Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6731
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6731, 1386 aa
1>>>pF1KE6731 1386 - 1386 aa - 1386 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0633+/-0.00117; mu= -16.3984+/- 0.070
mean_var=546.5238+/-112.555, 0's: 0 Z-trim(115.6): 133 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.054862
statistics sampled from 16074 (16202) to 16074 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.498), width: 16
Scan time: 6.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 9556 772.3 0
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 3376 283.2 3.6e-75
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 3375 283.1 3.8e-75
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 3222 271.0 1.8e-71
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 3217 270.6 2.5e-71
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 3194 268.8 8.9e-71
>>CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386 aa)
initn: 9556 init1: 9556 opt: 9556 Z-score: 4106.6 bits: 772.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9556; 100.0% identity (100.0% similar) in 1386 aa overlap (1-1386:1-1386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLRYLLKTLLQMNLFADSLAGDISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPE
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CCDS44 MLRYLLKTLLQMNLFADSLAGDISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DAMPRIVEQPPDLLVSRGEPATLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DAMPRIVEQPPDLLVSRGEPATLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GALFFPRIVHGRRARPDEGVYTCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GALFFPRIVHGRRARPDEGVYTCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EPAVLECVPPRGHPEPSVSWRKDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EPAVLECVPPRGHPEPSVSWRKDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAGERESAAAEVMVLERPSFLRRPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GRYEIRSDHSLWIGHVSAEDEGTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRYEIRSDHSLWIGHVSAEDEGTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GESVAFQCETKGNPPPAIFWQKEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GESVAFQCETKGNPPPAIFWQKEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 YYVCQAVSVAGSILAKALLEIKGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YYVCQAVSVAGSILAKALLEIKGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 SVRWKKDGQWLQGDDLQFKTMANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVRWKKDGQWLQGDDLQFKTMANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMRE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 DWGVSPDPPTEPSSPPGAPSQPVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DWGVSPDPPTEPSSPPGAPSQPVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TWRTVADGVQLETHTVSGLQPNTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TWRTVADGVQLETHTVSGLQPNTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 PWRGQQGLAEVAVRLQEPIVLGPRTLQVSWTVDGPVQLVQGFRVSWRVAGPEGGSWTMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PWRGQQGLAEVAVRLQEPIVLGPRTLQVSWTVDGPVQLVQGFRVSWRVAGPEGGSWTMLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE6 LQSPSQQSTVLRGLPPGTQIQIKVQAQGQEGLGAESLSVTRSIPEEAPSGPPQGVAVALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQSPSQQSTVLRGLPPGTQIQIKVQAQGQEGLGAESLSVTRSIPEEAPSGPPQGVAVALG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE6 GDGNSSITVSWEPPLPSQQNGVITEYQIWCLGNESRFHLNRSAAGWARSAMLRGLVPGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDGNSSITVSWEPPLPSQQNGVITEYQIWCLGNESRFHLNRSAAGWARSAMLRGLVPGLL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE6 YRTLVAAATSAGVGVPSAPVLVQLPSPPDLEPGLEVGAGLAVRLARVLREPAFLAGSGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRTLVAAATSAGVGVPSAPVLVQLPSPPDLEPGLEVGAGLAVRLARVLREPAFLAGSGAA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE6 CGALLLGLCAALYWRRKQRKELSHYTASFAYTPAVSFPHSEGLSGASSRPPMGLGPAPYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CGALLLGLCAALYWRRKQRKELSHYTASFAYTPAVSFPHSEGLSGASSRPPMGLGPAPYS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 WLADSWPHPSRSPSAQEPRGSCCPSNPDPDDRYYNEAGISLYLAQTARGTAAPGEGPVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WLADSWPHPSRSPSAQEPRGSCCPSNPDPDDRYYNEAGISLYLAQTARGTAAPGEGPVYS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE6 TIDPAGEELQTFHGGFPQHPSGDLGPWSQYAPPEWSQGDSGAKGGKVKLLGKPVQMPSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TIDPAGEELQTFHGGFPQHPSGDLGPWSQYAPPEWSQGDSGAKGGKVKLLGKPVQMPSLN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE6 WPEALPPPPPSCELSCLEGPEEELEGSSEPEEWCPPMPERSHLTEPSSSGGCLVTPSRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WPEALPPPPPSCELSCLEGPEEELEGSSEPEEWCPPMPERSHLTEPSSSGGCLVTPSRRE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE6 TPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPHLHQMPRRVPLGPSSPLSVSQPMLGIREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPHLHQMPRRVPLGPSSPLSVSQPMLGIREA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE6 RPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAPGRTWQGNGEMTPPLQGPRARFRKKPKALPYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAPGRTWQGNGEMTPPLQGPRARFRKKPKALPYRR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE6 ENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALELRAAGSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALELRAAGSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE6 EAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTAGSNSSRGSSSSRGSRGPGRSRSRSQSRSQSQRPGQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTAGSNSSRGSSSSRGSRGPGRSRSRSQSRSQSQRPGQK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE6 RREEPR
::::::
CCDS44 RREEPR
>>CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394 aa)
initn: 3432 init1: 2134 opt: 3376 Z-score: 1463.0 bits: 283.2 E(32554): 3.6e-75
Smith-Waterman score: 3655; 44.5% identity (68.5% similar) in 1370 aa overlap (48-1364:31-1362)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 SLAGDISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSR
:. . .:::. :: :::::.: :..::.
CCDS54 MARRHERVTRRMWTWAPGLLMMTVVFWGHQGNGQGQGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSK
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 GEPATLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPD
:::.:: :.::::: :.:::::.: :: : ..:::.::.:::::.::: :::::::..::
CCDS54 GEPTTLNCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPD
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 EGVYTCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPS
:: :.:::::::: :.:::::::::.:::::::.: .::::.::::.::: ::::::::.
CCDS54 EGSYVCVARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPT
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 VSWRKDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLER
. :.:: .:. ..: ::.:::::::.:.: :::::::.::..::.:::.: ::. :.::
CCDS54 IYWKKDKVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFER
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 PSFLRRPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPTGRYEIRSDHSLWIGHVS
:.:::::.::::: . : : :.:.::: : .::.:.:..:: :::.:..:..: : ..
CCDS54 PTFLRRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTM
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 AEDEGTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAPGESVAFQCETKGNPPPA
. ::::: :.::: ::. :::..:.:..:::.:..:.::..: :..:.: ::::::: ::
CCDS54 STDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 IFWQKEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKA
.:::::::: ::::.: ::..: :::: :.:.:: .::.:::::.:::..:::::::::
CCDS54 VFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKA
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 LLEIKGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQPSVRWKKDGQWLQGDDLQ
::. . : ::.::::::::::.. ... : :..::.: : . : :.: . : : .
CCDS54 QLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPR
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 FKTMANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDPPTEPSSPPG
. .::: : :.. : : :.::: ::.::..::. : . :. :.. . . :. ::
CCDS54 ATIQEQGTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES-GATISKNYDLSDLPG
490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KE6 APSQPVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGNTWRTVADGVQLETHTVS
::.: ::..::::.::.:.:. ...:.::::: ...:.:.:::. :. .::
CCDS54 PPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVR
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KE6 GLQPNTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVEDPWRGQQGLAEVAVRLQE
::.:::::::.:::.. :::.:::.:.:::::: :: : . :. :..: :::..
CCDS54 GLRPNTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHN
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720 730
pF1KE6 PIVLGPRTLQVSWTVDGPVQLVQGFRVSWR-VAGPEG-GSWTMLDLQSPSQQSTVLRGLP
:.:: : :.::.:::: :..::.:: .: ..: .. .:: :: . :...:.:: .:
CCDS54 PVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLK
660 670 680 690 700 710
740 750 760 770 780 790
pF1KE6 PGTQIQIKVQAQGQEGLGAESLSVTRSIPEEAPSGPPQGVAVALGGDGNS-SITVSWEPP
:. .:::. .: : .: : : :::::.:::.:.: :. :: ::.:::.::
CCDS54 KGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPP
720 730 740 750 760 770
800 810 820 830 840 850
pF1KE6 LPSQQNGVITEYQIWCLGNESRFHLNRSAAGWARSAMLRGLVPGLLYRTLVAAATSAGVG
:..:::.: ::.:::::::.:::.:... . ::... :: ::. ::. :::.::::::
CCDS54 PPDHQNGIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVG
780 790 800 810 820 830
860 870 880 890 900 910
pF1KE6 VPSAPVLVQLPSPPDLEPGLEVGAGLAVRLARVLREPAFLAGSGAACGALLLGLCAALYW
: : : . . .. : . ... ... :...:::.:: :.:: ..:.:. :::
CCDS54 VKSEPQPIIIGRRNEVVI-TENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYW
840 850 860 870 880 890
920 930 940 950 960 970
pF1KE6 RRKQRKELSHYTASFAYTPAVSFPHSEG-LSGASSRPPM-GLGPAPYSWLADSWPHPSR-
:::.:: ::.: ::.: ...: : . .::: . . : : ::::::: :
CCDS54 RRKKRKGLSNY--------AVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLP
900 910 920 930 940 950
980 990 1000 1010 1020
pF1KE6 -SPSAQEP-------RGSCCPSNPDPDDR---YYNEAGISLYLAQTARGTAAPGEGPVYS
. : . : ::. : : :. . ....: . :.. . . . .
CCDS54 VNNSNSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQA
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060
pF1KE6 TIDPAGEELQTFHGGFPQHPSGDL-GP-WSQ------------YAPPEWSQGDSGAKGGK
: : . : .:.. .. . :: : :.. :. :. ..:..:.::::
CCDS54 T--PYATT-QILHSNSIHELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGK
1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE6 VKL---LGKPVQMPSLNWPEA-LPPPP----PSCELSCLEGPEEELEGSSEPEEWCPPMP
: .:: . . .: .. ::::: :. :: . :. :.. . . ::::.:
CCDS54 KKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELE--HYAVEQQENGYDSDSWCPPLP
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE6 ERSHLTE------PSSSGGCLVTPSRRETPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPH
...: . .. . : : . ::. :.:::::::::::: . :: . :
CCDS54 VQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQA-H
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE6 LHQMPRRVPLGPSSPL----SVSQPMLGIREARPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAP
: .. : . .. : .:: . : : .: : : . : . :..
CCDS54 LDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQP--PVPPLGYVSGALISD-LETDVADDDADDE-
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE6 GRTWQGNGEMTPPL----QGPRARFRKKPKALPYRRENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALE
. :. :: : : . . . ... . .: . : : : ... .
CCDS54 ----EEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTS--SQRPRPTSPFSTDSNTSAA
1250 1260 1270 1280 1290
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE6 LRAAGSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDEEAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTA
: . .....:. :.: .: :::: .:::.::: :
CCDS54 LSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALP--HRREGMTDEEALVPYSKPSFPS----------P
1300 1310 1320 1330 1340
1350 1360 1370 1380
pF1KE6 GSNSSRGSSSSRGSRGPGRSRSRSQSRSQSQRPGQKRREEPR
:..:: :..::.:: :: ..
CCDS54 GGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
1350 1360 1370 1380 1390
>>CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378 aa)
initn: 3435 init1: 2137 opt: 3375 Z-score: 1462.6 bits: 283.1 E(32554): 3.8e-75
Smith-Waterman score: 3654; 44.6% identity (68.6% similar) in 1366 aa overlap (52-1364:19-1346)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 DISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSRGEPA
..:::. :: :::::.: :..::.:::.
CCDS43 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPT
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 TLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVY
:: :.::::: :.:::::.: :: : ..:::.::.:::::.::: :::::::..:::: :
CCDS43 TLNCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSY
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWR
.:::::::: :.:::::::::.:::::::.: .::::.::::.::: ::::::::.. :.
CCDS43 VCVARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWK
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 KDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFL
:: .:. ..: ::.:::::::.:.: :::::::.::..::.:::.: ::. :.:::.::
CCDS43 KDKVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFL
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 RRPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPTGRYEIRSDHSLWIGHVSAEDE
:::.::::: . : : :.:.::: : .::.:.:..:: :::.:..:..: : .. . ::
CCDS43 RRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDE
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 GTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAPGESVAFQCETKGNPPPAIFWQ
::: :.::: ::. :::..:.:..:::.:..:.::..: :..:.: ::::::: ::.:::
CCDS43 GTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 KEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKALLEI
::::: ::::.: ::..: :::: :.:.:: .::.:::::.:::..::::::::: ::.
CCDS43 KEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEV
350 360 370 380 390 400
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. : ::.::::::::::.. ... : :..::.: : . : :.: . : : . .
CCDS43 TDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQ
410 420 430 440 450 460
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pF1KE6 ANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDPPTEPSSPPGAPSQ
.::: : :.. : : :.::: ::.::..::. : . :. :.. . . :. :: ::.
CCDS43 EQGTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES-GATISKNYDLSDLPGPPSK
470 480 490 500 510 520
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: ::..::::.::.:.:. ...:.::::: ...:.:.:::. :. .:: ::.:
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::::::.:::.. :::.:::.:.:::::: :: : . :. :..: :::..:.::
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: :.::.:::: :..::.:: .: ..: .. .:: :: . :...:.:: .: :.
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.:::. .: : .: : : :::::.:::.:.: :. :: ::.:::.:: :..
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:::.: ::.:::::::.:::.:... . ::... :: ::. ::. :::.::::::: :
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: . . .. : . ... ... :...:::.:: :.:: ..:.:. ::::::.
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:: ::.: ::.: ...: : . .::: . . : : ::::::: : . :
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. : ::. : : :. . ....: . :.. . . . .: :
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. : .:.. .. . :: : :.. :. :. ..:..:.:::: :
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.:: . . .: .. ::::: :. :: . :. :.. . . ::::.: ...
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: . .. . : : . ::. :.:::::::::::: . :: . :: ..
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pF1KE6 PRRVPLGPSSPL----SVSQPMLGIREARPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAPGRTW
: . .. : .:: . : : .: : : . : . :..
CCDS43 TRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQP--PVPPLGYVSGALISD-LETDVADDDADDE-----
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pF1KE6 QGNGEMTPPL----QGPRARFRKKPKALPYRRENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALELRAA
. :. :: : : . . . ... . .: . : : : ... . : .
CCDS43 EEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTS--SQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQS
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pF1KE6 GSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDEEAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTAGSNS
.....:. :.: .: :::: .:::.::: : :..:
CCDS43 QRPRPTKKHKGGRMDQQPALP--HRREGMTDEEALVPYSKPSFPS----------PGGHS
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CCDS43 SSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
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. ::.: : .. : : :.:.:.. .::::::......: .:: .:: :.:. :.
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::.::.::::::::..:.:.:.:: .:.::.::: :. : . :. :......:..
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: ::. ...: :::: : .::... .: .: . : .: ......:...:.:. :
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: . :::.. ::..::::::.:.:.:... : . :... ::::. : . :::.:.::
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:: : : ..:: . . . : .: .:: ... :...:::.:: :::: .:. . :
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: .::.:. : :...: :.. .. ....:: . ... :: ::::.::. .
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. . . ::: . : : . :.. : . : :. :.. ::
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CCDS54 HWKPLGQQKQEVAPVQYNIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNTGGSYNSSDRGS
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. ::..: : : : ..:. .:: . ::::: : . : : . .. : . :
CCDS54 STSGSQGHK-KGARTP-KVPKQGGMNWADLLPPPPAHPPPH-SNSEEYNISVDESYDQEM
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CCDS54 PCPVPPARMYLQQDELEEEEDERGP--TPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQ
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: : . :....: :: :..: : .: : . : .:: .: . .
CCDS54 PMLQDCPEETGHMQHQPDRRRQPVSPPPP---PRP---ISPPHTYGYISGPLVSDMDTDA
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:
CCDS54 PEEEEDEADMEVAKMQTRRLLLRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSG
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>>CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE6 ISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSRGEPAT
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CCDS46 MIAEPAHFYLFGLICLCSGSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPAT
10 20 30 40
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pF1KE6 LPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVYT
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CCDS46 LNCKAEGRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYV
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 CVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWRK
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CCDS46 CVARNYLGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKK
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pF1KE6 DGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFLR
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CCDS46 DGSPLDDKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVK
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pF1KE6 RPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPTGRYEIRSDHSLWIGHVSAEDEG
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CCDS46 RPSNLAVTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMG
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CCDS46 WRREGSQNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYL
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CCDS46 EVTDVIADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIK
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pF1KE6 TMANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDPP--TEPSSPPG
. ::.: : .. : : :.:.:.. .::::::......: .:: .:: :.:. :.
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