Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6736, 1575 aa
1>>>pF1KE6736 1575 - 1575 aa - 1575 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5266+/-0.000541; mu= 4.8122+/- 0.033
mean_var=352.5926+/-73.851, 0's: 0 Z-trim(118.2): 326 B-trim: 97 in 1/52
Lambda= 0.068303
statistics sampled from 30565 (30932) to 30565 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 15.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575) 11207 1120.5 0
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581) 11185 1118.3 0
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259) 9261 928.6 0
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609) 4544 463.9 4.8e-129
XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTE ( 742) 2061 218.9 1.3e-55
NP_061486 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin sub (1111) 2061 219.1 1.7e-55
NP_005553 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin sub (1193) 2061 219.1 1.8e-55
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604) 1376 151.3 2.4e-35
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo ( 604) 1376 151.3 2.4e-35
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 1153 129.8 2e-28
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 1153 129.8 2e-28
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 1144 128.9 3.7e-28
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 1144 129.0 3.7e-28
XP_016881232 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (2626) 1112 126.0 4.2e-27
XP_011524284 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3243) 1112 126.1 4.8e-27
NP_001121189 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l (3277) 1112 126.1 4.8e-27
XP_011524283 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3298) 1112 126.1 4.9e-27
NP_937762 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (3333) 1112 126.1 4.9e-27
XP_011524282 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3336) 1112 126.1 4.9e-27
XP_011524281 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3339) 1112 126.1 4.9e-27
XP_011524280 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3342) 1112 126.1 4.9e-27
XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3609) 1109 125.9 6.3e-27
XP_011527120 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3654) 1109 125.9 6.4e-27
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695) 1109 125.9 6.4e-27
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700) 1109 125.9 6.4e-27
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 1089 123.5 1.5e-26
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 1084 123.0 2.2e-26
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 1084 123.0 2.2e-26
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 1084 123.0 2.2e-26
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 1084 123.0 2.2e-26
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 1074 122.0 4.2e-26
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300) 1074 122.2 5.1e-26
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 1055 120.1 1.5e-25
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 1055 120.1 1.5e-25
NP_006172 (OMIM: 602349) netrin-3 precursor [Homo ( 580) 1042 118.3 1.9e-25
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212) 922 106.9 1.1e-21
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172) 827 97.5 7e-19
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 827 97.5 7e-19
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172) 827 97.5 7e-19
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 827 97.5 7e-19
XP_016856761 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1108) 820 96.8 1.1e-18
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101) 808 95.6 2.5e-18
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488) 677 82.3 1.1e-14
NP_009054 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (1546) 641 79.3 2.8e-13
NP_996816 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (5202) 641 79.9 6.1e-13
NP_001098676 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit (1823) 545 69.9 2.2e-10
XP_005267041 (OMIM: 600133,615235) PREDICTED: lami (1823) 545 69.9 2.2e-10
XP_005267040 (OMIM: 600133,615235) PREDICTED: lami (1823) 545 69.9 2.2e-10
NP_002281 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit al (1816) 536 69.0 4e-10
NP_001098677 (OMIM: 600133,615235) laminin subunit (1816) 536 69.0 4e-10
>>NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit gamma- (1575 aa)
initn: 11207 init1: 11207 opt: 11207 Z-score: 5986.3 bits: 1120.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11207; 100.0% identity (100.0% similar) in 1575 aa overlap (1-1575:1-1575)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE6 QKSRAEDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QKSRAEDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE6 ASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE6 ERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE6 SQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE6 PAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570
pF1KE6 EAILHSLPENCASWQ
:::::::::::::::
NP_006 EAILHSLPENCASWQ
1570
>>XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: laminin (1581 aa)
initn: 9764 init1: 9764 opt: 11185 Z-score: 5974.6 bits: 1118.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11185; 99.6% identity (99.6% similar) in 1581 aa overlap (1-1575:1-1581)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE6 QKSRAEDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKSRAEDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE6 ASSSVQAATVTVMGARTLLADLE------GMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTR
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASSSVQAATVTVMGARTLLADLEASAGFAGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE6 KKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE6 ATLQQASQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATLQQASQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE6 LDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570
pF1KE6 ADKQNLEAILHSLPENCASWQ
:::::::::::::::::::::
XP_011 ADKQNLEAILHSLPENCASWQ
1570 1580
>>XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: laminin (1259 aa)
initn: 9261 init1: 9261 opt: 9261 Z-score: 4951.1 bits: 928.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9261; 100.0% identity (100.0% similar) in 1259 aa overlap (1-1259:1-1259)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFGRLAQASHTCGSPPED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQSPSMAFGVQYPTSVNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSASCQKTYGRPEGQYLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGLQEWVTSTELLISLDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEEL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 REVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPWGPLDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IPQEGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEGRVA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGAL
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE6 QKSRAEDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQ
>>NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 precu (1609 aa)
initn: 4371 init1: 2442 opt: 4544 Z-score: 2437.8 bits: 463.9 E(85289): 4.8e-129
Smith-Waterman score: 4884; 44.2% identity (71.9% similar) in 1598 aa overlap (10-1571:21-1600)
10 20 30 40
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAG----AGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFG
::.:: ::. :.: : : .::::::.: : ::::.
NP_002 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS
. :..:::.:::..: ..:..:. :. :::..:. .:.:..:::...: ..:::::
NP_002 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
.: :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::.
NP_002 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL
::..::.. . ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: :
NP_002 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA
:::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.:::::::::::::: .
NP_002 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS
.:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.::
NP_002 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP
:::::.: .:.:.: : :::::.:::.. :. : :. .::: :::. : :.:::
NP_002 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
: : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.:::: :.::.::
NP_002 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
:::. :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :. .:: :.. ::: .:
NP_002 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT
: . .:. . . . :: :::: : .:::: : ..::: :. : .. : :::.
NP_002 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KE6 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL
:: .:. . : ..: :. .. :.:.:... : : ::.::.:: ::::...
NP_002 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI
610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE6 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ
: . . :: .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: : ::.:: :.
NP_002 RGTYSERSAG--YLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPN
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE6 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP
:::. :: :.:: :. ::::.::.: : .: :: ::.: :.::. :: ..::::::
NP_002 LGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCP
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE6 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV
::: :.:...:...:::::.:: : :.:::.::::.:::::: : . :. :::: :.
NP_002 CPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNI
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE6 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: ::::: :.:. :....
NP_002 DPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQ
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE6 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC
: :.:::::: ::::::..::. : :::..:: :.::. : :: ::: . :: .::::
NP_002 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KE6 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR
:.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::.
NP_002 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE6 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL
:..:.: . . ::.::.:: :::...: ...: :. . . :. ..
NP_002 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE6 LGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT
: :: : :. . . . . . ...... ....... .:: . . . . ....
NP_002 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE6 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA
... . : ..: . .:. .: . :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. :
NP_002 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE6 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV
:. .: : .:. .: :: : : ..:.: . .:. .:.... .. :. .:.:
NP_002 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE6 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKTV----ASWQH
::. . . .. :..: :. : : ...:... ..:. ::. . ...
NP_002 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQ-LSPLDSE---TLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYED
1260 1270 1280 1290 1300
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE6 MATEAARTLQTAAQATLRQ--TEPLT--KLHQEARAALTQASSSVQAATVTVMGARTLLA
. : : . .. :.. :: : .: .: :: . : ... . :.. : .:
NP_002 L-REDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE6 DLEGMKLQFPRPKDQA--ALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKG
.:. . . : : :: :: .. .. .... .::..:.. ::.:: .. ::.:.
NP_002 NLKDFDRRVNDNKTAAEEAL-RKIPAI-NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKA
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE6 REAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAE
.::: .:. : : . : ... ... : .... :.: :.. :.:. . .
NP_002 HEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELKRKQDDADQD
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE6 RVGAGLS-----EMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALE
. ::.. : : . :... :. . . ...:: .::.::: . . ::: . .:.
NP_002 MMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDT--VDLNKLNEIEGTLN
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE6 RLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPENCAS
. . .. . ..:.::.: ::.:...:: :. .. :. :: : .::: : ..:: .:
NP_002 KAKDEM-KVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFN
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE6 WQ
NP_002 TPSIEKP
>>XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTED: l (742 aa)
initn: 1188 init1: 711 opt: 2061 Z-score: 1119.4 bits: 218.9 E(85289): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 2061; 45.9% identity (68.3% similar) in 608 aa overlap (304-898:9-602)
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 NGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS
:: : : ::.:.. .: :.:.:.:
XP_016 MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSR--REV--CDCNGKS
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 EECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL
..: ::::: :.::.: :: .: :.: : :::.:...::. : : ::.:.: :::
XP_016 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440
pF1KE6 QCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRP--------CTCNPAGSLDTCDPRS
.::..: :.::: ::: .::::::::: :...:: : :.::: :: .
XP_016 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCD--A
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFH
::: :: : :. ::::: : .::. :: ::..::::::: : :.:...::.: : ::
XP_016 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 QGAEGWWARSVGGSEHPPQWSP--NGVLLSPE--DEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILT
: ..:: : . .:: ::: . :. : . : ..:: ::::.:. :::: : .
XP_016 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 FRVPPGDS-PLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPL
.:: : : .. :::.:: .. :. : . .:.. .. :.. .: :
XP_016 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLN-EHPSNNWSPQL
280 290 300 310 320 330
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYT
:...::: :::.::.:.. : .: .. .: : :::: . :: ::: : ::.::
XP_016 SYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTG--YIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYK
340 350 360 370 380
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 GQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGF
::::..:: ::::. . ::...:.::.:. :.:::.:: : . .. : : ::
XP_016 GQFCQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGF
390 400 410 420 430 440
750 760 770 780 790 800
pF1KE6 YGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGL
:..: .. :.:::: . .:...::..::::..:::: : :::.: ::.::::.:
XP_016 YNDPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGE
450 460 470 480 490 500
810 820 830 840 850 860
pF1KE6 FGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPA
: .::. :::..::::.: :::: :.:.::.:.:::.: .:..:. :..:. ::: ::
XP_016 HGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPA
510 520 530 540 550 560
870 880 890 900 910 920
pF1KE6 DKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCH
::: :.:.:.: :: . : : : : : . .:
XP_016 DKCRACNCNPMG--SEPVGCRS-DGTCVCKPGFGGPNCEHGAFSCPACYNQVKIQMDQFM
570 580 590 600 610 620
930 940 950 960 970 980
pF1KE6 PLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN
XP_016 QQLQRMEALISKAQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKV
630 640 650 660 670 680
>>NP_061486 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin subunit (1111 aa)
initn: 1188 init1: 711 opt: 2061 Z-score: 1117.4 bits: 219.1 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 2156; 32.7% identity (57.8% similar) in 1234 aa overlap (304-1493:9-1110)
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 NGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS
:: : : ::.:.. .: :.:.:.:
NP_061 MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSR--REV--CDCNGKS
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 EECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL
..: ::::: :.::.: :: .: :.: : :::.:...::. : : ::.:.: :::
NP_061 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440
pF1KE6 QCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRP--------CTCNPAGSLDTCDPRS
.::..: :.::: ::: .::::::::: :...:: : :.::: :: .
NP_061 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCD--A
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFH
::: :: : :. ::::: : .::. :: ::..::::::: : :.:...::.: : ::
NP_061 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 QGAEGWWARSVGGSEHPPQWSP--NGVLLSPE--DEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILT
: ..:: : . .:: ::: . :. : . : ..:: ::::.:. :::: : .
NP_061 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 FRVPPGDS-PLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPL
.:: : : .. :::.:: .. :. : . .:.. .. :.. .: :
NP_061 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLN-EHPSNNWSPQL
280 290 300 310 320 330
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYT
:...::: :::.::.:.. : .: .. .: : :::: . :: ::: : ::.::
NP_061 SYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTG--YIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYK
340 350 360 370 380
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 GQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGF
::::..:: ::::. . ::...:.::.:. :.:::.:: : . .. : : ::
NP_061 GQFCQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGF
390 400 410 420 430 440
750 760 770 780 790 800
pF1KE6 YGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGL
:..: .. :.:::: . .:...::..::::..:::: : :::.: ::.::::.:
NP_061 YNDPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGE
450 460 470 480 490 500
810 820 830 840 850 860
pF1KE6 FGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPA
: .::. :::..::::.: :::: :.:.::.:.:::.: .:..:. :..:. ::: ::
NP_061 HGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPA
510 520 530 540 550 560
870 880 890 900 910 920
pF1KE6 DKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCH
::: :.:.:.:: .:: ::::
NP_061 DKCRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GCRS----
570 580
930 940 950 960 970 980
pF1KE6 PLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN
.
NP_061 -----------------------------------------------------------D
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE6 GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWL--
:::::.::: : .:. : : .::.:: :: . .. .: :. .
NP_061 GTCVCKPGFGGPNCE--HGAF----------SCPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISK
590 600 610 620 630
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE6 -QGSDCGSPWGPLDILLGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQ
::.: : :. . .: .. :. . .. :: ... :. .... .. . .:.
NP_061 AQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLD
640 650 660 670 680 690
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE6 RLNKGARCAQA-GSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIP-QEGPSQPTKWS
:. .. ..: ::: ... : . .. . . . .. : :.. .:: .. :. ..
NP_061 DLKMTVERVRALGSQYQ-NRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFK
700 710 720 730 740 750
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 HLATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLL-EGRVALETQRD------
:: :: ::.:: ..:... . .. :. . .:. . : :: . . :
NP_061 SLAQEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQG
760 770 780 790 800 810
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 LEDRYQEVQA-AQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRA
: .. ..... ::. : :. . .: ... . :.. : ... . : .:
NP_061 LVEKLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLL--DSVSRLQGVSDQSF--QVEEA
820 830 840 850 860 870
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE6 EDLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQT------AAQATLRQ----TEPLTKLHQEAR
. . :: .: . :. .:: : :: .. :: :.. : .: ..:
NP_061 KRIKQKADSLSSLVT--RHM-DEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRAN
880 890 900 910 920
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE6 AALTQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRK
: ..:. ... ...: . ....: .:. . :: : .: : : .. ..:.
NP_061 LAKSRAQEALSMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASD
930 940 950 960 970 980
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE6 KTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQA
::.:::: ::.:: .. ::. . :: .... . .: : . . : . . :
NP_061 KTQQAERALGSAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAME-KGLA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE6 TLQQASQQVLASEARRQELE---EAERVGAGLSEMEQ---QIRESRISLEKDIETLSELL
.:.. ..: .: .:.::: . . : ..: .. . ... .... ..::. ::
NP_061 SLKSEMREV-EGELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE6 ARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESD
.:
NP_061 HLMGM
1110
>>NP_005553 (OMIM: 150292,226650,226700) laminin subunit (1193 aa)
initn: 1188 init1: 711 opt: 2061 Z-score: 1117.0 bits: 219.1 E(85289): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 2238; 32.2% identity (58.0% similar) in 1315 aa overlap (304-1575:9-1188)
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 NGHASECGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRS
:: : : ::.:.. .: :.:.:.:
NP_005 MPALWLGCCLCFSLLLPAARATSR--REV--CDCNGKS
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 EECTFDRELFRSTGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHL
..: ::::: :.::.: :: .: :.: : :::.:...::. : : ::.:.: :::
NP_005 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
40 50 60 70 80 90
400 410 420 430 440
pF1KE6 QCDDTGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRP--------CTCNPAGSLDTCDPRS
.::..: :.::: ::: .::::::::: :...:: : :.::: :: .
NP_005 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCD--A
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFH
::: :: : :. ::::: : .::. :: ::..::::::: : :.:...::.: : ::
NP_005 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 QGAEGWWARSVGGSEHPPQWSP--NGVLLSPE--DEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILT
: ..:: : . .:: ::: . :. : . : ..:: ::::.:. :::: : .
NP_005 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 FRVPPGDS-PLPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQETSEDVAPPL
.:: : : .. :::.:: .. :. : . .:.. .. :.. .: :
NP_005 YRVDRGGRHPSAHDVILEGAGLRITAPLMPLGKTLPCGLTKTYTFRLN-EHPSNNWSPQL
280 290 300 310 320 330
630 640 650 660 670 680
pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYT
:...::: :::.::.:.. : .: .. .: : :::: . :: ::: : ::.::
NP_005 SYFEYRRLLRNLTALRIRATYGEYSTG--YIDNVTLISARPVSGAPAPWVEQCICPVGYK
340 350 360 370 380
690 700 710 720 730 740
pF1KE6 GQFCESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGTCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGF
::::..:: ::::. . ::...:.::.:. :.:::.:: : . .. : : ::
NP_005 GQFCQDCASGYKRDSARLGPFGTCIPCNCQGGGACDPDTGDCYSGDENPDIECADCPIGF
390 400 410 420 430 440
750 760 770 780 790 800
pF1KE6 YGNPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGL
:..: .. :.:::: . .:...::..::::..:::: : :::.: ::.::::.:
NP_005 YNDPHDPRS--CKPCPCHNGFSCSVMPETEEVVCNNCPPGVTGARCELCADGYFGDPFGE
450 460 470 480 490 500
810 820 830 840 850 860
pF1KE6 FGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPA
: .::. :::..::::.: :::: :.:.::.:.:::.: .:..:. :..:. ::: ::
NP_005 HGPVRPCQPCQCNNNVDPSASGNCDRLTGRCLKCIHNTAGIYCDQCKAGYFGDPLAPNPA
510 520 530 540 550 560
870 880 890 900 910 920
pF1KE6 DKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCH
::: :.:.:.:: .:: ::::
NP_005 DKCRACNCNPMGS-------EPV-----------------------------GCRS----
570 580
930 940 950 960 970 980
pF1KE6 PLGSQEDQCHPKTGQCTCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHEN
.
NP_005 -----------------------------------------------------------D
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE6 GTCVCRPGFEGYKCDRCHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWL--
:::::.::: : .:. : : .::.:: :: . .. .: :. .
NP_005 GTCVCKPGFGGPNCE--HGAF----------SCPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISK
590 600 610 620 630
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE6 -QGSDCGSPWGPLDILLGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQ
::.: : :. . .: .. :. . .. :: ... :. .... .. . .:.
NP_005 AQGGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLD
640 650 660 670 680 690
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE6 RLNKGARCAQAGSQKTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIP-QEGPSQPTKWSH
:. .. ..: ... ... : . .. . . . .. : :.. .:: .. :. ..
NP_005 DLKMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKS
700 710 720 730 740 750
1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 LATEARALARSHRDTATKIAATAWRALLASNTSYALLWNLL-EGRVALETQRD------L
:: :: ::.:: ..:... . .. :. . .:. . : :: . . : :
NP_005 LAQEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGL
760 770 780 790 800 810
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 EDRYQEVQA-AQKALRTAVAEVLPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAE
.. ..... ::. : :. . .: ... . :.. : ... . : .:.
NP_005 VEKLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLL--DSVSRLQGVSDQSF--QVEEAK
820 830 840 850 860 870
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE6 DLGLKAKALEKTVASWQHMATEAARTLQT------AAQATLRQ----TEPLTKLHQEARA
. :: .: . :. .:: : :: .. :: :.. : .: ..:
NP_005 RIKQKADSLSSLVT--RHM-DEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANL
880 890 900 910 920
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE6 ALTQASSSVQAATVTVMGARTLLADLEGMKLQFPRPKDQAALQRKADSVSDRLLADTRKK
: ..:. ... ...: . ....: .:. . :: : .: : : .. ..:. :
NP_005 AKSRAQEALSMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDK
930 940 950 960 970 980
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE6 TKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQAT
:.:::: ::.:: .. ::. . :: .... . .: : . . : . . :.
NP_005 TQQAERALGSAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAME-KGLAS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE6 LQQASQQVLASEARRQELE---EAERVGAGLSEMEQ---QIRESRISLEKDIETLSELLA
:.. ..: .: .:.::: . . : ..: .. . ... .... ..::. ::
NP_005 LKSEMREV-EGELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLH
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE6 RLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDL
. . .. ..: . : : . :..: .:. .: ::....::. ... .:...
NP_005 LMD--QPLSVDEEGLVLLEQKLSRAKTQINS--QLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSI
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1560 1570
pF1KE6 AEIRADKQNLEAILHSLPENCASWQ
: :: .::: : .:: .: . :
NP_005 DGILADVKNLENIRDNLPPGCYNTQALEQQ
1170 1180 1190
>>XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 isofor (604 aa)
initn: 1018 init1: 540 opt: 1376 Z-score: 755.7 bits: 151.3 E(85289): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 1383; 39.9% identity (65.7% similar) in 542 aa overlap (9-527:27-551)
10 20 30 40
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENA
::...: .:: : : :.:.::.: : ::
XP_006 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQP--DPCSDENGHPRRCIPDFVNA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 AFGRLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGA--HCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDES
:::. ...: ::: :: .: :. : :. :.:.::.. : ..:::... .
XP_006 AFGKDVRVSSTCGRPPARYCV-VSERGEERLRSCHLCNASDPKKAHPPAFLTDLNNPHNL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 TWWQSPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPY
: ::: .. .:.: .:..:: ::: .:.::: :.: . ::::.:::: : :.
XP_006 TCWQSENY---LQFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKSMDYGRTWVPF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QFYSASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFE
::::..:.: :.::. . ..:. : ::. .:. ::::: .:::::.:::::..:.
XP_006 QFYSTQCRKMYNRPHRAPITK-QNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTLDGRPSAHDFD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE6 ESPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQ-SYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASE
.:: ::.:::.:.. ....::.::::. : .. . ::.:::::..:::::::::::..
XP_006 NSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGGRCKCNGHAAR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 CGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFD
: : .:.: :.:::.: .:.:: :: :::: :.::. :.::. :::. ....: :.
XP_006 CVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNCNLHARRCRFN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 RELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYH--WDP---RMPCQPCDCQSAGSLH
::.. .:. :: : .:: .::: ::. :.:..:. : : :. :::. .:.
XP_006 MELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKACDCHPVGAAG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 LQCDDT-GTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCK
:..: : : :: ::: :.:: :... :.. :: :.. : .. .
XP_006 KTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAP-----PTTAASSVE
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE6 ENVEGNLCDR-CRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTA----QFQVHHILSDFHQ
: . :: :. . .:. . :.. . . :. : .: :. :.: ..:
XP_006 EPED---CDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVN-IISVYKQ
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KE6 GA-------EGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLI
:. .. : :: . . :. .:
XP_006 GTSRIRRGDQSLWIRSRDIACKCPKIKPLKKYLLLGNAEDSPDQSGIVADKSSLVIQWRD
530 540 550 560 570 580
>>NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo sapi (604 aa)
initn: 1018 init1: 540 opt: 1376 Z-score: 755.7 bits: 151.3 E(85289): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 1383; 39.9% identity (65.7% similar) in 542 aa overlap (9-527:27-551)
10 20 30 40
pF1KE6 MAAAALLLGLALLAPRAAGAGMGACYDGAGRPQRCLPVFENA
::...: .:: : : :.:.::.: : ::
NP_004 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQP--DPCSDENGHPRRCIPDFVNA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 AFGRLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGA--HCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDES
:::. ...: ::: :: .: :. : :. :.:.::.. : ..:::... .
NP_004 AFGKDVRVSSTCGRPPARYCV-VSERGEERLRSCHLCNASDPKKAHPPAFLTDLNNPHNL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 TWWQSPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPY
: ::: .. .:.: .:..:: ::: .:.::: :.: . ::::.:::: : :.
NP_004 TCWQSENY---LQFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKSMDYGRTWVPF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QFYSASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFE
::::..:.: :.::. . ..:. : ::. .:. ::::: .:::::.:::::..:.
NP_004 QFYSTQCRKMYNRPHRAPITK-QNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTLDGRPSAHDFD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE6 ESPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQ-SYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASE
.:: ::.:::.:.. ....::.::::. : .. . ::.:::::..:::::::::::..
NP_004 NSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGGRCKCNGHAAR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 CGPDVAGQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFD
: : .:.: :.:::.: .:.:: :: :::: :.::. :.::. :::. ....: :.
NP_004 CVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNCNLHARRCRFN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 RELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYH--WDP---RMPCQPCDCQSAGSLH
::.. .:. :: : .:: .::: ::. :.:..:. : : :. :::. .:.
NP_004 MELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKACDCHPVGAAG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 LQCDDT-GTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCK
:..: : : :: ::: :.:: :... :.. :: :.. : .. .
NP_004 KTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAP-----PTTAASSVE
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE6 ENVEGNLCDR-CRPGTFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTA----QFQVHHILSDFHQ
: . :: :. . .:. . :.. . . :. : .: :. :.: ..:
NP_004 EPED---CDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVN-IISVYKQ
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KE6 GA-------EGWWARSVGGSEHPPQWSPNGVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLI
:. .. : :: . . :. .:
NP_004 GTSRIRRGDQSLWIRSRDIACKCPKIKPLKKYLLLGNAEDSPDQSGIVADKSSLVIQWRD
530 540 550 560 570 580
>>XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTED: l (1798 aa)
initn: 893 init1: 379 opt: 1153 Z-score: 631.4 bits: 129.8 E(85289): 2e-28
Smith-Waterman score: 1897; 28.8% identity (50.1% similar) in 1682 aa overlap (135-1570:150-1762)
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SPSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYS
. :.: :: .. . . . :. :...:
XP_005 RAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 ASCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGR---PSAYNFEE
.: . : : : : . . : :..:.: : . :.: . .:. :. :
XP_005 YDCGADF--P-GVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPY----
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE6 SPGLQEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPK--VLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASE
: .:. . :.: ..: ::.:.::... ::. . ..::::. .. : : : : :::::
XP_005 SSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLL-DPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 CGP------DVAGQL--ACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSG
:.: . :.. :: :.::: : .::.: :..: :: . .: : :.: :
XP_005 CAPAPGAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE6 RSEECTFDRELFRSTGH--GGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDP----RMP--CQPC
... : :: .. ..:. :: : :. .::: ::: :. ::. :: : : :. :
XP_005 HTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYR-DPTKDLRDPAVCRSC
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KE6 DCQSAGSLHL-QCDD---------TGTCACKPTVTGWKCDRCLPGFHSLSEG---GCRPC
::. :: .::. .: : :: :.: .:..: :: .:: . ::: :
XP_005 DCDPMGSQDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRC
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KE6 TCNPAGSLD---TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPGTFNLQPHNPAGCSSCFC-YGHS
:: :.. ::: :: : ::. : : :::: :: ..:. :. :: : : : .
XP_005 QCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLS-HDLLGCRPCDCDVGGA
480 490 500 510 520
490 500 510 520
pF1KE6 --KVC-ASTAQFQV--HHILSDFHQGAEG----------WWARSVGGSE-----------
: .:.: . : . .: : : :... :.
XP_005 LDPQCDEGTGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPG
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560
pF1KE6 HPPQWSPNGVLLSPEDE--EELTA--PEKFLGDQRFSYGQPLI------LTFRVP-PGDS
. :.:. .: . : . : :.: :. . : . .: . : . : ::
XP_005 ETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRL-EPQVPEQWAELELIVQRPGPV
590 600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 P--------LPVQLRLEGTGLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELRFHLQET-SEDVAPPL
: .: . :..:: : :. : :. . . ..::. . . : :
XP_005 PAHSLCGHLVPKDDRIQGT-LQPHARY--LIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPE
650 660 670 680 690 700
630 640
pF1KE6 PPFHFQRLLANLTSLRLRV------SPG----------------------PSPAGP----
:. :: . : :: : : :: ..:
XP_005 TPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEAC
710 720 730 740 750 760
650 660 670 680 690
pF1KE6 ----VFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICS-------CPTGYTGQFCESCAPGYKREMP
. :. . ..: : .: .: :. : : .:. :. ::::: :
XP_005 APLLISLSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGP
770 780 790 800 810 820
700 710
pF1KE6 QG---------------------------GPYA--------------SCVPCTCNQHGT-
: : .. :: ::.:: :.
XP_005 TGCQACQCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADE
830 840 850 860 870 880
720 730 740 750 760
pF1KE6 CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCPCP---GQ-----SACTT
:. .:: :. : :: : ::::. ::.:.: . .:.::::: :. ..:
XP_005 CNTHTGACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQ
890 900 910 920 930 940
770 780 790 800 810 820
pF1KE6 IPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAVGNCD
:...:: :: : : :::.: : :::: :. :. :.::::.:: ::
XP_005 DEYSQQIVC-HCRAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGR---CQLCECSGNIDPMDPDACD
950 960 970 980 990 1000
830 840 850 860 870
pF1KE6 PLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMP------
: .:.::::::.: : :: ::. ::.:.: ..: :.:. :. .: :
XP_005 PHTGQCLRCLHHTEGPHCAHCKPGFHGQA----ARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCH
1010 1020 1030 1040 1050
880 890 900 910 920 930
pF1KE6 CDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQCTCR
::: .::: :::.: . .:.:: :.:..: :.::. : ::: .. :. :::: ::
XP_005 CDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCR
1060 1070 1080 1090 1100 1110
940 950 960 970 980 990
pF1KE6 PGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHE-NGTCVCRPGFEGYKCDRCH
: :..:..:: .: :.:: :. : . :::. .: : :::: : .::.:
XP_005 AGFGGRTCSECQELHWGDPGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE6 DNFFLTADGTHCQQCPSCYA----LVKEEAAKLKARLTLTEGWLQ-----GSDCGSPWGP
.: .. :. : .:.. .:.. ::. . :: :: :. .: :
XP_005 RGF--SGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQ-RLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWH-
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE6 LDILLGEAPRGDVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQ
.. :: . :: . :::.. . .: :.:. :.:.: . :
XP_005 MQEKLG------IVQG---IVGARNTSAASTAQL---VEAT-EELRR--------EIG--
1240 1250 1260 1270
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE6 KTCTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQEGPSQPTKW--SHLATEARALARSHR
.. .:..::: : . ..: ..: :..:: . . . . .:: .. .
XP_005 EATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDLLKHSNFLGAY
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE6 DTATKIAATAWRALLASNTSYAL-----LWNLLEGRVALETQRDL--EDRYQEVQAAQKA
:. . . . .: .::: :: . : .: :. : :: .. .: :.:
XP_005 DSIRHAHSQSAEAERRANTS-ALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRA
1340 1350 1360 1370 1380
1230 1240 1250 1260
pF1KE6 LR-----------TAVAEVLPEA--ESVLATVQQVGA-----DTAPYLALLASPGALPQK
: : . :.. : .. :: :: : : . :. ::
XP_005 LGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGLSCNGAAATA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE6 SRAEDLGLKAKA-LEKTVASWQHMATEAARTLQTAAQATLRQTEPLTKLHQEARAALTQA
. : . ...: :....: . ...:.: . :..: : : : . .:. . ::
XP_005 DLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA-SRGQVEQA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1330 1340 1350 1360
pF1KE6 SSSVQAATVTVM------GARTLLADLEGMK-LQFPRPKDQAALQRKADSVSDR------
.. .: .: :: .. . . :.. : . .:. : ....:
XP_005 NQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIAERVRSLAD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE6 ---LLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKGREAEVL--AKDSAKLAKALLRERKQAH
.:: : ...::..: .: : :. . ..::.. : . :. :... . :
XP_005 VDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIA---QGAI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE6 RRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAERVGAGLSEMEQQIRESRISLEKDIE
: : : .:. :: :. :. .:. ::: .:: .. :. ::
XP_005 RGAVADTRDTEQTLYQV-QERMAG---------AER---ALSSAGERARQLDALLEA--L
1630 1640 1650 1660 1670
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE6 TLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALERLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQE----SQQQ
:.. :.. .... ..: ...: : . :: ::. . . :. . . .: .
XP_005 KLKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQAR
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1540 1550 1560 1570
pF1KE6 ELQIQGFESDLAEIRADK-QNLEAILHSLPENCASWQ
:.. :: . :: : :. . . ::
XP_005 AEQLRDEARDLLQAAQDKLQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQ
1740 1750 1760 1770 1780 1790
XP_005 VQIYNTCQ
1575 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:51:38 2016 done: Tue Nov 8 15:51:41 2016
Total Scan time: 15.230 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]