FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9413, 372 aa
1>>>pF1KE9413 372 - 372 aa - 372 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7462+/-0.000462; mu= 19.8649+/- 0.029
mean_var=106.4453+/-28.166, 0's: 0 Z-trim(110.0): 558 B-trim: 2041 in 2/48
Lambda= 0.124311
statistics sampled from 17551 (18279) to 17551 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 7.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009158 (OMIM: 604838) probable G-protein couple ( 372) 2457 452.2 9e-127
XP_011534455 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_011534456 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
NP_001137429 (OMIM: 606915) probable G-protein cou ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_006715633 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
NP_110411 (OMIM: 606915) probable G-protein couple ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_011534459 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_016866823 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_011534461 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
XP_011534457 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G- ( 419) 1361 255.7 1.4e-67
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 400 83.3 1.1e-15
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 353 74.8 3.4e-13
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 353 74.9 3.5e-13
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 353 74.9 3.6e-13
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 353 74.9 3.6e-13
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 353 74.9 3.7e-13
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 353 74.9 3.8e-13
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 336 71.9 3.1e-12
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 336 71.9 3.1e-12
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 335 71.6 3.1e-12
NP_115940 (OMIM: 176400,604161,614837) kiSS-1 rece ( 398) 330 70.8 6.3e-12
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 329 70.7 7.9e-12
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 324 69.7 1.4e-11
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 320 69.0 2.3e-11
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 319 68.9 2.9e-11
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 315 68.1 4.3e-11
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 315 68.2 4.6e-11
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 315 68.2 4.8e-11
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 313 67.7 5.4e-11
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 313 67.7 5.4e-11
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 313 67.8 5.6e-11
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 313 67.8 5.6e-11
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 313 67.9 6.2e-11
NP_937822 (OMIM: 606925) pyroglutamylated RFamide ( 431) 311 67.4 7e-11
NP_722561 (OMIM: 612250) G-protein coupled recepto ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_011507680 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_011507678 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_011507679 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_016856349 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_011507677 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
NP_001254539 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_005245113 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_005245114 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_016856351 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
XP_016856350 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 311 67.5 8e-11
NP_001254540 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 546) 311 67.5 8.1e-11
XP_005245112 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 549) 311 67.5 8.1e-11
>>NP_009158 (OMIM: 604838) probable G-protein coupled re (372 aa)
initn: 2457 init1: 2457 opt: 2457 Z-score: 2397.0 bits: 452.2 E(85289): 9e-127
Smith-Waterman score: 2457; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCIIVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 GVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPARAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDLRQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYCGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQPS
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE9 TVYVCNENQSAV
::::::::::::
NP_009 TVYVCNENQSAV
370
>>XP_011534455 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa)
initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
XP_011 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
:::. :::::::.:::.:::.:..:.. :::. ::..:.:: :: :::.:: ..:.::
XP_011 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
XP_011 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
XP_011 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
: .. :: ::: :.:.:..:::.:::::::::. : .:: : ..:::...::..::
XP_011 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
::.::::.:....:
XP_011 PSAVYVCGEHRTVV
410
>>XP_011534456 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa)
initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
XP_011 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
:::. :::::::.:::.:::.:..:.. :::. ::..:.:: :: :::.:: ..:.::
XP_011 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
XP_011 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
XP_011 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
: .. :: ::: :.:.:..:::.:::::::::. : .:: : ..:::...::..::
XP_011 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
::.::::.:....:
XP_011 PSAVYVCGEHRTVV
410
>>NP_001137429 (OMIM: 606915) probable G-protein coupled (419 aa)
initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
NP_001 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
:::. :::::::.:::.:::.:..:.. :::. ::..:.:: :: :::.:: ..:.::
NP_001 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
NP_001 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
NP_001 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
: .. :: ::: :.:.:..:::.:::::::::. : .:: : ..:::...::..::
NP_001 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
NP_001 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
::.::::.:....:
NP_001 PSAVYVCGEHRTVV
410
>>XP_006715633 (OMIM: 606915) PREDICTED: probable G-prot (419 aa)
initn: 1382 init1: 1360 opt: 1361 Z-score: 1334.1 bits: 255.7 E(85289): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1361; 55.2% identity (83.4% similar) in 344 aa overlap (29-372:76-419)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
XP_006 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
:::. :::::::.:::.:::.:..:.. :::. ::..:.:: :: :::.:: ..:.::
XP_006 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
XP_006 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
XP_006 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
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240 250 260 270 280 290
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: .. :: ::: :.:.:..:::.:::::::::. : .:: : ..:::...::..::
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300 310 320 330 340 350
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.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
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360 370
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240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
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XP_011 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
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300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
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360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
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XP_011 PSAVYVCGEHRTVV
410
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
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XP_016 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
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pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
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XP_016 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
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pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
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XP_016 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
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360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
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XP_016 PSAVYVCGEHRTVV
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
: ::.:.:. .:... :.:::: :::..
XP_011 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
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XP_011 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
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XP_011 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
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pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
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XP_011 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
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240 250 260 270 280 290
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300 310 320 330 340 350
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XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
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360 370
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MACNSTSLEAYTYLLLNTSNASDSGSTQLPAPLRISLAIVMLLMTVVGFLGNTVVCII
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XP_011 YSFETMAPTGLSSLTVNSTAVPTTPAAFKSLNLPLQITLSAIMIFILFVSFLGNLVVCLM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VYQRPAMRSAINLLLATLAFSDIMLSLCCMPFTAVTLITVRWHFGDHFCRLSATLYWFFV
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XP_011 VYQKAAMRSAINILLASLAFADMLLAVLNMPFALVTILTTRWIFGKFFCRVSAMFFWLFV
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LEGVAILLIISVDRFLIIVQRQDKLNPRRAKVIIAVSWVLSFCIAGPSLTGWTLVEVPAR
.::::::::::.::::::::::::::: ::::.:::::. :::.: : .: ...:.:
XP_011 IEGVAILLIISIDRFLIIVQRQDKLNPYRAKVLIAVSWATSFCVAFPLAVGNPDLQIPSR
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 APQCVLGYTELPADRAYVVTLVVAVFFAPFGVMLCAYMCILNTVRKNAVRVHNQSDSLDL
:::::.::: :. .:::. . . :: :: :.: ..: ::::.:.::.:.:. ... :
XP_011 APQCVFGYTTNPGYQAYVILISLISFFIPFLVILYSFMGILNTLRHNALRIHSYPEGICL
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RQLTRAGLRRLQRQQQVSVDLSFKTKAFTTILILFVGFSLCWLPHSVYSLLSVFSQRFYC
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XP_011 SQASKLGLMSLQRPFQMSIDMGFKTRAFTTILILFAVFIVCWAPFTTYSLVATFSKHFYY
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 GSSFYATSTCVLWLSYLKSVFNPIVYCWRIKKFREACIELLPQTFQILPKVPERIRRRIQ
.:. :: .::: ::::..::..: ::::::..::....:..:..::..: . .:::.
XP_011 QHNFFEISTWLLWLCYLKSALNPLIYYWRIKKFHDACLDMMPKSFKFLPQLPGHTKRRIR
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE9 PSTVYVCNENQSAV
::.::::.:....:
XP_011 PSAVYVCGEHRTVV
410
372 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:20:44 2016 done: Sun Nov 6 18:20:45 2016
Total Scan time: 7.650 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]