Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9409
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9409, 361 aa
1>>>pF1KE9409 361 - 361 aa - 361 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0570+/-0.000694; mu= 18.3969+/- 0.042
mean_var=94.9267+/-24.241, 0's: 0 Z-trim(111.7): 272 B-trim: 1487 in 2/49
Lambda= 0.131638
statistics sampled from 12197 (12611) to 12197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 2456 476.5 1.6e-134
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 615 126.8 2.8e-29
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 570 118.3 1e-26
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 570 118.3 1.1e-26
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 570 118.3 1.1e-26
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 540 112.6 5.5e-25
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 540 112.7 5.9e-25
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 501 105.2 9.2e-23
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 499 104.8 1.2e-22
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 498 104.6 1.4e-22
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 485 102.2 7.6e-22
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 483 101.8 9.9e-22
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 482 101.6 1.1e-21
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 482 101.6 1.1e-21
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 482 101.6 1.2e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 468 98.9 7.1e-21
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 464 98.2 1.2e-20
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 459 97.2 2.4e-20
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 456 96.7 3.5e-20
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 453 96.1 5.1e-20
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 453 96.1 5.3e-20
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 447 95.0 1.1e-19
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 444 94.4 1.6e-19
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 444 94.4 1.7e-19
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 438 93.2 3.6e-19
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 438 93.3 3.8e-19
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 437 93.0 4.1e-19
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 437 93.1 4.6e-19
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 435 92.7 5.5e-19
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 434 92.5 6.1e-19
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 432 92.1 7.9e-19
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 432 92.1 8e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 431 91.9 9.7e-19
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 430 91.7 1.1e-18
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 429 91.5 1.2e-18
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 428 91.3 1.4e-18
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 428 91.3 1.4e-18
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 428 91.4 1.4e-18
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 427 91.1 1.6e-18
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 426 91.0 1.8e-18
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 424 90.5 2.3e-18
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 423 90.4 2.6e-18
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 422 90.2 3.1e-18
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 421 90.0 3.4e-18
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 415 88.8 7.4e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 415 88.9 8.3e-18
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 407 87.3 2.1e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 406 87.2 2.5e-17
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 405 87.0 2.8e-17
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 405 87.0 2.9e-17
>>CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 (361 aa)
initn: 2456 init1: 2456 opt: 2456 Z-score: 2528.7 bits: 476.5 E(32554): 1.6e-134
Smith-Waterman score: 2456; 100.0% identity (100.0% similar) in 361 aa overlap (1-361:1-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 QPLPGGQDSQCGEEPSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGRARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPLPGGQDSQCGEEPSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGRARR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 NSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAFVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAFVNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 CANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTASAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTASAS
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 W
:
CCDS14 W
>>CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 610 init1: 399 opt: 615 Z-score: 639.2 bits: 126.8 E(32554): 2.8e-29
Smith-Waterman score: 615; 36.3% identity (65.4% similar) in 295 aa overlap (35-323:29-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 EPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFVVWLL
.:: :..:..: :.: .:.::: .. :
CCDS29 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGAL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 AGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFALAGTRC
. : :::.: :...:::.:. :..:::::. : : : :. ::: ::. .. .
CCDS29 HFKPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 AGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLP
..:::. ::::::::.: . .: .: :: . : ..: .. : :::.:. : : .
CCDS29 CSVLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLID
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 GGQDSQCGEEPSHAFQGL-SLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRL----RRPPHVGRAR
. :.:. . .. . ::. :..:: .::. . ::: :.:.: .. . ..
CCDS29 --DKPYCAEKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 RNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLA-LRWGLTIATCLAFV
..:..::: . ..:. :::::.... :: ...: : : :. :. .. :::.
CCDS29 KKSIKIIFIVVAAFLVSWLPFNTFK---FLAIVSGLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 NSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTAS
:::.::.:: ..: .: . :
CCDS29 NSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFARR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 593.0 bits: 118.3 E(32554): 1e-26
Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:9-310)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA
::..... :: :: : .:.::.:: :.::..::.
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA
.:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::. :::..: .
CCDS31 LVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASAS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR
.. . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: ::.::....:
CCDS31 VSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPH
.. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : : . :.. .
CCDS31 NVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTI
. . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : . . .. :
CCDS31 IQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDTAMPI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRA
. :.:. :.: :::.: .: ..:.
CCDS31 TICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVS
290 300 310 320 330 340
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 592.6 bits: 118.3 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:38-339)
10 20 30 40
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAA
::..... :: :: : .:.::.::
CCDS82 CGCTTFGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 FAVGLLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGD
:.::..::..:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::.
CCDS82 FVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 GLCKLSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALL
:::..: ... . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: :
CCDS82 YLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 AGLPSLVYRGLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRI
:.::....:.. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : :
CCDS82 ASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 SRRLRRPPHVGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLL
. :.. .. . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : .
CCDS82 WKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LALRWGLTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRD
. .. :. :.:. :.: :::.: .: ..:.
CCDS82 DIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTL
310 320 330 340 350 360
350 360
pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW
CCDS82 SYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 463 init1: 392 opt: 570 Z-score: 592.5 bits: 118.3 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 570; 34.0% identity (67.0% similar) in 303 aa overlap (22-315:44-345)
10 20 30 40
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELEL-CP-AGDLPYGYVYIPALYLAA
::..... :: :: : .:.::.::
CCDS82 APQLRGGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSII
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 FAVGLLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGD
:.::..::..:: .. . ....:.:.:: ::: :.:::::::. .:. :::::.
CCDS82 FVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGN
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 GLCKLSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALL
:::..: ... . :...::. .:.:::::.:. ...: :: : ..: .: .: :
CCDS82 YLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 AGLPSLVYRGLQPLPGGQDSQCG---EEPSHAFQ-GLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRI
:.::....:.. . . . . :. : . .. ::.: .: :..:... : : :
CCDS82 ASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLI
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 SRRLRRPPHVGRAR-RNS--LRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLL
. :.. .. . . ::. ..::.:: : ::.: . . . : .:: . : .
CCDS82 WKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIA
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LALRWGLTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRD
. .. :. :.:. :.: :::.: .: ..:.
CCDS82 DIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTL
320 330 340 350 360 370
350 360
pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW
CCDS82 SYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
380 390
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 472 init1: 199 opt: 540 Z-score: 562.1 bits: 112.6 E(32554): 5.5e-25
Smith-Waterman score: 540; 34.5% identity (59.0% similar) in 322 aa overlap (30-345:43-356)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAG-DLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA
:: .: . ...:::: : .:::::.
CCDS14 DAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNG
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA
:. .: .:: .:::.::::.:: .::::::::. ::. .: ::.::::...
CCDS14 AVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGAL
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR
. . ::::::: .: :::: .:. . : . .: .::.. :: .::....
CCDS14 FNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEE-PSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGR
. . . ..: . :. . .: .: :. :.:::.: .:: .: : :.
CCDS14 SAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSR--GQ
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAF
: ..:.. .. .:. : :. . : : :::: : . . .... :..
CCDS14 RRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 VNSCANPLIYLLLDRSFRARA----LDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQA
.. : :::.: .. .:: : : .: : :. :: :: :::
CCDS14 MHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS----SRRDSSWSETSEAS
310 320 330 340 350 360
360
pF1KE9 ANTASASW
CCDS14 YSGL
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 472 init1: 199 opt: 540 Z-score: 561.5 bits: 112.7 E(32554): 5.9e-25
Smith-Waterman score: 540; 34.5% identity (59.0% similar) in 322 aa overlap (30-345:90-403)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAG-DLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNA
:: .: . ...:::: : .:::::.
CCDS48 DAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNG
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 FVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA
:. .: .:: .:::.::::.:: .::::::::. ::. .: ::.::::...
CCDS48 AVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAV--QWVFGSGLCKVAGAL
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYR
. . ::::::: .: :::: .:. . : . .: .::.. :: .::....
CCDS48 FNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFL
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEE-PSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGR
. . . ..: . :. . .: .: :. :.:::.: .:: .: : :.
CCDS48 SAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSR--GQ
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAF
: ..:.. .. .:. : :. . : : :::: : . . .... :..
CCDS48 RRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGY
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 VNSCANPLIYLLLDRSFRARA----LDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQA
.. : :::.: .. .:: : : .: : :. :: :: :::
CCDS48 MHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSS----SRRDSSWSETSEAS
360 370 380 390 400 410
360
pF1KE9 ANTASASW
CCDS48 YSGL
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 396 init1: 178 opt: 501 Z-score: 522.2 bits: 105.2 E(32554): 9.2e-23
Smith-Waterman score: 501; 33.6% identity (62.6% similar) in 289 aa overlap (37-319:37-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 WSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFVVWLLAG
.: ...: :: .:. :::::. :: .:
CCDS26 ADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFA-LAGTRCA
. : ..:...:.:: .:: ::..::.:. :: .: :: ::::. :. :.: .
CCDS26 YKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAA--DQWVFGLGLCKMISWMYLVGFY-S
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLPG
: ... ::.:::::.:. . . :: .. . ..:.::..:.::.... .
CCDS26 GIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTCYTERN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 GQDSQCGEE---PSHAFQGLSLLLL-LLTFVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPHVGRARRN
. : . : ... :: : . .: .:.:: . :::: : : :. : ..:
CCDS26 --HTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQ---HCKNEKKN
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 -SLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATCLAFVNS
....:::. :.: : :.. . . :..: .: : . : ... . ::::.
CCDS26 KAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQ-DCTFERYLDYAIQATETLAFVHC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 CANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTASAS
: ::.::..: ..:: :
CCDS26 CLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLH
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
initn: 179 init1: 177 opt: 499 Z-score: 520.3 bits: 104.8 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 499; 33.0% identity (58.0% similar) in 348 aa overlap (16-345:10-348)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLD--GL----EELELCP-AGDLPYGYVYIPALYLAAFAVG
::.. :. :. :. : . :: : : : .: ..
CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIA-YALVFLLS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 LLGNAFVVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCK
::::..:. .. : : ..:...:.:: ::: :.::::.:::. . : : :: :::
CCDS24 LLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG--WIFGTFLCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LSSFALAGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCC-GVWAVALLAGL
. :. . .: :::: .:::::::.:. .: : : . : : :.... .:
CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVH--ATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE9 PSLVYRGLQPLPGGQDSQC----GEEPSHAFQGLSLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRR
: ...: :.... : :.. .. . : .: . :..:: : :::: :
CCDS24 PFFLFRQAYH-PNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRT
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 LRRPPHVGRARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWG
: . :.:. .: ..:.:::. :. :::.. . . : : .. : . .
CCDS24 LFKA-HMGQKHR-AMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 LTIATCLAFVNSCANPLIYLLLDRSFR-----ARALDGACGRTGRLAR-RISSASSLSRD
: . :.:..:: ::.:: .. ..:: :. : .. ::: :..: .: : .
CCDS24 LDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKE-FLARHRVTSYTSSSVN
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KE9 DSSVFRCRAQAANTASASW
::
CCDS24 VSSNL
350
>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa)
initn: 180 init1: 179 opt: 498 Z-score: 519.1 bits: 104.6 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 498; 33.3% identity (60.5% similar) in 291 aa overlap (30-315:39-322)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAPTEPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAF
: .: . .. .: .: ..::::..
CCDS24 DSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFLLSLLGNSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 VVWLLAGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFAL
:. .. : : ..:...:.:: ::: :.::::.:::. . : : :: :::. :.
CCDS24 VMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG--WIFGTFLCKVVSLLK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 AGTRCAGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCC-GVWAVALLAGLPSLVYR
. .: :::: .:::::::.:. .: : : . : ..:...:: .:: :..:
CCDS24 EVNFYSGILLLACISVDRYLAIVH--ATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPVLLFR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 GLQPLPGGQDSQCGEEPSHAFQGLSLLLLLLT----FVLPLVVTLFCYCRISRRLRRPPH
.. . : :. .. . .:: .: :..::.. :::: : : . :
CCDS24 RTV-YSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFKA-H
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VGRARRNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLALRWGLTIATC
.:. .: ..:.:::. :. :::.. . . : : .. : . .: .
CCDS24 MGQKHR-AMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 LAFVNSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAA
:....:: ::::: .. ..::
CCDS24 LGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
310 320 330 340 350 360
361 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:44:14 2016 done: Sun Nov 6 18:44:14 2016
Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]