Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9411, 356 aa
1>>>pF1KE9411 356 - 356 aa - 356 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4024+/-0.00109; mu= 15.8879+/- 0.064
mean_var=114.2525+/-33.633, 0's: 0 Z-trim(104.4): 244 B-trim: 1036 in 2/45
Lambda= 0.119989
statistics sampled from 7585 (7899) to 7585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 2.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 2416 429.8 1.7e-120
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 741 139.8 3.2e-33
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 723 136.7 2.8e-32
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 663 126.3 3.8e-29
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 632 121.0 1.6e-27
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 632 121.0 1.6e-27
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 ( 333) 523 102.1 7.2e-22
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 507 99.3 5.1e-21
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 482 95.1 1.1e-19
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 454 90.2 3e-18
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 419 84.1 2e-16
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 411 82.8 5.4e-16
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 405 81.7 1e-15
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 404 81.5 1.2e-15
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 395 80.0 3.6e-15
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 395 80.0 3.6e-15
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 392 79.6 6.1e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 380 77.4 2.1e-14
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 380 77.4 2.2e-14
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 380 77.4 2.3e-14
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 378 77.1 2.8e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 375 76.5 4.1e-14
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 365 74.8 1.3e-13
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 365 74.8 1.3e-13
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 362 74.3 1.9e-13
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 360 73.8 2.1e-13
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 361 74.1 2.1e-13
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 356 73.3 4e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 356 73.3 4e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 356 73.3 4.1e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 356 73.3 4.1e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 356 73.3 4.1e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 356 73.3 4.1e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 356 73.3 4.2e-13
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 356 73.3 4.2e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 356 73.3 4.4e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 356 73.4 4.7e-13
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 347 71.6 1.1e-12
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 345 71.3 1.5e-12
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 343 71.0 1.8e-12
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 343 71.0 1.8e-12
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 342 70.8 2e-12
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 341 70.6 2.3e-12
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 340 70.4 2.5e-12
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 335 69.6 4.8e-12
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 324 67.7 1.9e-11
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 323 67.5 2e-11
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 321 67.1 2.5e-11
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 316 66.3 4.4e-11
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 317 66.5 4.5e-11
>>CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 (356 aa)
initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 2276.8 bits: 429.8 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 2416; 100.0% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (1-356:1-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MNGVSEGTRGCSDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MNGVSEGTRGCSDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 NGLVLWMTVFRMARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYIVSRQWLLGEWACKLYITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NGLVLWMTVFRMARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYIVSRQWLLGEWACKLYITF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VFLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VFLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TTRKWNGCTHCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TTRKWNGCTHCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AKLLREGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AKLLREGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 SFALGCVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFALGCVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
310 320 330 340 350
>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 726 init1: 222 opt: 741 Z-score: 709.8 bits: 139.8 E(32554): 3.2e-33
Smith-Waterman score: 741; 40.5% identity (70.7% similar) in 304 aa overlap (42-342:25-328)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 SDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFR
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CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFR
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 MARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYI-VSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNC
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CCDS12 MTRTVTTICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVF
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180
pF1KE9 LLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRTTRKW-NGCT
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CCDS12 LIGFIALDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 HCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLREGWV
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CCDS12 YCTFNFASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 HANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVV-LLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQASFALGCVN
...:: :.: ..:..::: : ::..: :: .: . :: . . .... . .:. :
CCDS12 KSSRPLRVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE9 SSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
: :::.::::::.::.:....:: ..: ::..:.
CCDS12 SCLNPMLYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 544 init1: 208 opt: 723 Z-score: 692.9 bits: 136.7 E(32554): 2.8e-32
Smith-Waterman score: 723; 37.5% identity (70.8% similar) in 312 aa overlap (35-341:16-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 SEGTRGCSDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGS--LRPLTVVILSASIVVGVLGNG
: : .: : ..... ....: ::::::
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 LVLWMTVFRMARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYIVSRQ-WLLGEWACKLYITFV
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CCDS12 LVIWVAGFRMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 FLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRT
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CCDS12 DINLFVSVYLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 T-RKWNGCTHCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIR
: :: :.: . : ..:: .. . . : ::..:: :..:: .: .:
CCDS12 TISTTNGDTYCIFNFAFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE9 AKLLREGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVV-LLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQ
::. :. ....:: :.. ..:..::: : :.... .:. .: . :: . . .:....
CCDS12 AKIHRNHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLIN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ASFALGCVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
. .:. :: :::.::::.::.:::....:: ..: ::. :
CCDS12 PTSSLAFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPP
290 300 310 320 330 340
CCDS12 EETELQAM
350
>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 641 init1: 284 opt: 663 Z-score: 636.8 bits: 126.3 E(32554): 3.8e-29
Smith-Waterman score: 663; 35.0% identity (72.2% similar) in 306 aa overlap (45-347:28-332)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 QPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFRMAR
.: .......:.::::::::.:.. :::..
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTH
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 TVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYY-IVSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNCLLV
::.:. ...::.::: .. .::. : .. .: .: . ::. .:.: .. :.: :..
CCDS12 TVTTISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIA
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 FISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALC-SAHLKFRTTRKWNGCTHCY
.:..:::. ::.:::. :::::. :. . .: :..: : . .. :. .: . :
CCDS12 LIALDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACT
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE9 LAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLREGWVHAN
. :. .. . :. .: . : .:..:: .:..:... :: .:. ..: ....
CCDS12 FNFSPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSS
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE9 RPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWR-RVMLKEIYHPRMLLILQASFALGCVNSSL
:: :.: ...:::. :::..:: :. : : .:. .:. .. . .... ::. :: :
CCDS12 RPLRVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRELLQGMYK-EIGIAVDVTSALAFFNSCL
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350
pF1KE9 NPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
::.::::.:.::.:.....: ..: ::. :. .:
CCDS12 NPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (371 aa)
initn: 577 init1: 220 opt: 632 Z-score: 607.5 bits: 121.0 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 632; 36.0% identity (65.6% similar) in 314 aa overlap (43-349:38-346)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 DRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFRM
: . ::. : .:.::::::. ...:.:
CCDS41 TSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKM
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 ARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYI-VSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNCL
.::. : :..::.:::.... ::: . : .. .:..: ::. ... ..:.: :
CCDS41 KKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 LVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRTTRKWNGCTHC
:..:: ::::::: :::. :::.:. : . .:.:: : : : :: : . .: :
CCDS41 LTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANLHGKISC
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KE9 YLAFNSDNETAQIW-----IEGV-VEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLR
. :. .. .. : .. : :.. :. .:: ::: :. :: .: : :: :
CCDS41 FNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVCKLQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 EGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQASFALG
. .....: ....... .::. : :.... :..: . .: .. : : . ::.
CCDS41 NRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTAMPGSVFS----LGLPLATALA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 CVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
.:: .::.::::.:.::. :: .: : :. :..:. :: :
CCDS41 IANSCMNPILYVFMGQDFK-KFKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSMNERTS
310 320 330 340 350 360
CCDS41 MNERETGML
370
>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 577 init1: 220 opt: 632 Z-score: 607.5 bits: 121.0 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 632; 36.0% identity (65.6% similar) in 314 aa overlap (43-349:40-348)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 DRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVFRM
: . ::. : .:.::::::. ...:.:
CCDS44 TSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVIIIATFKM
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 ARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYI-VSRQWLLGEWACKLYITFVFLSYFASNCL
.::. : :..::.:::.... ::: . : .. .:..: ::. ... ..:.: :
CCDS44 KKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHNMFTSVFL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE9 LVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRTTRKWNGCTHC
:..:: ::::::: :::. :::.:. : . .:.:: : : : :: : . .: :
CCDS44 LTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTANLHGKISC
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KE9 YLAFNSDNETAQIW-----IEGV-VEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLR
. :. .. .. : .. : :.. :. .:: ::: :. :: .: : :: :
CCDS44 FNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACYLTIVCKLQR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE9 EGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQASFALG
. .....: ....... .::. : :.... :..: . .: .. : : . ::.
CCDS44 NRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTAMPGSVFS----LGLPLATALA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 CVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
.:: .::.::::.:.::. :: .: : :. :..:. :: :
CCDS44 IANSCMNPILYVFMGQDFK-KFKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSMNERTS
310 320 330 340 350 360
CCDS44 MNERETGML
370
>>CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 (333 aa)
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10 20 30 40 50
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.:.: . . . : : . .:.. :. ..
CCDS73 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSII
10 20 30 40
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:.. ::: ::. :.: .::.:. :::: :. :. .. :: .: . . .: .: ::
CCDS73 GTITNGLYLWVLRFKMKQTVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCK
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120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LYITFVFLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSA
.. . :..:.: .: :..:: . .:.:::. .::: . :: ...:::. ::::
CCDS73 VFNGTLSLGMFTSVFFLSAIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 HLKFRTT---RKWN-GCTHCYLAFNSDNETAQI-----WIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFL
.: :: : :: . : . : : ... :. .. :: :. :..::::::
CCDS73 YLIFRETHHDRKGKVTCQNNY-AVSTNWESKEMQASRQWI------HVACFISRFLLGFL
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pF1KE9 GPLAIIGTCAHLIRAKLLREGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVV--LLVHLWRRV
:. :: : . . .:. ... ....: ..... . .::. : :... ::. . .
CCDS73 LPFFIIIFCYERVASKVKERSLFKSSKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 MLKEIYHPRMLLILQASFALGCVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEF
.:. .: .: .:: :. ..: ::.:::..:.. : .:. . . .:.:.
CCDS73 LLELTL---ILTVLTTSF-----NTIFSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSS
280 290 300 310 320
350
pF1KE9 LSSCPRGNAPRE
CCDS73 VERTQT
330
>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa)
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Smith-Waterman score: 518; 30.1% identity (64.4% similar) in 306 aa overlap (38-341:33-329)
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..: .. ...:. ..:.:. ::..:.:.
CCDS23 DLEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWF
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: :. .::.:. :..::.:::.. : ::. . :. .. .: .: : :: . :..:
CCDS23 TGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMF
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pF1KE9 ASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRTTRKWN
:: .:. ::.:. : ...:: . :::.. . . . .::::. . . : :: : ..:
CCDS23 ASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVEFN
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pF1KE9 GCTHCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIRAKLLRE
. : :: :.. . . .. :.. . .:..:.: :: .. : . :. ..
CCDS23 NHTLCYNNFQKHDPDLTL-----IRHHVLTWV-KFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKR
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pF1KE9 GWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVVLLVHLWRRVMLKEIY-HPRMLLILQASFALG
. . ..: .::.: :: . :.:.. : .:. .. .. : : : . : .:.
CCDS23 SILISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYH---LFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGLA
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pF1KE9 CVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE
.:: :::.:::.... :: .: .:.. : .. :
CCDS23 FLNSCLNPILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLET
300 310 320 330 340 350
CCDS23 AQ
>>CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 (395 aa)
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:.. . . ..:.. ::..:... :: .::
CCDS79 TLKPLCPILEQMSRLQSHSNTSIRYIDHAAVLLHGLASLLGLVENGVILFVVGCRMRQTV
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CCDS79 VTTWVLHLALSDLLASASLPFFTYFLAVGHSWELGTTFCKLHSSIFFLNMFASGFLLSAI
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:.:::..:. :::: ::::: : . . .: ::. .. :: : . .: ::
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: .: . ... ... .. ....:::.:: :::::.. . .: ..: .
CCDS79 VLLLNPGPDR-----DATCNSRQVALAVSKFLLAFLVPLAIIASSHAAVSLRLQHRGRRR
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.: ::. ..:.:: . :.:..: : : :. . .: . : .:. ::
CCDS79 PGRFVRLVAAVVAAFALCWGPYHVFSL--LEARAHANPGLRPLVWRGLPFVTSLAFFNSV
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:: :::.. :. .:. .:: ..:
CCDS79 ANPVLYVLTCPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALCS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE9 CSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASIVVGVLGNGLVLWMTVF---RMARTVSTVCF
:.: : : .. .:.: . . ::.. .
CCDS14 SGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN--IVVVTLFCCQKGPKKVSSIYI
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CCDS14 FNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFITCMSVDRY
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CCDS14 QSVIYPFLS-QRRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNACIMAFPPE
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CCDS14 -KYAQ-WSAGIA---LMKNI----LGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQ
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CCDS14 VLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCV
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CCDS14 NPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMS-CRKSSSLREMETFVS
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356 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 13:14:46 2016 done: Sun Nov 6 13:14:47 2016
Total Scan time: 2.670 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]