Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6646
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6646, 226 aa
1>>>pF1KE6646 226 - 226 aa - 226 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3279+/-0.000982; mu= 3.5412+/- 0.058
mean_var=170.7225+/-36.104, 0's: 0 Z-trim(109.5): 131 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.098159
statistics sampled from 10748 (10901) to 10748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 1.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS661.1 NEGR1 gene_id:257194|Hs108|chr1 ( 354) 1507 225.5 3.4e-59
CCDS2982.1 LSAMP gene_id:4045|Hs108|chr3 ( 338) 768 120.8 1e-27
CCDS8491.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 706 112.1 4.6e-25
CCDS41733.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 706 112.1 4.6e-25
CCDS81649.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 304) 696 110.6 1.1e-24
CCDS31722.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 338) 696 110.7 1.2e-24
CCDS8492.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 345) 696 110.7 1.2e-24
CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 316) 692 110.1 1.7e-24
CCDS44777.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 355) 692 110.1 1.9e-24
CCDS46158.1 IGLON5 gene_id:402665|Hs108|chr19 ( 336) 594 96.2 2.7e-20
>>CCDS661.1 NEGR1 gene_id:257194|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1507 init1: 1507 opt: 1507 Z-score: 1176.3 bits: 225.5 E(32554): 3.4e-59
Smith-Waterman score: 1507; 100.0% identity (100.0% similar) in 226 aa overlap (1-226:129-354)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RDYSLQIQNVDVTDDGPYTCSVQTQHTPRTMQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 TCLATGKPEPSISWRHISPSAKPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TCLATGKPEPSISWRHISPSAKPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
::::::::::::::::
CCDS66 LSSFTSIFYLKNAILQ
340 350
>>CCDS2982.1 LSAMP gene_id:4045|Hs108|chr3 (338 aa)
initn: 675 init1: 359 opt: 768 Z-score: 610.9 bits: 120.8 E(32554): 1e-27
Smith-Waterman score: 768; 53.7% identity (81.0% similar) in 216 aa overlap (2-216:123-336)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
::.: ::::::: .::.:.:::::.::::.
CCDS29 EYSLRIQKVDVYDEGSYTCSVQTQHEPKTSQVYLIVQVPPKISNISSDVTVNEGSNVTLV
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPFENGQ-YLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
:.:.:.::: :.:::..:... ::. . ::.: ::::.:.:.:::.: :.:: ::..::
CCDS29 CMANGRPEPVITWRHLTPTGREFEGEEEYLEILGITREQSGKYECKAANEVSSADVKQVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
:.::. ::: : ::. .: ::.. ..::...:: : ::::. . .. :. .:. :..
CCDS29 VTVNYPPTITESKSNEATTGRQASLKCEASAVPAPDFEWYRDDTRI-NSANGLEIKSTEG
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
.: :::::::.::.::::::::::::.::::: : :.... ::.:: .. : :. .
CCDS29 QSSLTVTNVTEEHYGNYTCVAANKLGVTNASLVLFRPGSVR-GINGSISLAVPLWLLAAS
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
: . :
CCDS29 LLCLLSKC
>>CCDS8491.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 690 init1: 445 opt: 706 Z-score: 563.4 bits: 112.1 E(32554): 4.6e-25
Smith-Waterman score: 706; 49.3% identity (76.6% similar) in 209 aa overlap (2-209:127-335)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: ::: ::: .::.:...:::.:..::
CCDS84 QYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLT
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
:.:::.:::...::::::.: : . .::.: ::::.:.:.::::: :::. : ::.::
CCDS84 CIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
:.::. : :.: :. : :..: ..::...:: :.::: .:.:..:..:. ..:
CCDS84 VTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPF
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
: : ::... .:::::::.:::: ::::. : :.... .:.. : : :
CCDS84 LSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNKLGHTNASIMLFGPGAVSEVSNGTSRRAGCVWLLPLL
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
CCDS84 VLHLLLKF
340
>>CCDS41733.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 690 init1: 445 opt: 706 Z-score: 563.4 bits: 112.1 E(32554): 4.6e-25
Smith-Waterman score: 706; 49.3% identity (76.6% similar) in 209 aa overlap (2-209:127-335)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: ::: ::: .::.:...:::.:..::
CCDS41 QYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLT
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
:.:::.:::...::::::.: : . .::.: ::::.:.:.::::: :::. : ::.::
CCDS41 CIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
:.::. : :.: :. : :..: ..::...:: :.::: .:.:..:..:. ..:
CCDS41 VTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPF
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
: : ::... .:::::::.:::: ::::. : :.... .:.. : : :
CCDS41 LSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNKLGHTNASIMLFGPGAVSEVSNGTSRRAGCVWLLPLL
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
CCDS41 VLHLLLKF
340
>>CCDS81649.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (304 aa)
initn: 694 init1: 449 opt: 696 Z-score: 556.4 bits: 110.6 E(32554): 1.1e-24
Smith-Waterman score: 696; 48.6% identity (76.1% similar) in 222 aa overlap (2-221:86-303)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: :::::.:..::.:.:::::..:::
CCDS81 QYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLL
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHIS-PSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKV
::: :.:::...:::.: .. : . .::.: : :::.::::::: :::. ::::::
CCDS81 CLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGFVSEDEYLEISDIKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKV
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 KVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFS
:..::. : :.. :. :. :..:.. ::...:: :.:.: : .: .: .:. :.: .
CCDS81 KITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKGILSCEASAVPMAEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKG
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TRSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVL
: :: ::... .:::::::.::::.::::. : :... :.. ::. ..: .:
CCDS81 RMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATNKLGNTNASITLYGPGAVIDGVN-SASRALACLWLSG
240 250 260 270 280 290
210 220
pF1KE6 TLSSFTSIFYLKNAILQ
:: . :..:
CCDS81 TLLAH---FFIKF
300
>>CCDS31722.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (338 aa)
initn: 694 init1: 449 opt: 696 Z-score: 555.8 bits: 110.7 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 696; 48.6% identity (76.1% similar) in 222 aa overlap (2-221:120-337)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: :::::.:..::.:.:::::..:::
CCDS31 QYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLL
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHIS-PSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKV
::: :.:::...:::.: .. : . .::.: : :::.::::::: :::. ::::::
CCDS31 CLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGFVSEDEYLEISDIKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKV
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 KVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFS
:..::. : :.. :. :. :..:.. ::...:: :.:.: : .: .: .:. :.: .
CCDS31 KITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKGILSCEASAVPMAEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKG
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TRSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVL
: :: ::... .:::::::.::::.::::. : :... :.. ::. ..: .:
CCDS31 RMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATNKLGNTNASITLYGPGAVIDGVN-SASRALACLWLSG
270 280 290 300 310 320
210 220
pF1KE6 TLSSFTSIFYLKNAILQ
:: . :..:
CCDS31 TLLAH---FFIKF
330
>>CCDS8492.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (345 aa)
initn: 694 init1: 449 opt: 696 Z-score: 555.7 bits: 110.7 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 696; 48.6% identity (76.1% similar) in 222 aa overlap (2-221:127-344)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: :::::.:..::.:.:::::..:::
CCDS84 QYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHIS-PSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKV
::: :.:::...:::.: .. : . .::.: : :::.::::::: :::. ::::::
CCDS84 CLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGFVSEDEYLEISDIKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKV
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 KVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFS
:..::. : :.. :. :. :..:.. ::...:: :.:.: : .: .: .:. :.: .
CCDS84 KITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKGILSCEASAVPMAEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKG
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TRSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVL
: :: ::... .:::::::.::::.::::. : :... :.. ::. ..: .:
CCDS84 RMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATNKLGNTNASITLYGPGAVIDGVN-SASRALACLWLSG
280 290 300 310 320 330
210 220
pF1KE6 TLSSFTSIFYLKNAILQ
:: . :..:
CCDS84 TLLAH---FFIKF
340
>>CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 690 init1: 445 opt: 692 Z-score: 553.2 bits: 110.1 E(32554): 1.7e-24
Smith-Waterman score: 692; 53.3% identity (80.4% similar) in 184 aa overlap (2-184:127-310)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: ::: ::: .::.:...:::.:..::
CCDS44 QYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLT
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
:.:::.:::...::::::.: : . .::.: ::::.:.:.::::: :::. : ::.::
CCDS44 CIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
:.::. : :.: :. : :..: ..::...:: :.::: .:.:..:..:. ..:
CCDS44 VTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPF
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
: : ::... .:::::::.:::: ::::. :
CCDS44 LSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNKLGHTNASIMLFGETVL
280 290 300 310
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
>>CCDS44777.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (355 aa)
initn: 690 init1: 445 opt: 692 Z-score: 552.5 bits: 110.1 E(32554): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 692; 53.3% identity (80.4% similar) in 184 aa overlap (2-184:127-310)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
.::: ::: ::: .::.:...:::.:..::
CCDS44 QYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLT
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPF-ENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVK
:.:::.:::...::::::.: : . .::.: ::::.:.:.::::: :::. : ::.::
CCDS44 CIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVK
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQGIIIQNFST
:.::. : :.: :. : :..: ..::...:: :.::: .:.:..:..:. ..:
CCDS44 VTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPF
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVLT
: : ::... .:::::::.:::: ::::. :
CCDS44 LSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNKLGHTNASIMLFEVKTTALTPWKGPGAVSEVSNGTSR
280 290 300 310 320 330
220
pF1KE6 LSSFTSIFYLKNAILQ
CCDS44 RAGCVWLLPLLVLHLLLKF
340 350
>>CCDS46158.1 IGLON5 gene_id:402665|Hs108|chr19 (336 aa)
initn: 542 init1: 246 opt: 594 Z-score: 477.8 bits: 96.2 E(32554): 2.7e-20
Smith-Waterman score: 594; 47.4% identity (75.3% similar) in 190 aa overlap (2-189:124-311)
10 20 30
pF1KE6 MQVHLTVQVPPKIYDISNDMTVNEGTNVTLT
::.: :.:: .: .::. .::::: ::.:
CCDS46 EFSILITEVGLGDEGLYTCSFQTRHQPYTTQVYLIVHVPARIVNISSPVTVNEGGNVNLL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CLATGKPEPSISWRHISPSAKPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDV-SFPDVRKVK
:::.:.:::...::.. . .:. :.: : : ::::::: ..: : : :: :.:
CCDS46 CLAVGRPEPTVTWRQLRDGFTS--EGEILEISDIQRGQAGEYECVTHNGVNSAPDSRRVL
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140
pF1KE6 VVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQ-QGIIIQNFS
:.::. ::: .. :. .. ::..:.:::. .::: :.::: .. : .: .:. .:.
CCDS46 VTVNYPPTITDVTSARTALGRAALLRCEAMAVPPADFQWYKDDRLLSSGTAEGLKVQTER
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TRSILTVTNVTQEHFGNYTCVAANKLGTTNASLPLNPPSTAQYGITGSADVLFSCWYLVL
:::.: .::. .:.::::: :::.::...::. : :..
CCDS46 TRSMLLFANVSARHYGNYTCRAANRLGASSASMRLLRPGSLENSAPRPPGLLALLSALGW
280 290 300 310 320 330
210 220
pF1KE6 TLSSFTSIFYLKNAILQ
CCDS46 LWWRM
226 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:04:55 2016 done: Tue Nov 8 15:04:56 2016
Total Scan time: 1.670 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]