Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6645
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6645, 285 aa
1>>>pF1KE6645 285 - 285 aa - 285 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4648+/-0.000889; mu= 13.7929+/- 0.053
mean_var=62.3679+/-12.568, 0's: 0 Z-trim(104.9): 25 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.162403
statistics sampled from 8119 (8132) to 8119 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 1.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 285) 1951 465.8 1.6e-131
CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 464) 1907 455.6 3.1e-128
CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 533) 1907 455.6 3.6e-128
CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 ( 535) 1271 306.6 2.6e-83
CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 ( 558) 1183 286.0 4.3e-77
CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 ( 532) 1163 281.3 1.1e-75
CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 532) 1159 280.3 2e-75
CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 469) 631 156.6 3.1e-38
>>CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (285 aa)
initn: 1951 init1: 1951 opt: 1951 Z-score: 2474.7 bits: 465.8 E(32554): 1.6e-131
Smith-Waterman score: 1951; 100.0% identity (100.0% similar) in 285 aa overlap (1-285:1-285)
10 20 30 40 50 60
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CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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190 200 210 220 230 240
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250 260 270 280
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CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
250 260 270 280
>>CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (464 aa)
initn: 1943 init1: 1907 opt: 1907 Z-score: 2415.6 bits: 455.6 E(32554): 3.1e-128
Smith-Waterman score: 1907; 99.6% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
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CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
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CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV
250 260 270 280 290 300
CCDS44 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDSVKVVKNKISLYKKVFPPN
310 320 330 340 350 360
>>CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (533 aa)
initn: 1943 init1: 1907 opt: 1907 Z-score: 2414.6 bits: 455.6 E(32554): 3.6e-128
Smith-Waterman score: 1907; 99.6% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS92 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS92 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS92 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
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CCDS92 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
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CCDS92 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV
250 260 270 280 290 300
CCDS92 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDSVKVVKNKISLYKKVFPPN
310 320 330 340 350 360
>>CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 (535 aa)
initn: 1293 init1: 1258 opt: 1271 Z-score: 1609.3 bits: 306.6 E(32554): 2.6e-83
Smith-Waterman score: 1271; 59.9% identity (90.1% similar) in 274 aa overlap (4-277:3-276)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS12 TNTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS12 SSSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
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CCDS12 DGFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
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CCDS12 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV
240 250 260 270 280 290
CCDS12 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA
300 310 320 330 340 350
>>CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 (558 aa)
initn: 1183 init1: 1183 opt: 1183 Z-score: 1497.6 bits: 286.0 E(32554): 4.3e-77
Smith-Waterman score: 1183; 58.7% identity (84.4% similar) in 269 aa overlap (4-272:3-271)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLSSIKCCVDEDLEPTCFERSDDIGGLWKFTESSKDGMTRVYKSLV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS12 TNVCKEMSCYSDFPFHEDYPNFMNHEKFWDYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSITKRPDF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS12 SETGQWDVVTETEGKQNRAVFDAVMVCTGHFLNPHLPLEAFPGIHKFKGQILHSQEYKIP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
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CCDS12 EGFQGKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGTWVLGRSSDWGYPYNMMVTRRC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
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CCDS12 CSFIAQVLPSRFLNWIQERKLNKRFNHEDYGLSITKGKKAKFIVNDELPNCILCGAITMK
240 250 260 270 280 290
CCDS12 TSVIEFTETSAVFEDGTVEENIDVVIFTTGYTFSFPFFEEPLKSLCTKKIFLYKQVFPLN
300 310 320 330 340 350
>>CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 1183 init1: 1141 opt: 1163 Z-score: 1472.6 bits: 281.3 E(32554): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 1163; 58.3% identity (84.9% similar) in 271 aa overlap (4-274:3-273)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS12 MGKKVAIIGAGVSGLASIRSCLEEGLEPTCFEKSNDIGGLWKFSDHAEEGRASIYKSVF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS12 SNSSKEMMCFPDFPFPDDFPNFMHNSKIQEYIIAFAKEKNLLKYIQFKTFVSSVNKHPDF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS12 ATTGQWDVTTERDGKKESAVFDAVMVCSGHHVYPNLPKESFPGLNHFKGKCFHSRDYKEP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
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CCDS12 GVFNGKRVLVVGLGNSGCDIATELSRTAEQVMISSRSGSWVMSRVWDNGYPWDMLLVTRF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
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CCDS12 GTFLKNNLPTAISDWLYVKQMNARFKHENYGLMPLNGVLRKEPVFNDELPASILCGIVSV
240 250 260 270 280 290
CCDS12 KPNVKEFTETSAIFEDGTIFEGIDCVIFATGYSFAYPFLDESIIKSRNNEIILFKGVFPP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 1196 init1: 1159 opt: 1159 Z-score: 1467.5 bits: 280.3 E(32554): 2e-75
Smith-Waterman score: 1159; 58.0% identity (82.6% similar) in 276 aa overlap (4-279:3-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
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CCDS12 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
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CCDS12 SNSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
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CCDS12 AVSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
. : :::..::.:::: :.::: :. :..::::: :.:...:. : ::: :..: .:.
CCDS12 DIFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
... . ... .:.:::. ..: .:: :. :..
CCDS12 QNMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFI
240 250 260 270 280 290
CCDS12 RPSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPA
300 310 320 330 340 350
>>CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (469 aa)
initn: 876 init1: 631 opt: 631 Z-score: 799.8 bits: 156.6 E(32554): 3.1e-38
Smith-Waterman score: 736; 44.2% identity (63.0% similar) in 276 aa overlap (4-279:3-215)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
::.:..:.:::::.:::::.::::::.::::.::.::::::
CCDS60 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRF----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
:.: :::: : :
CCDS60 --TTK---------------------------------------------VCSVTKCSDS
50
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
:.:::::::: : :.: .::.:::::: :: .:::.:::::. :::::::::.::.:
CCDS60 AVSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHP
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
. : :::..::.:::: :.::: :. :..::::: :.:...:. : ::: :..: .:.
CCDS60 DIFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRF
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280
pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
... . ... .:.:::. ..: .:: :. :..
CCDS60 QNMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFI
180 190 200 210 220 230
CCDS60 RPSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPA
240 250 260 270 280 290
285 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 15:04:25 2016 done: Tue Nov 8 15:04:25 2016
Total Scan time: 1.910 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]