Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6780
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6780, 567 aa
1>>>pF1KE6780 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2457+/-0.000875; mu= 19.0097+/- 0.053
mean_var=64.6378+/-12.978, 0's: 0 Z-trim(106.6): 15 B-trim: 509 in 1/49
Lambda= 0.159526
statistics sampled from 9046 (9060) to 9046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46734.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 738) 3824 889.1 0
CCDS14098.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 772) 3824 889.1 0
CCDS8185.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 ( 773) 2634 615.2 9e-176
CCDS31624.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 ( 756) 2561 598.4 1e-170
CCDS12779.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 803) 2179 510.5 3.1e-144
CCDS46147.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 792) 1902 446.8 4.7e-125
CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 ( 626) 787 190.1 6.9e-48
CCDS5604.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 ( 612) 692 168.2 2.6e-41
CCDS47634.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 ( 640) 692 168.2 2.7e-41
CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 630) 644 157.2 5.6e-38
CCDS44389.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 666) 644 157.2 5.9e-38
CCDS7232.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 748) 644 157.2 6.5e-38
CCDS575.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 658) 534 131.9 2.4e-30
CCDS81326.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 635) 400 101.0 4.5e-21
>>CCDS46734.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 (738 aa)
initn: 2210 init1: 2210 opt: 3824 Z-score: 4749.6 bits: 889.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3824; 99.5% identity (99.6% similar) in 569 aa overlap (1-567:170-738)
10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EMHGKTSNLTRIWAYLESVRPLLDDEEYYRMELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 KPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGAR
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIE
320 330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 RAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEH
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320
pF1KE6 AWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::
CCDS46 AWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQCQAVIESS
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 YQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASM
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 TRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGI
560 570 580 590 600 610
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFG
620 630 640 650 660 670
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 PVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
680 690 700 710 720 730
>>CCDS14098.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 (772 aa)
initn: 2210 init1: 2210 opt: 3824 Z-score: 4749.3 bits: 889.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3824; 99.5% identity (99.6% similar) in 569 aa overlap (1-567:204-772)
10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKLPVPRVSATIQRYLESVRPLLDDEEYYRMELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 KPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGAR
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIE
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 RAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEH
420 430 440 450 460 470
280 290 300 310 320
pF1KE6 AWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::
CCDS14 AWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQCQAVIESS
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 YQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASM
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 TRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGI
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 DRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFG
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 PVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
720 730 740 750 760 770
>>CCDS8185.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 (773 aa)
initn: 2176 init1: 1115 opt: 2634 Z-score: 3269.2 bits: 615.2 E(32554): 9e-176
Smith-Waterman score: 2634; 65.8% identity (86.2% similar) in 564 aa overlap (1-560:202-765)
10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
: ::..: .:::: :: ::::::.::
CCDS81 PRLPVPAVKDTVNRYLQSVRPLMKEEDFKRMTALAQDFAVGLGPRLQWYLKLKSWWATNY
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
::::::::::::::.:::::::::.:::. : : .:::: :: :::...::::::::::
CCDS81 VSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYILPTHIQAARAGNAIHAILLYRRKLDREEI
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140
pF1KE6 KPVMALG-IVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGA
::. :: .:.:: : ::::::.::::..::..::. ::.:..:::.::.::.:::. .
CCDS81 KPIRLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHMRDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDG
300 310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 RLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAI
:::::...:.:.:::::. : ::::: .::::::: :: ::. :::.:. :::: .:.:.
CCDS81 RLLKPREMEQQMQRILDNTSEPQPGEARLAALTAGDRVPWARCRQAYFGRGKNKQSLDAV
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 ERAAFFVALDEESYSYDPED-EASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNA
:.:::::.::: .: :: ..:.. :.:.:::: ::.::::::::.. ::::..::::
CCDS81 EKAAFFVTLDETEEGYRSEDPDTSMDSYAKSLLHGRCYDRWFDKSFTFVVFKNGKMGLNA
420 430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 EHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPK--QAVIK
::.::::::..::::.:.. ::..:::.: ::: : :: . ::::::::: : ::.
CCDS81 EHSWADAPIVAHLWEYVMSIDSLQLGYAEDGHCKGDINPNIPYPTRLQWDIPGECQEVIE
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 SSYQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEA
.: ..:. ::.::... : :. ::::.:::::::::::::.::::::..: :::::::::
CCDS81 TSLNTANLLANDVDFHSFPFVAFGKGIIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEA
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGA
::::.:::::::::::::.:: ::.::.. ..: . ::. :..:::.::::::::.
CCDS81 SMTRLFREGRTETVRSCTTESCDFVRAMVDPAQTVEQRLKLFKLASEKHQHMYRLAMTGS
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGG
::::::::::.:::::.: :::: ::::::::::::: ::.:...:: :..:.....:::
CCDS81 GIDRHLFCLYVVSKYLAVESPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFDLENNPEYVSSGGG
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 FGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAY
:::::::::::::...::: : :::::::: ::...::: :...:. :: ::
CCDS81 FGPVADDGYGVSYILVGENLINFHISSKFSCPETDSHRFGRHLKEAMTDIITLFGLSSNS
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 S
CCDS81 KK
>>CCDS31624.1 CPT1A gene_id:1374|Hs108|chr11 (756 aa)
initn: 2103 init1: 1042 opt: 2561 Z-score: 3178.5 bits: 598.4 E(32554): 1e-170
Smith-Waterman score: 2561; 66.5% identity (86.4% similar) in 544 aa overlap (1-540:202-745)
10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNY
: ::..: .:::: :: ::::::.::
CCDS31 PRLPVPAVKDTVNRYLQSVRPLMKEEDFKRMTALAQDFAVGLGPRLQWYLKLKSWWATNY
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VSDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEI
::::::::::::::.:::::::::.:::. : : .:::: :: :::...::::::::::
CCDS31 VSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYILPTHIQAARAGNAIHAILLYRRKLDREEI
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140
pF1KE6 KPVMALG-IVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGA
::. :: .:.:: : ::::::.::::..::..::. ::.:..:::.::.::.:::. .
CCDS31 KPIRLLGSTIPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHMRDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDG
300 310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 RLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAI
:::::...:.:.:::::. : ::::: .::::::: :: ::. :::.:. :::: .:.:.
CCDS31 RLLKPREMEQQMQRILDNTSEPQPGEARLAALTAGDRVPWARCRQAYFGRGKNKQSLDAV
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 ERAAFFVALDEESYSYDPED-EASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNA
:.:::::.::: .: :: ..:.. :.:.:::: ::.::::::::.. ::::..::::
CCDS31 EKAAFFVTLDETEEGYRSEDPDTSMDSYAKSLLHGRCYDRWFDKSFTFVVFKNGKMGLNA
420 430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 EHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPK--QAVIK
::.::::::..::::.:.. ::..:::.: ::: : :: . ::::::::: : ::.
CCDS31 EHSWADAPIVAHLWEYVMSIDSLQLGYAEDGHCKGDINPNIPYPTRLQWDIPGECQEVIE
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 SSYQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEA
.: ..:. ::.::... : :. ::::.:::::::::::::.::::::..: :::::::::
CCDS31 TSLNTANLLANDVDFHSFPFVAFGKGIIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEA
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGA
::::.:::::::::::::.:: ::.::.. ..: . ::. :..:::.::::::::.
CCDS31 SMTRLFREGRTETVRSCTTESCDFVRAMVDPAQTVEQRLKLFKLASEKHQHMYRLAMTGS
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGG
::::::::::.:::::.: :::: ::::::::::::: ::.:...:: :..:.....:::
CCDS31 GIDRHLFCLYVVSKYLAVESPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFDLENNPEYVSSGGG
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 FGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAY
:::::::::::::...::: : :::::::: ::
CCDS31 FGPVADDGYGVSYILVGENLINFHISSKFSCPETGIISQGPSSDT
720 730 740 750
pF1KE6 S
>>CCDS12779.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 (803 aa)
initn: 2188 init1: 891 opt: 2179 Z-score: 2703.0 bits: 510.5 E(32554): 3.1e-144
Smith-Waterman score: 2179; 55.6% identity (79.9% similar) in 567 aa overlap (3-566:204-768)
10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYVS
.::.:: : :: :: :::::::::::
CCDS12 QPVPSVQDTVRKYLESVRPILSDEDFDWTAVLAQEFLRLQASLLQWYLRLKSWWASNYVS
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 DWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEIKP
:::::..:::.:.:::::::::.::.. . : .:::: :: .::...::..:.:.:: :
CCDS12 DWWEEFVYLRSRNPLMVNSNYYMMDFLYVTPTPLQAARAGNAVHALLLYRHRLNRQEIPP
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGARLL
.. .:. :.:: :.:..:::::::: . : ..:: ::.::::.:.::::.. . ::
CCDS12 TLLMGMRPLCSAQYEKIFNTTRIPGVQKDYIRHLHDSQHVAVFHRGRFFRMGTHSRNSLL
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 KPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERA
.:. ::.::::::::::: : ::.::::::. : :::.: .. . . ::::.: :
CCDS12 SPRALEQQFQRILDDPSPACPHEEHLAALTAAPRGTWAQVRTSL--KTQAAEALEAVEGA
360 370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 AFFVALDEESYSYDPEDEA-SLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHA
::::.:: : . :: : ::. :..::: : ..:::::::::: :.::.:::..::.
CCDS12 AFFVSLDAEPAGLTREDPAASLDAYAHALLAGRGHDRWFDKSFTLIVFSNGKLGLSVEHS
420 430 440 450 460 470
280 290 300 310 320
pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSSY
::: :: ::.:::.:.:. :.:::. ::: :.:.:.: : :::::.: : . :. .
CCDS12 WADCPISGHMWEFTLATECFQLGYSTDGHCKGHPDPTLPQPQRLQWDLPDQIHSSISLAL
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 QVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASMT
. :: :...:. . : :::..:..:. : :.:.:::::::::::::.::::::..::
CCDS12 RGAKILSENVDCHVVPFSLFGKSFIRRCHLSSDSFIQIALQLAHFRDRGQFCLTYESAMT
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 RMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGID
:.: ::::::::::: :. ::.:: . .: . ::. :. ::: . . ::.: :.:
CCDS12 RLFLEGRTETVRSCTREACNFVRAMEDKEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVD
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450 460 470 480 490 500
pF1KE6 RHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGP
:::: ::.::..: ..::::..: :: :.::::::: .:...:: ...:.....::::::
CCDS12 RHLFALYIVSRFLHLQSPFLTQVHSEQWQLSTSQIPVQQMHLFDVHNYPDYVSSGGGFGP
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 VADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
. : ::::::.. :.. : :::::: ::..:...:.:.::. ::::.:.:::. . .
CCDS12 ADDHGYGVSYIFMGDGMITFHISSKKSSTKTDSHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQHFKRR
720 730 740 750 760 770
CCDS12 FRGSGKENSRHRCGFLSRQTGASKASMTSTDF
780 790 800
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10 20 30
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pF1KE6 DWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVMDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEIKP
:::::..:::.:.:::::::::.: ::: :: .::...::..:.:.:: :
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.. .:. :.:: :.:..:::::::: . : ..:: ::.::::.:.::::.. . ::
CCDS46 TLLMGMRPLCSAQYEKIFNTTRIPGVQKDYIRHLHDSQHVAVFHRGRFFRMGTHSRNSLL
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pF1KE6 KPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERA
.:. ::.::::::::::: : ::.::::::. : :::.: .. . . ::::.: :
CCDS46 SPRALEQQFQRILDDPSPACPHEEHLAALTAAPRGTWAQVRTSL--KTQAAEALEAVEGA
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pF1KE6 AFFVALDEESYSYDPEDEA-SLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHA
::::.:: : . :: : ::. :..::: : ..:::::::::: :.::.:::..::.
CCDS46 AFFVSLDAEPAGLTREDPAASLDAYAHALLAGRGHDRWFDKSFTLIVFSNGKLGLSVEHS
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pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQWDIPKQ--AVIKSSY
::: :: ::.:::.:.:. :.:::. ::: :.:.:.: : :::::.: : . :. .
CCDS46 WADCPISGHMWEFTLATECFQLGYSTDGHCKGHPDPTLPQPQRLQWDLPDQIHSSISLAL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE6 QVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASMT
. :: :...:. . : :::..:..:. : :.:.:::::::::::::.::::::..::
CCDS46 RGAKILSENVDCHVVPFSLFGKSFIRRCHLSSDSFIQIALQLAHFRDRGQFCLTYESAMT
530 540 550 560 570 580
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 RMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGID
:.: ::::::::::: :. ::.:: . .: . ::. :. ::: . . ::.: :.:
CCDS46 RLFLEGRTETVRSCTREACNFVRAMEDKEKTDPQCLALFRVAVDKHQALLKAAMSGQGVD
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pF1KE6 RHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGP
:::: ::.::..: ..::::..: :: :.::::::: .:...:: ...:.....::::::
CCDS46 RHLFALYIVSRFLHLQSPFLTQVHSEQWQLSTSQIPVQQMHLFDVHNYPDYVSSGGGFGP
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510 520 530 540 550 560
pF1KE6 VADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
. : ::::::.. :.. : :::::: ::..:...:.:.::. ::::.:.:::. . .
CCDS46 ADDHGYGVSYIFMGDGMITFHISSKKSSTKTDSHRLGQHIEDALLDVASLFQAGQHFKRR
710 720 730 740 750 760
CCDS46 FRGSGKENSRHRCGFLSRQTGASKASMTSTDF
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10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDK--TAPRLQKYLVLKSWWASNYV
:. ::: . .. :::: : .. . :..
CCDS69 PVPPLQQSLDHYLKALQPIVSEEEWAHTKQLVDEFQASGGVGERLQKGLERRARKTENWL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYVM----DLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR
:.:: . ::. :.:... :. :: :.: ... ::.: :.... .. .:
CCDS69 SEWWLKTAYLQYRQPVVIYSSPGVMLPKQDFVDLQGQLRFAAKL---IEGVLDFKVMIDN
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSR----HVAVYHKGRFFKL
: . :: :: :.: :. ..... :.:: :.....: .. :..: :. .::.:
CCDS69 ETL-PVEYLGGKPLCMNQYYQILSSCRVPGPKQDTVSNFSKTKKPPTHITVVHNYQFFEL
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150 160 170 180 190 200
pF1KE6 WLY--EGARLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGK
.: .:. : : . .:...: . : : ..: .. ::.. : ::.: ......
CCDS69 DVYHSDGTPLTADQ-IFVQLEKIWN--SSLQTNKEPVGILTSNHRNSWAKAYNTLIKDKV
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KE6 NKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHG-----NCYNRWFDKSFTL
:. ....:... : : :: .. :: . :. .::: : ::::::.. .
CCDS69 NRDSVRSIQKSIFTVCLDA-TMPRVSEDVYRSHVAGQ-MLHGGGSRLNSGNRWFDKTLQF
280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPTRLQ
: ..:. :: ::: :..: : : ..: . ::. . . .: : : .:.
CCDS69 IVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPIVTLLDYV-------IEYTKKPELVRSPLVPLPMPKKLR
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 WDIPKQAVIKSSYQVAKA----LADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLA
..: . :::. . :: . .:... . : ::: . :. . :::::.:.:::::
CCDS69 FNITPE--IKSDIEKAKQNLSIMIQDLDITVMVFHHFGKDFPKSEKLSPDAFIQMALQLA
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 HFRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAA
..: :. : :::.. :::. :::.:.:: . .: .::.:: ..: :. . .:..::.
CCDS69 YYRIYGQACATYESASLRMFHLGRTDTIRSASMDSLTFVKAMDDSSVTEHQKVELLRKAV
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440 450 460 470 480
pF1KE6 KKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSP--FL--AEVLSEPWRLSTSQIP-QS
. :... :. : ..::::. : : . :: : :. . ... ..:::::.: ..
CCDS69 QAHRGYTDRAIRGEAFDRHLLGLKLQAIEDLVSMPDIFMDTSYAIAMHFHLSTSQVPAKT
510 520 530 540 550 560
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pF1KE6 QIRMFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGN
. :: ::::. ::::: : : : : .:. : .:::: :...
CCDS69 DCVMF--------------FGPVVPDGYGVCYN-PMEAHINFSLSAYNSCAETNAARLAH
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550 560
pF1KE6 HIRKALLDIADLFQV-PKAYS
...:::::. :.: :.:
CCDS69 YLEKALLDMRALLQSHPRAKL
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10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYV
: ....::. . .:.. :. .. :..
CCDS56 SLPVPSLEESLKKYLESVKPFANQEEYKKTEEIVQKFQSGIGEKLHQKLLERAKGKRNWL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYV----MDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR
.:: . :: : : ..: :. .. . .: : :.: . .: :
CCDS56 EEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAHFEHYWPPKEGTQLER-GSITLWHNLNYWQLLR
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90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHL----SDSR---HVAVYHKGRF
.: :: .: .:. :.. .:.: ..:: : ... :..: :..: .::
CCDS56 KEKVPVHKVGNTPLDMNQFRMLFSTCKVPGITRDSIMNYFRTESEGRSPNHIVVLCRGRA
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150 160 170 180 190
pF1KE6 FKL-WLYEGARLLKPQDLEMQFQRILDD--PSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFF
: . ..:: :. : .: :. : : :: .::::. :..::.::. ..
CCDS56 FVFDVIHEGC-LVTPPELLRQLTYIHKKCHSEPDGPG---IAALTSEERTRWAKAREYLI
210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 S-SGKNKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTL
. . .: : :: :. . . .... : ::: . . :.: :. :: :::..:
CCDS56 GLDPENLALLEKIQSSLLVYSMEDSSPHVTPEDYSEII---AAILIGDPTVRWGDKSYNL
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAP-PTRL
:::.:: .: : .:: :: :. .. .: : . . . :. :. . : : .:
CCDS56 ISFSNGVFGCNCDHAPFDAMIMVNISYYV---D--EKIFQNEGRWKGSEKVRDIPLPEEL
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320 330 340 350 360 370
pF1KE6 QWDIPKQAVIKSSYQVAKAL--ADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAH
. . .... . :. : :.:... . : ::: : :. ::.:.:.:::::.
CCDS56 IFIVDEKVLNDINQAKAQYLREASDLQIAAYAFTSFGKKLTKNKMLHPDTFIQLALQLAY
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 FRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQK---
.: .:. ::..::: : .:::::.:::: :.. . :.:.. : ..::. ::
CCDS56 YRLHGHPGCCYETAMTRHFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPS---VNLRERQQKMLQ
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 AAKKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIR
: ::..:.. .: :.::::. : :..: :. : :....: : ... ...
CCDS56 AFAKHNKMMKDCSAGKGFDRHLLGLLLIAKEEGLPVP---ELFTDP--LFSKSGGGGNFV
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 MFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIR
. . ..: . : :.. .::: : : .. . :. : ::.:... .
CCDS56 L--STSLVGYLRVQGVVVPMVHNGYGFFYHIR-DDRFVVACSAWKSCPETDAEKLVQLTF
550 560 570 580 590
560
pF1KE6 KALLDIADLFQVPKAYS
:. :. .:
CCDS56 CAFHDMIQLMNSTHL
600 610
>>CCDS47634.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 (640 aa)
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10 20 30
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYV
: ....::. . .:.. :. .. :..
CCDS47 DPDAKRGFLDLTREGIQVKPFANQEEYKKTEEIVQKFQSGIGEKLHQKLLERAKGKRNWL
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40 50 60 70 80
pF1KE6 SDWWEEYIYLRGRSPLMVNSNYYV----MDLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDR
.:: . :: : : ..: :. .. . .: : :.: . .: :
CCDS47 EEWWLNVAYLDVRIPSQLNVNFAGPAAHFEHYWPPKEGTQLER-GSITLWHNLNYWQLLR
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EEIKPVMALGIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHL----SDSR---HVAVYHKGRF
.: :: .: .:. :.. .:.: ..:: : ... :..: :..: .::
CCDS47 KEKVPVHKVGNTPLDMNQFRMLFSTCKVPGITRDSIMNYFRTESEGRSPNHIVVLCRGRA
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190
pF1KE6 FKL-WLYEGARLLKPQDLEMQFQRILDD--PSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFF
: . ..:: :. : .: :. : : :: .::::. :..::.::. ..
CCDS47 FVFDVIHEGC-LVTPPELLRQLTYIHKKCHSEPDGPG---IAALTSEERTRWAKAREYLI
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200 210 220 230 240 250
pF1KE6 S-SGKNKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTL
. . .: : :: :. . . .... : ::: . . :.: :. :: :::..:
CCDS47 GLDPENLALLEKIQSSLLVYSMEDSSPHVTPEDYSEII---AAILIGDPTVRWGDKSYNL
290 300 310 320 330 340
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAP-PTRL
:::.:: .: : .:: :: :. .. .: : . . . :. :. . : : .:
CCDS47 ISFSNGVFGCNCDHAPFDAMIMVNISYYV---D--EKIFQNEGRWKGSEKVRDIPLPEEL
350 360 370 380 390
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. . .... . :. : :.:... . : ::: : :. ::.:.:.:::::.
CCDS47 IFIVDEKVLNDINQAKAQYLREASDLQIAAYAFTSFGKKLTKNKMLHPDTFIQLALQLAY
400 410 420 430 440 450
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pF1KE6 FRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQK---
.: .:. ::..::: : .:::::.:::: :.. . :.:.. : ..::. ::
CCDS47 YRLHGHPGCCYETAMTRHFYHGRTETMRSCTVEAVRWCQSMQDPS---VNLRERQQKMLQ
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 AAKKHQNMYRLAMTGAGIDRHLFCLYLVSKYLGVSSPFLAEVLSEPWRLSTSQIPQSQIR
: ::..:.. .: :.::::. : :..: :. : :....: : ... ...
CCDS47 AFAKHNKMMKDCSAGKGFDRHLLGLLLIAKEEGLPVP---ELFTDP--LFSKSGGGGNFV
520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 MFDPEQHPNHLGAGGGFGPVADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIR
. . ..: . : :.. .::: : : .. . :. : ::.:... .
CCDS47 L--STSLVGYLRVQGVVVPMVHNGYGFFYHIR-DDRFVVACSAWKSCPETDAEKLVQLTF
570 580 590 600 610 620
560
pF1KE6 KALLDIADLFQVPKAYS
:. :. .:
CCDS47 CAFHDMIQLMNSTHL
630 640
>>CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (630 aa)
initn: 606 init1: 224 opt: 644 Z-score: 795.3 bits: 157.2 E(32554): 5.6e-38
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10 20 30 40
pF1KE6 MELLAKEFQDKTAPRLQKYLVLKSWWASNYVSDWWEEYIYLRGRS
::. :. .. ..:.::..: . .:: .:
CCDS72 CMRHLVSEEQFRKSQAIVQQFGAPGGLGETLQQKLLERQEKTANWVSEYWLNDMYLNNRL
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 PLMVNSNYYVM-DLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRRKLDREEIKPVMALGIV---PM
: :::. :. . .:: : ...: ... :. :: . : : : . :.
CCDS72 ALPVNSSPAVIFARQHFPGTDDQLRFAASLISGVLSYKALLDSHSIPTDCAKGQLSGQPL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150
pF1KE6 CSYQMERMFNTTRIPG--KDTDVLQHLS---DSRHVAVYHKGRFFKLWLYEGARLLKPQD
: :. .:.. :.:: .:: : :. : . .:: : ..:: : . . : :. :
CCDS72 CMKQYYGLFSSYRLPGHTQDTLVAQNSSIMPEPEHVIVACCNQFFVLDVVINFRRLSEGD
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERAAFFV
: :...:. : . .. ::. :: :::.:: .. ... :. .:. ::: .:
CCDS72 LFTQLRKIVKMASNEDERLPPIGLLTSDGRSEWAEARTVLVKDSTNRDSLDMIERCICLV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 ALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCY-----NRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHA
:: . : : . . ::::. : :::.:::. .. ..: :. ::.
CCDS72 CLDAPGGV-----ELSDTHRALQLLHGGGYSKNGANRWYDKSLQFVVGRDGTCGVVCEHS
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE6 WADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPA--LAPPTRLQWDI-PK-QAVIKS
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CCDS72 PFDGIVLVQCTEHLLK----HV--TQSSRKLIRADSVSELPAPRRLRWKCSPEIQGHLAS
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