1350 1360
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE9 QPPPPPPPPPPPPQQPLPPPPNLEPAP--PSLGDPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSV
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CCDS49 -------------EQHLAPQEHMQNLPFEPRTAVKNFMASELDDNAGLS-RSETGSTISM
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