Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6722
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6722, 765 aa
1>>>pF1KE6722 765 - 765 aa - 765 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7855+/-0.000383; mu= 18.2156+/- 0.024
mean_var=81.3239+/-16.172, 0's: 0 Z-trim(113.7): 37 B-trim: 405 in 1/54
Lambda= 0.142222
statistics sampled from 23190 (23226) to 23190 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 8.370
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006355 (OMIM: 607812,610511) protein transport ( 765) 5193 1075.8 0
XP_016876417 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: prot ( 748) 5026 1041.5 0
NP_116780 (OMIM: 224100,610512,616858) protein tra ( 767) 4539 941.6 0
XP_016883082 (OMIM: 224100,610512,616858) PREDICTE ( 767) 4539 941.6 0
NP_006354 (OMIM: 224100,610512,616858) protein tra ( 767) 4539 941.6 0
NP_001166216 (OMIM: 224100,610512,616858) protein ( 767) 4539 941.6 0
NP_116781 (OMIM: 224100,610512,616858) protein tra ( 767) 4539 941.6 0
XP_011534657 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: prot ( 772) 3939 818.5 0
XP_005267319 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: prot ( 789) 3939 818.5 0
NP_001166217 (OMIM: 224100,610512,616858) protein ( 749) 3663 761.8 0
XP_011529842 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra ( 733) 174 45.9 0.00071
XP_016863141 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1172) 174 46.1 0.001
XP_011529841 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1203) 174 46.1 0.0011
XP_011529839 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1241) 174 46.1 0.0011
XP_011529838 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1244) 174 46.1 0.0011
NP_001305014 (OMIM: 607184) protein transport prot (1267) 174 46.1 0.0011
NP_006314 (OMIM: 607184) protein transport protein (1268) 174 46.1 0.0011
NP_001287742 (OMIM: 607184) protein transport prot (1298) 174 46.1 0.0011
XP_005262745 (OMIM: 607184) PREDICTED: protein tra (1299) 174 46.1 0.0011
XP_016864452 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra ( 555) 159 42.8 0.0048
NP_001239160 (OMIM: 607183) protein transport prot ( 613) 159 42.8 0.0052
XP_006714586 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra (1035) 159 42.9 0.0079
XP_016864450 (OMIM: 607183) PREDICTED: protein tra (1067) 159 43.0 0.0082
NP_068817 (OMIM: 607183) protein transport protein (1093) 159 43.0 0.0083
>>NP_006355 (OMIM: 607812,610511) protein transport prot (765 aa)
initn: 5193 init1: 5193 opt: 5193 Z-score: 5755.8 bits: 1075.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5193; 99.7% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPVTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPLTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSPDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSPDES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 SYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQILIYH
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPILYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQILIYH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE6 KVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
730 740 750 760
>>XP_016876417 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: protein (748 aa)
initn: 5022 init1: 5022 opt: 5026 Z-score: 5570.8 bits: 1041.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5026; 98.4% identity (99.2% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPVTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPLTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSPDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSPDES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 SYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQILIYH
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPILYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQILIYH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 GETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE6 KVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
::::::::::::::::: .. . .:
XP_016 KVNPSQTHNNMYAWGQEIHPEVFRNKMS
730 740
>>NP_116780 (OMIM: 224100,610512,616858) protein transpo (767 aa)
initn: 3268 init1: 3268 opt: 4539 Z-score: 5030.6 bits: 941.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4539; 84.9% identity (95.8% similar) in 767 aa overlap (1-764:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::.::::::
NP_116 MATYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLLTPLKERPDLPPVQYEPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::: ::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.::::.::::::.::::.::::
NP_116 CSRPTCKAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYGGISEVNQPAELMPQFSTIEYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
. :: : :::::::::::.:..::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
NP_116 IQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSK--VPVTQATRGPQVQQPP-PSNRFLQPVQKID
:::::::::::::::.:::.:.::::.: .:. :: : : :. : :.::::::.:::
NP_116 EGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPMQQA-RPAQPQEHPFASSRFLQPVHKID
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MNLTDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQG
::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
NP_116 MNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PGMVVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGL
:::::::::: ::::::::.::::...::.:::.: ::::.:..:: :::::::::::::
NP_116 PGMVVGDELKIPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRTAANGHCIDIYACALDQTGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 LEMKCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKIS
:::::: ::::::::::::::::::::::::.::::..:.:.:.::.::..:::::.::.
NP_116 LEMKCCANLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFTKDFNGDFRMAFGATLDVKTSRELKIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GAIGPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRG
:::::::::: :::::::::.:.::: :::::::.::.::.::::::::::.::::::::
NP_116 GAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKICGLDPTSTLGIYFEVVNQHNTPIPQGGRG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 AIQFVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETE
::::::.::::: :::::::::::::::.:.:...: :.:::::::.:::::...:::.:
NP_116 AIQFVTHYQHSSTQRRIRVTTIARNWADVQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 EGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSP
:::::::::::::::::::::.:.:.::.:::.:..:::::::::::::: :::::::::
NP_116 EGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSP
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 DESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIL
:::::::::: ::::::::::::::.:.::: :::::::::::::::::::::::::::.
NP_116 DESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE6 IYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARF
:: :::::::::.:::::::::::.::::::.:::::::..::::::::.::::::::::
NP_116 IYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KE6 LLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC
720 730 740 750 760
>>XP_016883082 (OMIM: 224100,610512,616858) PREDICTED: p (767 aa)
initn: 3268 init1: 3268 opt: 4539 Z-score: 5030.6 bits: 941.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4539; 84.9% identity (95.8% similar) in 767 aa overlap (1-764:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::.::::::
XP_016 MATYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPLACLLTPLKERPDLPPVQYEPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::: ::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.::::.::::::.::::.::::
XP_016 CSRPTCKAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYGGISEVNQPAELMPQFSTIEYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
. :: : :::::::::::.:..::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
XP_016 IQRGAQSPLIFLYVVDTCLEEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSK--VPVTQATRGPQVQQPP-PSNRFLQPVQKID
:::::::::::::::.:::.:.::::.: .:. :: : : :. : :.::::::.:::
XP_016 EGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPMQQA-RPAQPQEHPFASSRFLQPVHKID
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
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::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
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360 370 380 390 400 410
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XP_016 GAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKICGLDPTSTLGIYFEVVNQHNTPIPQGGRG
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480 490 500 510 520 530
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::::::.::::: :::::::::::::::.:.:...: :.:::::::.:::::...:::.:
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:::::::::: ::::::::::::::.:.::: :::::::::::::::::::::::::::.
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:: :::::::::.:::::::::::.::::::.:::::::..::::::::.::::::::::
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:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
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>>NP_006354 (OMIM: 224100,610512,616858) protein transpo (767 aa)
initn: 3268 init1: 3268 opt: 4539 Z-score: 5030.6 bits: 941.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4539; 84.9% identity (95.8% similar) in 767 aa overlap (1-764:1-766)
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:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::.::::::
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. :: : :::::::::::.:..::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
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::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
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:::::::::: ::::::::.::::...::.:::.: ::::.:..:: :::::::::::::
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:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::.::::::
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. :: : :::::::::::.:..::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
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::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
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>>NP_116781 (OMIM: 224100,610512,616858) protein transpo (767 aa)
initn: 3268 init1: 3268 opt: 4539 Z-score: 5030.6 bits: 941.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4539; 84.9% identity (95.8% similar) in 767 aa overlap (1-764:1-766)
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. :: : :::::::::::.:..::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
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NP_116 EGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPMQQA-RPAQPQEHPFASSRFLQPVHKID
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pF1KE6 MNLTDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQG
::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
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:::::::::: ::::::::.::::...::.:::.: ::::.:..:: :::::::::::::
NP_116 PGMVVGDELKIPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRTAANGHCIDIYACALDQTGL
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pF1KE6 LEMKCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKIS
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NP_116 LEMKCCANLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFTKDFNGDFRMAFGATLDVKTSRELKIA
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pF1KE6 AIQFVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETE
::::::.::::: :::::::::::::::.:.:...: :.:::::::.:::::...:::.:
NP_116 AIQFVTHYQHSSTQRRIRVTTIARNWADVQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESE
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NP_116 EGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSP
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pF1KE6 DESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIL
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NP_116 DESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIV
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pF1KE6 IYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARF
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NP_116 IYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARF
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pF1KE6 LLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC
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>>XP_011534657 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: protein (772 aa)
initn: 3939 init1: 3939 opt: 3939 Z-score: 4365.2 bits: 818.5 E(85289): 0
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pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
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pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
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pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPVTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPLTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
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pF1KE6 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE6 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQ---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQRRDFPKTSGEILENQEKARSA
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE6 ---FMFHLRRSSFLQVFNNSPDESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_011 CLKFMFHLRRSSFLQVFNNSPDESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPILYAYSFSGPPEPVL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE6 LDSSSILADRILLMDTFFQILIYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDSSSILADRILLMDTFFQILIYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEIL
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700 710 720 730 740 750
pF1KE6 HSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .. . .:
XP_011 HSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNMYAWGQEIHPEVFRNKMS
730 740 750 760 770
760
pF1KE6 KKLAVSSAA
>>XP_005267319 (OMIM: 607812,610511) PREDICTED: protein (789 aa)
initn: 3939 init1: 3939 opt: 3939 Z-score: 4365.1 bits: 818.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5135; 96.7% identity (97.0% similar) in 789 aa overlap (1-765:1-789)
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pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
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pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
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pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPVTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSKVPLTQATRGPQVQQPPPSNRFLQPVQKIDMNL
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQGPGM
250 260 270 280 290 300
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pF1KE6 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGLLEM
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pF1KE6 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKISGAI
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pF1KE6 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRGAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETEEGP
490 500 510 520 530 540
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pF1KE6 DVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQ---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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580 590 600 610 620 630
pF1KE6 ---FMFHLRRSSFLQVFNNSPDESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
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640 650 660 670 680 690
pF1KE6 LDSSSILADRILLMDTFFQILIYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDSSSILADRILLMDTFFQILIYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEIL
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700 710 720 730 740 750
pF1KE6 HSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HSRFPMPRYIDTEHGGSQARFLLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHL
730 740 750 760 770 780
760
pF1KE6 KKLAVSSAA
:::::::::
XP_005 KKLAVSSAA
>>NP_001166217 (OMIM: 224100,610512,616858) protein tran (749 aa)
initn: 4038 init1: 3268 opt: 3663 Z-score: 4059.4 bits: 761.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4392; 82.9% identity (93.9% similar) in 767 aa overlap (1-764:1-748)
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pF1KE6 MTTYLEFIQQNEERDGVRFSWNVWPSSRLEATRMVVPVAALFTPLKERPDLPPIQYEPVL
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::.::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 CSRTTCRAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCYQRNQFPPSYAGISELNQPAELLPQFSSIEYV
::: ::.:::::::::::::::::::::.:::::::.:.::::.::::::.::::.::::
NP_001 CSRPTCKAVLNPLCQVDYRAKLWACNFCFQRNQFPPAYGGISEVNQPAELMPQFSTIEYV
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pF1KE6 VLRGPQMPLIFLYVVDTCMEDEDLQALKESMQMSLSLLPPTALVGLITFGRMVQVHELGC
. ...::::::::.::::::::: :::::::::::::::::.:
NP_001 I------------------QEDDLQALKESLQMSLSLLPPDALVGLITFGRMVQVHELSC
130 140 150 160
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pF1KE6 EGISKSYVFRGTKDLSAKQLQEMLGLSK--VPVTQATRGPQVQQPP-PSNRFLQPVQKID
:::::::::::::::.:::.:.::::.: .:. :: : : :. : :.::::::.:::
NP_001 EGISKSYVFRGTKDLTAKQIQDMLGLTKPAMPMQQA-RPAQPQEHPFASSRFLQPVHKID
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 MNLTDLLGELQRDPWPVPQGKRPLRSSGVALSIAVGLLECTFPNTGARIMMFIGGPATQG
::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::::::.: ::: :::
NP_001 MNLTDLLGELQRDPWPVTQGKRPLRSTGVALSIAVGLLEGTFPNTGARIMLFTGGPPTQG
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 PGMVVGDELKTPIRSWHDIDKDNAKYVKKGTKHFEALANRAATTGHVIDIYACALDQTGL
:::::::::: ::::::::.::::...::.:::.: ::::.:..:: :::::::::::::
NP_001 PGMVVGDELKIPIRSWHDIEKDNARFMKKATKHYEMLANRTAANGHCIDIYACALDQTGL
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pF1KE6 LEMKCCPNLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRVFTKDMHGQFKMGFGGTLEIKTSREIKIS
:::::: ::::::::::::::::::::::::.::::..:.:.:.::.::..:::::.::.
NP_001 LEMKCCANLTGGYMVMGDSFNTSLFKQTFQRIFTKDFNGDFRMAFGATLDVKTSRELKIA
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 GAIGPCVSLNSKGPCVSENEIGTGGTCQWKICGLSPTTTLAIYFEVVNQHNAPIPQGGRG
:::::::::: :::::::::.:.::: :::::::.::.::.::::::::::.::::::::
NP_001 GAIGPCVSLNVKGPCVSENELGVGGTSQWKICGLDPTSTLGIYFEVVNQHNTPIPQGGRG
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pF1KE6 AIQFVTQYQHSSGQRRIRVTTIARNWADAQTQIQNIAASFDQEAAAILMARLAIYRAETE
::::::.::::: :::::::::::::::.:.:...: :.:::::::.:::::...:::.:
NP_001 AIQFVTHYQHSSTQRRIRVTTIARNWADVQSQLRHIEAAFDQEAAAVLMARLGVFRAESE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE6 EGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGEYHKDDPSSFRFSETFSLYPQFMFHLRRSSFLQVFNNSP
:::::::::::::::::::::.:.:.::.:::.:..:::::::::::::: :::::::::
NP_001 EGPDVLRWLDRQLIRLCQKFGQYNKEDPTSFRLSDSFSLYPQFMFHLRRSPFLQVFNNSP
530 540 550 560 570 580
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pF1KE6 DESSYYRHHFMRQDLTQSLIMIQPIMYAYSFSGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIL
:::::::::: ::::::::::::::.:.::: :::::::::::::::::::::::::::.
NP_001 DESSYYRHHFARQDLTQSLIMIQPILYSYSFHGPPEPVLLDSSSILADRILLMDTFFQIV
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pF1KE6 IYHGETIAQWRKSGYQDMPEYENFRHLLQAPVDDAQEILHSRFPMPRYIDTEHGGSQARF
:: :::::::::.:::::::::::.::::::.:::::::..::::::::.::::::::::
NP_001 IYLGETIAQWRKAGYQDMPEYENFKHLLQAPLDDAQEILQARFPMPRYINTEHGGSQARF
650 660 670 680 690 700
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pF1KE6 LLSKVNPSQTHNNMYAWGQESGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAA
:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLSKVNPSQTHNNLYAWGQETGAPILTDDVSLQVFMDHLKKLAVSSAC
710 720 730 740
765 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:42:29 2016 done: Tue Nov 8 15:42:30 2016
Total Scan time: 8.370 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]