FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9290, 319 aa
1>>>pF1KE9290 319 - 319 aa - 319 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9817+/-0.000525; mu= 17.8935+/- 0.032
mean_var=70.2740+/-15.216, 0's: 0 Z-trim(107.1): 52 B-trim: 227 in 1/46
Lambda= 0.152995
statistics sampled from 15102 (15144) to 15102 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.502), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 2076 467.9 1.2e-131
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1719 389.1 6.3e-108
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1653 374.5 1.5e-103
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1615 366.1 5.1e-101
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1593 361.3 1.4e-99
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1593 361.3 1.4e-99
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1593 361.3 1.4e-99
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1347 307.0 3.3e-83
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1333 303.9 2.7e-82
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1328 302.8 5.8e-82
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 853 197.9 2.1e-50
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 779 181.6 1.8e-45
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 687 161.3 2.4e-39
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 685 160.9 3.2e-39
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 602 142.5 1e-33
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 582 138.1 2.2e-32
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 581 137.9 2.6e-32
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 564 134.2 3.5e-31
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 505 121.1 2.9e-27
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 429 104.3 3.2e-22
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 416 101.5 2.3e-21
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 410 100.2 6.1e-21
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 365 90.2 5.9e-18
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 350 86.9 5.5e-17
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 319 80.1 7e-15
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 315 79.2 1.2e-14
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 139 40.4 0.0068
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 139 40.4 0.0068
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 139 40.4 0.0072
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 139 40.4 0.0073
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 139 40.4 0.0073
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 2076 init1: 2076 opt: 2076 Z-score: 2484.3 bits: 467.9 E(85289): 1.2e-131
Smith-Waterman score: 2076; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
:::::::::::::::::::
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1719 init1: 1719 opt: 1719 Z-score: 2058.6 bits: 389.1 E(85289): 6.3e-108
Smith-Waterman score: 1719; 86.8% identity (95.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::: ::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::.:.::::.::::: :.:::::::::::: ::::.:::::::.::::.::::::::::.
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.::::::::::::::::::::::::::::.. .::::::::.::::::::::: :: :.:
NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
.:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
::::.:.:: .. ::..::::::.:: :::::::::::: ::::::: ::::: :::::
NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
::
NP_795 VKGEKPSSS
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1653 init1: 1653 opt: 1653 Z-score: 1979.9 bits: 374.5 E(85289): 1.5e-103
Smith-Waterman score: 1653; 82.5% identity (94.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
:::::::::: :.:: ::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::.::.: ::::: ::::: ::::.::: ::::.::::.::.::::.::::::.:::.
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.:::::::.::.::::::::.::::::::.: : :::.:::.::::::.:::: ::::.:
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
:.::.::.::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
::::..::: ..: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::. ..:::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
::
NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1615 init1: 1615 opt: 1615 Z-score: 1934.6 bits: 366.1 E(85289): 5.1e-101
Smith-Waterman score: 1615; 81.8% identity (93.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..::.:::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::.::.: .:::::::::: :::::::::.:::.:::::::.::::.::::::::::.
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.:::::::.::.::::::::.:.:::::: : : :::::::.:::::::::.: :. :.:
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
:.:.::.::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
::::..::: ..: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::::.::::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
::
NP_795 VKGEKPSSP
>>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1593 init1: 1593 opt: 1593 Z-score: 1908.5 bits: 361.3 E(85289): 1.4e-99
Smith-Waterman score: 1593; 80.9% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.:: :::::::::::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::
XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::.::.: :::::::::.: ::::.::::.:::.: :::::.::::.:::::::::::
XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.:::::::.::.::::::::.:::::.::.. :::::::::.::::::: ::: :. :.:
XP_006 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::.::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.:: ::
XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
::.:.:::: .. ::..::::::::: :: :.:::::: ::::::: .:::: ..::
XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1593 init1: 1593 opt: 1593 Z-score: 1908.5 bits: 361.3 E(85289): 1.4e-99
Smith-Waterman score: 1593; 80.9% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.:: :::::::::::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::.::.: :::::::::.: ::::.::::.:::.: :::::.::::.:::::::::::
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.:::::::.::.::::::::.:::::.::.. :::::::::.::::::: ::: :. :.:
NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
::::.::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.:: ::
NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
::.:.:::: .. ::..::::::::: :: :.:::::: ::::::: .:::: ..::
NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1593 init1: 1593 opt: 1593 Z-score: 1908.5 bits: 361.3 E(85289): 1.4e-99
Smith-Waterman score: 1593; 80.9% identity (93.3% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::.:: :::::::::::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::
XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
::::.::.: :::::::::.: ::::.::::.:::.: :::::.::::.:::::::::::
XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
.:::::::.::.::::::::.:::::.::.. :::::::::.::::::: ::: :. :.:
XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
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XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
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250 260 270 280 290 300
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XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
310
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10 20 30 40 50 60
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NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
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NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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.: ..
NP_795 AKGQNQSTP
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
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Smith-Waterman score: 1333; 68.8% identity (88.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
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NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
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NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
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NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
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pF1KE9 YFLSMIISVCNLGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
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NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
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initn: 1328 init1: 1328 opt: 1328 Z-score: 1592.4 bits: 302.8 E(85289): 5.8e-82
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10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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pF1KE9 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
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NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
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NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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310
pF1KE9 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
319 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]