FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6792, 790 aa
1>>>pF1KE6792 790 - 790 aa - 790 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8073+/-0.000511; mu= 13.9453+/- 0.032
mean_var=170.4271+/-32.652, 0's: 0 Z-trim(114.4): 205 B-trim: 123 in 1/50
Lambda= 0.098244
statistics sampled from 23972 (24207) to 23972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16
Scan time: 11.410
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_068566 (OMIM: 604779) disintegrin and metallopr ( 790) 5505 793.7 0
NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metallopr ( 722) 1927 286.6 2.6e-76
NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_001265054 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
XP_011529862 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_001124176 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
XP_011529861 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_001124175 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
XP_011529858 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
XP_011529859 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_055084 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopr ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_001265055 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_001124177 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
XP_011529863 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1733 259.1 5.4e-68
NP_003805 (OMIM: 603712) disintegrin and metallopr ( 776) 1568 235.7 5.7e-61
XP_005268208 (OMIM: 603712) PREDICTED: disintegrin ( 776) 1568 235.7 5.7e-61
XP_011542984 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 801) 1457 220.0 3.2e-56
NP_003807 (OMIM: 602713,612775) disintegrin and me ( 819) 1457 220.0 3.2e-56
XP_016869431 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 821) 1457 220.0 3.3e-56
NP_001455 (OMIM: 601533) disintegrin and metallopr ( 735) 1189 182.0 8.2e-45
NP_003808 (OMIM: 607310) disintegrin and metallopr ( 754) 1132 173.9 2.3e-42
XP_016869432 (OMIM: 607310) PREDICTED: disintegrin ( 755) 1132 173.9 2.3e-42
XP_011532984 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 651) 1029 159.2 5.1e-38
XP_016865498 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 651) 1029 159.2 5.1e-38
NP_150377 (OMIM: 603640) disintegrin and metallopr ( 918) 1029 159.4 6.4e-38
XP_005266060 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 955) 1029 159.4 6.6e-38
XP_016872195 (OMIM: 602714) PREDICTED: disintegrin ( 520) 993 154.0 1.5e-36
XP_016872194 (OMIM: 602714) PREDICTED: disintegrin ( 753) 993 154.2 1.9e-36
NP_001275902 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 906) 993 154.3 2.2e-36
NP_003465 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 909) 993 154.3 2.2e-36
NP_001275904 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 735) 987 153.3 3.4e-36
NP_001275903 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 737) 987 153.3 3.4e-36
NP_067673 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 738) 987 153.3 3.4e-36
NP_001265042 (OMIM: 601533) disintegrin and metall ( 716) 938 146.4 4.1e-34
XP_011527675 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 492) 928 144.8 8.6e-34
NP_001269376 (OMIM: 607114) disintegrin and metall ( 812) 928 145.0 1.2e-33
XP_011527669 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 812) 928 145.0 1.2e-33
NP_079496 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 813) 928 145.0 1.2e-33
XP_006723703 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 823) 928 145.0 1.2e-33
XP_011527668 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 928 145.0 1.2e-33
XP_006723702 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 928 145.0 1.2e-33
XP_005260900 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 826) 928 145.0 1.2e-33
XP_011542781 (OMIM: 601533) PREDICTED: disintegrin ( 609) 914 142.9 3.9e-33
NP_003803 (OMIM: 603710) disintegrin and metallopr ( 832) 840 132.6 6.9e-30
XP_005246989 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 838 132.3 8.4e-30
XP_011510388 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 838 132.3 8.4e-30
XP_005273439 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 621) 773 122.9 4.1e-27
XP_011542671 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 673) 773 123.0 4.3e-27
XP_016868465 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 715) 773 123.0 4.5e-27
XP_011542670 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 773 123.0 4.6e-27
>>NP_068566 (OMIM: 604779) disintegrin and metalloprotei (790 aa)
initn: 5505 init1: 5505 opt: 5505 Z-score: 4231.2 bits: 793.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5505; 100.0% identity (100.0% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PVSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PVSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKESL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DSKATISTCMGGLRGVFNIDAKHYQIEPLKASPSFEHVVYLLKKEQFGNQVCGLSDDEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 DSKATISTCMGGLRGVFNIDAKHYQIEPLKASPSFEHVVYLLKKEQFGNQVCGLSDDEIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WQMAPYENKARLRDFPGSYKHPKYLELILLFDQSRYRFVNNNLSQVIHDAILLTGIMDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 WQMAPYENKARLRDFPGSYKHPKYLELILLFDQSRYRFVNNNLSQVIHDAILLTGIMDTY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FQDVRMRIHLKALEVWTDFNKIRVGYPELAEVLGRFVIYKKSVLNARLSSDWAHLYLQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 FQDVRMRIHLKALEVWTDFNKIRVGYPELAEVLGRFVIYKKSVLNARLSSDWAHLYLQRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YNDALAWSFGKVCSLEYAGSVSTLLDTNILAPATWSAHELGHAVGMSHDEQYCQCRGRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 YNDALAWSFGKVCSLEYAGSVSTLLDTNILAPATWSAHELGHAVGMSHDEQYCQCRGRLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 CIMGSGRTGFSNCSYISFFKHISSGATCLNNIPGLGYVLKRCGNKIVEDNEECDCGSTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CIMGSGRTGFSNCSYISFFKHISSGATCLNNIPGLGYVLKRCGNKIVEDNEECDCGSTEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 CQKDRCCQSNCKLQPGANCSIGLCCHDCRFRPSGYVCRQEGNECDLAEYCDGNSSSCPND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CQKDRCCQSNCKLQPGANCSIGLCCHDCRFRPSGYVCRQEGNECDLAEYCDGNSSSCPND
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 VYKQDGTPCKYEGRCFRKGCRSRYMQCQSIFGPDAMEAPSECYDAVNLIGDQFGNCEITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VYKQDGTPCKYEGRCFRKGCRSRYMQCQSIFGPDAMEAPSECYDAVNLIGDQFGNCEITG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 IRNFKKCESANSICGRLQCINVETIPDLPEHTTIISTHLQAENLMCWGTGYHLSMKPMGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 IRNFKKCESANSICGRLQCINVETIPDLPEHTTIISTHLQAENLMCWGTGYHLSMKPMGI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 PDLGMINDGTSCGEGRVCFKKNCVNSSVLQFDCLPEKCNTRGVCNNRKNCHCMYGWAPPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PDLGMINDGTSCGEGRVCFKKNCVNSSVLQFDCLPEKCNTRGVCNNRKNCHCMYGWAPPF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 CEEVGYGGSIDSGPPGLLRGAIPSSIWVVSIIMFRLILLILSVVFVFFRQVIGNHLKPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CEEVGYGGSIDSGPPGLLRGAIPSSIWVVSIIMFRLILLILSVVFVFFRQVIGNHLKPKQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 EKMPLSKAKTEQEESKTKTVQEESKTKTGQEESEAKTGQEESKAKTGQEESKANIESKRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 EKMPLSKAKTEQEESKTKTVQEESKTKTGQEESEAKTGQEESKAKTGQEESKANIESKRP
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE6 KAKSVKKQKK
::::::::::
NP_068 KAKSVKKQKK
790
>>NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metalloprotei (722 aa)
initn: 1735 init1: 649 opt: 1927 Z-score: 1490.9 bits: 286.6 E(85289): 2.6e-76
Smith-Waterman score: 1932; 39.8% identity (69.6% similar) in 723 aa overlap (12-722:11-717)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS
:. :::. .. :.. : .: : ::.:: :. ::. . .
NP_003 MAVDGTLVYIRVTLLLLWLGVFLSISGYCQAGPSQHFTSPEVVIPLKVISRGRSAKAPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PVSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKESL
.:: :.. :.:::.:. :.::. ::: ::..:. ::::. .:: :: : : :. .
NP_003 WLSYSLRFGGQKHVVHMRVKKLLVSRHLPVFTYTDDRALLEDQLFIPDDCYYHGYVEAAP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 DSKATISTCMGGLRGVFNIDAKHYQIEPLKASPSFEHVVYLLKKE--QFGNQVCGLSDDE
.: ...:.:.::.:::..:.. :.:::.. : .:::.:: .... :: . :::.. :
NP_003 ESLVVFSACFGGFRGVLKISGLTYEIEPIRHSATFEHLVYKINSNETQFPAMRCGLTEKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IEWQMAPYENKARLRDFPGS----YKHPKYLELILLFDQSRYRFVNNNLSQVIHDAILLT
. :. .:. : : . : .:::... ... . . ..:.:.: .:..:..
NP_003 VARQQLEFEEAENSALEPKSAGDWWTHAWFLELVVVVNHDFFIYSQSNISKVQEDVFLVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GIMDTYFQDVRMRIHLKALEVWTDFNKIRVGYPELAEVLGRFVIYKKSVLNARLSSDWAH
.:.:...... : : ..:.:.. : . . . .::. : .:. :. .:. : ::
NP_003 NIVDSMYKQLGTYIILIGIEIWNQGNVF--PMTSIEQVLNDFSQWKQISLS-QLQHDAAH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LYLQRKYNDALAWSF-GKVCSLEYAGSVSTLLDTNILAPATWSAHELGHAVGMSHDEQYC
.... . . :. .. . .: .:... . :. ::::::..::.:::..:
NP_003 MFIKNSLISILGLAYVAGICRPPIDCGVDNFQGDTWSLFANTVAHELGHTLGMQHDEEFC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE6 QCRGRLNCIMGSGRTG---FSNCSYISFFKHISSGATCLNNIPGLG--YVLKRCGNKIVE
: :. .:::.. :. :.:::: .:.: . ..::.: : :: ..:::::: .::
NP_003 FC-GERGCIMNTFRVPAEKFTNCSYADFMKTTLNQGSCLHNPPRLGEIFMLKRCGNGVVE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 DNEECDCGSTEECQKDRCCQSNCKLQPGANCSIGLCCHDCRFRPSGYVCRQEGNECDLAE
.:.:::::...:..: :: :: :.::: :..::::.::.: ::: .:::: ::::: :
NP_003 REEQCDCGSVQQCEQDACCLLNCTLRPGAACAFGLCCKDCKFMPSGELCRQEVNECDLPE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 YCDGNSSSCPNDVYKQDGTPCKYEGRCFRKGCRSRYMQCQSIFGPDAMEAPSECYDAVNL
.:.:.: .::.: : ::: ::. . :..: : .. ..:. ::: :: : ..:: .:
NP_003 WCNGTSHQCPEDRYVQDGIPCSDSAYCYQKRCNNHDQHCREIFGKDAKSASQNCYKEINS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 IGDQFGNCEITGIRNFKKCESANSICGRLQCINVETIPDLPEHTTIISTHLQAENLMCWG
:..::.: :.: .. ::. .. .:::.:: ::. :: : .: :. ::.. .. :::
NP_003 QGNRFGHCGINGT-TYLKCHISDVFCGRVQCENVRDIPLLQDHFTLQHTHIN--GVTCWG
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE6 TGYHLSMKPMGIPDLGMINDGTSCGEGRVCFKKNCVNSSVLQFDCLPEKCNTRGVCNNRK
::: :. : :.: ..::: :: :..:..:.::. :::. :::: :: .:.:::..
NP_003 IDYHLRMN---ISDIGEVKDGTVCGPGKICIHKKCVSLSVLSHVCLPETCNMKGICNNKH
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE6 NCHCMYGWAPPFCEEVGYGGSIDSGPPGLLRGAIPSSIWVVSIIMFRLILLILSVVFVFF
.::: :::.::.:.. :::::::::: . ::.. : . :. . : .:. .....
NP_003 HCHCGYGWSPPYCQHRGYGGSIDSGPASAKRGVFLPLIVIPSLSV--LTFLFTVGLLMYL
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE6 RQVIGNHLKPKQEKMPLSKAKTEQEESKTKTVQEESKTKTGQEESEAKTGQEESKAKTGQ
:: : ::. :
NP_003 RQCSG----PKETKAHSSG
710 720
>>NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopro (820 aa)
initn: 1497 init1: 638 opt: 1733 Z-score: 1341.6 bits: 259.1 E(85289): 5.4e-68
Smith-Waterman score: 1778; 34.1% identity (65.9% similar) in 795 aa overlap (13-790:4-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSVQIFLSQCRLLLLLVPTMLLKSLGEDVIFHPEGEFDSYEVTIPEKLSFRGEVQGVVS
:::: ..:. :. ::. . .:.:: ... : ..:..
NP_001 MKMLLLLHCLGVFLSCSGHIQDEHPQ-YHSPPDVVIPVRIT--GTTRGMTP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE6 P--VSYLLQLKGKKHVLHLWPKRLLLPRHLRVFSFTEHGELLEDHPYIPKDCNYMGSVKE
: .::.: . :.::..:. :.::. .:: ::..:..: .:::.:.. ..: : : :.
NP_001 PGWLSYILPFGGQKHIIHIKVKKLLFSKHLPVFTYTDQGAILEDQPFVQNNCYYHGYVEG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SLDSKATISTCMGGLRGVFNIDAKHYQIEPLKASPSFEHVVYLLKKE--QFGNQVCGLSD
. .: ...:::.::..:...:. :.:.:: : .:::.:: . .: ::... :. .
NP_001 DPESLVSLSTCFGGFQGILQINDFAYEIKPLAFSTTFEHLVYKMDSEEKQFSTMRSGFMQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DEIEWQMAPYE---NKARLRDFPGSYKHPKYLELILLFDQSRYRFVNNNLSQVIHDAILL
.:: .: : . . .. : . : . .:.....:. : . : :....: ..
NP_001 NEITCRMEFEEIDNSTQKQSSYVGWWIHFRIVEIVVVIDNYLYIRYERNDSKLLEDLYVI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TGIMDTYFQDVRMRIHLKALEVWTDFNKIRVGYPELAEVLGRFVIYKKSVLNARLSSDWA
..:.:. .. . ... : .::.::. : : : .. . . . .:. .. :.. : .
NP_001 VNIVDSILDVIGVKVLLFGLEIWTNKNLIVV--DDVRKSVHLYCKWKSENITPRMQHDTS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 HLY--LQRKYNDALAWSFGKVCSLEYAGSVSTLLDTNILAPATWSAHELGHAVGMSHDEQ
::. : . .... .: .:. . . .. :... .. . . ::.::: .::.:::.
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