Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6718
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6718, 682 aa
1>>>pF1KE6718 682 - 682 aa - 682 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6297+/-0.00123; mu= 17.3679+/- 0.074
mean_var=60.2669+/-11.927, 0's: 0 Z-trim(100.0): 25 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.165209
statistics sampled from 5922 (5929) to 5922 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43411.1 GFPT2 gene_id:9945|Hs108|chr5 ( 682) 4416 1061.8 0
CCDS33216.1 GFPT1 gene_id:2673|Hs108|chr2 ( 681) 3637 876.1 0
CCDS58713.1 GFPT1 gene_id:2673|Hs108|chr2 ( 699) 2442 591.3 1.6e-168
>>CCDS43411.1 GFPT2 gene_id:9945|Hs108|chr5 (682 aa)
initn: 4416 init1: 4416 opt: 4416 Z-score: 5682.0 bits: 1061.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4416; 99.9% identity (100.0% similar) in 682 aa overlap (1-682:1-682)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNHEVKERHIQLVKKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVVIHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQLEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKTRMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKRSAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGLKDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDVCFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTKAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS43 ISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTKAYT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYTQRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKDPCF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 AKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLLSFH
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE6 LAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
::::::::::::::::::::::
CCDS43 LAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
670 680
>>CCDS33216.1 GFPT1 gene_id:2673|Hs108|chr2 (681 aa)
initn: 3640 init1: 2440 opt: 3637 Z-score: 4678.5 bits: 876.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3637; 79.0% identity (94.6% similar) in 685 aa overlap (1-682:1-681)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLV
:::::::.::.:::::.::.::::::::::::::::::::..::.: :.. .:::.
CCDS33 MCGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGYDSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 KKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVV
::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::::::: :: ::::::::::.:::.:
CCDS33 KKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTRWATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQ
::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::..::::..: .:.:::::::::
CCDS33 IHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKLVKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLENVKNICKT
:::::::::::::.::.::.:::::::::::::..::::..::::::: .. :. :.
CCDS33 LEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEHKLSTDHIPILYRTG--KDKKGSCN-
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDDIAAVADGKLSIHRVKR
..:.::..:: : .::::..:::::::.::::::::::::::.:::.::.:::::.::
CCDS33 -LSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDDVAAVVDGRLSIHRIKR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTMRGRVNFETNTVLLGGL
.:.: :.::.::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::. :: ::::
CCDS33 TAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTMRGRVNFDDYTVNLGGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDV
:::.:::.::::::.:.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEELTELPVMVELASDFLDRNTPVFRDDV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 CFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDCGVHINAGPEVGVASTK
:::.::::::::::..:::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS33 CFFLSQSGETADTLMGLRYCKERGALTVGITNTVGSSISRETDCGVHINAGPEIGVASTK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 AYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEVLSLEEKIHDLALELYT
::::::.:::::.::: .::::.:.::.::. ::. ::.:::::::....:. :: :::
CCDS33 AYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATELYH
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 QRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALIDKQMPVIMVIMKD
:.:.:.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::.::.:
CCDS33 QKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE6 PCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHTVDCLQGILSVIPLQLL
.::::::::::.::::::...:.:.:::. : . .::..::.::::::::::::::::
CCDS33 HTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHSVDCLQGILSVIPLQLL
600 610 620 630 640 650
660 670 680
pF1KE6 SFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
.::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
660 670 680
>>CCDS58713.1 GFPT1 gene_id:2673|Hs108|chr2 (699 aa)
initn: 3640 init1: 2440 opt: 2442 Z-score: 3139.0 bits: 591.3 E(32554): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 3610; 77.2% identity (92.4% similar) in 701 aa overlap (1-682:1-699)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MCGIFAYMNYRVPRTRKEIFETLIKGLQRLEYRGYDSAGVAIDGNNH---EVKERHIQLV
:::::::.::.:::::.::.::::::::::::::::::::..::.: :.. .:::.
CCDS58 MCGIFAYLNYHVPRTRREILETLIKGLQRLEYRGYDSAGVGFDGGNDKDWEANACKIQLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 KKRGKVKALDEELYKQDSMDLKVEFETHFGIAHTRWATHGVPSAVNSHPQRSDKGNEFVV
::.:::::::::..::..::: .::..:.::::::::::: :: ::::::::::.:::.:
CCDS58 KKKGKVKALDEEVHKQQDMDLDIEFDVHLGIAHTRWATHGEPSPVNSHPQRSDKNNEFIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IHNGIITNYKDLRKFLESKGYEFESETDTETIAKLIKYVFDNRETEDITFSTLVERVIQQ
::::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::..::::..: .:.:::::::::
CCDS58 IHNGIITNYKDLKKFLESKGYDFESETDTETIAKLVKYMYDNRESQDTSFTTLVERVIQQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE6 LEGAFALVFKSVHYPGEAVATRRGSPLLIGVRSKYKLSTEQIPILYRTCTLE--------
:::::::::::::.::.::.:::::::::::::..::::..::::::: .
CCDS58 LEGAFALVFKSVHFPGQAVGTRRGSPLLIGVRSEHKLSTDHIPILYRTARTQIGSKFTRW
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 --------NVKNICKTRMKRLDSSACLHAVGDKAVEFFFASDASAIIEHTNRVIFLEDDD
. :. :. ..:.::..:: : .::::..:::::::.::::::::::::::
CCDS58 GSQGERGKDKKGSCN--LSRVDSTTCLFPVEEKAVEYYFASDASAVIEHTNRVIFLEDDD
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 IAAVADGKLSIHRVKRSASDDPSRAIQTLQMELQQIMKGNFSAFMQKEIFEQPESVFNTM
.:::.::.:::::.::.:.: :.::.::::::::::::::::.::::::::::::: :::
CCDS58 VAAVVDGRLSIHRIKRTAGDHPGRAVQTLQMELQQIMKGNFSSFMQKEIFEQPESVVNTM
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 RGRVNFETNTVLLGGLKDHLKEIRRCRRLIVIGCGTSYHAAVATRQVLEELTELPVMVEL
::::::. :: :::::::.:::.::::::.:.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS58 RGRVNFDDYTVNLGGLKDHIKEIQRCRRLILIACGTSYHAGVATRQVLEELTELPVMVEL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 ASDFLDRNTPVFRDDVCFFISQSGETADTLLALRYCKDRGALTVGVTNTVGSSISRETDC
:::::::::::::::::::.::::::::::..:::::.:::::::.::::::::::::::
CCDS58 ASDFLDRNTPVFRDDVCFFLSQSGETADTLMGLRYCKERGALTVGITNTVGSSISRETDC
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 GVHINAGPEVGVASTKAYTSQFISLVMFGLMMSEDRISLQNRRQEIIRGLRSLPELIKEV
:::::::::.::::::::::::.:::::.::: .::::.:.::.::. ::. ::.:::::
CCDS58 GVHINAGPEIGVASTKAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 LSLEEKIHDLALELYTQRSLLVMGRGYNYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPL
::....:. :: ::: :.:.:.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSMDDEIQKLATELYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE6 ALIDKQMPVIMVIMKDPCFAKCQNALQQVTARQGRPIILCSKDDTESSKFAYKTIELPHT
::.:: :::::.::.: .::::::::::.::::::...:.:.:::. : . .::..::.
CCDS58 ALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKEDTETIKNTKRTIKVPHS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680
pF1KE6 VDCLQGILSVIPLQLLSFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VDCLQGILSVIPLQLLAFHLAVLRGYDVDFPRNLAKSVTVE
660 670 680 690
682 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:40:58 2016 done: Tue Nov 8 15:40:58 2016
Total Scan time: 2.130 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]