Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9405
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9405, 360 aa
1>>>pF1KE9405 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5975+/-0.00111; mu= 14.5594+/- 0.066
mean_var=121.8409+/-38.517, 0's: 0 Z-trim(104.0): 278 B-trim: 1099 in 2/46
Lambda= 0.116192
statistics sampled from 7261 (7701) to 7261 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 2415 416.8 1.5e-116
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 615 115.0 1e-25
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 555 105.0 1.1e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 555 105.0 1.1e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 555 105.0 1.1e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 520 99.1 6.2e-21
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 510 97.4 2e-20
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 510 97.4 2e-20
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 505 96.6 3.5e-20
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 504 96.4 4e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 490 94.1 2e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 489 93.9 2.3e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 486 93.4 3.3e-19
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 483 92.9 4.5e-19
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 483 92.9 4.6e-19
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 478 92.0 7.9e-19
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 477 91.9 9.4e-19
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 476 91.7 1e-18
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 462 89.4 5.3e-18
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 458 88.7 8.2e-18
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 450 87.4 2.1e-17
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 450 87.4 2.2e-17
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 449 87.2 2.5e-17
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 447 86.8 2.9e-17
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 447 86.9 3.1e-17
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 440 85.7 6.9e-17
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 440 85.7 6.9e-17
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 440 85.7 7e-17
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 440 85.7 7.1e-17
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 439 85.5 7.7e-17
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 436 85.0 1e-16
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 437 85.3 1.1e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 436 85.0 1.1e-16
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 436 85.0 1.1e-16
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 436 85.0 1.1e-16
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 434 84.7 1.4e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 432 84.4 1.8e-16
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 431 84.1 1.8e-16
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 431 84.2 1.9e-16
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 431 84.2 1.9e-16
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 431 84.2 2e-16
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 430 84.1 2.4e-16
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 429 83.8 2.4e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 428 83.7 2.9e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 428 83.7 2.9e-16
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 427 83.5 2.9e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 428 83.7 2.9e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 428 83.7 2.9e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 428 83.7 2.9e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 428 83.8 3e-16
>>CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 2415 init1: 2415 opt: 2415 Z-score: 2206.1 bits: 416.8 E(32554): 1.5e-116
Smith-Waterman score: 2415; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PYCAEKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKLKKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PYCAEKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKLKKSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 KIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVSGLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAFANSCVNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVSGLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAFANSCVNPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 IYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFARRRKRSVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFARRRKRSVSL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 (361 aa)
initn: 610 init1: 399 opt: 615 Z-score: 575.3 bits: 115.0 E(32554): 1e-25
Smith-Waterman score: 615; 36.3% identity (65.4% similar) in 295 aa overlap (29-318:35-323)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGAL
.:: :..:..: :.: .:.::: .. :
CCDS14 EPWSPSPGSAPWDYSGLDGLEELELCPAGDLPYGYVYIPALYLAAFAVGLLGNAFVVWLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 HFKPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMH
. : :::.: :...:::.:. :..:::::. : : : :. ::: ::. .. .
CCDS14 AGRRGPRRLVDTFVLHLAAADLGFVLTLPLWAAAAALGGRWPFGDGLCKLSSFALAGTRC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 CSVLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLID
..:::. ::::::::.: . .: .: :: . : ..: .. : :::.:. : : .
CCDS14 AGALLLAGMSVDRYLAVVKLLEARPLRTPRCALASCCGVWAVALLAGLPSLVYRGLQPLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 --DKPYCAEKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKL
. :.:. . .. . ::. :..:: .::. . ::: :.:.: .. . ..
CCDS14 GGQDSQCGEEPSHAFQGL-SLLLLLLTFVLPLVVTLFCYCRISRRL----RRPPHVGRAR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 KKSIKIIFIVVAAFLVSWLPFNTFK---FLAIVSGLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAFA
..:..::: . ..:. :::::.... :: ...: : : :. :. .. :::.
CCDS14 RNSLRIIFAIESTFVGSWLPFSALRAVFHLARLGALPLPCPLLLA-LRWGLTIATCLAFV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 NSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFARR
:::.::.:: ..: .: . :
CCDS14 NSCANPLIYLLLDRSFRARALDGACGRTGRLARRISSASSLSRDDSSVFRCRAQAANTAS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 462 init1: 396 opt: 555 Z-score: 521.0 bits: 105.0 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 555; 32.9% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (31-317:26-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHF
: :..:..:. .:..:..:: ... ...:
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCS
. . ..:..::: .:. ::.:::::. : : :..::: .: .: :.. :
CCDS31 YMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYAS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDK
:.::::.:.::::::: :. :: : : :.: ::... : .::... :.. .:..
CCDS31 VFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE9 --PYCA---EKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKK
:: :.. . . . .:. :. :. :.: :.: : : . : :. ..::
CCDS31 NITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEI--QKNKP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LKKSI-KIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVS--GLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAF
. .: :::. .: :. ::.: . : :: .. :. .. . . :.. .: .. .:.
CCDS31 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRI-ADIVDTAMPITICIAY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ANSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFAR
:.:.::..: .. . ..: ... :
CCDS31 FNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 462 init1: 396 opt: 555 Z-score: 520.6 bits: 105.0 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 555; 32.9% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (31-317:55-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHF
: :..:..:. .:..:..:: ... ...:
CCDS82 TQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYF
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCS
. . ..:..::: .:. ::.:::::. : : :..::: .: .: :.. :
CCDS82 YMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYAS
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDK
:.::::.:.::::::: :. :: : : :.: ::... : .::... :.. .:..
CCDS82 VFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENT
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KE9 --PYCA---EKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKK
:: :.. . . . .:. :. :. :.: :.: : : . : :. ..::
CCDS82 NITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEI--QKNKP
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LKKSI-KIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVS--GLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAF
. .: :::. .: :. ::.: . : :: .. :. .. . . :.. .: .. .:.
CCDS82 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRI-ADIVDTAMPITICIAY
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ANSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFAR
:.:.::..: .. . ..: ... :
CCDS82 FNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKP
330 340 350 360 370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 462 init1: 396 opt: 555 Z-score: 520.5 bits: 105.0 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 555; 32.9% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (31-317:61-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHF
: :..:..:. .:..:..:: ... ...:
CCDS82 TQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYF
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KPGSRRLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCS
. . ..:..::: .:. ::.:::::. : : :..::: .: .: :.. :
CCDS82 YMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYAS
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 VLLLTCMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDK
:.::::.:.::::::: :. :: : : :.: ::... : .::... :.. .:..
CCDS82 VFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENT
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230
pF1KE9 --PYCA---EKKATPIKLIWSLVALIFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKK
:: :.. . . . .:. :. :. :.: :.: : : . : :. ..::
CCDS82 NITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEI--QKNKP
220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 LKKSI-KIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVS--GLRQEHYLPSAILQLGMEVSGPLAF
. .: :::. .: :. ::.: . : :: .. :. .. . . :.. .: .. .:.
CCDS82 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRI-ADIVDTAMPITICIAY
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ANSCVNPFIYYIFDSYIRRAIVHCLCPCLKNYDFGSSTETSDSHLTKALSTFIHAEDFAR
:.:.::..: .. . ..: ... :
CCDS82 FNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKP
330 340 350 360 370 380
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 421 init1: 237 opt: 520 Z-score: 489.3 bits: 99.1 E(32554): 6.2e-21
Smith-Waterman score: 520; 32.8% identity (63.5% similar) in 274 aa overlap (36-302:47-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 TSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGNLVLMGALHFKPGSR
.:..: .:. : : :.:.. . . : .
CCDS14 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVNIVVVTLFCCQKGPK
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RLIDIFIINLAASDFIFLVTLPLWVDKEASLGLWRTGSFLCKGSSYMISVNMHCSVLLLT
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CCDS14 KVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFIT
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130 140 150 160 170 180
pF1KE9 CMSVDRYLAIVWPVVSRKFRRTDCAYVVCASIWFISCLLGLPTLLSRELTLIDDKPYCAE
::::::: ....: .:.. . .:.: .: ..:: .:::. :.. :. :
CCDS14 CMSVDRYQSVIYPFLSQRRNPWQASYIV-PLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNAC
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KE9 KKATPIKLI--WSL-VAL---IFTFFVPLLSIVTCYCCIARKLCAHYQQSGKHNKKLKKS
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CCDS14 IMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGI-RKHLLKTNSYGKNRITRDQV
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 IKIIFIVVAAFLVSWLPFNTFKFLAIVSGLRQEHYLPS-AILQLGMEVSGPLAFANSCVN
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CCDS14 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
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::.:
CCDS14 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS
320 330 340 350 360
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... .. .. : . : . ..:...:..:..:::.: :: :. : :.::::.
CCDS46 GLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN---WYFGNFLCKAVH
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. .::.. :::.:. .:.::::::: . :.. :. :: ...:. . :: .: ..
CCDS46 VIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFI
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... ::. : . : : : .: .. ...: . :..::: : :: .:
CCDS46 FANVSEADDRYIC--DRFYPNDL-WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKL-SH-
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: :.:. :..: :.. ::.. :::. ..: .: :. .: . ...
CCDS46 --SKGHQKR--KALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEII---KQGCEFENTVH
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. . .. ::: . :.::..: .. . .. . : :
CCDS46 KW-ISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSV
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350 360
pF1KE9 LSTFIHAEDFARRRKRSVSL
CCDS46 STESESSSFHSS
350
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Smith-Waterman score: 510; 29.9% identity (62.3% similar) in 318 aa overlap (11-317:24-321)
10 20 30 40
pF1KE9 MDPEETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTG
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CCDS33 MSIPLPLLQIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPC--FREENAN--FNKIFLPTIYSIIFLTG
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..:: ... .. .. : . : . ..:...:..:..:::.: :: :. : :.:::
CCDS33 IVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN---WYFGNFLC
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:. . .::.. :::.:. .:.::::::: . :.. :. :: ...:. . :: .
CCDS33 KAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTI
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: .. ... ::. : . : : : .: .. ...: . :..::: : ::
CCDS33 PDFIFANVSEADDRYIC--DRFYPNDL-WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKL
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230 240 250 260 270
pF1KE9 CAHYQQSGKHNKKLKKSIKIIFIVVAAFLVSWLPF------NTFKFLAIVSGLRQEHYLP
.: : :.:. :..: :.. ::.. :::. ..: .: :. .: .
CCDS33 -SH---SKGHQKR--KALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEII---KQGCEFE
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... . . .. ::: . :.::..: .. . .. . : :
CCDS33 NTVHKW-ISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGG
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CCDS33 HSSVSTESESSSFHSS
350
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CCDS26 VVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAAD--QWVFGLGLCKMISWM
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CCDS26 YLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFS
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CCDS26 TCYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTL-----QH
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pF1KE9 EDFARRRKRSVSL
CCDS26 STMDHDLHDAL
350 360
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pF1KE9 ETSVYLDYYYATSPNSDIRETHSHVPYTSVFLPVFYTAVFLTGVLGN-LVLMGALHFKPG
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CCDS24 LSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVG
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CCDS24 -RSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVN-G-WIFGTFLCKVVSLLKEVNFYSGILL
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CCDS24 LACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFI-CLSIWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPA
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CCDS24 CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFKAHMGQ--KH-----R
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CCDS24 AMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLV-LLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATEILGILHS
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360 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 03:53:33 2016 done: Mon Nov 7 03:53:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]