Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6763
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6763, 840 aa
1>>>pF1KE6763 840 - 840 aa - 840 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8917+/-0.00119; mu= 17.8895+/- 0.071
mean_var=77.9110+/-15.416, 0's: 0 Z-trim(103.1): 27 B-trim: 45 in 2/47
Lambda= 0.145303
statistics sampled from 7256 (7266) to 7256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 ( 840) 5577 1179.5 0
CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 831) 3536 751.6 1.3e-216
CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 837) 3535 751.4 1.5e-216
CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 838) 3534 751.2 1.7e-216
CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 830) 2571 549.3 9.9e-156
CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 ( 856) 2248 481.6 2.5e-135
CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 614) 2069 444.0 3.7e-124
>>CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 (840 aa)
initn: 5577 init1: 5577 opt: 5577 Z-score: 6314.8 bits: 1179.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5577; 99.9% identity (99.9% similar) in 840 aa overlap (1-840:1-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
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CCDS58 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LERILRFLEDEMQNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQ
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CCDS58 GFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQSK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 WSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 MKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWCC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 FDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKPF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 ILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNFGDVF
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CCDS58 ILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNFGDVF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 VHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIVGVFI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
790 800 810 820 830 840
>>CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (831 aa)
initn: 3490 init1: 1574 opt: 3536 Z-score: 4002.6 bits: 751.6 E(32554): 1.3e-216
Smith-Waterman score: 3542; 61.6% identity (85.1% similar) in 844 aa overlap (1-840:1-831)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
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CCDS11 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
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CCDS11 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR
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CCDS11 NFLELTELKFILRKTQQFFD---EMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINR
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC
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CCDS11 ERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV
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CCDS11 EGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQS
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CCDS11 RKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVML
. .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS11 NQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGS
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CCDS11 LFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSY
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CCDS11 SWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 KMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWC
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CCDS11 KMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 CFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKP
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CCDS11 AYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 FILRASH-RKSQLQASRIQEDATENIEGD--SSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGEEFNF
..:: .. :...: .: :. : ...:. .... . : .. .. ..::.:
CCDS11 LVLRRQYLRRKHL--------GTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDF
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 GDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIV
::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::.... .: .
CCDS11 GDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE6 GVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDG
.:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: ::::.:: .:
CCDS11 VLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREG
770 780 790 800 810 820
840
pF1KE6 TAEE
::
CCDS11 KFEE
830
>>CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (837 aa)
initn: 3537 init1: 1574 opt: 3535 Z-score: 4001.4 bits: 751.4 E(32554): 1.5e-216
Smith-Waterman score: 3537; 61.7% identity (84.2% similar) in 852 aa overlap (1-840:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
: .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: :::::::::::::
CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::.
CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGVINR
.::::::::..:.:::.::. ..:: . :..:.::: . . .:::.::::::
CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFD---EMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGVINR
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKIC
::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::....::::
CCDS45 ERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKV
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CCDS45 EGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 QKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTTVQS
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CCDS45 RKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVML
. .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS45 NQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGILMT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGS
: :.::.: : :.::::..::...: : :::.:::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS45 LFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSY
::::.::: . .:. .... . :::.::.::: ::.:::::::::::.:.::::::::.
CCDS45 SWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 KMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKWC
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CCDS45 KMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 CFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIKP
.:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. ::::::.::
CCDS45 AYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE6 FILRASH-RKSQLQAS-----RI-----QEDATENIEGDSSSPSSRSGQRTSADTHGALD
..:: .. :...: . :. .::: : :. :. : :..... : :
CCDS45 LVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDA-EIIQHDQLSTHSEDADEPSED------
660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KE6 DHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQ
: :.:::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::.
CCDS45 ---EVFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLS
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KE6 TRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPF
... .: . .:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: ::
CCDS45 VKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPF
770 780 790 800 810 820
830 840
pF1KE6 SFKHILDGTAEE
::.:: .: ::
CCDS45 SFEHIREGKFEE
830
>>CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (838 aa)
initn: 3471 init1: 1574 opt: 3534 Z-score: 4000.2 bits: 751.2 E(32554): 1.7e-216
Smith-Waterman score: 3540; 61.6% identity (84.9% similar) in 848 aa overlap (1-840:1-838)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
: .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: :::::::::::::
CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::.
CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFF-ETETN---LADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAG
.::::::::..:.:::.:: :.: . .:: . :..:.::: . . .:::.::
CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VINRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKI
::::::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::....
CCDS45 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KKICDGFRATVYPCPERAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSW
::::.::::..::::: ::.:: .::.:..:: :..:::.::::.:: :: : . :
CCDS45 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
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300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LIKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMT
.:::.::::.:: ::.:::::::.:.:::.: ::.: :. ::..: : :::.. :..
CCDS45 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 TVQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHG
.:.. .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: :::
CCDS45 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 TVMLLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN
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CCDS45 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
430 440 450 460 470 480
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pF1KE6 IFGSSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTF
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CCDS45 IFGSSWSVRPMF-TYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTF
490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 LNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMII
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CCDS45 LNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIF
540 550 560 570 580 590
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pF1KE6 FKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWML
.:: .:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. :::::
CCDS45 YKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWML
600 610 620 630 640 650
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pF1KE6 LIKPFILRASH-RKSQLQASRIQEDATENIEGD--SSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGE
:.::..:: .. :...: .: :. : ...:. .... . : .. .. ..
CCDS45 LFKPLVLRRQYLRRKHL--------GTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAD
660 670 680 690 700 710
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pF1KE6 EFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGW
::.:::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::....
CCDS45 EFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSL
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pF1KE6 GGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKH
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CCDS45 AGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEH
780 790 800 810 820 830
840
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: .: ::
CCDS45 IREGKFEE
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CCDS81 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA
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CCDS81 QLHQLQLHAAVLRQGH---EPQLAAAHTDGASERTPLLQAPGGP-HQDLRVNFVAGAVEP
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CCDS81 HKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRKIT
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: :. :.: .. : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..:
CCDS81 DCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQV
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CCDS81 HKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVAH---RIP
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. :::. :::.:::.::.:::::::: :.:.:::::::::::::::::::: ::: .:
CCDS81 CRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLM
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pF1KE6 LLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFG
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CCDS81 FLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFP
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pF1KE6 SSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNS
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CCDS81 SGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLG-PYPFGIDPIWSLAANHLSFLNS
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pF1KE6 YKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMIIFKW
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CCDS81 FKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKW
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pF1KE6 CCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWMLLIK
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CCDS81 LCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPS-NRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGT
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pF1KE6 PFILRASHRKSQLQASRIQEDATENIEGDSSSP-SSRSGQRTSADTHGALDDHGE-EFNF
:. : ::. .:. : . :: : . : .: .: .. . :.:::. : :.
CCDS81 PLHLLHRHRR-RLR-RRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVP
660 670 680 690 700
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pF1KE6 GDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGWGGIV
..:..::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::: :: :..
CCDS81 SEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVA
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pF1KE6 GVFI--IFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHIL
.: . :::.:::.::::::.::::::::::::::::::::::: : :::.:::.:
CCDS81 AVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATD
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840
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CCDS81 D
830
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CCDS92 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
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pF1KE6 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
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CCDS92 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
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pF1KE6 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV
..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:.
CCDS92 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL
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::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.:
CCDS92 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK
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:::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: .
CCDS92 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV
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CCDS92 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI
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. .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: :::
CCDS92 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF
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::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.:
CCDS92 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN
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.:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.:::::
CCDS92 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI
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::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.::
CCDS92 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC
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pF1KE6 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV
.::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..:
CCDS92 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV
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pF1KE6 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT
.. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :..
CCDS92 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ
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pF1KE6 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW
: : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS92 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW
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pF1KE6 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV
.:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS92 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV
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pF1KE6 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
: : :: ::::
CCDS92 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA
840 850
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pF1KE6 ICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIKKICDGFRATVYPCPE
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CCDS53 MTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPFLQ
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pF1KE6 RAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWLIKVQKMKAVYHILNM
. : :.... . ..: :. .:: ...: .. ..:.:::::: ::.
CCDS53 QEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLALNQ
40 50 60 70 80 90
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pF1KE6 CNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRAL-EQGMELSGSSMAPIMTTVQSKTAPPTFNRTN
:....:..:.::: : : : ...:: ...:: . :..: . . :::. :::
CCDS53 CSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEGVSAVA---HRIPCRDMPPTLIRTN
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pF1KE6 KFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGTVMLLAALWMILNER
.:::.::.:::::::: :.:.:::::::::::::::::::: ::: .:.: :: :.: :
CCDS53 RFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAEN
150 160 170 180 190 200
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pF1KE6 RLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVQPMFRNG
: . ..::::.:::.::::.::::.::::::.:::.:::.. .:: :.::: : ..
CCDS53 RPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQS
210 220 230 240 250 260
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pF1KE6 TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIV
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CCDS53 GWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLG-PYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVV
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.:.:::.:..:::..: . ..:. .::. :.: :::::::..:.:: : . . ::
CCDS53 HMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAP
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::::::::::::..: : : :: .:. ::. .::.:: :: .:: :. : ::. .
CCDS53 SILIHFINMFLFSHSPS-NRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRR-R
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CCDS53 LR-RRPADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTI
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CCDS53 EFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFA
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pF1KE6 VLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
:.::::::.::::::::::::::::::::::: : :::.:::.:
CCDS53 VMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
570 580 590 600 610
840 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:08:33 2016 done: Tue Nov 8 16:08:34 2016
Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]