Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6696
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6696, 400 aa
1>>>pF1KE6696 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9899+/-0.000836; mu= 9.8278+/- 0.050
mean_var=123.2246+/-24.759, 0's: 0 Z-trim(111.7): 125 B-trim: 179 in 2/50
Lambda= 0.115538
statistics sampled from 12451 (12594) to 12451 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 ( 400) 2699 460.8 1e-129
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 1402 244.7 1.9e-64
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 1402 244.7 1.9e-64
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 803 144.7 1.5e-34
CCDS45121.1 SYT16 gene_id:83851|Hs108|chr14 ( 645) 385 75.2 2e-13
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 354 69.9 5e-12
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 354 69.9 5e-12
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 350 69.2 7.9e-12
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 340 67.5 2.3e-11
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 340 67.5 2.4e-11
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 334 66.6 5.1e-11
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 332 66.2 6.1e-11
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 332 66.2 6.7e-11
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 332 66.3 7e-11
>>CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 (400 aa)
initn: 2699 init1: 2699 opt: 2699 Z-score: 2442.2 bits: 460.8 E(32554): 1e-129
Smith-Waterman score: 2699; 99.8% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRGRRGDRMTINIQEHMAINVCPGPIRPIRQISDYFPRGPGPEGGGGSGGEAPAHLVPLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS10 MRGRRGDRMTINIQEHMAINVCPGPIRPIRQISDYFPRGPGPEGGGGGGGEAPAHLVPLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE6 ARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
370 380 390 400
>>CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 (690 aa)
initn: 1399 init1: 708 opt: 1402 Z-score: 1270.4 bits: 244.7 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 1409; 56.6% identity (75.6% similar) in 389 aa overlap (23-389:300-684)
10 20 30 40
pF1KE6 MRGRRGDRMTINIQEHMAINVCPGPI-RPIRQISDYFPRGPG---P---EGG
::: : : . : :: : :
CCDS31 QASRPAPGSVQSPAPPQPGQPGTPGGSRPGPGPAGRFPDQKPEVAPSDPGTTAPPREERT
270 280 290 300 310 320
50 60 70 80 90
pF1KE6 GGSGG--------------EAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAE-VDSYDSDDATAL
:: :: .: . : ::: ::. : ..:::::.::.:
CCDS31 GGVGGYPAVGAREDRMSHPSGPYSQASAAAPQPAAARQPPPPEEEEEEANSYDSDEATTL
330 340 350 360 370 380
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRN
:.:::.::::. . .:.:.:..:::::::: :::::::::::::::: :.:::.::: ::
CCDS31 GALEFSLLYDQDNSSLQCTIIKAKGLKPMDSNGLADPYVKLHLLPGASKSNKLRTKTLRN
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 TLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFN
: ::.::: :.: ::::.:. .:.:::.::::::..::::::: : :..:::.:.:.::
CCDS31 TRNPIWNETLVYHGITDEDMQRKTLRISVCDEDKFGHNEFIGETRFSLKKLKPNQRKNFN
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 ICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLV
::::: .:. .. ..: ::.. : : ::.:. : .::::.::.:: ::... ::.:
CCDS31 ICLERVIPMKRAGTTGSA-RGMALY--EEEQVER-VGDIEERGKILVSLMYSTQQGGLIV
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 GILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELST
::.::.::::::.::::::.:: .:.::. ::.:::: .:::::::::::::::.:. :
CCDS31 GIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPDMGKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIKHSD
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 LATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSEL
:: :.:...:::::::::::.::: .:: .:.:: ::: .::.. : .:::: : .:
CCDS31 LAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHWYECLKNKDKKIERWHQLQNEN
630 640 650 660 670 680
400
pF1KE6 PPAAGALSSA
CCDS31 HVSSD
690
>>CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 (694 aa)
initn: 1399 init1: 708 opt: 1402 Z-score: 1270.3 bits: 244.7 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 1409; 56.6% identity (75.6% similar) in 389 aa overlap (23-389:304-688)
10 20 30 40
pF1KE6 MRGRRGDRMTINIQEHMAINVCPGPI-RPIRQISDYFPRGPG---P---EGG
::: : : . : :: : :
CCDS44 QASRPAPGSVQSPAPPQPGQPGTPGGSRPGPGPAGRFPDQKPEVAPSDPGTTAPPREERT
280 290 300 310 320 330
50 60 70 80 90
pF1KE6 GGSGG--------------EAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAE-VDSYDSDDATAL
:: :: .: . : ::: ::. : ..:::::.::.:
CCDS44 GGVGGYPAVGAREDRMSHPSGPYSQASAAAPQPAAARQPPPPEEEEEEANSYDSDEATTL
340 350 360 370 380 390
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRN
:.:::.::::. . .:.:.:..:::::::: :::::::::::::::: :.:::.::: ::
CCDS44 GALEFSLLYDQDNSSLQCTIIKAKGLKPMDSNGLADPYVKLHLLPGASKSNKLRTKTLRN
400 410 420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 TLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFN
: ::.::: :.: ::::.:. .:.:::.::::::..::::::: : :..:::.:.:.::
CCDS44 TRNPIWNETLVYHGITDEDMQRKTLRISVCDEDKFGHNEFIGETRFSLKKLKPNQRKNFN
460 470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 ICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLV
::::: .:. .. ..: ::.. : : ::.:. : .::::.::.:: ::... ::.:
CCDS44 ICLERVIPMKRAGTTGSA-RGMALY--EEEQVER-VGDIEERGKILVSLMYSTQQGGLIV
520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 GILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELST
::.::.::::::.::::::.:: .:.::. ::.:::: .:::::::::::::::.:. :
CCDS44 GIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPDMGKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIKHSD
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 LATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSEL
:: :.:...:::::::::::.::: .:: .:.:: ::: .::.. : .:::: : .:
CCDS44 LAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHWYECLKNKDKKIERWHQLQNEN
630 640 650 660 670 680
400
pF1KE6 PPAAGALSSA
CCDS44 HVSSD
690
>>CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 (412 aa)
initn: 1717 init1: 777 opt: 803 Z-score: 734.0 bits: 144.7 E(32554): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 1619; 61.3% identity (74.9% similar) in 426 aa overlap (4-393:5-408)
10 20 30 40
pF1KE6 MRGRRGDRMTINIQEHMAINVCPGPIRPIRQISDYFPRGP-G--PEGG-----------
:::.. ::.:::::::.:::::::::.:::::::: : : :..:
CCDS73 MTLRRRGEKATISIQEHMAIDVCPGPIRPIKQISDYFPRFPRGLPPDAGPRAAAPPDAPA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KE6 ----GGSGGEAPA-----------HLVPLALAPPAALLG-------ATTPEDGAEVDSYD
.:.: ..:. .: . :. : : ::: ..:.:.
CCDS73 RPAVAGAGRRSPSDGAREDDEDVDQLFGAYGSSPGPSPGPSPARPPAKPPEDEPDADGYE
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 SDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKL
::: ::::::.:.::::. . .:::.: .:::::::: :::::::::::::::: :::::
CCDS73 SDDCTALGTLDFSLLYDQENNALHCTITKAKGLKPMDHNGLADPYVKLHLLPGASKANKL
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 KTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKP
.::: ::::::.::: ::: ::::.:. .:.:::.::::::. ::::::: ::::..:::
CCDS73 RTKTLRNTLNPTWNETLTYYGITDEDMIRKTLRISVCDEDKFRHNEFIGETRVPLKKLKP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 SQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSS
.. : :.::::.:.:. . . : ::::::::.::.:::
CCDS73 NHTKTFSICLEKQLPVDKTEDKS----------------------LEERGRILISLKYSS
250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 RRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFF
...::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS73 QKQGLLVGIVRCAHLAAMDANGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTAVKKKTLNPEFNEEFC
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 YEIELSTLATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERW
:::. . :: :.:::::::::::::::::::: :: :.:: ::: :::.. : .:::
CCDS73 YEIKHGDLAKKSLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVVLGIHAKGERLKHWFDCLKNKDKRIERW
340 350 360 370 380 390
390 400
pF1KE6 HTLTSELPPAAGALSSA
:::::::: :
CCDS73 HTLTSELPGAVLSD
400 410
>>CCDS45121.1 SYT16 gene_id:83851|Hs108|chr14 (645 aa)
initn: 221 init1: 120 opt: 385 Z-score: 354.6 bits: 75.2 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 385; 27.8% identity (58.1% similar) in 313 aa overlap (78-386:339-642)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 SGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLH
.: : :. . : :. . : :: :
CCDS45 TAFNSRGFEDSYATDSSSMWSPEEQDRTNLQVPSGVSEPISKCGDLDVIFEYRAASQKLT
310 320 330 340 350 360
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 CSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITD
.:.::.:: : .:. . :.. :::: : .. .:. ::. :::. : .:.. .
CCDS45 VTIVRAQGLPDKDRSGVNSWQVHVVLLPG--KKHRGRTNIQRGP-NPVFREKVTFAKLEP
370 380 390 400 410 420
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 DDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSA
:.. ..:. . :.......:: : .:.: . . .. :: : .. :: ..
CCDS45 RDVAACAVRFRLYAARKMTRERMMGEKLFYLSHLHPEGEMKVTLVLE---PRSNISSGGS
430 440 450 460 470 480
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERG--RILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNG
: . .. .. :. : . : ..:..:::.. : : ... .:. . ::
CCDS45 PLSPSAVSHSDSTSSTQS---LSHGGAPELLVGLSYNATTGRLSVEMIKGSHFRNLAVNR
490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 YSDPYVKTYLRPDVDKK-SKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD
: : : .: .: .. :. :: ... :: ..: : ... : :. :: ..:..
CCDS45 APDTYGKLFLLNSVGQEMSRCKTSIRRGQPNPVYKETFVFQVALFQLSDVTLMISVYNRR
540 550 560 570 580 590
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARK-HWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
: ...:: ..:: .. :: .. :: . . . :::::
CCDS45 TMKRKEMIGWIALGQNSSGEEEQDHWEEMKETKGQQICRWHTLLES
600 610 620 630 640
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 686 init1: 326 opt: 354 Z-score: 329.4 bits: 69.9 E(32554): 5e-12
Smith-Waterman score: 558; 37.0% identity (59.2% similar) in 316 aa overlap (75-389:127-408)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 GGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASC
:: : . . . :: :...: :: .
CCDS76 GGKNAINMKDVKDLGKTMKDQDDDAETGLTDGEEKE--EPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNN
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 TLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSG
: .:..: : .:..: .:::::. ::: : .:..::..:.:::::.::..:..
CCDS76 QLLVGIIQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK-
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 ITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSS
. ... :.: .:: : :..:....:::..::. . :. :. : :
CCDS76 VPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD------FGHVTEEWRDLQSA--
220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 MSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVN
:. :: :. : : .:: : : : ::. .: :::.
CCDS76 ---------------EKEEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNLKKMDVG
270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD
: :::::: .: . . .:.:: .::.:::: .:: : .:. . . . ::: :::
CCDS76 GLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 -IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
::: :: :: : .: .. : .:::: : .: . .:::: :
CCDS76 KIGK-NDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK
370 380 390 400 410
>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (422 aa)
initn: 686 init1: 326 opt: 354 Z-score: 329.4 bits: 69.9 E(32554): 5e-12
Smith-Waterman score: 559; 36.9% identity (58.0% similar) in 331 aa overlap (60-389:118-411)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 RQISDYFPRGPGPEGGGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATA
:: : : : :: : . . .
CCDS90 KNKKKGKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKDQALKDDDAETGLT---DGEEKE--EPKEEEK
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 LGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQR
:: :...: :: . : .:..: : .:..: .:::::. ::: : .:..::..:
CCDS90 LGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKFETKVHR
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 NTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHF
.:::::.::..:.. . ... :.: .:: : :..:....:::..::. . :
CCDS90 KTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD------F
210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 NICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLL
. :. : : :. :: :. : : .:: : :
CCDS90 GHVTEEWRDLQSA-----------------EKEEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLT
260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 VGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELS
: ::. .: :::.: :::::: .: . . .:.:: .::.:::: .:: : .:. .
CCDS90 VVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 TLATKTLEVTVWDYD-IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTS
. . ::: ::: ::: :: :: : .: .. : .:::: : .: . .::::
CCDS90 QIQKVQVVVTVLDYDKIGK-NDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQV
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE6 ELPPAAGALSSA
:
CCDS90 EEEVDAMLAVKK
420
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 733 init1: 336 opt: 350 Z-score: 325.8 bits: 69.2 E(32554): 7.9e-12
Smith-Waterman score: 558; 36.7% identity (58.5% similar) in 313 aa overlap (78-389:128-408)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 SGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLH
: .. . . :: :.:.: :: . :
CCDS14 KGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLT
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 CSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITD
..:.: : .:..: .:::::. ::: : .: .::..:.::::..:: .:.. .
CCDS14 VGVLQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFK-VPY
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 DDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSA
... :.: .:. : :..:....:::..::. : :..:
CCDS14 QELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNT----------------VDLGQPIEEWR
220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYS
:.: : :. :. : : :: : : : ::. .: :::.: :
CCDS14 DLQG-----GEKEEPEK-------LGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLS
260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD-IG
::::: .: . . .:.:: :::::::: ::: : .:: . . . ::: ::: .:
CCDS14 DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLG
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 KSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
: :. :: . .: .: : .:::: : .: . .::.: :
CCDS14 K-NEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
370 380 390 400 410
>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa)
initn: 697 init1: 296 opt: 340 Z-score: 317.4 bits: 67.5 E(32554): 2.3e-11
Smith-Waterman score: 548; 35.4% identity (57.3% similar) in 342 aa overlap (58-392:68-373)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 PIRQISDYFPRGPGPEGGGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSD--
: : :.: : . . :.. :
CCDS74 GTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPTPVASATAQVQPEVEELEPAPSGPG
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 ----DATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKAN
: :: :...: :: : : .::.: :: .:..: .::::...::: :
CCDS74 QQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGSSDPYVRVYLLPD--KRR
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 KLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRL
. .::..:.:::: ..: .... . .. .:: .:: : :..:.:. :::.:::.
CCDS74 RYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMS--
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 KPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSY
.: :. : . : : ::. : . . :. : : .:: :
CCDS74 --------------SVDLGRPVQ---AWR-------ELQAAPREE---EKLGDICFSLRY
220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 SSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEE
: : .:. .: :::.: ::::::..: : :.:: .::.:::: .::
CCDS74 VPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEA
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 FFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD-IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAAL
: .:. . . .:.:: ::: .:: :. :: :..: .: : . .::.: : .: .
CCDS74 FSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGK-NEAIGRVAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPI
310 320 330 340 350 360
390 400
pF1KE6 ERWHTLTSELPPAAGALSSA
.::.: ::
CCDS74 AQWHSLR---PPDRVRLLPAP
370 380
>>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 697 init1: 296 opt: 340 Z-score: 317.3 bits: 67.5 E(32554): 2.4e-11
Smith-Waterman score: 547; 37.0% identity (59.7% similar) in 308 aa overlap (86-392:105-377)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKG
: :: :...: :: : : .::.: :
CCDS12 KGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMG
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVL
: .:..: .::::...::: : . .::..:.:::: ..: .... . .. .::
CCDS12 LAALDLGGSSDPYVRVYLLPD--KRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCY
.:: : :..:.:. :::.:::. .. : : :. . ..:: :
CCDS12 VMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMS----------SVDLGR--PVQAWRELQAAPR-----
200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYL
:: :. : : .:: : : : .:. .: :::.: ::::::..:
CCDS12 ------EEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD-IGKSNDFIGG
: :.:: .::.:::: .:: : .:. . . .:.:: ::: .:: :. ::
CCDS12 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGK-NEAIGR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE6 VSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA
:..: .: : . .::.: : .: . .::.: ::
CCDS12 VAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLR---PPDRVRLLPAP
350 360 370 380
400 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:29:46 2016 done: Tue Nov 8 15:29:46 2016
Total Scan time: 1.860 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]