Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9448, 478 aa
1>>>pF1KE9448 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9520+/-0.000842; mu= 11.1585+/- 0.051
mean_var=157.7173+/-43.493, 0's: 0 Z-trim(111.8): 317 B-trim: 1398 in 2/50
Lambda= 0.102126
statistics sampled from 12076 (12691) to 12076 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 3243 489.8 2.6e-138
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 2599 395.0 9.7e-110
CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 ( 354) 547 92.5 7.9e-19
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 452 78.5 1.2e-14
CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 411 72.5 8.4e-13
CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 ( 348) 395 70.1 4.3e-12
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 396 70.4 5.2e-12
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 396 70.4 5.3e-12
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 396 70.4 5.4e-12
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 389 69.3 8.8e-12
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 387 68.9 9.7e-12
CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX ( 364) 382 68.2 1.7e-11
CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX ( 364) 382 68.2 1.7e-11
CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX ( 364) 382 68.2 1.7e-11
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 382 68.2 1.7e-11
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 377 67.5 3e-11
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 377 67.5 3.1e-11
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 377 67.5 3.2e-11
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 377 67.6 3.4e-11
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 374 67.0 3.6e-11
CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX ( 364) 373 66.9 4.2e-11
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 369 66.2 5.7e-11
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 366 65.8 8.3e-11
>>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (478 aa)
initn: 3243 init1: 3243 opt: 3243 Z-score: 2596.6 bits: 489.8 E(32554): 2.6e-138
Smith-Waterman score: 3243; 99.8% identity (99.8% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNPPSGPRVLPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MNPPSGPRVPPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLATFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLATFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 VASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFTPAVRAYTMLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFTPAVRAYTMLLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 CFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 VILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 IAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQESLGSESEVGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQESLGSESEVGW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE9 THMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKAPPRPQGHEAETPGKTKGLIPSQDPRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKAPPRPQGHEAETPGKTKGLIPSQDPRM
430 440 450 460 470
>>CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 (489 aa)
initn: 2567 init1: 2567 opt: 2599 Z-score: 2083.7 bits: 395.0 E(32554): 9.7e-110
Smith-Waterman score: 3211; 97.5% identity (97.5% similar) in 489 aa overlap (1-478:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNPPSGPRVLPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNPPSGPRVPPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE9 PTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCR-----------SRSLRTPANMFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS31 PTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRAVLRGVTVMMQSRSLRTPANMFI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 INLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 INLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLTSCSWDYMSFT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 PAVRAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAVRAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNGESLWQRQRLQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 SECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIAKASAIHNPII
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 YAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSNLSWISIRRRQ
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 ESLGSESEVGWTHMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKAPPRPQGHEAETPGKTKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESLGSESEVGWTHMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKAPPRPQGHEAETPGKTKG
430 440 450 460 470 480
470
pF1KE9 LIPSQDPRM
:::::::::
CCDS31 LIPSQDPRM
>>CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 (354 aa)
initn: 418 init1: 229 opt: 547 Z-score: 451.5 bits: 92.5 E(32554): 7.9e-19
Smith-Waterman score: 547; 30.8% identity (62.0% similar) in 292 aa overlap (69-357:32-313)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 LGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRS
: . : . ..:. . .:: :.: :
CCDS49 ALNHTALPQDERLPHYLRDGDPFASKLSWEADLVAGFYLTIIGILSTFGNGYVLYMSSRR
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 RSLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSM
.. ::... ::::: :. .: . : . : . ..:.:: ::..:.. : .:: .:.
CCDS49 KKKLRPAEIMTINLAVCDLGISVVGKPFTIISCFCHRWVFGWIGCRWYGWAGFFFGCGSL
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLG-VWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGL
::.::..::::: : ..:: ::. :.. :. .: :: :. :. : . :::: .
CCDS49 ITMTAVSLDRYLKICY--LSYGVWLKRKHAYICLAAIWAYASFWTTMPLVGLGDYVPEPF
130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 LTSCSWDYMSFTPAV--RAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGAC
:::. :. .: ... . . : ..:: .:.. :. :. .. ... . : .
CCDS49 GTSCTLDWWLAQASVGGQVFILNILFFCLLLPTAVIVFSYVKIIAKVKSSSKEVAHFDSR
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 KGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVP
... : : :..:. .:. :...: ::..:.. . : . .: ::
CCDS49 IHSSHVL--------EMKLTKVAMLICAGFLIAWIPYAVVSVWSAFGRPDSIPIQLSVVP
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 AVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTS
...::..:..::::: . :.
CCDS49 TLLAKSAAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 (337 aa)
initn: 498 init1: 225 opt: 452 Z-score: 376.2 bits: 78.5 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 588; 30.9% identity (66.1% similar) in 298 aa overlap (70-367:25-311)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 GRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSR
: ..: ....:. ....:. :. : . .
CCDS36 MLRNNLGNSSDSKNEDGSVFSQTEHNIVATYLIMAGMISIISNIIVLGIFIKYK
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 SLRTPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMI
::::.: .::::::.:. .: :. .:.:: .: :: .::. :: . .::..:.
CCDS36 ELRTPTNAIIINLAVTDIGVSSIGYPMSAASDLYGSWKFGYAGCQVYAGLNIFFGMASIG
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 TLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLT
::..:.::::.: : . .... ...: :.:. .: :.: :..::..:.:. .
CCDS36 LLTVVAVDRYLTICLPDVGRRMTTNTYIGLIL-GAWINGLFWALMPIIGWASYAPDPTGA
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 SCSWDYMSFTPAVRAYTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKGNG
.:. .. . . .::: . . :..:: ...::: . .:.. .: . : .
CCDS36 TCTINWRKNDRSFVSYTMTVIAINFIVPLTVMFYCYYHVTLSIKH-----HTTSDCTESL
180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 ESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAVIA
. :. : ..:. ...: .:...:.::: : : : : . . : :. . ..:
CCDS36 NRDWSDQ-----IDVTKMSVIMICMFLVAWSPYSIVCLWASFGDPKKIPPPMAIIAPLFA
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 KASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHTSN
:.:...:: ::.... :.: :. . :
CCDS36 KSSTFYNPCIYVVANKKFRRAMLAMFKCQTHQTMPVTSILPMDVSQNPLASGRI
290 300 310 320 330
>>CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 (348 aa)
initn: 518 init1: 208 opt: 411 Z-score: 343.3 bits: 72.5 E(32554): 8.4e-13
Smith-Waterman score: 551; 28.7% identity (67.0% similar) in 300 aa overlap (73-367:40-323)
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 PSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSRSLR
:.. ..:. . :. :. ..:. . ..::
CCDS30 YVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLR
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 TPANMFIINLAVSDFLMSFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLT
:: :....::::.:..: . . .::. ..:: :::.. .: ..: : .. .:.
CCDS30 TPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLV
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210
pF1KE9 AIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGV---WLYALAWSLPPFFGWSAYVPEGLLT
..:..::.:. .:...: . .. ...:: :..::: . ::. ::: :.::::
CCDS30 VLAIERYVVVCKPMSNFRFGENH----AIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQC
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 SCSWDYMSFTPAVRAYTMLLCCFV--FFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTFGACKG
::. ::... : : .... :: : .:..::..:: . ...:.. : .. .
CCDS30 SCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQ-
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 NGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPAV
..: ........... :.. :.::..::. :. . . : . ..::
CCDS30 -----------KAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAF
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 IAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSHT
.::..::.::.:: . . ..: . . :
CCDS30 FAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
300 310 320 330 340
>>CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 (348 aa)
initn: 339 init1: 187 opt: 395 Z-score: 330.6 bits: 70.1 E(32554): 4.3e-12
Smith-Waterman score: 489; 28.5% identity (62.3% similar) in 305 aa overlap (66-367:30-319)
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 ISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPLPTVDVPDHAHYTLGTVILLVGLTGMLGNLTVIYTF
: : : .. . : : :. : :. .
CCDS58 MRKMSEEEFYLFKNISSVGPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFMGTVFLIGFPLNAMVLVAT
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 CRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLMS-FTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFG
: ..:: : :....:.. . ::. :. ::: ..: ..::. : . .: :.. :
CCDS58 LRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVF-VASCNGYFVFGRHVCALEGFLGTVAG
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 ISSMITLTAIALDRYLVITRPLATFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFGWSAYVP
. . .:. .:..::.:: .:...: .::. : :.:..: ... :.::::::: ..:
CCDS58 LVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKH-ALTVVLATWTIGIGVSIPPFFGWSRFIP
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 EGLLTSCSWDYMSFTPAVRA--YTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGRALQTF
::: ::. :... :. :: .: : :..:: .: . : ..::.. .. :
CCDS58 EGLQCSCGPDWYTVGTKYRSESYTWFLFIFCFIVPLSLICFSYTQLLRALKAVAAQQQES
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 GACKGNGESLWQRQRLQSECKMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMS
.. . ..: .......... : . ..::.: :. . : : .
CCDS58 ATTQ------------KAEREVSRMVVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGLDLRLV
240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 SVPAVIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRST
..:. ..:.. :.::::: . . .... : . . :
CCDS58 TIPSFFSKSACIYNPIIYCFMNKQFQACIMK-MVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTVSSTQ
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 LTSHTSNLSWISIRRRQESLGSESEVGWTHMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKA
CCDS58 VGPN
>>CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 (529 aa)
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>>CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 (402 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]