Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9392
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9392, 1278 aa
1>>>pF1KE9392 1278 - 1278 aa - 1278 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4887+/-0.000993; mu= -0.7818+/- 0.060
mean_var=229.2414+/-46.742, 0's: 0 Z-trim(112.7): 34 B-trim: 70 in 1/52
Lambda= 0.084709
statistics sampled from 13385 (13413) to 13385 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 8448 1046.1 0
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 8400 1040.2 0
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 6150 765.2 0
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 6048 752.8 1.3e-216
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 999 135.7 6.6e-31
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 771 107.9 1.7e-22
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 771 107.9 1.7e-22
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 761 106.7 3.9e-22
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 751 105.4 9.1e-22
>>CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa)
initn: 6392 init1: 6392 opt: 8448 Z-score: 5587.5 bits: 1046.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8448; 99.8% identity (99.8% similar) in 1278 aa overlap (1-1278:1-1276)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTNKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTNKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 DALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 TQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 AVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 LKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILRES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 QHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 AVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 RVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 TNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 VEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGAS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 LTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 PGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 ATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 NGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS78 NGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGIS--EGDTPKKASSATITVTNTAIAT
910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 ATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSS
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 SSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAM
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 ERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 KKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 TIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270
pF1KE9 VRYVRQGLCWLRIDAHLL
::::::::::::::::::
CCDS78 VRYVRQGLCWLRIDAHLL
1260 1270
>>CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa)
initn: 6246 init1: 5848 opt: 8400 Z-score: 5555.8 bits: 1040.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8400; 99.2% identity (99.2% similar) in 1282 aa overlap (1-1278:1-1276)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYK----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 LRESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTAT
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LRESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTK------MLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTAT
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 ELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSES
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 NEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 MKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 QPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 LAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 CGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 LSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQ
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 RLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE9 VSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNT
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE9 AIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALP
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 LLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTEC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 GNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 MFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCN
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE9 NGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270
pF1KE9 MTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
1260 1270
>>CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (952 aa)
initn: 6148 init1: 6148 opt: 6150 Z-score: 4071.8 bits: 765.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6150; 99.0% identity (99.5% similar) in 946 aa overlap (333-1278:10-952)
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 PSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILRESQH
.:.: .. :::::::::::::::::::
CCDS55 MKFKRRHQAFPSFFKMK---VSLPSDPSCVEEILRESQH
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 LTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAV
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 EKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRV
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTN
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 ASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVE
220 230 240 250 260 270
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 KNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKK
280 290 300 310 320 330
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLT
340 350 360 370 380 390
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 LSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPG
400 410 420 430 440 450
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 HSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEAT
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pF1KE9 TICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNG
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910 920 930 940 950 960
pF1KE9 PFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATAT
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 VTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSS
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pF1KE9 TNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMER
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pF1KE9 DPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKK
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pF1KE9 DHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTI
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pF1KE9 PQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVR
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1270
pF1KE9 YVRQGLCWLRIDAHLL
::::::::::::::::
CCDS55 YVRQGLCWLRIDAHLL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEY
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pF1KE9 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN
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pF1KE9 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK
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pF1KE9 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE
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pF1KE9 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE9 LRE-----------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK
::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK
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390 400 410 420 430 440
pF1KE9 SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQA
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450 460 470 480 490 500
pF1KE9 SGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQ
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510 520 530 540 550 560
pF1KE9 NKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRP
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570 580 590 600 610 620
pF1KE9 TQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKES
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pF1KE9 VELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDS
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pF1KE9 NTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSP
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pF1KE9 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTA
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pF1KE9 VTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNS
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pF1KE9 SRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGK
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930 940 950 960 970 980
pF1KE9 FCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTT
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pF1KE9 TTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAK
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 KLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRL
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pF1KE9 KNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIP
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1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE9 SPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHW
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1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE9 DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
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.::..:. .: ::::::.:: .: : . ::.:::: :.:
CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSK
10 20 30 40
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pF1KE9 GDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRII
: :..:.:. ::::::::... ..: . ::.::: .:: . ..:..:.:: ::..
CCDS41 EDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-LVAIPKPTVPPSADEKSNPNFF-EQRHG--
50 60 70 80 90 100
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pF1KE9 PPHQDNT-HPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ
::.. : .: : : :. ..:...:. : : . :. ....::: . .
CCDS41 GSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQ----RTSAGSSS--GTNSSGQRHDRE
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNP---SAKEDSNPNSSGEDAF-KEIFQSNS
. ... :... . . .:. . ..: :. ..:. : :.: :: .:.:
CCDS41 SYNNSGSSSRKKG--QHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 PEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGL-SVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQ
:.. . ..: : . ::: :.:.:::.:. :.. :::::::::::::..
CCDS41 PRDPDANWDSP-------SRVPFSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQES
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 APDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTI-LQTSEVSLPSDPSC
. : :. .: :: .. . ::: ::..: :. : : ..: .: ::
CCDS41 ---MEPKLSSEHYSSQSHGN----SMTELKPS---SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDVSC
270 280 290 300 310
360 370 380
pF1KE9 VEEILRESQHLTP-----------------------------GFTLQKWNDPTTRASTKS
:.:::.: : : : :: .:. ..:.
CCDS41 VDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPS-KTSNGH
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 VSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNP-VNPPLATPQPP
: ::::.:::::::.:: .. : .:. ::..: : . .
CCDS41 QS-KSMLKDDLKLSSSED--------------SDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSE
380 390 400 410
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pF1KE9 PAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLN
: .. :.: : ::::: :::..:::..:::.:: . :.:::::: :::::::.:::
CCDS41 GADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLN
420 430 440 450 460 470
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pF1KE9 KVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK-TNASQVPAE-PKERPLLSLIR
::. .. : : ... : : .. . . . :. : . . ::: . :
CCDS41 KVNPHKVS--------PASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPKETSSATPGR
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610
pF1KE9 EKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPN--I
.. . :: :. ..: . :....:: :.:::::::.:: .. . :. . :
CCDS41 DS---KTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE----PRGGLKI
540 550 560 570 580
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pF1KE9 TSSTPKEKESVELHDPPRGRNKAT---AHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKS
: :: . : . : .:.::. ..:: .:: . . . :::::.. .: ::
CCDS41 ESETPVDLAS----SMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKS
590 600 610 620 630 640
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pF1KE9 REFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNN
::.::::.:.::: :. :.: :: ...: : : . : .. :. ..
CCDS41 REIIETDTSSSDS--DESESL-----PP----SSQTPKYPE------SNRTPVKPSSVEE
650 660 670 680
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pF1KE9 NLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPD
. :. .. :::. . :.:::: . .. : :::::.::.:.::. .. : : .
CCDS41 EDSFFRQR-MFSPME--EKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGE
690 700 710 720 730 740
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pF1KE9 HKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPA
.:.. : :.. : :: . ::::::: . . :: . :. ..
CCDS41 KKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESKKPKTEDKNSA----------
750 760 770 780 790
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pF1KE9 PPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTG
::: ..::.... : ::. :.: : .:.: :. .. : . ..:....
CCDS41 -GHKPSSNRESSKQSAA---KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGS-------RKRTISQSS
800 810 820 830
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pF1KE9 QITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVT
.. :.. . : .: : : ..: :. .. : ... :
CCDS41 SLKSSSNSNKET------SGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSK--------------EVK
840 850 860 870
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pF1KE9 ATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDD
: ..... .. : :.::. :: ::.:::
CCDS41 EKAPSSSSNCPPSA---------------------------PTLDSSKP--RRTKLVFDD
880 890 900 910
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE9 SVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMY
..::.:.::::::::.:::: ..: ::: : ::..:: :::::.:.. :.:::. ::
CCDS41 RNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMY
920 930 940 950 960 970
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE9 SETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLME
::::.:..:.:.:::. .: :. .::.:.::: :: ::::::.:::::..:.:::..: :
CCDS41 SETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTE
980 990 1000 1010 1020 1030
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 YFKQNASKVAQIPSPWV-SNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGP---------VTIPQ
..: :. . .: ::: . :.. . ::::: ..:: :. :: ..: :::::
CCDS41 HLK-NSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVS-PKLSPGNS-GNYSSGASSASASGSSVTIPQ
1040 1050 1060 1070 1080
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 RIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSS-MTNLVRY
.::.::::.:..::: : . : ::.:..:..:.::::..:: .:::: ..: ::.::::
CCDS41 KIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1270
pF1KE9 VRQGLCWLRIDAHLL
.:::: ::: ::.:.
CCDS41 TRQGLHWLRQDAKLIS
1150 1160
>>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MDLFDF--FRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTN
:: ::. ...::::. : :: ::.::...: ::::::.::.: :.:...::.::::::
CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 KGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRI
::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: :: . : ... .
CCDS42 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 IPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ
: .: :.: : ....... :.. .: :: ..: . : ....
CCDS42 QPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--GQQRATQQGSLR
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEES
:: : .:. ..: ::. :
CCDS42 TLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCN--------------------V
170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 EFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDIS
: ..:. : : . ::: ::::::.: : :. ::::::::::::::::::: :
CCDS42 EVGLQTQERP-PAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDES
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 PTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCVEEIL
: :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: : .. ::::::.
CCDS42 PKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEII
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390
pF1KE9 RE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSML
:: :: .. : . : .: .. ...: :::
CCDS42 REMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSML
310 320 330 340 350 360
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pF1KE9 EDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGG
::::::::::.. : . : : .:.. . :.. . . . . ..::.
CCDS42 EDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGS
370 380 390 400 410 420
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pF1KE9 SGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKS
:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::::::: . .:
CCDS42 SSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-NPHKP
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: :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . : .:. ::: ..
CCDS42 PILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTAN
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: : .:..:.: .. .:. .:. ::: ...:....
CCDS42 KAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAG
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: . .:. ... :: . : .. . ::: : .. ::.. ::
CCDS42 DGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGL
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pF1KE9 GKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--G
..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. :.:: . :: :
CCDS42 SRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANG
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.: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: .....::::::: ::
CCDS42 GSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLL
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::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.: . . :
CCDS42 SRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREI
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pF1KE9 KQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR
:. : . : : . . : :. . : :.::.. :.::: . ..
CCDS42 KKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHK
840 850 860 870 880 890
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pF1KE9 ---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATI
....... : : : .:. .: ::: . .. . :: : : . .
CCDS42 YTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSE
900 910 920 930
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pF1KE9 TVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTS
.. . .:. .
CCDS42 NIP-----------------------------------------------LHKSRPQTKP
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pF1KE9 WAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAAL
:. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. ::::::.:::.:::
CCDS42 WS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAAL
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pF1KE9 SFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLS
:: :::::::. :.:.:::::::::::::.:::::::. ..: :. ::.::.::::::.
CCDS42 SFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE9 LLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNT--PSPVSLNN--VS
::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.: :::.: : .:
CCDS42 LLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPAS
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pF1KE9 PINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEF
....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:..:.:::.:..::.::
CCDS42 SVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREF
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KE9 FGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
:.::: ::::.: :::: .::.: .::: ::: .:::
CCDS42 FNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
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50 60 70 80 90 100
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CCDS33 YSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKID
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CCDS33 EHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--G
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CCDS33 QQRATQQGSLRTLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCN----------
190 200 210
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: ..:. : : . ::: ::::::.: : :. ::::::::::
CCDS33 ----------VEVGLQTQERP-PAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRP
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::::::::: :: :: : :.: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: :
CCDS33 MDGQDQAPDESPKLKSSS--ETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRS
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.. ::::::.:: :: .. : . : .: ..
CCDS33 GETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPES
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...: :::::::::::::.. : . : : .:.. . :.. . .
CCDS33 PDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSS
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. . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::
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::::: . .: : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . :
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.:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. .:. :::
CCDS33 CKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKK
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...:.... : . .:. ... :: . : .. . ::: : ..
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CCDS33 C--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGN
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. :: :.: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: ....
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.::::::: ::::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.:
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. . : :. : . : : . . : :. . : :.::.. :
CCDS33 -CDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSP
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.::: . .. ....... : : : .:. .: ::: . .. . :
CCDS33 ISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQPHGG
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pF1KE9 DTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTG
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CCDS33 DLTKAAHNNSENIP----------------------------------------------
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. .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. :::
CCDS33 -LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKF
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CCDS33 GKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDK
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.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.: :
CCDS33 QLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKSTGTP
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pF1KE9 SPVSLNN--VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDM
::.: : .: ....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:..:.:
CCDS33 SPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEM
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pF1KE9 ADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
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CCDS33 ADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTNKG
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CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKG
10 20 30 40 50
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pF1KE9 DALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSV--PQNPNNKNEPSFFPEQKNRI
: :..:.:: ::::.:.:..:...:. .: . .: . :. : .. : .: .. .
CCDS54 DELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHT
60 70 80 90 100 110
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pF1KE9 IPPHQDNTHP-SAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNP--STVLASQASGQP-
::. : :.:. .. : . . . : : .: : :... ::
CCDS54 SVHHQSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE9 ---------------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDS
.. ..:.. . .: .. :. : .. . ... : .. .:
CCDS54 FGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE9 NPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTS
. ..:.... : ..::.. :. .: .::.::.. : :.::: .: :.
CCDS54 KVHGSSNNS-KGYCPAKSPKDLAVKVHDKETP--QDSLVAPAQPPS-QTFPPPSLPSKSV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 MGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSF-GTLLDGKPSAASSKTKLP
::::::::::::::::::. :: ::: : .. . .: : : .: .: :.:
CCDS54 AMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE---DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMP
300 310 320 330 340
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pF1KE9 KFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILRE-----------------------------SQHLTP
. :. : . .. ::::::.: :::..
CCDS54 S----QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSS
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 GFTLQKWNDPTTRASTKSVS-FKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEK
:: : .... ..: . .:::::::.::..:: .. :. ::
CCDS54 VTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSED--------------SDSEQTPEK
410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 AKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVAT
. : . : . :.: ....:.. : : :.:.: :::..:::..::: :: .. .
CCDS54 PPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAE-SESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPA
460 470 480 490 500
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::::::.:::::::.::.::. : .: : : :: .: : . . . .
CCDS54 PEPEPPTTNKWQLDNWLTKVS---------QPAAPPEGPRSTEPPRRHP-ESKGSSDSAT
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pF1KE9 SQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVE
:: .: :. : : :: :: . :. . . : ... :: :.: :::::
CCDS54 SQEHSESKDPPPKS--SSKA-PRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPV
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pF1KE9 KNTS-----TDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPL
: .. :. .:.. ... : .: :. ..:. . : .::.: .:
CCDS54 KASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTS---KDKPKVKTKGRP-RAAASNEPKPAVPP
620 630 640 650 660 670
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pF1KE9 APEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC
. ::::... .: . . ..:. :. : . .: : : : ...
CCDS54 SSEKKKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS---
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CCDS54 GSR--------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDL
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