FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6759, 543 aa
1>>>pF1KE6759 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5242+/-0.000824; mu= 16.8757+/- 0.049
mean_var=63.1392+/-12.859, 0's: 0 Z-trim(106.5): 78 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.161408
statistics sampled from 8967 (9046) to 8967 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 3652 859.2 0
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CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 1224 293.8 3.2e-79
CCDS81906.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 483) 917 222.3 1e-57
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 772 188.6 1.5e-47
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 737 180.4 4.6e-45
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CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 631 155.7 1e-37
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 602 149.0 1.2e-35
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 588 145.7 1.2e-34
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 574 142.5 1.1e-33
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 573 142.2 1.3e-33
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 570 141.5 2.2e-33
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 564 140.1 5.7e-33
CCDS5319.2 CYP2W1 gene_id:54905|Hs108|chr7 ( 490) 536 133.6 5.2e-31
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 535 133.4 5.4e-31
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 534 133.2 7.2e-31
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 525 131.1 3.1e-30
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 447 112.9 8.6e-25
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 447 112.9 9.1e-25
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 368 94.5 3.2e-19
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 355 91.5 2.7e-18
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CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 336 87.1 5.7e-17
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 335 86.8 6.7e-17
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 324 84.3 4e-16
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 322 83.8 5.5e-16
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 317 82.6 1.2e-15
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 314 81.9 2e-15
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 306 80.1 7.1e-15
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 298 78.2 2.1e-14
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 299 78.4 2.2e-14
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 297 77.9 2.3e-14
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CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 294 77.3 4.9e-14
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 294 77.3 4.9e-14
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 294 77.3 5.2e-14
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 289 76.1 1.1e-13
CCDS45303.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 363) 281 74.2 3e-13
CCDS32291.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 521) 281 74.2 4.1e-13
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 271 71.9 2e-12
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 270 71.7 2.2e-12
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 270 71.7 2.5e-12
>>CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 3652 init1: 3652 opt: 3652 Z-score: 4591.0 bits: 859.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3652; 99.8% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEHWKVQRRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEHWKVQRRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVGAGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVGAGSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAFILSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAFILSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQL
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FVNQWSVNHDPLKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNLQAKE
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 TCQ
:::
CCDS17 TCQ
>>CCDS10268.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 (512 aa)
initn: 1175 init1: 626 opt: 1277 Z-score: 1602.5 bits: 306.2 E(32554): 6.1e-83
Smith-Waterman score: 1277; 40.1% identity (70.8% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
: :.:.. : .:: .. : : : . . . ::::..::::
CCDS10 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
CCDS10 GHMLTLGKNPHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
CCDS10 YTFTLISNGQSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. :. :.. :..::..::
CCDS10 LISTLQELMAGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.::: ..:.. ::..: .:. .: .... : ::. :..
CCDS10 SGNPADFIPILRYLPNPSLNAFKD---LNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHI-RDITDSL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
CCDS10 IEHCQEKQLDEN--ANVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::.:: .::. :..:::
CCDS10 QEELDTVIGRSRRPRLSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELS
::::::..::: : :: .: : ::: :: :.: :. .:.::..:::.:::: ..
CCDS10 GRCVFVNQWQINHDQKLWVNPSEFLPERFLTPDGAIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 KMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIKPKSFKVNVTLRESMELLDSAVQNL
. ..:::..:: .. .: . . . :. ::::.:
CCDS10 RWEVFLFLAILLQRVEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
470 480 490 500 510
540
pF1KE6 QAKETCQ
>>CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 (516 aa)
initn: 1168 init1: 497 opt: 1224 Z-score: 1535.7 bits: 293.8 E(32554): 3.2e-79
Smith-Waterman score: 1224; 38.4% identity (70.5% similar) in 518 aa overlap (15-526:8-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
:.: : ::: ... : . :: : . ..:: :..:::.
CCDS32 MALSQSVPFSA--TELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:.. ..:. ::...:...:::::.:::.:: :..::. .:.::::.::. : :: .
CCDS32 GHVLTLGKNPHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
. ... :.:..:. : : ..:: :.. . .: .. .: : . :: :: .::.
CCDS32 YTSTLITDGQSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . .:: .::.::::..:.::: .. ... :. :.....:: .:..
CCDS32 LISRLQELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETAS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.:::. ...:. .:. : :. .: ... ... ::. :.
CCDS32 SGNPLDFFPILRYLPNPA---LQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSV-RDITGAL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
. ..: ...: . :.. ..:::::. ::..::..: :. .. :..: ..
CCDS32 FKHSKK----GPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:.:.:::. ::. :..: :::.: ::::.:: .:.. :..:::
CCDS32 QKELDTVIGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGL-INKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEEL
::::::.::::: : .: .: : ::: :: ::: :. ..:.:..:::::::: :
CCDS32 KCCVFVNQWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SKMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIK-PKSFKVNVTLRESMELLDSAVQ
.: ..:::..:: .: .: . :. . .. ::::.: . .:.. :: :.
CCDS32 AKWEIFLFLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
470 480 490 500 510
540
pF1KE6 NLQAKETCQ
>>CCDS81906.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 (483 aa)
initn: 1030 init1: 328 opt: 917 Z-score: 1149.8 bits: 222.3 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 1085; 36.7% identity (66.1% similar) in 504 aa overlap (13-512:2-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
: :.:.. : .:: .. : : : . . . ::::..::::
CCDS81 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
:. ..:. ::...:....::::.:::.:: :.:::.: .:.::::.::. : :: .
CCDS81 GHMLTLGKNPHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ASFRVVSGGRSMAFGHYSEH-WKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
.: ..:.:.::.:. : : ..:: :.. ...: .. .: : :: :: .::.
CCDS81 YTFTLISNGQSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
:.. : . : . ..: .::.:.::. :.::: ::.:. :. :.. :..::..::
CCDS81 LISTLQELMAGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
.:. .: .: :.:.::: ..:.. ::..: .:. .: .... : ::. :..
CCDS81 SGNPADFIPILRYLPNPSLNAFKD---LNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHI-RDITDSL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
: ..: .. ....:. :.. . :.:::. ::..::..: :. .. : :: ..
CCDS81 IEHCQEKQLDEN--ANVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
: ::: :.::.: : ..:. .:::. ::. :..: ::::: ::::
CCDS81 QEELDTVIGRSRRPRLSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHRKL------------
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pF1KE6 DTVVFVNQWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELS
: :: .: : ::: :: :.: :. .:.::..:::.:::: ..
CCDS81 -----------------WVNPSEFLPERFLTPDGAIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIA
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480 490 500 510 520 530
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. ..:::..:: .. .: . . . :. ::::.:
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540
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20 30 40 50 60 70
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.:: . : . .. ::.:. . . .:
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80 90 100 110 120
pF1KE6 L--SFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAFASFRVVSGG
. .: .: ..:: ....:.:. :... .. ...:...:. :. :: .:.. ..:..
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50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 RS-MAFGHYSEHWKVQRRAAHSMMRNFFTRQPRSRQVLEGHVLSEARELVALLVRGSADG
:. .::. . ::...:: : . . : . : :: . .: : .:. . .:
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.: . :::.::.: .::. :.. :::. . ..:: . ... ::::..:::.
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pF1KE6 YFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAFILSAEKKAAGDS
::: . .. .. .. : ::... :..: . .:.:... . : .:.
CCDS75 IFPNKTLEKLKSHVKIRNDLLNKILENY---KEKFRSDSIT-NMLDTLM---QAKMNSDN
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..: : : .. .:: :::::. .: .....: : .. . :.:. .. :.::
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pF1KE6 VGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPKDTVVFVN
:: .: : ..:. : . : . :..:. .:. ::: .....:. . . : : :..:
CCDS75 VGFSRTPTISDRNRLLLLEATIREVLRLRPVAPMLIPHKANVDSSIGEFAVDKGTEVIIN
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pF1KE6 QWSVNHDPVKWPNPENFDPARFLDKDG--LINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQLF
:...:. .: .:..: : :::. : ::. ... . :..: : :::: :....::
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:... : .. :... :.. ... :. :: ::::.. .:..
CCDS75 LIMAWLLQRFDLEV-PDD-GQLPSLEGI---PKVVFLIDSFKVKIKVRQAWREAQAEGST
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540
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10 20 30 40
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: : : . ::: :. : .. . ::: :... .: ::.:: :
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10 20 30 40 50
50 60 70 80
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. :::: :::.:: ::.. .. .. .:.::: ::..
CCDS34 GIPPGPTPWPLVGNFGHVLLPPFLRRRSWLSSRTRAAGIDPSVIGPQVLLAHLARVYGSI
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90 100 110 120 130 140
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:.. .: .:::. .....:::::. .:.::: . .:. ....:.::. :. :
CCDS34 FSFFIGHYLVVVLSDFHSVREALVQQAEVFSDRPRVPLISIVTKEKGVVFAHYGPVWRQQ
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150 160 170 180 190 200
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:. .:: .:.: .. :: ... : . . : . . . : : :.... ::.
CCDS34 RKFSHSTLRHF----GLGKLSLEPKIIEEFKYVKAEMQKHGED-PFC---PFSIISNAVS
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210 220 230 240 250
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:.. ..::: :... . ::...:. . : . .: ::.. ::: :.: .: :
CCDS34 NIICSLCFGQRFDYTNSEFKKMLGFMSR-GLEICLNSQVLLVNICPWLYYLPFGP----F
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260 270 280 290 300 310
pF1KE6 REFEQLNRNFSNFILDKFLR-HCESLRPGAAPRDMMDAFILSAEKKAAGDSHGGGARLDL
.:..:.......: : :... : ::: :.:..: ..: :.. ..:... .:
CCDS34 KELRQIEKDITSF-LKKIIKDHQESL-DRENPQDFIDMYLLHMEEERKNNSNSS---FDE
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pF1KE6 ENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRVQAELDQVVGRDRLPCMGDQPN
: . : :.: :. :: ...: : :: .. :::: .:. :...:.: .: : . :. .
CCDS34 EYLFYIIGDLFIAGTDTTTNSLLWCLLYMSLNPDVQEKVHEEIERVIGANRAPSLTDKAQ
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380 390 400 410 420 430
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.::. : ..:..:.. ::..::: :. :: . :: ::: :... : :::..::. : .:
CCDS34 MPYTEATIMEVQRLTVVVPLAIPHMTSENTVLQGYTIPKGTLILPNLWSVHRDPAIWEKP
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440 450 460 470 480 490
pF1KE6 ENFDPARFLDKDGLINKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEELSKMQLFLFISILAHQCDFRANP
:.: : :::: .: . : : . :..::: :.::.:.::.:::.. : .. : : :
CCDS34 EDFYPNRFLDDQGQLIKKET--FIPFGIGKRVCMGEQLAKMELFLMFVSLMQSFAF-ALP
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.. : .. .:::. :. :..... :
CCDS34 EDSKKPLLTGRFGLTLAPHPFNITISRR
520 530 540
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: ::.. . .:::.. :...:.: ::::. : .
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:: : : . : .: ::.::::...:. :.::::: :...::: .: ::::
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.... : ::.. ...:. :. ::: . : .::. ... :: : ::
CCDS46 VPITQILGFGPRSQGVFLARYGPAWREQRRFSVSTLRNL----GLGKKSLEQWVTEEAAC
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: : .. : : . : : ::.::.... : :. .:::.: .::. .: :
CCDS46 LCAAFANHS--GRPFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQE-GLKEE
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.: : .:. : : ..: . :.: ... : . ::..: .: . :. :::.
CCDS46 SGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKVLR----FQKAFLT-QLDELLTEHRMTWDPAQPPRDL
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.:: :. .:: :. ... .. ::. ...:.:.:.. : ::.: : :::. .:::
CCDS46 TEAF-LAEMEKAKGNPESS---FNDENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDV
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: ::: :.:.:.:. : : :::: ..::. : ..:..::...::. . : :. . : :.
CCDS46 QRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGF
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.::: :....: :: .: . : .: : : .::: .: . : . . ::.:.: :.:
CCDS46 RIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEA--FLPFSAGRRACLG
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: :..:.::::.. : .. .: . ..: . . ... ..:. ... .. :
CCDS46 EPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVSPSPYELCAVPR
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540
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:.: :: : . : :: . : : :: :.:
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:: . . :.. ... :: :: . .: :::::.: .:...::...: :. : .
CCDS74 GNILQLDVKDMSKSLTNFSKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGS
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: . :. : .. :.. ...:: :: .::: ... .: .: ::: ::
CCDS74 FPVAEKVNKGLGILFSN-GKRWKEIRRFCLMTLRNF----GMGKRSIEDRVQEEARCLVE
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: . .:. :: . : ::. .: : :... : .: .:. :.:.... :
CCDS74 ELRKTNASPC--DPTFILGCAPCNVICSVIFHDRFDYKDQRFLNLM---EKFNENLRILS
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::.: :: . . ... .::. ...:... .: ::: ..: ::..
CCDS74 ----SPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYIKSYVLERIKEHQESLDMNSA-RDFI
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: :... :. ..:. ... .:.. ::.::.:::. .: ::.:.. :::. .::.:
CCDS74 DCFLIKMEQ----EKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVT
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..:: :.. ::::.: ::: :. ..::. : ..: .:. ...:...:::.: ... .:
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::: :..... :: :. ..:::: :::..::::.: ..: .. : ::.::: :.::
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:..:.::::.. . .. ..... . : ....
CCDS74 GLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVD-PKDIDITPIANAFGRVPPLYQLCFIPV
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>>CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 (490 aa)
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:::: :.::: . . . :.. :..
CCDS74 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSK
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:: :: . .: .:::.: .....::.. : :. : : . .. : ...:.. ..
CCDS74 IYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSN-GK
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.:: :: . .::: ... .: .: ::: :: : . .:. :: .
CCDS74 RWKEIRRFSLMTLRNF----GMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPC--DPTFILGC
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: ::. .. : :... : .: .:. . .: : :.. ::.: ::. .
CCDS74 APCNVICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVST-------PWIQICNNFPTIIDY
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..: .:.. . ::.: .: ::. . :::..: :... ::. ... .
CCDS74 FPGTHNKLLKNLAFMESDILEKVKEHQESMDINN-PRDFIDCFLIKMEKEKQNQQ----S
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.. .::. : .:..::. .: ::.:.. :::. ..:.: ..:: :...:.::.: :::
CCDS74 EFTIENLVITAADLLGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQ
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CCDS74 DRGHMPYTDAVVHEVQRYIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKE
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.:::: ::: .:::. : ..: .. : ::.::: :.:: :..:.::::.... .. ..
CCDS74 FPNPEMFDPRHFLDEGGNFKK--SNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNL
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.. .:.. :.. : ...
CCDS74 KSLIDPKDLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
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>>CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 678 init1: 425 opt: 653 Z-score: 817.5 bits: 160.9 E(32554): 3.3e-39
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