Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9426, 797 aa
1>>>pF1KE9426 797 - 797 aa - 797 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9965+/-0.000628; mu= 17.3908+/- 0.039
mean_var=115.6720+/-24.297, 0's: 0 Z-trim(106.6): 286 B-trim: 59 in 1/47
Lambda= 0.119251
statistics sampled from 14375 (14712) to 14375 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 11.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_116176 (OMIM: 612307) adhesion G-protein couple ( 797) 5171 902.4 0
XP_011511547 (OMIM: 612307) PREDICTED: adhesion G- ( 662) 4141 725.1 2.4e-208
NP_001295291 (OMIM: 612307) adhesion G-protein cou ( 502) 3150 554.5 4.1e-157
XP_016866574 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1116) 318 67.6 3.4e-10
NP_001027566 (OMIM: 612243,616503) G-protein coupl (1193) 318 67.6 3.5e-10
NP_065188 (OMIM: 612243,616503) G-protein coupled (1221) 318 67.6 3.6e-10
XP_005267118 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1222) 318 67.6 3.6e-10
NP_001027567 (OMIM: 612243,616503) G-protein coupl (1222) 318 67.6 3.6e-10
XP_006715581 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1223) 318 67.6 3.6e-10
XP_006715580 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1249) 318 67.7 3.7e-10
XP_011534266 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1250) 318 67.7 3.7e-10
NP_940971 (OMIM: 612243,616503) G-protein coupled (1250) 318 67.7 3.7e-10
XP_006715579 (OMIM: 612243,616503) PREDICTED: G-pr (1251) 318 67.7 3.7e-10
NP_001171763 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot ( 966) 292 63.1 6.8e-09
NP_001171764 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot ( 979) 292 63.1 6.8e-09
NP_001171766 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot ( 987) 292 63.1 6.9e-09
NP_001171765 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot ( 993) 292 63.1 6.9e-09
NP_001073329 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot ( 995) 292 63.1 6.9e-09
NP_001171762 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot (1001) 292 63.1 6.9e-09
NP_001073328 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot (1003) 292 63.1 6.9e-09
NP_005747 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-protein (1014) 292 63.1 7e-09
NP_001073327 (OMIM: 300572,300985) adhesion G-prot (1017) 292 63.1 7e-09
XP_011543737 (OMIM: 300572,300985) PREDICTED: adhe (1017) 292 63.1 7e-09
XP_006724518 (OMIM: 300572,300985) PREDICTED: adhe (1017) 292 63.1 7e-09
XP_011543736 (OMIM: 300572,300985) PREDICTED: adhe (1017) 292 63.1 7e-09
NP_001284635 (OMIM: 607018) adhesion G protein-cou (1123) 280 61.1 3.1e-08
XP_016856287 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1163) 280 61.1 3.2e-08
XP_016856286 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1173) 280 61.1 3.2e-08
NP_001284634 (OMIM: 607018) adhesion G protein-cou (1177) 280 61.1 3.3e-08
NP_001284633 (OMIM: 607018) adhesion G protein-cou (1403) 280 61.2 3.7e-08
NP_036434 (OMIM: 607018) adhesion G protein-couple (1403) 280 61.2 3.7e-08
XP_016856281 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1408) 280 61.2 3.7e-08
XP_005270725 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1446) 280 61.2 3.8e-08
XP_016856278 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1446) 280 61.2 3.8e-08
XP_016856277 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1451) 280 61.2 3.8e-08
XP_011521251 (OMIM: 616965) PREDICTED: adhesion G- ( 528) 271 59.2 5.4e-08
NP_001291305 (OMIM: 616965) adhesion G-protein cou ( 528) 271 59.2 5.4e-08
NP_722579 (OMIM: 616965) adhesion G-protein couple ( 528) 271 59.2 5.4e-08
XP_011521252 (OMIM: 616965) PREDICTED: adhesion G- ( 528) 271 59.2 5.4e-08
XP_016856284 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1181) 273 59.9 7.5e-08
XP_016856285 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1186) 273 59.9 7.5e-08
XP_016856283 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1191) 273 59.9 7.6e-08
XP_016856282 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1225) 273 59.9 7.7e-08
NP_001317574 (OMIM: 607018) adhesion G protein-cou (1416) 273 60.0 8.6e-08
XP_016856279 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1421) 273 60.0 8.6e-08
XP_005270723 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1459) 273 60.0 8.7e-08
XP_016856276 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1459) 273 60.0 8.7e-08
XP_016856275 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1463) 273 60.0 8.8e-08
XP_016856274 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1463) 273 60.0 8.8e-08
XP_006710552 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 273 60.0 8.8e-08
>>NP_116176 (OMIM: 612307) adhesion G-protein coupled re (797 aa)
initn: 5171 init1: 5171 opt: 5171 Z-score: 4818.2 bits: 902.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5171; 99.9% identity (100.0% similar) in 797 aa overlap (1-797:1-797)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MASCRAWNLRVLVAVVCGLLTGIILGLGIWRIVIRIQRGKSTSSSSTPTEFCRNGGTWEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MASCRAWNLRVLVAVVCGLLTGIILGLGIWRIVIRIQRGKSTSSSSTPTEFCRNGGTWEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFARIPVGRYGPSLQTCGKDTPNAGNPMAVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GRCICTEEWKGLRCTIANFCENSTYMGFTFARIPVGRYGPSLQTCGKDTPNAGNPMAVRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CSLSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQILTSDANKLTAENIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 CSLSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQILTSDANKLTAENIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATANDDALTTLIEQMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATANDDALTTLIEQMET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 YSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 ASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 ASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 LMTFRKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLI
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LMTFKKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 FNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 FNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 FTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 FTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 TKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 TVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 TVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSP
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE9 STEEITLSESDNAKESI
:::::::::::::::::
NP_116 STEEITLSESDNAKESI
790
>>XP_011511547 (OMIM: 612307) PREDICTED: adhesion G-prot (662 aa)
initn: 4140 init1: 4140 opt: 4141 Z-score: 3861.6 bits: 725.1 E(85289): 2.4e-208
Smith-Waterman score: 4141; 98.3% identity (99.4% similar) in 659 aa overlap (139-797:5-662)
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 TPNAGNPMAVRLCSLSLYGEIELQKVTIGNCNENLETLEKQVKDVTAPLNNISSEVQILT
: ... . ..:::::::::::::::::::
XP_011 MDHPC-KHVARILQMVKDVTAPLNNISSEVQILT
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 SDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATAND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDANKLTAENITSATRVVGQIFNTSRNASPEAKKVAIVTVSQLLDASEDAFQRVAATAND
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 DALTTLIEQMETYSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DALTTLIEQMETYSLSLGNQSVVEPNIAIQSANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSSLVSS
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 STFIHTNVDGLNPDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STFIHTNVDGLNPDAQTELQVLLNMTKNYTKTCGFVVYQNDKLFQSKTFTAKSDFSQKII
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 SSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDWDTYGCQKDKGTDGFL
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 RCRCNHTTNFAVLMTFRKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RCRCNHTTNFAVLMTFKKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTVIFQIVTRKVRKTSVT
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE9 WVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDIPRTDTINIPNPMCTA
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE9 IAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLIGWGVPAIVVAITVGV
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KE9 IYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVTIILISNVVMFITISI
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KE9 KVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLF
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KE9 NTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPT
580 590 600 610 620 630
770 780 790
pF1KE9 LHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
640 650 660
>>NP_001295291 (OMIM: 612307) adhesion G-protein coupled (502 aa)
initn: 3140 init1: 3140 opt: 3150 Z-score: 2941.7 bits: 554.5 E(85289): 4.1e-157
Smith-Waterman score: 3150; 98.2% identity (99.0% similar) in 494 aa overlap (306-797:9-502)
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 SVQKGASSSLVSSSTFIHTNVDGLNPDAQTELQVLLNMT--KNYTKTCGFVVYQNDKLFQ
:: .:: : ..:::::::::::::::::
NP_001 MPVKMLFKELLLLLMMMPLQHYTKTCGFVVYQNDKLFQ
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 SKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKTFTAKSDFSQKIISSKTDENEQDQSASVDMVFSPKYNQKEFQLYSYACVYWNLSAKDW
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 DTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAVLMTFRKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTYGCQKDKGTDGFLRCRCNHTTNFAVLMTFKKDYQYPKSLDILSNVGCALSVTGLALTV
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 IFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IFQIVTRKVRKTSVTWVLVNLCISMLIFNLLFVFGIENSNKNLQTSDGDINNIDFDNNDI
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 PRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILFISLI
220 230 240 250 260 270
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 GWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEKICWLAIPEPNGVIKSPLLWSFIVPVT
280 290 300 310 320 330
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGITWILAYLMLVN
340 350 360 370 380 390
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 DDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIGRRKSLPSVTRP
400 410 420 430 440 450
760 770 780 790
pF1KE9 RLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
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170 180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270 280
pF1KE9 NDDALTTLIEQMETYSL-SLGNQSVVEPNIAIQ-SANFSSENAVGPSNVRFSVQKGASSS
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pF1KE9 NNDIPRTDTINIPNPMCTAIAALLHYFLLVTFTWNALSAAQLYYLLIRTMKPLPRHFILF
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XP_006 G--------------LCIAVAVLLHFFLLATFTWMGLEAIHMYIALVKVFNTYIRRYILK
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pF1KE9 ISLIGWGVPAIVVAITVGVIYSQNGNNPQWELDYRQEK---ICWLAIPEPNGVIKSPLLW
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XP_006 FCIIGWGLPALVVSV---VLASRNNNEVYGKESYGKEKGDEFCW---------IQDPVI-
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pF1KE9 SFIVPVT----IILISNVVMFITISIKVLWKNNQNLTSTKKVSSMKKIVSTLSVAVVFGI
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XP_006 -FYVTCAGYFGVMFFLNIAMFIVVMVQICGRNGKRSNRTLREEVLRNLRSVVSLTFLLGM
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pF1KE9 TWILAYLMLVNDDSIRIVFSYIFCLFNTTQGLQIFILYTVRTKVFQSEASKVLMLLSSIG
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XP_006 TWGFAFFAW---GPLNIPFMYLFSIFNSLQGLFIFIFHCAMKENVQKQWRQHLCCGRFRL
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pF1KE9 RRKSLPSVTRPRLRVKMYNFLRSLPTLHERFRLLETSPSTEEITLSESDNAKESI
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