Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6764, 950 aa
1>>>pF1KE6764 950 - 950 aa - 950 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1447+/-0.000408; mu= 18.3953+/- 0.026
mean_var=111.3632+/-22.404, 0's: 0 Z-trim(115.4): 356 B-trim: 176 in 1/49
Lambda= 0.121536
statistics sampled from 25391 (25772) to 25391 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 10.050
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_620686 (OMIM: 607509) A disintegrin and metallo ( 950) 6692 1185.1 0
XP_005271476 (OMIM: 607509) PREDICTED: A disintegr ( 619) 4447 791.3 0
NP_008968 (OMIM: 605175) A disintegrin and metallo ( 889) 2660 478.1 8.6e-134
NP_008919 (OMIM: 605174) A disintegrin and metallo ( 967) 2642 475.0 8.1e-133
NP_005090 (OMIM: 603876) A disintegrin and metallo ( 837) 2380 429.0 4.9e-119
NP_008969 (OMIM: 605007) A disintegrin and metallo ( 930) 2235 403.6 2.4e-111
NP_891550 (OMIM: 605421) A disintegrin and metallo (1935) 2222 401.6 2e-110
NP_001305710 (OMIM: 605421) A disintegrin and meta (1907) 2130 385.5 1.4e-105
NP_001307265 (OMIM: 603876) A disintegrin and meta ( 846) 2091 378.3 8.9e-104
NP_079279 (OMIM: 611681) A disintegrin and metallo (1910) 2080 376.7 6.2e-103
XP_011537056 (OMIM: 611681) PREDICTED: A disintegr (1911) 2070 374.9 2.1e-102
XP_016875468 (OMIM: 611681) PREDICTED: A disintegr (1506) 1502 275.3 1.7e-72
XP_016872634 (OMIM: 605175) PREDICTED: A disintegr ( 873) 1491 273.1 4.3e-72
XP_011527750 (OMIM: 605007) PREDICTED: A disintegr ( 874) 1403 257.7 1.9e-67
XP_016865552 (OMIM: 225410,604539) PREDICTED: A di (1046) 1324 243.9 3.2e-63
NP_055059 (OMIM: 225410,604539) A disintegrin and (1211) 1324 244.0 3.5e-63
NP_055087 (OMIM: 605009) A disintegrin and metallo (1686) 1297 239.4 1.2e-61
XP_005254194 (OMIM: 605009) PREDICTED: A disintegr (1689) 1297 239.4 1.2e-61
NP_955387 (OMIM: 607512,615458) A disintegrin and (1221) 1272 234.9 2e-60
XP_011521226 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di ( 978) 1270 234.4 2.1e-60
XP_011521225 (OMIM: 607512,615458) PREDICTED: A di (1049) 1270 234.4 2.3e-60
NP_001313287 (OMIM: 607512,615458) A disintegrin a (1049) 1270 234.4 2.3e-60
XP_011530724 (OMIM: 605011) PREDICTED: A disintegr (1177) 1269 234.3 2.8e-60
XP_011530723 (OMIM: 605011) PREDICTED: A disintegr (1186) 1269 234.3 2.8e-60
NP_055058 (OMIM: 605011) A disintegrin and metallo (1205) 1269 234.3 2.8e-60
NP_620687 (OMIM: 607510) A disintegrin and metallo (1224) 1266 233.8 4.1e-60
XP_011537605 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 820) 1211 224.0 2.4e-57
XP_011537602 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr (1056) 1211 224.1 3e-57
NP_631894 (OMIM: 607506) A disintegrin and metallo (1226) 1211 224.2 3.3e-57
XP_011537608 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 791) 1203 222.6 6.3e-57
XP_011537610 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 791) 1203 222.6 6.3e-57
XP_011537609 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 791) 1203 222.6 6.3e-57
XP_011537607 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 807) 1203 222.6 6.4e-57
NP_542453 (OMIM: 607506) A disintegrin and metallo (1223) 1205 223.1 6.8e-57
XP_011541424 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 827) 1177 218.1 1.5e-55
XP_011541423 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 863) 1177 218.1 1.6e-55
XP_011541422 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 868) 1177 218.1 1.6e-55
XP_011541421 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 892) 1177 218.1 1.6e-55
XP_011541419 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 966) 1177 218.1 1.7e-55
XP_011541415 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1117) 1177 218.2 1.9e-55
XP_011541416 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr (1117) 1177 218.2 1.9e-55
NP_922932 (OMIM: 605008) A disintegrin and metallo (1117) 1177 218.2 1.9e-55
NP_001311441 (OMIM: 606184) A disintegrin and meta (1509) 1173 217.6 3.9e-55
NP_112219 (OMIM: 277600,608990) A disintegrin and (1103) 1108 206.1 8.3e-52
XP_016882827 (OMIM: 277600,608990) PREDICTED: A di (1103) 1108 206.1 8.3e-52
NP_112217 (OMIM: 606184) A disintegrin and metallo (1594) 1106 205.8 1.4e-51
XP_016865394 (OMIM: 606184) PREDICTED: A disintegr (1631) 1106 205.9 1.4e-51
XP_011541425 (OMIM: 605008) PREDICTED: A disintegr ( 738) 1093 203.3 3.8e-51
XP_016865395 (OMIM: 606184) PREDICTED: A disintegr (1467) 1096 204.1 4.4e-51
XP_011537604 (OMIM: 607506) PREDICTED: A disintegr ( 914) 1087 202.3 9.3e-51
>>NP_620686 (OMIM: 607509) A disintegrin and metalloprot (950 aa)
initn: 6692 init1: 6692 opt: 6692 Z-score: 6343.4 bits: 1185.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6692; 100.0% identity (100.0% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLLLGILTLAFAGRTAGGSEPEREVVVPIRLDPDINGRRYYWRGPEDSGDQGLIFQITAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 MLLLGILTLAFAGRTAGGSEPEREVVVPIRLDPDINGRRYYWRGPEDSGDQGLIFQITAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QEDFYLHLTPDAQFLAPAFSTEHLGVPLQGLTGGSSDLRRCFYSGDVNAEPDSFAAVSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 QEDFYLHLTPDAQFLAPAFSTEHLGVPLQGLTGGSSDLRRCFYSGDVNAEPDSFAAVSLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GGLRGAFGYRGAEYVISPLPNASAPAAQRNSQGAHLLQRRGVPGGPSGDPTSRCGVASGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GGLRGAFGYRGAEYVISPLPNASAPAAQRNSQGAHLLQRRGVPGGPSGDPTSRCGVASGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NPAILRALDPYKPRRAGFGESRSRRRSGRAKRFVSIPRYVETLVVADESMVKFHGADLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 NPAILRALDPYKPRRAGFGESRSRRRSGRAKRFVSIPRYVETLVVADESMVKFHGADLEH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YLLTLLATAARLYRHPSILNPINIVVVKVLLLRDRDSGPKVTGNAALTLRNFCAWQKKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 YLLTLLATAARLYRHPSILNPINIVVVKVLLLRDRDSGPKVTGNAALTLRNFCAWQKKLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KVSDKHPEYWDTAILFTRQDLCGATTCDTLGMADVGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 KVSDKHPEYWDTAILFTRQDLCGATTCDTLGMADVGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 HELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRANHMMSPTLIQIDRANPWSACSAAIITDFLDSGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 HELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRANHMMSPTLIQIDRANPWSACSAAIITDFLDSGHG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 DCLLDQPSKPISLPEDLPGASYTLSQQCELAFGVGSKPCPYMQYCTKLWCTGKAKGQMVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 DCLLDQPSKPISLPEDLPGASYTLSQQCELAFGVGSKPCPYMQYCTKLWCTGKAKGQMVC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QTRHFPWADGTSCGEGKLCLKGACVERHNLNKHRVDGSWAKWDPYGPCSRTCGGGVQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 QTRHFPWADGTSCGEGKLCLKGACVERHNLNKHRVDGSWAKWDPYGPCSRTCGGGVQLAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 RQCTNPTPANGGKYCEGVRVKYRSCNLEPCPSSASGKSFREEQCEAFNGYNHSTNRLTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RQCTNPTPANGGKYCEGVRVKYRSCNLEPCPSSASGKSFREEQCEAFNGYNHSTNRLTLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 VAWVPKYSGVSPRDKCKLICRANGTGYFYVLAPKVVDGTLCSPDSTSVCVQGKCIKAGCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VAWVPKYSGVSPRDKCKLICRANGTGYFYVLAPKVVDGTLCSPDSTSVCVQGKCIKAGCD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GNLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIRQRGYKGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GNLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIRQRGYKGLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 GDDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSAVERDLVVKGSLLRYSGTGTAVESLQASRPILEPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 GDDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSAVERDLVVKGSLLRYSGTGTAVESLQASRPILEPLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 VEVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEPREDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 VEVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEPREDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 ARWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRGSAGQRTVPACDAAHRPVETQACGEPCPTWELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ARWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRGSAGQRTVPACDAAHRPVETQACGEPCPTWELS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KE6 AWSPCSKSCGRGFQRRSLKCVGHGGRLLARDQCNLHRKPQELDFCVLRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 AWSPCSKSCGRGFQRRSLKCVGHGGRLLARDQCNLHRKPQELDFCVLRPC
910 920 930 940 950
>>XP_005271476 (OMIM: 607509) PREDICTED: A disintegrin a (619 aa)
initn: 4447 init1: 4447 opt: 4447 Z-score: 4218.5 bits: 791.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4447; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (332-950:1-619)
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VSDKHPEYWDTAILFTRQDLCGATTCDTLGMADVGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTAH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MADVGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTAH
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRANHMMSPTLIQIDRANPWSACSAAIITDFLDSGHGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRANHMMSPTLIQIDRANPWSACSAAIITDFLDSGHGD
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 CLLDQPSKPISLPEDLPGASYTLSQQCELAFGVGSKPCPYMQYCTKLWCTGKAKGQMVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CLLDQPSKPISLPEDLPGASYTLSQQCELAFGVGSKPCPYMQYCTKLWCTGKAKGQMVCQ
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 TRHFPWADGTSCGEGKLCLKGACVERHNLNKHRVDGSWAKWDPYGPCSRTCGGGVQLARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TRHFPWADGTSCGEGKLCLKGACVERHNLNKHRVDGSWAKWDPYGPCSRTCGGGVQLARR
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 QCTNPTPANGGKYCEGVRVKYRSCNLEPCPSSASGKSFREEQCEAFNGYNHSTNRLTLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QCTNPTPANGGKYCEGVRVKYRSCNLEPCPSSASGKSFREEQCEAFNGYNHSTNRLTLAV
220 230 240 250 260 270
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 AWVPKYSGVSPRDKCKLICRANGTGYFYVLAPKVVDGTLCSPDSTSVCVQGKCIKAGCDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AWVPKYSGVSPRDKCKLICRANGTGYFYVLAPKVVDGTLCSPDSTSVCVQGKCIKAGCDG
280 290 300 310 320 330
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 NLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIRQRGYKGLIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIRQRGYKGLIG
340 350 360 370 380 390
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 DDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSAVERDLVVKGSLLRYSGTGTAVESLQASRPILEPLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSAVERDLVVKGSLLRYSGTGTAVESLQASRPILEPLTV
400 410 420 430 440 450
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 EVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEPREDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEPREDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPPA
460 470 480 490 500 510
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 RWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRGSAGQRTVPACDAAHRPVETQACGEPCPTWELSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRGSAGQRTVPACDAAHRPVETQACGEPCPTWELSA
520 530 540 550 560 570
910 920 930 940 950
pF1KE6 WSPCSKSCGRGFQRRSLKCVGHGGRLLARDQCNLHRKPQELDFCVLRPC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSPCSKSCGRGFQRRSLKCVGHGGRLLARDQCNLHRKPQELDFCVLRPC
580 590 600 610
>>NP_008968 (OMIM: 605175) A disintegrin and metalloprot (889 aa)
initn: 2667 init1: 785 opt: 2660 Z-score: 2523.0 bits: 478.1 E(85289): 8.6e-134
Smith-Waterman score: 2828; 46.4% identity (73.7% similar) in 918 aa overlap (1-895:15-888)
10 20 30 40
pF1KE6 MLLLGILTLAFAG--RTAGGSEPEREVVVPIRLDPDINGRRYYWRG
.::: .: :: .. : :.:.. :.::: ::
NP_008 MLPAPAAPRWPPLLLLLLLLLPLARGAPARPAAGGQAS-ELVVPTRL-------------
10 20 30 40
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 PEDSGDQGLIFQITAFQEDFYLHLTPDAQFLAPAFSTEHLGVPLQGLTGGSSDLRRCFYS
: ..:. : ....:: . : :.:.:: .:::: :. :.:: .. ::: :: ::.:
NP_008 PGSAGE--LALHLSAFGKGFVLRLAPDDSFLAPEFKIERLGGSGRA-TGGERGLRGCFFS
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 GDVNAEPDSFAAVSLCGGLRGAFGYRGAEYVISPLPNASAPAAQRNSQGAHLLQRRGVPG
: ::.::.:.:::::: :: :.: : :..:.: .:.. :: : ::: : :.
NP_008 GTVNGEPESLAAVSLCRGLSGSFLLDGEEFTIQP-QGAGGSLAQ-----PHRLQRWG-PA
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KE6 GPSGDPTS-RCGVASGWNPAILRA---LDPYKPRRAGFGESRSRR-----RSGRAKRFVS
: : . . : .: . :. : . . .:. :. ..:.:::::
NP_008 GARPLPRGPEWEVETGEGQRQERGDHQEDSEEESQEEEAEGASEPPPPLGATSRTKRFVS
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 IPRYVETLVVADESMVKFHGADLEHYLLTLLATAARLYRHPSILNPINIVVVKVLLLRDR
:.::::.::: ::. :.::::....:::...:::.:.:::: : ::..:::::...:.
NP_008 EARFVETLLVADASMAAFYGADLQNHILTLMSVAARIYKHPSIKNSINLMVVKVLIVEDE
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DSGPKVTGNAALTLRNFCAWQKKLNKVSDKHPEYWDTAILFTRQDLCGAT-TCDTLGMAD
::.:. :..::::::: ::...:. ::.:::..:::::.:::..:: :::::.::
NP_008 KWGPEVSDNGGLTLRNFCNWQRRFNQPSDRHPEHYDTAILLTRQNFCGQEGLCDTLGVAD
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 VGTMCDPKRSCSVIEDDGLPSAFTTAHELGHVFNMPHDNVKVCEEVFGKLRANHMMSPTL
.::.:::..:::::::.:: .: : :::::::..::::. : : ..:: . .:.:.: .
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...... ::: ::: .:..::.:::::::: :. . :: ::: : : :.:::. :
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: . :: .. :..::: . .. .:.:.. .:::::: :: :.:: .:.:. .
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..... . .::.:: : :.: ::::::::::...:.: .: : :::.:: : :.::.::
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: : . . :. .... :: . :.:: :.:. ::..::.: :.:.:
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pF1KE6 QGKCIKAGCDGNLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSID
.:::...:::: .::: ..::::::::::.:: :..: :.: .::. :: :: ::. :
NP_008 RGKCVRTGCDGIIGSKLQYDKCGVCGGDNSSCTKIVGTFNKKSKGYTDVVRIPEGATHIK
700 710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 IRQRGYKGLIGDDNYLALKNSQGKYLLNGHFVVSAVERDLVVKGSLLRYSGTGTAVESLQ
.:: : :::::...:.::.::....:. : . ..:... ::: . . :.
NP_008 VRQFKAKDQTRFTAYLALKKKNGEYLINGKYMISTSETIIDINGTVMNYSGWSHRDDFLH
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820
pF1KE6 AS--RPILEPLTVEVLSVGKMTPPRVRYSFYLPKEPREDKSSHPKDPRGPSVLHNSVLSL
. : : :..:.. : :::::..:: ::. :.: ::: :
NP_008 GMGYSATKEILIVQILATDPTKPLDVRYSFFVPK-----KST-------PKV--NSVTSH
820 830 840 850 860
830 840 850 860 870 880
pF1KE6 -SNQVEQPDDRPPARWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRGSAGQRTVPACDAAHRPVET
::.: . ..: .::.: : :: .: .: . :.:.:. ..... . .: ..::
NP_008 GSNKVGSHTSQP--QWVTGPWLACSRTCDTGWHTRTVQCQ-DGNRKLAKGCPLSQRPSAF
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890 900 910 920 930 940
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. :
NP_008 KQCLLKKC
930
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....:: ..: ..:: .: :.:: :.. :
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150 160 170 180
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. . ..... :.. ::..: . : . : :. :
NP_891 SMDEQEDEEEQNKPHIIYRRSAPQREPSTGRHACDTSEHKNRHSKDKKKTRARKWGERIN
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190 200 210 220 230
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. ::. .: ..:. .: .: :.:::.: ::.::.:::::. ::..:
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: .:.::.:::.. .: .:. ::: : ::::.:..........::... :: ::.:::
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::.. :. . : :::.:.::::.: : :::::.:..::.::: ::::. ::.::
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:::.:.:.:::..: :.: :: .::: :....:::: :: ::. ::::. : .:::..
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. :.:.: :::::: : :: : : :: .. .. .::::..:.:.: :::::
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pF1KE6 KCIKAGCDGNLGSKKRFDKCGVCGGDNKSCKKVTGLFTKPMHGYNFVVAIPAGASSIDIR
: .:::: :.:: : ::::::::::.::: :.: :. .::: :: :::::..::.:
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: . : ..::::::. : ::::: .: : . .. .:: : : .: .
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:.:. : :: : :: ..: . :::.:: : . . :
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:.. . :.. .: . . :. : : :. :::. ::::: : :::
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::. . .: ..:. :.. .. : :
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:. . :: . ::: . :. :: :. :: :: .::.: :.. ::... .
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:: : .: :: ::..:..: :.:.: :. : :. : .: : .:
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: .. :.. : .: . : : :: :. .::: :: ::::: :.: . :
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150 160 170 180
pF1KE6 NASAPAAQRNSQGAHLLQRRGVPGGPSGDPTSRCGV---------------ASGWNPAI-
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pF1KE6 ----LRALDPYKPRRA--GFGE----SRSRRRSGRAKRFVSIPRYVETLVVADESMVKFH
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NP_001 QHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGSETAVERINST
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::. . .: ..:. :.. .. : :
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initn: 688 init1: 211 opt: 295 Z-score: 277.5 bits: 63.7 E(85289): 1e-08
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pF1KE6 SSHPKDPRGPSVLHNSVLSLSNQVEQPDDRPPARWVAGSWGPCSASCGSGLQKRAVDCRG
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:. . :: . ::: . :. :: :. :: :: .::.: :.. ::... .
NP_001 ENGSVADESACATLPRPVAKEECSVTPCGQWKALDWSSCSVTCGQGRATRQVMCVNYSDH
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: ..: .... .:.. .:: : ::. .
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:: : .: :: ::..:..: :.:.: :. : :. : .: : .:
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:
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: : : : .: :. ::.::: : ..: :
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.. :::.:.:.. :.. .: : :.: .: .: : : :
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.: : :
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. :::.:.::.:.:.. :. ::.. .::.::: .:: . :. :: :::: ::::::.
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.:::.. .:.::: :.. ::.:::.: : ::: :. .. ..::::.:. :::: :.:
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.:. .:.. . ::: ::
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NP_079 EEMCDQSTRPCSQRRCWSQDCVQHKGMERGRLNCSTSCERKDSHQRMECTDNQIRQVNEI
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950 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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