Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6715
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6715, 748 aa
1>>>pF1KE6715 748 - 748 aa - 748 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5833+/-0.000885; mu= 10.8846+/- 0.054
mean_var=133.2374+/-26.518, 0's: 0 Z-trim(110.9): 23 B-trim: 8 in 1/52
Lambda= 0.111112
statistics sampled from 11955 (11974) to 11955 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10962.1 JPH3 gene_id:57338|Hs108|chr16 ( 748) 4999 812.9 0
CCDS6217.1 JPH1 gene_id:56704|Hs108|chr8 ( 661) 2187 362.1 1.6e-99
CCDS13325.1 JPH2 gene_id:57158|Hs108|chr20 ( 696) 1956 325.1 2.3e-88
CCDS9603.1 JPH4 gene_id:84502|Hs108|chr14 ( 628) 1543 258.9 1.8e-68
CCDS13326.1 JPH2 gene_id:57158|Hs108|chr20 ( 129) 824 143.3 2.3e-34
>>CCDS10962.1 JPH3 gene_id:57338|Hs108|chr16 (748 aa)
initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999 Z-score: 4335.7 bits: 812.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4999; 99.6% identity (99.6% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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CCDS10 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKSSLASQRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKSSLASQRSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEFS
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKVDRAVEAAERAATIAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 PSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEVLSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDSPLQSF
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CCDS10 PSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEVLSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTPDDSPLQSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSWGEEQAGGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSWGEEQAGGSR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 GVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 LELQEEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGACRGLGDDHRLEDRGFGVQRLRSKAQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS10 LELQEEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGACRGLGDDHRPEDRGFGVQRLRSKAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE6 NKENFRPASSAEPAVQKLASLRLGGAEPRLLRWDLTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NKENFRPASSAEPAVQKLASLRLGGAEPRLLRWDLTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE6 STGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
730 740
>>CCDS6217.1 JPH1 gene_id:56704|Hs108|chr8 (661 aa)
initn: 2168 init1: 1120 opt: 2187 Z-score: 1900.4 bits: 362.1 E(32554): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 2187; 63.4% identity (83.2% similar) in 517 aa overlap (3-510:2-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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CCDS62 MTGGRFDFDDGGTYCGGWEEGKAHGHGICTGPKGQGEYSGSWSHGFEVVGGYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: ::::::::.:.:.::::.:.:::.::::::::::. . :.::::::::::::::
CCDS62 YQGYWAQGKRHGLGVETKGKWMYRGEWSHGFKGRYGVRQSLCTPARYEGTWSNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
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CCDS62 VETYGDGGTYQGQWAGGMRHGYGVRQSVPYGMATVIRSPLRTSLASLRSEQSNGSVLH-D
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPAVAGSPAVSRGGFVLVAHSDSEILKSKKKGLFRR-SLLSGLKLRKSESKSSLASQRS
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CCDS62 AA-AAADSPAGTRGGFVLNFHADAELAGKKKGGLFRRGSLLGSMKLRKSESKSSISSKRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEWKNDKRSG
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CCDS62 ---SVRSDAAMSRISS--SDANSTISFGDVDCDFCPVEDHVDATTTETYMGEWKNDKRNG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRKNLIPLRASKI
::::.::.:.:::::::.:.:::::: .::::.:::::::.:::: : ::.:::.: .:
CCDS62 FGVSERSNGMKYEGEWANNKRHGYGCTVFPDGSKEEGKYKNNILVRGIRKQLIPIRHTKT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 REKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEARIARITAKEF
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CCDS62 REKVDRAIEGAQRAAAMARTKVEIANSRTAHARAKADAADQAALAARQECDIARAVAREL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 SPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEV----LSTGTPLQQESPELYRKGTTPSDLTTDDS
::.: . : .: . . : . : : . : .:::..::::::: . . :
CCDS62 SPDFY--QPGPDYVKQRFQEGVDAKENPEEKVPEKPPTPKESPHFYRKGTTPPR-SPEAS
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 PLQSFPTSPAATPPP----APAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDCARSSW
: .: :::..: : :.. .. . .:.:. ::.
CCDS62 PKHSH--SPASSPKPLKKQNPSSGARLNQDKRSVA-DEQVTAIVNKPLMSKAPTKEAGAV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GEEQAGGSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTESPPVFTWTSHHRAS
CCDS62 VPQSKYSGRHHIPNPSNGELHSQYHGYYVKLNAPQHPPVDVEDGDGSSQSSSALVHKPSA
530 540 550 560 570 580
>>CCDS13325.1 JPH2 gene_id:57158|Hs108|chr20 (696 aa)
initn: 1820 init1: 1099 opt: 1956 Z-score: 1699.9 bits: 325.1 E(32554): 2.3e-88
Smith-Waterman score: 1989; 46.8% identity (66.7% similar) in 771 aa overlap (3-747:2-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
:::::.:::::.:::::: :::::::.::::::::::.:::. :::: ::::::::::
CCDS13 MSGGRFDFDDGGAYCGGWEGGKAHGHGLCTGPKGQGEYSGSWNFGFEVAGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
..: :.::::::.:.:.::.:.::::::::::::::.:. ...::::::::.::::::::
CCDS13 FEGYWSQGKRHGLGIETKGRWLYKGEWTHGFKGRYGIRQSSSSGAKYEGTWNNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
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CCDS13 TETYADGGTYQGQFTNGMRHGYGVRQSVPYGMAVVVRSPLRTSLSSLRSEHSNGT-VAPD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 --ASPAVAG----SPAVSRGGFVL--VAHSDSEILKSKKKGLFRRSLLSGLKLRKSESKS
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CCDS13 SPASPASDGPALPSPAIPRGGFALSLLANAEAAARAPKGGGLFQRGALLG-KLRRAESRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE6 SLASQRSKQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEA---ELAVIEDDIDATTTETYV
:..::::. : ..:. .:: ::: :: ::::: : : .: ::::::::::.
CCDS13 SVGSQRSRVSFLKSD-----LSSGASDAASTASLGEAAEGADEAAPFEADIDATTTETYM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GEWKNDKRSGFGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILVGGKRK
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CCDS13 GEWKNDKRSGFGVSERSSGLRYEGEWLDNLRHGYGCTTLPDGHREEGKYRHNVLVKDTKR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 NLIPLRASKIREKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEA
.. :...:.:.::...::.:.:::. :.::::::::::::..:::::: :: :..:.
CCDS13 RMLQLKSNKVRQKVEHSVEGAQRAAAIARQKAEIAASRTSHAKAKAEAAEQAALAANQES
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE6 RIARITAKEFSPSFQHRENGLEYQRPKR-QTSCDDIEVL---------STGTPLQ-QESP
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CCDS13 NIARTLARELAPDF--YQPGPEYQKRRLLQEILENSESLLEPPDRGAGAAGLPQPPRESP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ELYRKGTTPSDLTTDDSPLQSFPTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQML
.:... :: : . : :::.::: : :. . : .:
CCDS13 QLHER-ETPR-------PEGGSP-SPAGTPPQPKRPRPGVS-----------KDG---LL
480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE6 LEGRAGDCARSSWGEEQAG-GSRGVRSGALRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGNPKPRERRTE
: .:. : .: :::.: ..:.::..:. : .. :
CCDS13 SPG--------AWNGEPSGEGSRSVTP-------------SEGAGRRSPARPATERMAIE
510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE6 SPPVFTWTSHHRASNHSPGGSRLLELQ-EEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGAC
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CCDS13 ------------ALQAPPAPSREPEVALYQGYHSYAVRTTPPEPPPFEDQPEPEVSGSES
550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KE6 RGLGDDHRLEDRGFGVQRLRSKAQNKENFRPAS-SAEPAVQKLAS-LRLGGAEPRLLRWD
. . . ::. .:. ::. .: . : . .: : :
CCDS13 APSSP----ATAPLQAPTLRGPEPARET--PAKLEPKPIIPKAEPRAKARKTEARGLTKA
600 610 620 630 640
700 710 720 730 740
pF1KE6 LTFSPPQKSLPVALESDEENGDELKSSTGSAPILVVMVILLNIGVAILFINFFI
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CCDS13 GAKKKARKEAALAAEAEVEV-EEVPNT-----ILICMVILLNIGLAILFVHLLT
650 660 670 680 690
>>CCDS9603.1 JPH4 gene_id:84502|Hs108|chr14 (628 aa)
initn: 1417 init1: 525 opt: 1543 Z-score: 1342.8 bits: 258.9 E(32554): 1.8e-68
Smith-Waterman score: 1620; 47.0% identity (69.4% similar) in 627 aa overlap (1-605:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
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CCDS96 MSPGGKFDFDDGGCYVGGWEAGRAHGYGVCTGPGAQGEYSGCWAHGFESLGVFTGPGGHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
::: : ::::.:.:.: :..:.:.::: :.::: :: : . .: .: : :..:.:::::
CCDS96 YQGHWQQGKREGLGVERKSRWTYRGEWLGGLKGRSGVWESV-SGLRYAGLWKDGFQDGYG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
:::::::::::::: .: :.:::::::::: .::..::: :::..: .:. : :
CCDS96 TETYSDGGTYQGQWQAGKRHGYGVRQSVPYHQAALLRSPRRTSLDSGHSDPP--TPPPPL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 ASPA-VAGSPAV-SRGGFVLVAHSDSEILKSKKK-----GLFRRSLL-SGLKLRKSESKS
:. .:::: :::::::.. .:.. .:.:. :.:::::: ::: : . .:
CCDS96 PLPGDEGGSPASGSRGGFVLAGPGDADGASSRKRTPAAGGFFRRSLLLSGL--RAGGRRS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SLASQRSKQSSFRSEAGMSTVSSTASDIHSTISLGEAEAELAVIEDDIDATTTETYVGEW
::.:.:. :.:::.. : :.::. : : : : :.:: ...::.:.:::
CCDS96 SLGSKRG---SLRSEVS-SEVGSTGPP-GSEASGPPAAAPPALIE----GSATEVYAGEW
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 KNDKRSGFGVSQRSDGLKYEGEWASNRRHGYGCMTFPDGTKEEGKYKQNILV-GGKRKNL
. :.::::::::::.::.::::: .::::::: : :::..::::::.: :: ::. ..:
CCDS96 RADRRSGFGVSQRSNGLRYEGEWLGNRRHGYGRTTRPDGSREEGKYKRNRLVHGGRVRSL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE6 IPL--RASKIREKVDRAVEAAERAATTAKQKAEIAASRTSHSRAKAEAALTAAQKAQEEA
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CCDS96 LPLALRRGKVKEKVDRAVEGARRAVSAARQRQEIAAARAADALLKAVAASSVAEKAVEAA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 RIARITAKEFSPSFQHRENGLEYQRPKRQTSCDDIEVLSTGTPLQQESPELYRKGTTPSD
:.:.. :....: .. : .::.... .: : ::...:: .:..: :::.
CCDS96 RMAKLIAQDLQPMLE--APG---RRPRQDSEGSDTE------PLDEDSPGVYENGLTPSE
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 LTTD--DSPLQSF-PTSPAATPPPAPAARNKVAHFSRQVSVDEERGGDIQMLLEGRAGDC
. . .:: .: : : : : : . .. . :: . :: :: : ..
CCDS96 GSPELPSSPASSRQPWRPPACRSPLPPGGDQ-GPFSSPKAWPEEWGG------AGAQAEE
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KE6 ARSSWGEEQAG-GSRGVRSGA-LRGGLLVDDFRTRGSGRKQPGN---PKPRERR---TES
. .:..:: . : :.:. : :: .: . :: :.. :. : : : ::
CCDS96 LAGYEAEDEAGMQGPGPRDGSPLLGG--CSD--SSGSLREEEGEDEEPLPPLRAPAGTEP
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KE6 PPVFTWTSHHRASNHSPGGSRLLELQEEKLSNYRMEMKPLLRMETHPQKRRYSKGGACRG
:. . . .: .: :: :
CCDS96 EPIAMLVLRGSSSRGPDAGCLTEELGEPAATERPAQPGAANPLVVGAVALLDLSLAFLFS
570 580 590 600 610 620
>>CCDS13326.1 JPH2 gene_id:57158|Hs108|chr20 (129 aa)
initn: 824 init1: 824 opt: 824 Z-score: 730.3 bits: 143.3 E(32554): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 824; 80.2% identity (96.0% similar) in 126 aa overlap (3-128:2-127)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSSGGRFNFDDGGSYCGGWEDGKAHGHGVCTGPKGQGEYTGSWSHGFEVLGVYTWPSGNT
:::::.:::::.:::::: :::::::.::::::::::.:::. :::: ::::::::::
CCDS13 MSGGRFDFDDGGAYCGGWEGGKAHGHGLCTGPKGQGEYSGSWNFGFEVAGVYTWPSGNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YQGTWAQGKRHGIGLESKGKWVYKGEWTHGFKGRYGVRECAGNGAKYEGTWSNGLQDGYG
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CCDS13 FEGYWSQGKRHGLGIETKGRWLYKGEWTHGFKGRYGIRQSSSSGAKYEGTWNNGLQDGYG
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 TETYSDGGTYQGQWVGGMRQGYGVRQSVPYGMAAVIRSPLRTSINSLRSEHTNGTALHPD
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CCDS13 TETYADGGMC
120
748 residues in 1 query sequences
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