FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6775, 635 aa
1>>>pF1KE6775 635 - 635 aa - 635 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5430+/-0.000964; mu= 18.1246+/- 0.058
mean_var=73.1388+/-15.006, 0's: 0 Z-trim(105.8): 33 B-trim: 472 in 1/48
Lambda= 0.149969
statistics sampled from 8585 (8611) to 8585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS13902.1 SLC5A1 gene_id:6523|Hs108|chr22 ( 664) 266 67.3 7.7e-11
>>CCDS1740.1 SLC5A6 gene_id:8884|Hs108|chr2 (635 aa)
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Smith-Waterman score: 4209; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FYRLHLTSAYEYLELRFNKTVRVCGTVTFIFQMVIYMGVVLYAPSLALNAVTGFDLWLSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEFSEARAIMLSRGLAFGYGLLCLGMAYISSQM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGSIVTSMG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SSMPPSPSNGSSFSLPTNLTVATVTTLMPLTTFSKPTGLQRFYSLSYLWYSAHNSTTVIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VGLIVSLLTGRMRGRSLNPATIYPVLPKLLSLLPLSCQKRLHCRSYGQDHLDTGLFPEKP
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610 620 630
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RNGVLGDSRDKEAMALDGTAYQGSSSTCILQETSL
610 620 630
>>CCDS9080.1 SLC5A8 gene_id:160728|Hs108|chr12 (610 aa)
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Smith-Waterman score: 1694; 46.4% identity (73.0% similar) in 593 aa overlap (17-594:3-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVGVSTSAPLSPTSGTSVGMSTFSIMDYVVFVLLLVLSLAIGLYHACRGWGRHTVGELL
: :..:: . :::::. .::.: :::.:.: : :..: ..:
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:. :.: .:::::: :.:.:::..::.:::.::::. . ... ::. ..: :..:.::
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::.: .::.:::::::::: ::.:::: :: : ..: :.:.:::.:::: ::::::: .:
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110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQHGR
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170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 ISGFELDPDPFVRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYAVFPF
.. ....:.:. ::::::. .::.: :.:::::.:::::.: ... : :: : .
CCDS90 LNFWNFNPNPLQRHTFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 MGPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGSIVTSM
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CCDS90 MGALLQAALSVFGMVGGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQI---
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: . .. :
CCDS90 YKSHPVEDGGTDNPAFNHIELNSDQSGKSNGTRL
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>>CCDS7860.2 SLC5A12 gene_id:159963|Hs108|chr11 (618 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVGVSTSAPLSPTSGTSVGMSTFSIMDYVVFVLLLVLSLAIGLYHACRGWGRHTVGELL
...:.. :::::. :. .: .::.. : . . : :.:
CCDS78 MEVKNFAVWDYVVFAALFFISSGIGVFFAIKERKKATSREFL
10 20 30 40
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pF1KE6 MADRKMGCLPVALSLLATFQSAVAILGVPSEIYRFGTQYWFLGCCYFLGLLIPAHIFIPV
.. :.:. ::.::: :.:.:::..::.:::.::::... . :.. .:. ...:.::
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CCDS78 FYRSGITSTYEYLQLRFNKPVRYAATVIYIVQTILYTGVVVYAPALALNQVTGFDLWGSV
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pF1KE6 LALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQHGR
.: ::::: : .:::::::.:::.:: .::..: :.:.: ::...::. : ... .:
CCDS78 FATGIVCTFYCTLGGLKAVVWTDAFQMVVMIVGFLTVLIQGSTHAGGFHNVLEQSTNGSR
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pF1KE6 ISGFELDPDPFVRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYAVFPF
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. : . . ::.:...... . .::::.. ::::... .:::::::.:: :
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pF1KE6 GPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGSIVTSMG
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CCDS78 GGVVQASLSIHGMCGGPMLGLFSLGIVFPFVNWKGALGGLLTGITLSFWVAIGAFIY---
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:.:.. ... :: :. . . ::. : . :.: . .::.:::.::: .
CCDS78 ----PAPAS-KTWPLPLSTDQCIKSNVTATGPPVLSSRPGIADTWYSISYLYYSAVGCLG
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pF1KE6 VIVVGLIVSLLTGRMRGRSLNPATIYPVLPKLLSLLPLSCQKRLHCRSYGQDHLDTGLFP
::.:.:.::.:::.::....: : :: .:. . : . . : : .: :.:
CCDS78 CIVAGVIISLITGRQRGEDIQPLLIRPVC-NLFCFW--SKKYKTLCWC-GVQH-DSGTEQ
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pF1KE6 EKPRNGVLGDSRDKEAMALDGTAYQGSSSTCILQETSL
:. .::
CCDS78 ENLENGSARKQGAESVLQNGLRRESLVHVPGYDPKDKSYNNMAFETTHF
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>>CCDS12368.1 SLC5A5 gene_id:6528|Hs108|chr19 (643 aa)
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Smith-Waterman score: 1499; 40.3% identity (69.7% similar) in 628 aa overlap (23-629:11-630)
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pF1KE6 MSVGVSTSAPLSPTSGTSVGMSTFSIMDYVVFVLLLVLSLAIGLYHACRGWGRHTVGELL
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CCDS12 MEAVETGERPTFGAWDYGVFALMLLVSTGIGLWVGLARGGQRSAEDFF
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pF1KE6 MADRKMGCLPVALSLLATFQSAVAILGVPSEIYRFGTQYWFLGCCYFLGLLIPAHIFIPV
. :... :::.::: :.:.::: .:::::: ::.: .. .. .:. .. : .:.::
CCDS12 TGGRRLAALPVGLSLSASFMSAVQVLGVPSEAYRYGLKFLWMCLGQLLNSVLTALLFMPV
50 60 70 80 90 100
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:::: :::.:::::.::...::.:::. .: ..: :.:.:::.: :: :::.:.: :.
CCDS12 FYRLGLTSTYEYLEMRFSRAVRLCGTLQYIVATMLYTGIVIYAPALILNQVTGLDIWASL
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 LALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQHGR
:. ::.:: :::.::.:::.::::::..::. : .:. : ::: .: ..:..:.:
CCDS12 LSTGIICTFYTAVGGMKAVVWTDVFQVVVMLSGFWVVLARGVMLVGGPRQVLTLAQNHSR
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 ISGFELDPDPFVRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYA--VF
:. ....::: :.::::.. ::... ::.:::::::::::.. :::: : :. :
CCDS12 INLMDFNPDPRSRYTFWTFVVGGTLVWLSMYGVNQAQVQRYVACRTEKQAKLALLINQVG
230 240 250 260 270 280
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: :: . : :.:::..: . . .::::.. .:.:... :::.::::.::
CCDS12 LFLIVSSAACC--GIVMFVFYTDCDPLLLGRISAPDQYMPLLVLDIFEDLPGVPGLFLAC
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 LFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEFSEARAIMLSRGLAFGYGLLCLGMAYISS
.::.::: :...:..:.::.::::.: . .. . ...:.::.. :: :: .: .::
CCDS12 AYSGTLSTASTSINAMAAVTVEDLIKPRLRSLAPRKLVIISKGLSLIYGSACLTVAALSS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 QMGP-VLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGSIVT
.: :::......:...::::: : ::::.: : ::...:: :::....:...:. .
CCDS12 LLGGGVLQGSFTVMGVISGPLLGAFILGMFLPACNTPGVLAGLGAGLALSLWVALGATLY
410 420 430 440 450 460
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. . .: : . ..: : : :. .. : . . :.:. . ::..
CCDS12 PPSEQTMRVLPSSAARCVALSVNASGLLDPALLPANDSSRAPSSGMDASRPALADSFYAI
470 480 490 500 510 520
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pF1KE6 SYLWYSAHNSTTVIVVGLIVSLLTGRMRGRSLNPATIYPVLPKLL-SLLPLSCQKRLHCR
:::.:.: .. :... : ..: ::: . .: :. .. : . :. : :
CCDS12 SYLYYGALGTLTTVLCGALISCLTGPTKRSTLAPGLLWWDLARQTASVAPKEEVAILDDN
530 540 550 560 570 580
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pF1KE6 SY-GQDHLDTGLFPEKPRNGVLGDSRDKEAM----ALDGTAYQGSSSTCILQETSL
: ..: :: .:: : : ..:. . :.:. :: . :.
CCDS12 LVKGPEELPTG--NKKP-PGFLPTNEDRLFFLGQKELEGA---GSWTPCVGHDGGRDQQE
590 600 610 620 630 640
CCDS12 TNL
>>CCDS59278.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 (569 aa)
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Smith-Waterman score: 395; 24.8% identity (57.0% similar) in 491 aa overlap (14-485:6-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVGVSTSAPLSPTSGTSVGMSTFSIMDYVVFVLLLVLSLAIGLYHACRGWGRHTVGELL
:: . . .:. : .:... ..:..:.:.. .::. .:.::. .
CCDS59 MAANSTSDLHTPGTQLSVADIIVITVYFALNVAVGIWSSCRA-SRNTVNGYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MADRKMGCLPVALSLLATFQSAVAILGVPSEIYRFGTQYWFLGCCYFLGLLIPAHIFIPV
.: : : :.. ::.:. ... ..:. . : . :: : .:.:.
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130 140 150 160 170
pF1KE6 FYRLHLTSAYEYLELRFN-KTVRVCGTV-TFIFQMVIYMGVVLYAPSLALNAVTGFDLWL
. .... ::.. :.. . .:. .: ...... ... ::: .: .. :....:
CCDS59 YISSEIVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSVFTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 S-VLALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQ
: .:.::: ::: . : :. . . ::: . . . .:. : ..
CCDS59 STILTLGI-----TALYTIAA------FDQIGGY-GQLEAAYAQAIP----SRTIANTTC
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pF1KE6 H-GRISGFELDPDPFVRHTFWT-LAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCY
: : ..... :: . :: ..:: ..: . ..:. ::: ::.: . : .
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. .... . . . :.. : . . : .: .: . : .::.:.
CCDS59 LASYLKMLPMGLIIMPGMISRALFPDDVGCVVPSECLRACGAEVGCSNIAYPKLVMELM-
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: :: ::.:: .... .:...: ::: .:. :. : :. .: . ....: . .
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:. ...:.: .:. : .. :. . .. :. ..: ::.:. :: :: ::.
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:::: .: .: . . ::
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10 20 30 40 50 60
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:: . . .:. : .:... ..:..:.:.. .::. .:.::. .
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.: : : :.. ::.:. ... ..:. . : . :: : .:.:.
CCDS59 LAGRDMTWWPIGASLFASSEGSGLFIGLAGSGAAGGLAVAGFEWNATYVLLALAWVFVPI
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. .... ::.. :.. . .:. .: ...... ... ::: .: .. :....:
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: .:.:::. ..:: ::: :::.::..:::.: .: . . : . ..:: :.. :. .:
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pF1KE6 ------------H-GRISGFELDPDPFVRHTFWT-LAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLS
: : ..... :: . :: ..:: ..: . ..:. ::: ::
CCDS59 AIPSRTIANTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLS
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.: . : : .. .: . ::.. ... :
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.::: ::.:: .... .:...: ::: .:. :. : :. .: . ....: .
CCDS59 SRALFPGLRGLMIAVMLAALMSSLTSIFNSSSTLFTMDIWRRLRPRSGERELLLVGRLVI
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. :. ...:.: .:. : .. :. . .. :. ..: ::.:. :: :: :
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:.:::: .: .: . . ::
CCDS59 LIAGLV----VGATRLVLEFLNPAPPCGEPDTRPAVLGSIHYLHFAVALFALSGAVVVAG
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:: . . .:. : .:... ..:..:.:.. .::. .:.::. .
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. .... ::.. :.. . .:. .: ...... ... ::: .: .. :....:
CCDS42 YISSEIVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSVFTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYL
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: .:.:::. ..:: ::: :::.::..:::.: .: . . : . ..:: :.. :. .:
CCDS42 STILTLGIT-ALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQ
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pF1KE6 ------------H-GRISGFELDPDPFVRHTFWT-LAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLS
: : ..... :: . :: ..:: ..: . ..:. ::: ::
CCDS42 AIPSRTIANTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLS
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.: . : . . .... . . . :.. : . . : .: .:
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. : .::.:. : :: ::.:: .... .:...: ::: .:. :. : :. .:
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. ....: . . :. ...:.: .:. : .. :. . .. :. ..: ::.:.
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:: :: ::.:::: .: .: . . ::
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. .... ::.. :.. . .:. .: ...... ... ::: .: .. :....:
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: .:.:::. ..:: ::: :::.::..:::.: .: . . : . ..:: :.. :. .:
CCDS11 STILTLGIT-ALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQ
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: : ..... :: . :: ..:: ..: . ..:. ::: ::
CCDS11 AIPSRTIANTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLS
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.: .. ...:. : ..:. . . : .:. ..: .: ... .:.....
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..:.. . : .::.:. : :: ::.:: .... .:...: ::: .
CCDS11 VVPSECLRACGAEVGCSNIAYPKLVMELM---PIGLRGLMIAVMLAALMSSLTSIFNSSS
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:. :. : :. .: . ....: . . :. ...:.: .:. : .. :.
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. .. :. ..: ::.:. :: :: ::.:::: .: .: . . ::
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CCDS11 RPAVLGSIHYLHFAVALFALSGAVVVAGSLLTPPPQSVQIENLTWWTLAQDVPLGTKAGD
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: :.:. : :.: . . .. . : .:.:: ... ::.::. . . : ::
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CCDS10 YFLAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAWIFL
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:.. ..:. :::. ::. . . .: ..: ... ..: .:: .. .. .::
CCDS10 PIYIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLHLDL
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CCDS10 YLAIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKEKYF
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:.::... : ..:.. ::.. : . :: . : . ..:. ::: :
CCDS10 LALASNRSENSSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTDQVIVQRTL
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.... . : . . .. . : . . :.: . . : :. . :.
CCDS10 AAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKICSNPSGCS
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pF1KE6 -LYFVMDLLKGLP-GLPGLFIACLFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEFSEARA
. . .:. :: :: ::..: . .. .:...: ::: .:. :: :. :: .
CCDS10 DIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLRPRASEKEL
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pF1KE6 IMLSRGLAFGYGLLCLGMAYI----SSQMGPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCA
....: .: :. ... .: .:: : .. :: ... :. .: .: :. .
CCDS10 MIVGR--VFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQLFIYIQSISSYLQPPVAVVFIMGCFWKRT
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pF1KE6 NPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGSIVTSMGSSMPPS--PSNGSSFS-LPTNLTVATVT--T
: :: ::..::.... . ... . :. : .:. : .. ..::: :
CCDS10 NEKGAFWGLISGLLLGLVRLVLDFIYVQPRCDQPDERPVLVKSIHYLYFSMILSTVTLIT
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. .. :..: . . :. :.. :.
CCDS10 VSTVSWFTEPPSKEMVSHLT--WFTRHDPVVQKEQAPPAAPLSLTLSQNGMPEASSSSSV
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CCDS13 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKT-NRGTIGGFF
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CCDS13 LAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIFVPI
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. . . . :::. ::. . ..: .. .: :. . .. ..: .. .. . :.::.:
CCDS13 YIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLDLYL
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... : . .:::. ::: .::.::..::..:..:.. .. . .::: : :
CCDS13 AIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKYVNA
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pF1KE6 VAS----QHGRISGFELDPDPFVRHTF---------WT-LAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQ
. : .. ::. : : : : . :: . : . .::. ::
CCDS13 TPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTNQVIVQ
240 250 260 270 280 290
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