Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6747
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6747, 856 aa
1>>>pF1KE6747 856 - 856 aa - 856 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5423+/-0.00039; mu= 20.6365+/- 0.024
mean_var=81.7902+/-16.635, 0's: 0 Z-trim(113.1): 35 B-trim: 287 in 1/53
Lambda= 0.141815
statistics sampled from 22311 (22345) to 22311 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 7.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036595 (OMIM: 219200,278250,611716) V-type prot ( 856) 5694 1175.3 0
NP_065683 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131
NP_570855 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131
XP_005250450 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2248 470.3 1.6e-131
XP_005250451 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2248 470.3 1.6e-131
NP_570856 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131
XP_016880255 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 816) 1833 385.4 5.8e-106
NP_001123492 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 838) 1830 384.8 9.1e-106
XP_005257520 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 784) 1828 384.3 1.1e-105
XP_005257518 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 790) 1828 384.3 1.2e-105
XP_016880256 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 809) 1828 384.4 1.2e-105
NP_005168 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 116 ( 831) 1825 383.7 1.8e-105
XP_016880260 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 777) 1823 383.3 2.3e-105
XP_016880259 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 783) 1823 383.3 2.3e-105
XP_016880257 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 803) 1823 383.3 2.4e-105
XP_011523210 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 802) 1815 381.7 7.4e-105
XP_016880258 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 795) 1810 380.7 1.5e-104
XP_005257516 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 844) 1659 349.8 3.1e-95
XP_016880261 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1288 273.8 1.6e-72
XP_016880262 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1288 273.8 1.6e-72
NP_001123493 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 837) 1288 273.9 2.2e-72
XP_016872579 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 532) 1217 259.2 3.6e-68
NP_006044 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 614) 1217 259.3 4e-68
XP_011543028 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 1217 259.4 5.1e-68
XP_005273766 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 1217 259.4 5.1e-68
NP_006010 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 830) 1217 259.4 5.1e-68
XP_016872578 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 805) 1116 238.7 8.3e-62
XP_016880263 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 575) 1042 223.4 2.3e-57
>>NP_036595 (OMIM: 219200,278250,611716) V-type proton A (856 aa)
initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6292.3 bits: 1175.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5694; 100.0% identity (100.0% similar) in 856 aa overlap (1-856:1-856)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE6 SFSLLSSKFNNDDSVA
::::::::::::::::
NP_036 SFSLLSSKFNNDDSVA
850
>>NP_065683 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPase 1 (840 aa)
initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2482.0 bits: 470.3 E(85289): 1.6e-131
Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
: :.:::: :::.::::: .:: :.. ::: :::::.:::.::.:::::::.::.:::
NP_065 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
::::: .: .:. . .: . : :: .: .... .. :.::: ::.:...:.. :..
NP_065 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL
..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:.
NP_065 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK
::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.:
NP_065 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV
:::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: .
NP_065 KICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI
:.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:.
NP_065 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF
. .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: :::
NP_065 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN
::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.:
NP_065 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI
.:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.:::::
NP_065 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC
::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.::
NP_065 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV
.::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..:
NP_065 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ
.. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :..
NP_065 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT
650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE6 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW
: : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_065 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV
.:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.:::::::::::::
NP_065 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV
760 770 780 790 800 810
840 850
pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA
: : :: ::::
NP_065 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE
820 830 840
>>NP_570855 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPase 1 (840 aa)
initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2482.0 bits: 470.3 E(85289): 1.6e-131
Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
: :.:::: :::.::::: .:: :.. ::: :::::.:::.::.:::::::.::.:::
NP_570 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
::::: .: .:. . .: . : :: .: .... .. :.::: ::.:...:.. :..
NP_570 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL
..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:.
NP_570 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK
::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.:
NP_570 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV
:::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: .
NP_570 KICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI
:.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:.
NP_570 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF
. .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: :::
NP_570 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN
::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.:
NP_570 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI
.:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.:::::
NP_570 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC
::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.::
NP_570 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV
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