Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9397
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9397, 5536 aa
1>>>pF1KE9397 5536 - 5536 aa - 5536 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.8268+/-0.00137; mu= -31.6113+/- 0.083
mean_var=861.8237+/-177.879, 0's: 0 Z-trim(116.7): 244 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.043688
statistics sampled from 17062 (17293) to 17062 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.531), width: 16
Scan time: 16.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44873.1 KMT2D gene_id:8085|Hs108|chr12 (5537) 38622 2452.7 0
CCDS5931.1 KMT2C gene_id:58508|Hs108|chr7 (4911) 3100 213.7 4e-53
>>CCDS44873.1 KMT2D gene_id:8085|Hs108|chr12 (5537 aa)
initn: 28968 init1: 28968 opt: 38622 Z-score: 13166.5 bits: 2452.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 38622; 100.0% identity (100.0% similar) in 5537 aa overlap (1-5536:1-5537)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDSQKLAGEDKDSEPAADGPAASEDPSATESDLPNPHVGEVSVLSSGSPRLQETPQDCSG
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CCDS44 MDSQKLAGEDKDSEPAADGPAASEDPSATESDLPNPHVGEVSVLSSGSPRLQETPQDCSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GPVRRCALCNCGEPSLHGQRELRRFELPFDWPRCPVVSPGGSPGPNEAVLPSEDLSQIGF
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CCDS44 GPVRRCALCNCGEPSLHGQRELRRFELPFDWPRCPVVSPGGSPGPNEAVLPSEDLSQIGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PEGLTPAHLGEPGGSCWAHHWCAAWSAGVWGQEGPELCGVDKAIFSGISQRCSHCTRLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEGLTPAHLGEPGGSCWAHHWCAAWSAGVWGQEGPELCGVDKAIFSGISQRCSHCTRLGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SIPCRSPGCPRLYHFPCATASGSFLSMKTLQLLCPEHSEGAAYLEEARCAVCEGPGELCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SIPCRSPGCPRLYHFPCATASGSFLSMKTLQLLCPEHSEGAAYLEEARCAVCEGPGELCD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 LFFCTSCGHHYHGACLDTALTARKRAGWQCPECKVCQACRKPGNDSKMLVCETCDKGYHT
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CCDS44 LFFCTSCGHHYHGACLDTALTARKRAGWQCPECKVCQACRKPGNDSKMLVCETCDKGYHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 FCLKPPMEELPAHSWKCKACRVCRACGAGSAELNPNSEWFENYSLCHRCHKAQGGQTIRS
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CCDS44 FCLKPPMEELPAHSWKCKACRVCRACGAGSAELNPNSEWFENYSLCHRCHKAQGGQTIRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 VAEQHTPVCSRFSPPEPGDTPTDEPDALYVACQGQPKGGHVTSMQPKEPGPLQCEAKPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAEQHTPVCSRFSPPEPGDTPTDEPDALYVACQGQPKGGHVTSMQPKEPGPLQCEAKPLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 KAGVQLEPQLEAPLNEEMPLLPPPEESPLSPPPEESPTSPPPEASRLSPPPEELPASPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAGVQLEPQLEAPLNEEMPLLPPPEESPLSPPPEESPTSPPPEASRLSPPPEELPASPLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 EALHLSRPLEESPLSPPPEESPLSPPPESSPFSPLEESPLSPPEESPPSPALETPLSPPP
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CCDS44 EALHLSRPLEESPLSPPPEESPLSPPPESSPFSPLEESPLSPPEESPPSPALETPLSPPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 EASPLSPPFEESPLSPPPEELPTSPPPEASRLSPPPEESPMSPPPEESPMSPPPEASRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EASPLSPPFEESPLSPPPEELPTSPPPEASRLSPPPEESPMSPPPEESPMSPPPEASRLF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 PPFEESPLSPPPEESPLSPPPEASRLSPPPEDSPMSPPPEESPMSPPPEVSRLSPLPVVS
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CCDS44 PPFEESPLSPPPEESPLSPPPEASRLSPPPEDSPMSPPPEESPMSPPPEVSRLSPLPVVS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 RLSPPPEESPLSPPPEESPTSPPPEASRLSPPPEDSPTSPPPEDSPASPPPEDSLMSLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLSPPPEESPLSPPPEESPTSPPPEASRLSPPPEDSPTSPPPEDSPASPPPEDSLMSLPL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 EESPLLPLPEEPQLCPRSEGPHLSPRPEEPHLSPRPEEPHLSPQAEEPHLSPQPEEPCLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EESPLLPLPEEPQLCPRSEGPHLSPRPEEPHLSPRPEEPHLSPQAEEPHLSPQPEEPCLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 AVPEEPHLSPQAEGPHLSPQPEELHLSPQTEELHLSPVPEEPCLSPQPEESHLSPQSEEP
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AVPEEPHLSPQAEGPHLSPQPEELHLSPQTEEPHLSPVPEEPCLSPQPEESHLSPQSEEP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 CLSPRPEESHLSPELEKPPLSPRPEKPPEEPGQCPAPEELPLFPPPGEPSLSPLLGEPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CLSPRPEESHLSPELEKPPLSPRPEKPPEEPGQCPAPEELPLFPPPGEPSLSPLLGEPAL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 SEPGEPPLSPLPEELPLSPSGEPSLSPQLMPPDPLPPPLSPIITAAAPPALSPLGELEYP
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CCDS44 SEPGEPPLSPLPEELPLSPSGEPSLSPQLMPPDPLPPPLSPIITAAAPPALSPLGELEYP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 FGAKGDSDPESPLAAPILETPISPPPEANCTDPEPVPPMILPPSPGSPVGPASPILMEPL
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CCDS44 FGAKGDSDPESPLAAPILETPISPPPEANCTDPEPVPPMILPPSPGSPVGPASPILMEPL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 PPQCSPLLQHSLVPQNSPPSQCSPPALPLSVPSPLSPIGKVVGVSDEAELHEMETEKVSE
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CCDS44 PPQCSPLLQHSLVPQNSPPSQCSPPALPLSVPSPLSPIGKVVGVSDEAELHEMETEKVSE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 PECPALEPSATSPLPSPMGDLSCPAPSPAPALDDFSGLGEDTAPLDGIDAPGSQPEPGQT
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CCDS44 PECPALEPSATSPLPSPMGDLSCPAPSPAPALDDFSGLGEDTAPLDGIDAPGSQPEPGQT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 PGSLASELKGSPVLLDPEELAPVTPMEVYPECKQTAGQGSPCEEQEEPRAPVAPTPPTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGSLASELKGSPVLLDPEELAPVTPMEVYPECKQTAGQGSPCEEQEEPRAPVAPTPPTLI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 KSDIVNEISNLSQGDASASFPGSEPLLGSPDPEGGGSLSMELGVSTDVSPARDEGSLRLC
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CCDS44 KSDIVNEISNLSQGDASASFPGSEPLLGSPDPEGGGSLSMELGVSTDVSPARDEGSLRLC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 TDSLPETDDSLLCDAGTAISGGKAEGEKGRRRSSPARSRIKQGRSSSFPGRRRPRGGAHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDSLPETDDSLLCDAGTAISGGKAEGEKGRRRSSPARSRIKQGRSSSFPGRRRPRGGAHG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE9 GRGRGRARLKSTASSIETLV-ADIDSSPSKEEEEEDDDTMQNTVVLFSNTDKFVLMQDMC
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRGRGRARLKSTASSIETLVVADIDSSPSKEEEEEDDDTMQNTVVLFSNTDKFVLMQDMC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE9 VVCGSFGRGAEGHLLACSQCSQCYHPYCVNSKITKVMLLKGWRCVECIVCEVCGQASDPS
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CCDS44 VVCGSFGRGAEGHLLACSQCSQCYHPYCVNSKITKVMLLKGWRCVECIVCEVCGQASDPS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE9 RLLLCDDCDISYHTYCLDPPLLTVPKGGWKCKWCVSCMQCGAASPGFHCEWQNSYTHCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLLLCDDCDISYHTYCLDPPLLTVPKGGWKCKWCVSCMQCGAASPGFHCEWQNSYTHCGP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE9 CASLVTCPICHAPYVEEDLLIQCRHCERWMHAGCESLFTEDDVEQAADEGFDCVSCQPYV
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CCDS44 CASLVTCPICHAPYVEEDLLIQCRHCERWMHAGCESLFTEDDVEQAADEGFDCVSCQPYV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE9 VKPVAPVAPPELVPMKVKEPEPQYFRFEGVWLTETGMALLRNLTMSPLHKRRQRRGRLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VKPVAPVAPPELVPMKVKEPEPQYFRFEGVWLTETGMALLRNLTMSPLHKRRQRRGRLGL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE9 PGEAGLEGSEPSDALGPDDKKDGDLDTDELLKGEGGVEHMECEIKLEGPVSPDVEPGKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGEAGLEGSEPSDALGPDDKKDGDLDTDELLKGEGGVEHMECEIKLEGPVSPDVEPGKEE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE9 TEESKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRKSHTRTKKGPAAQAEVLSGDGQPDEVIPADLPAEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TEESKKRKRKPYRPGIGGFMVRQRKSHTRTKKGPAAQAEVLSGDGQPDEVIPADLPAEGA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE9 VEQSLAEGDEKKKQQRRGRKKSKLEDMFPAYLQEAFFGKELLDLSRKALFAVGVGRPSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEQSLAEGDEKKKQQRRGRKKSKLEDMFPAYLQEAFFGKELLDLSRKALFAVGVGRPSFG
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE9 LGTPKAKGDGGSERKELPTSQKGDDGPDIADEESRGLEGKADTPGPEDGGVKASPVPSDP
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CCDS44 LGTPKAKGDGGSERKELPTSQKGDDGPDIADEESRGLEGKADTPGPEDGGVKASPVPSDP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE9 EKPGTPGEGMLSSDLDRISTEELPKMESKDLQQLFKDVLGSEREQHLGCGTPGLEGSRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKPGTPGEGMLSSDLDRISTEELPKMESKDLQQLFKDVLGSEREQHLGCGTPGLEGSRTP
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE9 LQRPFLQGGLPLGNLPSSSPMDSYPGLCQSPFLDSRERGGFFSPEPGEPDSPWTGSGGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQRPFLQGGLPLGNLPSSSPMDSYPGLCQSPFLDSRERGGFFSPEPGEPDSPWTGSGGTT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE9 PSTPTTPTTEGEGDGLSYNQRSLQRWEKDEELGQLSTISPVLYANINFPNLKQDYPDWSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSTPTTPTTEGEGDGLSYNQRSLQRWEKDEELGQLSTISPVLYANINFPNLKQDYPDWSS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KE9 RCKQIMKLWRKVPAADKAPYLQKAKDNRAAHRINKVQKQAESQINKQTKVGDIARKTDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RCKQIMKLWRKVPAADKAPYLQKAKDNRAAHRINKVQKQAESQINKQTKVGDIARKTDRP
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KE9 ALHLRIPPQPGALGSPPPAAAPTIFIGSPTTPAGLSTSADGFLKPPAGSVPGPDSPGELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALHLRIPPQPGALGSPPPAAAPTIFIGSPTTPAGLSTSADGFLKPPAGSVPGPDSPGELF
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2160 2170 2180 2190 2200 2210
pF1KE9 LKLPPQVPAQVPSQDPFGLAPAYPLEPRFPTAPPTYPPYPSPTGAPAQPPMLGASSRPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LKLPPQVPAQVPSQDPFGLAPAYPLEPRFPTAPPTYPPYPSPTGAPAQPPMLGASSRPGA
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2220 2230 2240 2250 2260 2270
pF1KE9 GQPGEFHTTPPGTPRHQPSTPDPFLKPRCPSLDNLAVPESPGVGGGKASEPLLSPPPFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GQPGEFHTTPPGTPRHQPSTPDPFLKPRCPSLDNLAVPESPGVGGGKASEPLLSPPPFGE
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2280 2290 2300 2310 2320 2330
pF1KE9 SRKALEVKKEELGASSPSYGPPNLGFVDSPSSGTHLGGLELKTPDVFKAPLTPRASQVEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRKALEVKKEELGASSPSYGPPNLGFVDSPSSGTHLGGLELKTPDVFKAPLTPRASQVEP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KE9 QSPGLGLRPQEPPPAQALAPSPPSHPDIFRPGSYTDPYAQPPLTPRPQPPPPESCCALPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QSPGLGLRPQEPPPAQALAPSPPSHPDIFRPGSYTDPYAQPPLTPRPQPPPPESCCALPP
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2400 2410 2420 2430 2440 2450
pF1KE9 RSLPSDPFSRVPASPQSQSSSQSPLTPRPLSAEAFCPSPVTPRFQSPDPYSRPPSRPQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSLPSDPFSRVPASPQSQSSSQSPLTPRPLSAEAFCPSPVTPRFQSPDPYSRPPSRPQSR
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2460 2470 2480 2490 2500 2510
pF1KE9 DPFAPLHKPPRPQPPEVAFKAGSLAHTSLGAGGFPAALPAGPAGELHAKVPSGQPPNFVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPFAPLHKPPRPQPPEVAFKAGSLAHTSLGAGGFPAALPAGPAGELHAKVPSGQPPNFVR
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2520 2530 2540 2550 2560 2570
pF1KE9 SPGTGAFVGTPSPMRFTFPQAVGEPSLKPPVPQPGLPPPHGINSHFGPGPTLGKPQSTNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPGTGAFVGTPSPMRFTFPQAVGEPSLKPPVPQPGLPPPHGINSHFGPGPTLGKPQSTNY
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2580 2590 2600 2610 2620 2630
pF1KE9 TVATGNFHPSGSPLGPSSGSTGESYGLSPLRPPSVLPPPAPDGSLPYLSHGASQRSGITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVATGNFHPSGSPLGPSSGSTGESYGLSPLRPPSVLPPPAPDGSLPYLSHGASQRSGITS
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2640 2650 2660 2670 2680 2690
pF1KE9 PVEKREDPGTGMGSSLATAELPGTQDPGMSGLSQTELEKQRQRQRLRELLIRQQIQRNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVEKREDPGTGMGSSLATAELPGTQDPGMSGLSQTELEKQRQRQRLRELLIRQQIQRNTL
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2700 2710 2720 2730 2740 2750
pF1KE9 RQEKETAAAAAGAVGPPGSWGAEPSSPAFEQLSRGQTPFAGTQDKSSLVGLPPSKLSGPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQEKETAAAAAGAVGPPGSWGAEPSSPAFEQLSRGQTPFAGTQDKSSLVGLPPSKLSGPI
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2760 2770 2780 2790 2800 2810
pF1KE9 LGPGSFPSDDRLSRPPPPATPSSMDVNSRQLVGGSQAFYQRAPYPGSLPLQQQQQQLWQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGPGSFPSDDRLSRPPPPATPSSMDVNSRQLVGGSQAFYQRAPYPGSLPLQQQQQQLWQQ
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2820 2830 2840 2850 2860 2870
pF1KE9 QQATAATSMRFAMSARFPSTPGPELGRQALGSPLAGISTRLPGPGEPVPGPAGPAQFIEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQATAATSMRFAMSARFPSTPGPELGRQALGSPLAGISTRLPGPGEPVPGPAGPAQFIEL
2830 2840 2850 2860 2870 2880
2880 2890 2900 2910 2920 2930
pF1KE9 RHNVQKGLGPGGTPFPGQGPPQRPRFYPVSEDPHRLAPEGLRGLAVSGLPPQKPSAPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RHNVQKGLGPGGTPFPGQGPPQRPRFYPVSEDPHRLAPEGLRGLAVSGLPPQKPSAPPAP
2890 2900 2910 2920 2930 2940
2940 2950 2960 2970 2980 2990
pF1KE9 ELNNSLHPTPHTKGPTLPTGLELVNRPPSSTELGRPNPLALEAGKLPCEDPELDDDFDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELNNSLHPTPHTKGPTLPTGLELVNRPPSSTELGRPNPLALEAGKLPCEDPELDDDFDAH
2950 2960 2970 2980 2990 3000
3000 3010 3020 3030 3040 3050
pF1KE9 KALEDDEELAHLGLGVDVAKGDDELGTLENLETNDPHLDDLLNGDEFDLLAYTDPELDTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KALEDDEELAHLGLGVDVAKGDDELGTLENLETNDPHLDDLLNGDEFDLLAYTDPELDTG
3010 3020 3030 3040 3050 3060
3060 3070 3080 3090 3100 3110
pF1KE9 DKKDIFNEHLRLVESANEKAEREALLRGVEPGPLGPEERPPPAADASEPRLASVLPEVKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DKKDIFNEHLRLVESANEKAEREALLRGVEPGPLGPEERPPPAADASEPRLASVLPEVKP
3070 3080 3090 3100 3110 3120
3120 3130 3140 3150 3160 3170
pF1KE9 KVEEGGRHPSPCQFTIATPKVEPAPAANSLGLGLKPGQSMMGSRDTRMGTGPFSSSGHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KVEEGGRHPSPCQFTIATPKVEPAPAANSLGLGLKPGQSMMGSRDTRMGTGPFSSSGHTA
3130 3140 3150 3160 3170 3180
3180 3190 3200 3210 3220 3230
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5530
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:.:. :: . .:.. :.::. . . . : .::.:
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:: . .
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. : : ..: :. .: ::
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.:. . : .:: :.:: . :: ::.:.:::
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.. . . . : :: . .: .: ..: .. : :: ::.
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:. ..:: .. ::. .: .: ::. : :: : : : :.: .
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. :: . ::.. . :::. : . . :.. : : : : . . .:
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: .::: : . .: : : : . .: :. : .: : . :: .
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::. :. :.: .: ::.. . :: . :. . ::. ...:..
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. . : : :. . : :: : .. .:: :: .:: ::: :.
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::: ::::..:::.: : ..: . . . .::: :.. .: : . ..:
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. .: .: .:: :... . ..: : ... ..: : :::: . . ...
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. :.: : :. :.: :.. ... .. . ... ... ..:
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..:. :. .::: .. .:. .... :..: :: . .:: :
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: :.: : . ::.: : . .
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.. :. :: .: .. :::. :.: : ::: ::::::::::.:::::...:. :
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::::: .:::::::: : ::::::.::::.::: ::::::::::::::: :::.:: :::
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::: .::::.:.:::::::..:. .:: ::::: :..: : :
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.:. . : ::: ::. :: :. : : : : :.:::
CCDS59 MMPS-VQP----QPPL-IPGA-------TPPTMSQPTFPMVP------QQLQHQQHTTVI
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..:. :. .::. .: .: .:: :
CCDS59 --IAQLPIKTCTP-APGTVSNA-------------------------NPQSGP-----PP
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CCDS59 RVE-FDDNNPFSESFQERERKERLREQQERQRIQLMQE---------VDRQRALQQRMEM
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..:: .... . : :.: ....:.:
CCDS59 NIQQGSINSPSTQT---------------------------FMQTNERRQVG--------
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: . :: : : . :... .::: ..:.. : : .. . .:.::
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.: . : :: . :: :: :
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.: .: . . .: :.. . .. .:::: : . .. :
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: : : .
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::.:..... .. :.: ::.: .. ::
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. .::: : .: . .:. : .. :..:. :.::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]