Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9441, 907 aa
1>>>pF1KE9441 907 - 907 aa - 907 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9624+/-0.000445; mu= 24.4310+/- 0.028
mean_var=123.3301+/-26.625, 0's: 0 Z-trim(112.9): 536 B-trim: 362 in 1/53
Lambda= 0.115489
statistics sampled from 21411 (22021) to 21411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 12.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 5994 1011.4 0
NP_001264156 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 835) 4735 801.6 0
NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 4368 740.5 8.4e-213
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 3295 561.8 5.8e-159
NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-conta ( 915) 3134 534.9 6.7e-151
XP_005245461 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 924) 3124 533.3 2.1e-150
XP_011508143 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 2825 483.4 2e-135
XP_016857486 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 2825 483.4 2e-135
XP_011508140 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 2610 447.6 1.3e-124
XP_011508144 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 2607 447.0 1.6e-124
XP_011508145 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 2607 447.0 1.6e-124
XP_011508148 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 2607 447.0 1.6e-124
XP_011508142 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 852) 2606 446.9 2e-124
NP_001017404 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 828) 2490 427.6 1.3e-118
XP_011508146 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 708) 2250 387.5 1.3e-106
NP_060960 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich repea ( 951) 1748 304.0 2.2e-81
XP_016857487 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 609) 1719 298.9 5e-80
NP_001333361 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich re ( 927) 1556 272.0 9.4e-72
XP_011508141 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 1519 265.8 6.7e-70
XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 876) 1433 251.5 1.3e-65
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 685 126.7 3.8e-28
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 685 126.7 3.9e-28
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 647 120.2 2.6e-26
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 647 120.2 2.6e-26
XP_011531035 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 729) 584 109.9 4.6e-23
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 571 107.4 1.5e-22
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 571 107.4 1.5e-22
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618) 571 107.6 1.9e-22
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669) 571 107.7 2e-22
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695) 571 107.7 2e-22
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 557 105.4 1e-21
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 557 105.4 1.1e-21
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 557 105.4 1.1e-21
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 542 102.8 5.4e-21
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 538 101.8 6.5e-21
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 538 101.8 6.5e-21
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 538 101.9 6.6e-21
NP_001094861 (OMIM: 609792) leucine-rich repeat an ( 592) 495 94.9 1.2e-18
XP_016869794 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_016869793 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_016869795 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_011516030 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
NP_001245211 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat an ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_011516021 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_016869792 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_011516026 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
XP_016869796 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 468 90.5 2.7e-17
NP_689783 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat and i ( 606) 468 90.5 2.7e-17
NP_001288123 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 461 89.3 6.2e-17
NP_001288124 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614) 461 89.3 6.2e-17
>>NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-containin (907 aa)
initn: 5994 init1: 5994 opt: 5994 Z-score: 5405.5 bits: 1011.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5994; 99.9% identity (100.0% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-907)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
NP_003 VAFVPCL
>>NP_001264156 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-contai (835 aa)
initn: 4731 init1: 4731 opt: 4735 Z-score: 4272.2 bits: 801.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5362; 92.0% identity (92.1% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-835)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
:::::::::::::::::::::::
NP_001 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSL-------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------------------------------HLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
770 780 790 800 810 820
pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
NP_001 VAFVPCL
830
>>NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-contai (883 aa)
initn: 4305 init1: 4305 opt: 4368 Z-score: 3941.5 bits: 740.5 E(85289): 8.4e-213
Smith-Waterman score: 5779; 97.2% identity (97.4% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_001 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRSA
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pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
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pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
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pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
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pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
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pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
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pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
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pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
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pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
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pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
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pF1KE9 VAFVPCL
:::::::
NP_001 VAFVPCL
880
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Smith-Waterman score: 3295; 55.7% identity (80.9% similar) in 894 aa overlap (22-906:23-904)
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pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE
:..:. : .::. :::. :: ..: .:::.::::
NP_001 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA
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pF1KE9 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL
.:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.:
NP_001 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE9 MLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPV
::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : :: :::::::::::::::::
NP_001 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV
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pF1KE9 QAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL
.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.::::::::::::. :: . :.:::.::::
NP_001 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL
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pF1KE9 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRS
:::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.::: : :::::::::::::::
NP_001 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS
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pF1KE9 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL
:::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.:
NP_001 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL
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pF1KE9 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS
:.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.:::
NP_001 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS
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pF1KE9 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC
:: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::
NP_001 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC
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pF1KE9 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDL
: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. : : .::... :..: :
NP_001 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE9 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI
: ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.
NP_001 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV
:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::
NP_001 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV
600 610 620 630 640 650
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pF1KE9 FLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC
.::::::.. . :.. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..:::::::
NP_001 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC
660 670 680 690 700 710
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pF1KE9 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL
:: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.:
NP_001 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW
720 730 740 750 760 770
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pF1KE9 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED
:.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:
NP_001 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD
780 790 800 810 820 830
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pF1KE9 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY
: :: .. . : . ..::.:::::::::.: :.. : : . :
NP_001 LRRLRPRA-----GDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--
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900
pF1KE9 PVTESCHLSSVAFVPCL
: :. . ::... :
NP_001 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG
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>>NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-containin (915 aa)
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Smith-Waterman score: 3134; 56.0% identity (81.0% similar) in 856 aa overlap (60-906:8-852)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 LLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSL
: ..:.. : ::::::...: :. . :
NP_067 MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHL
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pF1KE9 RFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANH
::::::::.:: :..:: ::.::::::.:::::::: .:.::: .: ::::::::::
NP_067 RFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANL
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pF1KE9 ISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNL
:: :: : :: :::::::::::::::::.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::
NP_067 ISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNL
100 110 120 130 140 150
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pF1KE9 SSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNI
.::::::::::::. :: . :.:::.:::::::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::
NP_067 TSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNI
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pF1KE9 RSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTAN
..::::::.::: : ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..
NP_067 KAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEI
:: :::: : : ::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::..: :.::.:.::
NP_067 LEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEI
280 290 300 310 320 330
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pF1KE9 KVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLK
.:::.:: ::..:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...:..:: :: :::
NP_067 GADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLK
340 350 360 370 380 390
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pF1KE9 LTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--
: :: ::.. .:...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: .... .:: .
NP_067 LKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESS
400 410 420 430 440 450
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pF1KE9 KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIG
:. :.. : : .::... :..: : : ::::::.::::::::.:...: ::..
NP_067 KRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLA
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 VWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFG
::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::
NP_067 VWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFG
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 SFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLK
.:...:: ::.:.::.. :::....::.::.::::::.. . :.. . . ..:..
NP_067 QFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVR
580 590 600 610 620 630
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pF1KE9 VIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMM
. .: : :: ::.:: . ..::::::::: : :.:...:. :::...::.:::..
NP_067 AGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVV
640 650 660 670 680 690
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pF1KE9 TIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEV
. :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: :.:.. .: ::::::::.:...: ..::.
NP_067 AGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEA
700 710 720 730 740 750
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pF1KE9 IKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQ
.: .::::.:::::::::::.::::::..:: :: .. .. : : . ..::.
NP_067 VKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKS
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pF1KE9 SCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL
:::::::::.: :.. : : . : : :. . ::... :
NP_067 SCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCV
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NP_067 EPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
870 880 890 900 910
>>XP_005245461 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-rich re (924 aa)
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pF1KE9 PDGRMLLRVDCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNA
::::::...: :. . :::::::::.::
XP_005 MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNH
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110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGL
:..:: ::.::::::.:::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : ::
XP_005 LSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGL
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 HSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNR
:::::::::::::::::.:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.:::::::::::
XP_005 SSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNR
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 IHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNP
:. :: . :.:::.:::::::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.:::
XP_005 IQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNP
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 SLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQIS
: ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : :
XP_005 LLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIR
240 250 260 270 280 290
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pF1KE9 SLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLR
::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::.
XP_005 LLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE9 SLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLIS
.:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:
XP_005 ALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFS
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pF1KE9 SENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE
...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. : :
XP_005 KDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAE
420 430 440 450 460 470
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pF1KE9 ----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCN
.::... :..: : : ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::
XP_005 NHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCN
480 490 500 510 520 530
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pF1KE9 ALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENG
.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:
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