Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6643
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6643, 326 aa
1>>>pF1KE6643 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2145+/-0.00094; mu= 16.3086+/- 0.056
mean_var=63.3212+/-12.688, 0's: 0 Z-trim(104.4): 30 B-trim: 24 in 1/48
Lambda= 0.161176
statistics sampled from 7883 (7908) to 7883 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 2207 522.0 2.6e-148
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1925 456.4 1.3e-128
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1321 315.9 2.7e-86
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1313 314.1 9.8e-86
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1281 306.6 1.7e-83
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1274 305.0 5.3e-83
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1272 304.5 7.3e-83
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1095 263.4 1.7e-70
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1082 260.4 1.4e-69
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 1037 249.9 1.8e-66
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 982 237.1 1.5e-62
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 914 221.3 8.4e-58
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 727 177.8 9.5e-45
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 613 151.3 9.7e-37
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 457 114.8 4e-26
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 362 92.8 2.6e-19
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 362 92.9 3e-19
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 2207 init1: 2207 opt: 2207 Z-score: 2776.1 bits: 522.0 E(32554): 2.6e-148
Smith-Waterman score: 2207; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa)
initn: 1925 init1: 1925 opt: 1925 Z-score: 2422.5 bits: 456.4 E(32554): 1.3e-128
Smith-Waterman score: 1925; 99.7% identity (100.0% similar) in 286 aa overlap (1-286:1-286)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS55 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS55 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQVARSS
250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1310 init1: 1261 opt: 1321 Z-score: 1662.8 bits: 315.9 E(32554): 2.7e-86
Smith-Waterman score: 1321; 58.7% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS70 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS70 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS70 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS70 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS70 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
300 310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1302 init1: 1253 opt: 1313 Z-score: 1652.7 bits: 314.1 E(32554): 9.8e-86
Smith-Waterman score: 1313; 58.4% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS70 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS70 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS70 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS70 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS70 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
300 310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1255 init1: 1196 opt: 1281 Z-score: 1612.5 bits: 306.6 E(32554): 1.7e-83
Smith-Waterman score: 1281; 56.7% identity (84.6% similar) in 319 aa overlap (8-326:6-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS70 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS70 FPMALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS70 NKPGLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS70 DPVLCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLD
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS70 GLNRNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
300 310 320
>>CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1257 init1: 1198 opt: 1274 Z-score: 1603.7 bits: 305.0 E(32554): 5.3e-83
Smith-Waterman score: 1274; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS70 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS70 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS70 SPMSLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS70 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLE
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS70 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS70 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
300 310 320
>>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1257 init1: 1198 opt: 1272 Z-score: 1601.2 bits: 304.5 E(32554): 7.3e-83
Smith-Waterman score: 1272; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (10-326:8-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
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CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
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CCDS73 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
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CCDS73 SPMSLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
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CCDS73 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
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CCDS73 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
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CCDS73 GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
300 310 320
>>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 1024 init1: 756 opt: 1095 Z-score: 1378.9 bits: 263.4 E(32554): 1.7e-70
Smith-Waterman score: 1095; 50.0% identity (77.0% similar) in 318 aa overlap (9-326:4-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
:. :..: ..::.::::.. .: : . .::::::.:::::: :..:::
CCDS58 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWK----SPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]