Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9428
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9428, 399 aa
1>>>pF1KE9428 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7079+/-0.000855; mu= 11.9106+/- 0.052
mean_var=113.5828+/-23.063, 0's: 0 Z-trim(110.7): 13 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.120342
statistics sampled from 11806 (11817) to 11806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1609.1 GPR137B gene_id:7107|Hs108|chr1 ( 399) 2706 480.3 1.3e-135
CCDS53655.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 ( 475) 1226 223.4 3.4e-58
CCDS53656.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 ( 396) 1220 222.3 6e-58
CCDS8066.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 ( 417) 1220 222.4 6.3e-58
CCDS53657.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 ( 320) 1166 212.9 3.4e-55
CCDS45106.1 GPR137C gene_id:283554|Hs108|chr14 ( 429) 1062 194.9 1.2e-49
CCDS53658.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 ( 346) 754 141.4 1.2e-33
>>CCDS1609.1 GPR137B gene_id:7107|Hs108|chr1 (399 aa)
initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706 Z-score: 2548.1 bits: 480.3 E(32554): 1.3e-135
Smith-Waterman score: 2706; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MRPERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFI
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CCDS16 MRPERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 YVQLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YVQLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PVCLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PVCLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 KTGNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLANIYLESKGSSVCQVTAIG
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CCDS16 KTGNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLANIYLESKGSSVCQVTAIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 VTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 VTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 WELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 WELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE9 LQGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDSTLDPDKPSLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LQGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDSTLDPDKPSLG
370 380 390
>>CCDS53655.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 1215 init1: 729 opt: 1226 Z-score: 1158.3 bits: 223.4 E(32554): 3.4e-58
Smith-Waterman score: 1226; 54.4% identity (76.6% similar) in 355 aa overlap (4-354:41-393)
10 20 30
pF1KE9 MRPERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDS-LPPT
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CCDS53 VVKAQLGPTVALEGRAPRAPGPSCLGNGNCQRPGPITSRNVTRASLP-DMESNLSGLVPA
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE9 --LTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFIYVQLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWAS
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CCDS53 AGLVPALPPAVTLGLTAAYTTLYALLFFSVYAQLWLVLLYGHKRLSYQTVFLALCLLWAA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE9 LRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPVCLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPE
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CCDS53 LRTTLFSFYFRDTPRANRLGPLPFWLLYCCPVCLQFFTLTLMNLYFAQVVFKAKVKRRPE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE9 LLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKTGNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLS
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CCDS53 MSRGLLAVRGAFVGASLLFLLVNVLCAVLSHRRRAQPWALLLVRVLVSDSLFVICALSLA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE9 ICLYKISKMSLA-NIYLESKGSSVCQVTAIGVTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSF
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CCDS53 ACLCLVARRAPSTSIYLEAKGTSVCQAAAMGGAMVLLYASRACYNLTALALAPQSRLDTF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 DYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFVWELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVP
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CCDS53 DYDWYNVSDQADLVNDLGNKGYLVFGLILFVWELLPTTLLVGFFRVHRPPQDLSTSHILN
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 SHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGLQGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDS
.. :. :::::: . . :. .:
CCDS53 GQVFASRSYFFDRAGHCE-DEGCSWEHSRGESTRCQDQAATTTVSTPPHRRDPPPSPTEY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS53656.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 (396 aa)
initn: 1215 init1: 729 opt: 1220 Z-score: 1153.8 bits: 222.3 E(32554): 6e-58
Smith-Waterman score: 1220; 56.7% identity (80.2% similar) in 323 aa overlap (33-354:14-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFIYV
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CCDS53 MESNLSGLVPAAGLVPALPPAVTLGLTAAYTTLYALLFFSVYA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPV
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CCDS53 QLWLVLLYGHKRLSYQTVFLALCLLWAALRTTLFSFYFRDTPRANRLGPLPFWLLYCCPV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKT
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CCDS53 CLQFFTLTLMNLYFAQVVFKAKVKRRPEMSRGLLAVRGAFVGASLLFLLVNVLCAVLSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLA-NIYLESKGSSVCQVTAIGV
. ... ::: ..:.:::.::.::. :: ... . . .::::.::.::::..:.:
CCDS53 RRAQPWALLLVRVLVSDSLFVICALSLAACLCLVARRAPSTSIYLEAKGTSVCQAAAMGG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 TVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFVW
...:::.::::::: :... .. . .:::::::::::::: :.::. ::..::..::::
CCDS53 AMVLLYASRACYNLTALALAPQSRLDTFDYDWYNVSDQADLVNDLGNKGYLVFGLILFVW
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGL
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CCDS53 ELLPTTLLVGFFRVHRPPQDLSTSHILNGQVFASRSYFFDRAGHCE-DEGCSWEHSRGES
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE9 QGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDSTLDPDKPSLG
CCDS53 TSMSGSLGSGSWYGAIGREPGWYGGSQTKTTPLLFSQVPGPGGHHHSLYSTPQT
350 360 370 380 390
>>CCDS8066.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 (417 aa)
initn: 1215 init1: 729 opt: 1220 Z-score: 1153.5 bits: 222.4 E(32554): 6.3e-58
Smith-Waterman score: 1220; 56.7% identity (80.2% similar) in 323 aa overlap (33-354:14-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFIYV
:.::.:: : ::::..::..::::: .:.
CCDS80 MESNLSGLVPAAGLVPALPPAVTLGLTAAYTTLYALLFFSVYA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPV
:::::: : :::::::.::: :::.::.:::.::::::.: :: :.:. :::::: ::
CCDS80 QLWLVLLYGHKRLSYQTVFLALCLLWAALRTTLFSFYFRDTPRANRLGPLPFWLLYCCPV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKT
::::::::::::::.::.:::: : ::. . : . : . ::.:::::. :::: .
CCDS80 CLQFFTLTLMNLYFAQVVFKAKVKRRPEMSRGLLAVRGAFVGASLLFLLVNVLCAVLSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLA-NIYLESKGSSVCQVTAIGV
. ... ::: ..:.:::.::.::. :: ... . . .::::.::.::::..:.:
CCDS80 RRAQPWALLLVRVLVSDSLFVICALSLAACLCLVARRAPSTSIYLEAKGTSVCQAAAMGG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 TVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFVW
...:::.::::::: :... .. . .:::::::::::::: :.::. ::..::..::::
CCDS80 AMVLLYASRACYNLTALALAPQSRLDTFDYDWYNVSDQADLVNDLGNKGYLVFGLILFVW
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGL
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CCDS80 ELLPTTLLVGFFRVHRPPQDLSTSHILNGQVFASRSYFFDRAGHCE-DEGCSWEHSRGES
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE9 QGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDSTLDPDKPSLG
CCDS80 TRCQDQAATTTVSTPPHRRDPPPSPTEYPGPSPPHPRPLCQVCLPLLAQDPGGRGYPLLW
350 360 370 380 390 400
>>CCDS53657.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1166 init1: 729 opt: 1166 Z-score: 1104.5 bits: 212.9 E(32554): 3.4e-55
Smith-Waterman score: 1166; 59.8% identity (82.1% similar) in 291 aa overlap (33-322:14-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFIYV
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CCDS53 MESNLSGLVPAAGLVPALPPAVTLGLTAAYTTLYALLFFSVYA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPV
:::::: : :::::::.::: :::.::.:::.::::::.: :: :.:. :::::: ::
CCDS53 QLWLVLLYGHKRLSYQTVFLALCLLWAALRTTLFSFYFRDTPRANRLGPLPFWLLYCCPV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKT
::::::::::::::.::.:::: : ::. . : . : . ::.:::::. :::: .
CCDS53 CLQFFTLTLMNLYFAQVVFKAKVKRRPEMSRGLLAVRGAFVGASLLFLLVNVLCAVLSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLA-NIYLESKGSSVCQVTAIGV
. ... ::: ..:.:::.::.::. :: ... . . .::::.::.::::..:.:
CCDS53 RRAQPWALLLVRVLVSDSLFVICALSLAACLCLVARRAPSTSIYLEAKGTSVCQAAAMGG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 TVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFVW
...:::.::::::: :... .. . .:::::::::::::: :.::. ::..::..::::
CCDS53 AMVLLYASRACYNLTALALAPQSRLDTFDYDWYNVSDQADLVNDLGNKGYLVFGLILFVW
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFFDNPRRYDSDDDLAWNIAPQGL
:::::::.: ::::. : .::
CCDS53 ELLPTTLLVGFFRVHRPPQDLYVGQSRLWELVWCHRA
290 300 310 320
>>CCDS45106.1 GPR137C gene_id:283554|Hs108|chr14 (429 aa)
initn: 733 init1: 485 opt: 1062 Z-score: 1005.1 bits: 194.9 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1068; 48.4% identity (72.5% similar) in 364 aa overlap (9-352:2-361)
10 20 30 40
pF1KE9 MRPERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLT-----------PAVPPYVKLGLTVVY
: :.::: . .:. : : . ::: :.:.:.:..
CCDS45 MRVSVPGPAAAAAPAAGREPSTPGGGSGGGGAVAAASGAAVPGSVQLALSVLH
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 TVFYALLFVFIYVQLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSL
...:: ::.: :.::: .: ::..::::::. :::::.::.:::.::: :. . :
CCDS45 ALLYAALFAFAYLQLWRLLLYRERRLSYQSLCLFLCLLWAALRTTLFSAAFSLSGSLPLL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 SP------FVFWLLYCFPVCLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASL
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CCDS45 RPPAHLHFFPHWLLYCFPSCLQFSTLCLLNLYLAEVICKVRC--ATELDRHKILLHLGFI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 FISLVFLLVNLTCAVLVKTGNWERKV--IVSVRVAINDTLFVLCAVSLSIC-LYKISKMS
. ::.::.::::::.::. : .. : ::. :::.::.:::.:: .: . ::.:::
CCDS45 MASLLFLVVNLTCAMLVHGDVPENQLKWTVFVRALINDSLFILCAISL-VCYICKITKMS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LANIYLESKGSSVCQVTAIGVTVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQA
::.:::::: :.::....: .:::::.::::::: ....::. :.: : :.::.:
CCDS45 SANVYLESKGMSLCQTVVVGSVVILLYSSRACYNLVVVTISQDTLESPFNYGWDNLSDKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 DLKNQLGDAGYVLFGVVLFVWELLPTTLVVYFFRVRNPTKDLTNPGMVPSHGFSPRSYFF
... :. :..::.:::.:: .:. :: :::.. ...:. ::. ::..: :.:::
CCDS45 HVEDISGEE-YIVFGMVLFLWEHVPAWSVVLFFRAQRLNQNLAPAGMINSHSYSSRAYFF
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE9 DNPRRYDSDDDLAWNIAPQGLQGGFAPDYYDWGQQTNSFLAQAGTLQDSTLDPDKPSLG
::::::::::::
CCDS45 DNPRRYDSDDDLPRLGSSREGSLPNSQSLGWYGTMTGCGSSSYTVTPHLNGPMTDTAPLL
350 360 370 380 390 400
>>CCDS53658.1 GPR137 gene_id:56834|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 971 init1: 731 opt: 754 Z-score: 717.4 bits: 141.4 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 894; 47.7% identity (66.6% similar) in 323 aa overlap (33-354:14-285)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 PERPRPRGSAPGPMETPPWDPARNDSLPPTLTPAVPPYVKLGLTVVYTVFYALLFVFIYV
:.::.:: : ::::..::..::::: .:.
CCDS53 MESNLSGLVPAAGLVPALPPAVTLGLTAAYTTLYALLFFSVYA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QLWLVLRYRHKRLSYQSVFLFLCLFWASLRTVLFSFYFKDFVAANSLSPFVFWLLYCFPV
:::::: : :::::::.::: :::.::.:::.::::::.: :: :.:. :::::: ::
CCDS53 QLWLVLLYGHKRLSYQTVFLALCLLWAALRTTLFSFYFRDTPRANRLGPLPFWLLYCCPV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CLQFFTLTLMNLYFTQVIFKAKSKYSPELLKYRLPLYLASLFISLVFLLVNLTCAVLVKT
::::::::::::::.::.:::: : ::. . : . : . ::.:::::. :::: .
CCDS53 CLQFFTLTLMNLYFAQVVFKAKVKRRPEMSRGLLAVRGAFVGASLLFLLVNVLCAVLSHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GNWERKVIVSVRVAINDTLFVLCAVSLSICLYKISKMSLA-NIYLESKGSSVCQVTAIGV
. ... ::: ..:.:::.::.::. :: ... . . .::::.:
CCDS53 RRAQPWALLLVRVLVSDSLFVICALSLAACLCLVARRAPSTSIYLEAK------------
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 TVILLYTSRACYNLFILSFSQNKSVHSFDYDWYNVSDQADLKNQLGDAGYVLFGVVLFVW
::: :.::. ::..::..::::
CCDS53 --------------------------------------ADLVNDLGNKGYLVFGLILFVW
220 230
310 320 330 340 350 360
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