Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6715
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6715, 748 aa
1>>>pF1KE6715 748 - 748 aa - 748 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0249+/-0.000343; mu= 8.3534+/- 0.022
mean_var=142.4026+/-28.796, 0's: 0 Z-trim(118.6): 53 B-trim: 560 in 1/53
Lambda= 0.107477
statistics sampled from 31743 (31796) to 31743 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 9.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065706 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 iso ( 748) 4999 786.9 0
XP_005251331 (OMIM: 605266,607831) PREDICTED: junc ( 661) 2187 350.9 9.8e-96
NP_001304759 (OMIM: 605266,607831) junctophilin-1 ( 661) 2187 350.9 9.8e-96
XP_005251332 (OMIM: 605266,607831) PREDICTED: junc ( 661) 2187 350.9 9.8e-96
NP_065698 (OMIM: 605266,607831) junctophilin-1 [Ho ( 661) 2187 350.9 9.8e-96
NP_065166 (OMIM: 605267,613873) junctophilin-2 iso ( 696) 1956 315.1 6.2e-85
XP_016878973 (OMIM: 605268,606438) PREDICTED: junc ( 148) 969 161.7 1.9e-39
NP_001258534 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 ( 150) 964 161.0 3.3e-39
XP_016878972 (OMIM: 605268,606438) PREDICTED: junc ( 176) 956 159.8 9e-39
NP_001258533 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 ( 186) 956 159.8 9.5e-39
NP_787109 (OMIM: 605267,613873) junctophilin-2 iso ( 129) 824 139.2 1e-32
XP_006723896 (OMIM: 605267,613873) PREDICTED: junc ( 147) 821 138.8 1.5e-32
>>NP_065706 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 isoform (748 aa)
initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999 Z-score: 4195.3 bits: 786.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4999; 99.6% identity (99.6% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKSSLASQRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKSSLASQRSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEFS
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EKVDRAVEAAERAATIAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 PSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEVLSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDSPLQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_065 PSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEVLSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTPDDSPLQSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSWGEEQAGGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSWGEEQAGGSR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 GVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 LELQEEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGACRGLGDDHRLEDRGFGVQRLRSKAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
NP_065 LELQEEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGACRGLGDDHRPEDRGFGVQRLRSKAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 NKENFRPASSAEPAVQKLASLRLGGAEPRLLRWDLTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NKENFRPASSAEPAVQKLASLRLGGAEPRLLRWDLTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE6 STGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
730 740
>>XP_005251331 (OMIM: 605266,607831) PREDICTED: junctoph (661 aa)
initn: 2168 init1: 1120 opt: 2187 Z-score: 1839.7 bits: 350.9 E(85289): 9.8e-96
Smith-Waterman score: 2187; 63.4% identity (83.2% similar) in 517 aa overlap (3-510:2-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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XP_005 MTGGRFDFDDGGTYCGGWEEGKAHGHGICTGPKGQGEYSGSWSHGFEVVGGYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: ::::::::.:.:.::::.:.:::.::::::::::. . :.::::::::::::::
XP_005 YQGYWAQGKRHGLGVETKGKWMYRGEWSHGFKGRYGVRQSLCTPARYEGTWSNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
.:::.:::::::::.::::.:::::::::::::.:::::::::. :::::..::..:: :
XP_005 VETYGDGGTYQGQWAGGMRHGYGVRQSVPYGMATVIRSPLRTSLASLRSEQSNGSVLH-D
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRR-SLLSGLKLRKSESKSSLASQRS
:. :.: ::: .:::::: :.:.:. .:: ::::: :::...::::::::::..:.::
XP_005 AA-AAADSPAGTRGGFVLNFHADAELAGKKKGGLFRRGSLLGSMKLRKSESKSSISSKRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSG
: ::.:.:: .:: :: .::::.:... .. .:: .::::::::.::::::::.:
XP_005 ---SVRSDAAMSRISS--SDANSTISFGDVDCDFCPVEDHVDATTTETYMGEWKNDKRNG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKI
::::.::.:.:::::::.:.:::::: .::::.:::::::.:::: : ::.:::.: .:
XP_005 FGVSERSNGMKYEGEWANNKRHGYGCTVFPDGSKEEGKYKNNILVRGIRKQLIPIRHTKT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 REKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEF
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XP_005 REKVDRAIEGAQRAAAMARTKVEIANSRTAHARAKADAADQAALAARQECDIARAVAREL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 SPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEV----LSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDS
::.: . : .: . . : . : : . : .:::..::::::: . . :
XP_005 SPDFY--QPGPDYVKQRFQEGVDAKENPEEKVPEKPPTPKESPHFYRKGTTPPR-SPEAS
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 PLQSFPTSPAATPPP----APAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSW
: .: :::..: : :.. .. . .:.:. ::.
XP_005 PKHSH--SPASSPKPLKKQNPSSGARLNQDKRSVA-DEQVTAIVNKPLMSKAPTKEAGAV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GEEQAGGSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRAS
XP_005 VPQSKYSGRHHIPNPSNGELHSQYHGYYVKLNAPQHPPVDVEDGDGSSQSSSALVHKPSA
530 540 550 560 570 580
>>NP_001304759 (OMIM: 605266,607831) junctophilin-1 [Hom (661 aa)
initn: 2168 init1: 1120 opt: 2187 Z-score: 1839.7 bits: 350.9 E(85289): 9.8e-96
Smith-Waterman score: 2187; 63.4% identity (83.2% similar) in 517 aa overlap (3-510:2-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
.::::.:::::.::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::.: ::::::::
NP_001 MTGGRFDFDDGGTYCGGWEEGKAHGHGICTGPKGQGEYSGSWSHGFEVVGGYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: ::::::::.:.:.::::.:.:::.::::::::::. . :.::::::::::::::
NP_001 YQGYWAQGKRHGLGVETKGKWMYRGEWSHGFKGRYGVRQSLCTPARYEGTWSNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
.:::.:::::::::.::::.:::::::::::::.:::::::::. :::::..::..:: :
NP_001 VETYGDGGTYQGQWAGGMRHGYGVRQSVPYGMATVIRSPLRTSLASLRSEQSNGSVLH-D
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRR-SLLSGLKLRKSESKSSLASQRS
:. :.: ::: .:::::: :.:.:. .:: ::::: :::...::::::::::..:.::
NP_001 AA-AAADSPAGTRGGFVLNFHADAELAGKKKGGLFRRGSLLGSMKLRKSESKSSISSKRS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSG
: ::.:.:: .:: :: .::::.:... .. .:: .::::::::.::::::::.:
NP_001 ---SVRSDAAMSRISS--SDANSTISFGDVDCDFCPVEDHVDATTTETYMGEWKNDKRNG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKI
::::.::.:.:::::::.:.:::::: .::::.:::::::.:::: : ::.:::.: .:
NP_001 FGVSERSNGMKYEGEWANNKRHGYGCTVFPDGSKEEGKYKNNILVRGIRKQLIPIRHTKT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 REKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEF
:::::::.:.:.:::. :. :.::: :::.:.::::.:: :: :..: ::: .:.:.
NP_001 REKVDRAIEGAQRAAAMARTKVEIANSRTAHARAKADAADQAALAARQECDIARAVAREL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 SPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEV----LSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDS
::.: . : .: . . : . : : . : .:::..::::::: . . :
NP_001 SPDFY--QPGPDYVKQRFQEGVDAKENPEEKVPEKPPTPKESPHFYRKGTTPPR-SPEAS
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 PLQSFPTSPAATPPP----APAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSW
: .: :::..: : :.. .. . .:.:. ::.
NP_001 PKHSH--SPASSPKPLKKQNPSSGARLNQDKRSVA-DEQVTAIVNKPLMSKAPTKEAGAV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GEEQAGGSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRAS
NP_001 VPQSKYSGRHHIPNPSNGELHSQYHGYYVKLNAPQHPPVDVEDGDGSSQSSSALVHKPSA
530 540 550 560 570 580
>>XP_005251332 (OMIM: 605266,607831) PREDICTED: junctoph (661 aa)
initn: 2168 init1: 1120 opt: 2187 Z-score: 1839.7 bits: 350.9 E(85289): 9.8e-96
Smith-Waterman score: 2187; 63.4% identity (83.2% similar) in 517 aa overlap (3-510:2-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
.::::.:::::.::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::.: ::::::::
XP_005 MTGGRFDFDDGGTYCGGWEEGKAHGHGICTGPKGQGEYSGSWSHGFEVVGGYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: ::::::::.:.:.::::.:.:::.::::::::::. . :.::::::::::::::
XP_005 YQGYWAQGKRHGLGVETKGKWMYRGEWSHGFKGRYGVRQSLCTPARYEGTWSNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
.:::.:::::::::.::::.:::::::::::::.:::::::::. :::::..::..:: :
XP_005 VETYGDGGTYQGQWAGGMRHGYGVRQSVPYGMATVIRSPLRTSLASLRSEQSNGSVLH-D
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRR-SLLSGLKLRKSESKSSLASQRS
:. :.: ::: .:::::: :.:.:. .:: ::::: :::...::::::::::..:.::
XP_005 AA-AAADSPAGTRGGFVLNFHADAELAGKKKGGLFRRGSLLGSMKLRKSESKSSISSKRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSG
: ::.:.:: .:: :: .::::.:... .. .:: .::::::::.::::::::.:
XP_005 ---SVRSDAAMSRISS--SDANSTISFGDVDCDFCPVEDHVDATTTETYMGEWKNDKRNG
240 250 260 270 280 290
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pF1KE6 FGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKI
::::.::.:.:::::::.:.:::::: .::::.:::::::.:::: : ::.:::.: .:
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pF1KE6 REKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEF
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XP_005 REKVDRAIEGAQRAAAMARTKVEIANSRTAHARAKADAADQAALAARQECDIARAVAREL
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pF1KE6 SPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEV----LSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDS
::.: . : .: . . : . : : . : .:::..::::::: . . :
XP_005 SPDFY--QPGPDYVKQRFQEGVDAKENPEEKVPEKPPTPKESPHFYRKGTTPPR-SPEAS
420 430 440 450 460
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pF1KE6 PLQSFPTSPAATPPP----APAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSW
: .: :::..: : :.. .. . .:.:. ::.
XP_005 PKHSH--SPASSPKPLKKQNPSSGARLNQDKRSVA-DEQVTAIVNKPLMSKAPTKEAGAV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GEEQAGGSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRAS
XP_005 VPQSKYSGRHHIPNPSNGELHSQYHGYYVKLNAPQHPPVDVEDGDGSSQSSSALVHKPSA
530 540 550 560 570 580
>>NP_065698 (OMIM: 605266,607831) junctophilin-1 [Homo s (661 aa)
initn: 2168 init1: 1120 opt: 2187 Z-score: 1839.7 bits: 350.9 E(85289): 9.8e-96
Smith-Waterman score: 2187; 63.4% identity (83.2% similar) in 517 aa overlap (3-510:2-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
.::::.:::::.::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::.: ::::::::
NP_065 MTGGRFDFDDGGTYCGGWEEGKAHGHGICTGPKGQGEYSGSWSHGFEVVGGYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: ::::::::.:.:.::::.:.:::.::::::::::. . :.::::::::::::::
NP_065 YQGYWAQGKRHGLGVETKGKWMYRGEWSHGFKGRYGVRQSLCTPARYEGTWSNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
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NP_065 VETYGDGGTYQGQWAGGMRHGYGVRQSVPYGMATVIRSPLRTSLASLRSEQSNGSVLH-D
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRR-SLLSGLKLRKSESKSSLASQRS
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NP_065 AA-AAADSPAGTRGGFVLNFHADAELAGKKKGGLFRRGSLLGSMKLRKSESKSSISSKRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSG
: ::.:.:: .:: :: .::::.:... .. .:: .::::::::.::::::::.:
NP_065 ---SVRSDAAMSRISS--SDANSTISFGDVDCDFCPVEDHVDATTTETYMGEWKNDKRNG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKI
::::.::.:.:::::::.:.:::::: .::::.:::::::.:::: : ::.:::.: .:
NP_065 FGVSERSNGMKYEGEWANNKRHGYGCTVFPDGSKEEGKYKNNILVRGIRKQLIPIRHTKT
300 310 320 330 340 350
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pF1KE6 REKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEF
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NP_065 REKVDRAIEGAQRAAAMARTKVEIANSRTAHARAKADAADQAALAARQECDIARAVAREL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE6 SPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEV----LSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDS
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NP_065 SPDFY--QPGPDYVKQRFQEGVDAKENPEEKVPEKPPTPKESPHFYRKGTTPPR-SPEAS
420 430 440 450 460
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pF1KE6 PLQSFPTSPAATPPP----APAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSW
: .: :::..: : :.. .. . .:.:. ::.
NP_065 PKHSH--SPASSPKPLKKQNPSSGARLNQDKRSVA-DEQVTAIVNKPLMSKAPTKEAGAV
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pF1KE6 GEEQAGGSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRAS
NP_065 VPQSKYSGRHHIPNPSNGELHSQYHGYYVKLNAPQHPPVDVEDGDGSSQSSSALVHKPSA
530 540 550 560 570 580
>>NP_065166 (OMIM: 605267,613873) junctophilin-2 isoform (696 aa)
initn: 1820 init1: 1099 opt: 1956 Z-score: 1645.8 bits: 315.1 E(85289): 6.2e-85
Smith-Waterman score: 1989; 46.8% identity (66.7% similar) in 771 aa overlap (3-747:2-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
:::::.:::::.:::::: :::::::.::::::::::.:::. :::: ::::::::::
NP_065 MSGGRFDFDDGGAYCGGWEGGKAHGHGLCTGPKGQGEYSGSWNFGFEVAGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
..: :.::::::.:.:.::.:.::::::::::::::.:. ...::::::::.::::::::
NP_065 FEGYWSQGKRHGLGIETKGRWLYKGEWTHGFKGRYGIRQSSSSGAKYEGTWNNGLQDGYG
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
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NP_065 TETYADGGTYQGQFTNGMRHGYGVRQSVPYGMAVVVRSPLRTSLSSLRSEHSNGT-VAPD
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pF1KE6 --ASPAVAG----SPAVSRGGFVL--VAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKS
:::: : :::. ::::.: .:.... : :::.:. : : :::..::..
NP_065 SPASPASDGPALPSPAIPRGGFALSLLANAEAAARAPKGGGLFQRGALLG-KLRRAESRT
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pF1KE6 SLASQRSKQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEA---ELAVIEDDIDATTTETYV
:..::::. : ..:. .:: ::: :: ::::: : : .: ::::::::::.
NP_065 SVGSQRSRVSFLKSD-----LSSGASDAASTASLGEAAEGADEAAPFEADIDATTTETYM
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290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GEWKNDKRSGFGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRK
::::::::::::::.::.::.::::: .: :::::: :.::: .:::::..:.:: ..
NP_065 GEWKNDKRSGFGVSERSSGLRYEGEWLDNLRHGYGCTTLPDGHREEGKYRHNVLVKDTKR
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pF1KE6 NLIPLRASKIREKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEA
.. :...:.:.::...::.:.:::. :.::::::::::::..:::::: :: :..:.
NP_065 RMLQLKSNKVRQKVEHSVEGAQRAAAIARQKAEIAASRTSHAKAKAEAAEQAALAANQES
360 370 380 390 400 410
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pF1KE6 RIARITAKEFSPSFQHRENGLEYQRPKR-QTSCDDIEVL---------STGTPLQ-QESP
::: :.:..:.: . : :::. . : .. : : ..: : .:::
NP_065 NIARTLARELAPDF--YQPGPEYQKRRLLQEILENSESLLEPPDRGAGAAGLPQPPRESP
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460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ELYRKGTTPSDLTTDDSPLQSFPTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQML
.:... :: : . : :::.::: : :. . : .:
NP_065 QLHER-ETPR-------PEGGSP-SPAGTPPQPKRPRPGVS-----------KDG---LL
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pF1KE6 LEGRAGDCARSSWGEEQAG-GSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTE
: .:. : .: :::.: ..:.::..:. : .. :
NP_065 SPG--------AWNGEPSGEGSRSVTP-------------SEGAGRRSPARPATERMAIE
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pF1KE6 SPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRLLELQ-EEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGAC
: . :. :: :. . .: .. : . : . .:.
NP_065 ------------ALQAPPAPSREPEVALYQGYHSYAVRTTPPEPPPFEDQPEPEVSGSES
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pF1KE6 RGLGDDHRLEDRGFGVQRLRSKAQNKENFRPAS-SAEPAVQKLAS-LRLGGAEPRLLRWD
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NP_065 APSSP----ATAPLQAPTLRGPEPARET--PAKLEPKPIIPKAEPRAKARKTEARGLTKA
600 610 620 630 640
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pF1KE6 LTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKSSTGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
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NP_065 GAKKKARKEAALAAEAEVEV-EEVPNT-----ILICMVILLNIGLAILFVHLLT
650 660 670 680 690
>>XP_016878973 (OMIM: 605268,606438) PREDICTED: junctoph (148 aa)
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Smith-Waterman score: 969; 89.3% identity (91.9% similar) in 149 aa overlap (1-148:1-148)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQ-WVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHP
::::::: . : :. : : :..:
XP_016 TETYSDGVIAEKQMWLKGTPTHVG-REAV
130 140
>>NP_001258534 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 isof (150 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
::::::::
NP_001 TETYSDGGGWTRTSAVEAGCWREEGGPSAQ
130 140 150
>>XP_016878972 (OMIM: 605268,606438) PREDICTED: junctoph (176 aa)
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Smith-Waterman score: 956; 100.0% identity (100.0% similar) in 127 aa overlap (1-127:1-127)
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pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
:::::::
XP_016 TETYSDGVAASFSPLVEGIDLCLHSKMPPHSGQSRGRKPGSCLLLLLLLLLLLLLL
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>>NP_001258533 (OMIM: 605268,606438) junctophilin-3 isof (186 aa)
initn: 956 init1: 956 opt: 956 Z-score: 816.7 bits: 159.8 E(85289): 9.5e-39
Smith-Waterman score: 956; 100.0% identity (100.0% similar) in 127 aa overlap (1-127:1-127)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
:::::::
NP_001 TETYSDGDATAFGAEPGPEARELPAAAAAAAAAAAAAVRWFLCREPWPALQLPACLDSPI
130 140 150 160 170 180
748 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:38:53 2016 done: Tue Nov 8 15:38:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]