Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6633
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6633, 316 aa
1>>>pF1KE6633 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5016+/-0.00102; mu= 14.0029+/- 0.061
mean_var=59.8943+/-12.330, 0's: 0 Z-trim(103.3): 77 B-trim: 179 in 1/48
Lambda= 0.165723
statistics sampled from 7254 (7336) to 7254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 1.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9787.1 RDH12 gene_id:145226|Hs108|chr14 ( 316) 2063 501.9 2.6e-142
CCDS32104.1 RDH11 gene_id:51109|Hs108|chr14 ( 318) 1518 371.6 4.5e-103
CCDS54320.1 RDH13 gene_id:112724|Hs108|chr19 ( 331) 945 234.6 8.1e-62
CCDS11246.2 DHRS13 gene_id:147015|Hs108|chr17 ( 377) 810 202.4 4.7e-52
CCDS1693.1 RDH14 gene_id:57665|Hs108|chr2 ( 336) 745 186.8 2e-47
CCDS42627.1 RDH13 gene_id:112724|Hs108|chr19 ( 260) 741 185.8 3.1e-47
CCDS58326.1 RDH11 gene_id:51109|Hs108|chr14 ( 248) 739 185.3 4.2e-47
CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs108|chrX ( 330) 649 163.8 1.6e-40
CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs108|chrY ( 330) 649 163.8 1.6e-40
CCDS42196.1 WWOX gene_id:51741|Hs108|chr16 ( 414) 538 137.3 1.9e-32
CCDS58292.1 DHRS12 gene_id:79758|Hs108|chr13 ( 317) 474 122.0 6.1e-28
CCDS9430.1 DHRS12 gene_id:79758|Hs108|chr13 ( 242) 292 78.5 6e-15
CCDS31976.1 DHRS12 gene_id:79758|Hs108|chr13 ( 271) 261 71.1 1.1e-12
>>CCDS9787.1 RDH12 gene_id:145226|Hs108|chr14 (316 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 2668.3 bits: 501.9 E(32554): 2.6e-142
Smith-Waterman score: 2063; 99.7% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETARELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETARELA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEKQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEKQLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVSAPARVVNVSSVAHHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS97 ILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLERLKVSAPARVVNVSSVAHHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GKIPFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRSELVRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GKIPFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRSELVRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ERLWNVSCELLGIRWE
::::::::::::::::
CCDS97 ERLWNVSCELLGIRWE
310
>>CCDS32104.1 RDH11 gene_id:51109|Hs108|chr14 (318 aa)
initn: 1550 init1: 1511 opt: 1518 Z-score: 1964.0 bits: 371.6 E(32554): 4.5e-103
Smith-Waterman score: 1518; 72.5% identity (91.4% similar) in 313 aa overlap (1-313:5-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETA
:. : :: :. :::.::.:::....::: ..:::::::::.::::::::::::
CCDS32 MVELMFPLLLLLLPFL--LYMAAPQIRKMLSSGVCTSTVQLPGKVVVVTGANTGIGKETA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEE
.:::.::::::.::::: ::: .:.::.. : :.:::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 KELAQRGARVYLACRDVEKGELVAKEIQTTTGNQQVLVRKLDLSDTKSIRAFAKGFLAEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVSAPARVVNVSSV
:.::.:::::::::::::::::::: :.:::::::::::.::::.:: :::.:.:::::.
CCDS32 KHLHVLINNAGVMMCPYSKTADGFEMHIGVNHLGHFLLTHLLLEKLKESAPSRIVNVSSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AHHIGKIPFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRSE
:::.:.: ::.::.:: :. :.:::::::::.:::.:::.::.:.:::::.::::.:.::
CCDS32 AHHLGRIHFHNLQGEKFYNAGLAYCHSKLANILFTQELARRLKGSGVTTYSVHPGTVQSE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LVRHSSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRARN
::::::.. .: ::: :.:: ..::::::::::.:::: :::..::::. .::: .:::
CCDS32 LVRHSSFMRWMWWLFSFFIKTPQQGAQTSLHCALTEGLEILSGNHFSDCHVAWVSAQARN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 NKTAERLWNVSCELLGIRWE
. :.:::.:::.:::.
CCDS32 ETIARRLWDVSCDLLGLPID
300 310
>>CCDS54320.1 RDH13 gene_id:112724|Hs108|chr19 (331 aa)
initn: 943 init1: 623 opt: 945 Z-score: 1223.3 bits: 234.6 E(32554): 8.1e-62
Smith-Waterman score: 945; 50.5% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (22-313:21-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETARELA
.. . .::.: ... .:::.:..:::::::::.:: :::
CCDS54 MSRYLLPLSALGTVAGAAVLLKDYVTGGACPSKATIPGKTVIVTGANTGIGKQTALELA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEKQLH
::. . .::::. : :.::..:: .: : .: .:.:::.. :::: :: .. ::...
CCDS54 RRGGNIILACRDMEKCEAAAKDIRGETLNHHVNARHLDLASLKSIREFAAKIIEEEERVD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVSAPARVVNVSSVAHHI
::::::::: ::. : :::: ..::::::::::: :::..::.:::.:..:.::.::
CCDS54 ILINNAGVMRCPHWTTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLDKLKASAPSRIINLSSLAHVA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 GKIPFHDLQ-SEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRSELVR
:.: : ::. . ..:. :::.:::: ::::.::..::::.:::. :.::::.:.:: :
CCDS54 GHIDFDDLNWQTRKYNTKAAYCQSKLAIVLFTKELSRRLQGSGVTVNALHPGVARTELGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 HSSLL------CLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPR
:... : .: .::. . .:: : . :.:: : .:::::. :. .:.
CCDS54 HTGIHGSTFSSTTLGPIFWLLVKSPELAAQPSTYLAVAEELADVSGKYFDGLKQKAPAPE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 ARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE
:.....:.::: : .:.:.
CCDS54 AEDEEVARRLWAESARLVGLEAPSVREQPLPR
300 310 320 330
>>CCDS11246.2 DHRS13 gene_id:147015|Hs108|chr17 (377 aa)
initn: 618 init1: 416 opt: 810 Z-score: 1048.0 bits: 202.4 E(32554): 4.7e-52
Smith-Waterman score: 810; 46.9% identity (71.7% similar) in 318 aa overlap (1-313:4-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETAR
.:. ::: . . ..:. .. ::. .: :...:.::::.:::: ::
CCDS11 MEALLLGAGLLLGAYVLVYYNL--VKAPPCGGMG----NLRGRTAVVTGANSGIGKMTAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEK
::: ::::: .:::. .::.:: ..: .. :..:. :::.. :.:::: .::. :
CCDS11 ELARRGARVVLACRSQERGEAAAFDLRQESGNNEVIFMALDLASLASVRAFATAFLSSEP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVSAPARVVNVSSVA
.: :::.:::. : ..: ..:. : :::.: ::::.::: ::. ::.::: :.:.:
CCDS11 RLDILIHNAGISSC--GRTREAFNLLLRVNHIGPFLLTHLLLPCLKACAPSRVVVVASAA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HHIGKIPFHDLQSEKRYSRGF--AYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRS
: :.. :. :. : :: .:::::::.::::..:..:::: ::.::: : :
CCDS11 HCRGRLDFKRLDRPVVGWRQELRAYADTKLANVLFARELANQLEATGVTCYAAHPGPVNS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EL-VRH-SSLLCLLWRLFSPFV-KTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSP
:: .:: . : : : .. .: .. : :::: :.::: ::.:::::.::..:. : :
CCDS11 ELFLRHVPGWLRPLLRPLAWLVLRAPRGGAQTPLYCALQEGIEPLSGRYFANCHVEEVPP
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 RARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE
::....:.:::..: .: :.
CCDS11 AARDDRAAHRLWEASKRLAGLGPGEDAEPDEDPQSEDSEAPSSLSTPHPEEPTVSQPYPS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS1693.1 RDH14 gene_id:57665|Hs108|chr2 (336 aa)
initn: 881 init1: 584 opt: 745 Z-score: 964.8 bits: 186.8 E(32554): 2e-47
Smith-Waterman score: 884; 46.3% identity (72.8% similar) in 313 aa overlap (18-313:25-334)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGK
:.: .... :: . ::.:.:::::.:.:.
CCDS16 MAVATAAAVLAALGGALWLAARRFVGPRVQRLRRGG---DPGLMHGKTVLITGANSGLGR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE6 ETARELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNS-------------QVLVRKLDLS
:: :: :::: ..::: ..: ::...: . ... ...::.:::.
CCDS16 ATAAELLRLGARVIMGCRDRARAEEAAGQLRRELRQAAECGPEPGVSGVGELIVRELDLA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 DTKSIRAFAEGFLAEEKQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLE
. .:.::: . .: :: .: .::::::...::: :: :::: ..::::::::::: :::
CCDS16 SLRSVRAFCQEMLQEEPRLDVLINNAGIFQCPYMKTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QLKVSAPARVVNVSSVAHHIGKIPFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQG
:: :::.:.: ::: .. : : : ::.::. :...: : .:::::.:::::::.::.:
CCDS16 LLKSSAPSRIVVVSSKLYKYGDINFDDLNSEQSYNKSFCYSRSKLANILFTRELARRLEG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE6 TGVTTYAVHPGVVRSELVRHSSLLCLLWRLFS----PFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEP
:.::. ..:::.::..: :: . :. ::. : :: ::::::.. : . .:
CCDS16 TNVTVNVLHPGIVRTNLGRHIHIPLLVKPLFNLVSWAFFKTPVEGAQTSIYLASSPEVEG
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE6 LSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE
.::.::.:::. . :.: ....:..::..: ..:.
CCDS16 VSGRYFGDCKEEELLPKAMDESVARKLWDISEVMVGLLK
300 310 320 330
>>CCDS42627.1 RDH13 gene_id:112724|Hs108|chr19 (260 aa)
initn: 736 init1: 416 opt: 741 Z-score: 961.5 bits: 185.8 E(32554): 3.1e-47
Smith-Waterman score: 741; 50.4% identity (76.4% similar) in 246 aa overlap (75-313:3-248)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 TGANTGIGKETARELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKS
: :.::..:: .: : .: .:.:::.. ::
CCDS42 MEKCEAAAKDIRGETLNHHVNARHLDLASLKS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IRAFAEGFLAEEKQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKV
:: :: .. ::... ::::::::: ::. : :::: ..::::::::::: :::..::.
CCDS42 IREFAAKIIEEEERVDILINNAGVMRCPHWTTEDGFEMQFGVNHLGHFLLTNLLLDKLKA
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SAPARVVNVSSVAHHIGKIPFHDLQ-SEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGV
:::.:..:.::.:: :.: : ::. . ..:. :::.:::: ::::.::..::::.::
CCDS42 SAPSRIINLSSLAHVAGHIDFDDLNWQTRKYNTKAAYCQSKLAIVLFTKELSRRLQGSGV
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KE6 TTYAVHPGVVRSELVRHSSLL------CLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPL
:. :.::::.:.:: ::... : .: .::. . .:: : . :.:: : .
CCDS42 TVNALHPGVARTELGRHTGIHGSTFSSTTLGPIFWLLVKSPELAAQPSTYLAVAEELADV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310
pF1KE6 SGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE
:::::. :. .:.:.....:.::: : .:.:.
CCDS42 SGKYFDGLKQKAPAPEAEDEEVARRLWAESARLVGLEAPSVREQPLPR
220 230 240 250 260
>>CCDS58326.1 RDH11 gene_id:51109|Hs108|chr14 (248 aa)
initn: 1151 init1: 732 opt: 739 Z-score: 959.2 bits: 185.3 E(32554): 4.2e-47
Smith-Waterman score: 1016; 56.2% identity (70.3% similar) in 313 aa overlap (1-313:5-245)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETA
:. : :: :. :::.::.:::....::: ..:::::::::.::::::::::::
CCDS58 MVELMFPLLLLLLPFL--LYMAAPQIRKMLSSGVCTSTVQLPGKVVVVTGANTGIGKETA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEE
.:::.::::::.::::: ::: .:.::.. : :.:::::::::::::::::::.::::::
CCDS58 KELAQRGARVYLACRDVEKGELVAKEIQTTTGNQQVLVRKLDLSDTKSIRAFAKGFLAEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVSAPARVVNVSSV
:.::.:::::::::::::::::::: :.::::::
CCDS58 KHLHVLINNAGVMMCPYSKTADGFEMHIGVNHLG--------------------------
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AHHIGKIPFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRLQGTGVTTYAVHPGVVRSE
.:::::.::::.:.::
CCDS58 --------------------------------------------SGVTTYSVHPGTVQSE
160
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LVRHSSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRARN
::::::.. .: ::: :.:: ..::::::::::.:::: :::..::::. .::: .:::
CCDS58 LVRHSSFMRWMWWLFSFFIKTPQQGAQTSLHCALTEGLEILSGNHFSDCHVAWVSAQARN
170 180 190 200 210 220
300 310
pF1KE6 NKTAERLWNVSCELLGIRWE
. :.:::.:::.:::.
CCDS58 ETIARRLWDVSCDLLGLPID
230 240
>>CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs108|chrX (330 aa)
initn: 664 init1: 371 opt: 649 Z-score: 840.9 bits: 163.8 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 656; 43.4% identity (68.1% similar) in 288 aa overlap (38-313:42-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETARELASRGARVY
: .:...::.. ::: ::..:: : .:
CCDS35 RVYAVGAAVILAQLLRRCRGGFLEPVFPPRPDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEKQLHILINNAG
:: . :.....:.:. .: :..: ::.. ::: :.. : .. ::.::::::
CCDS35 IAGNNDSKAKQVVSKIKEETLNDKVEFLYCDLASMTSIRQFVQKFKMKKIPLHVLINNAG
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVS-AP---ARVVNVSSVAHHIGKI
::: : :: :::: :.:.:.::::::: :::. :: : .: ::::.:::..:.....
CCDS35 VMMVPQRKTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGHSARVVTVSSATHYVAEL
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRL--QGTGVTTYAVHPGVVRSELVRH-
. :::: :: :: .:::: :::: .: . : .:. ::. .: :::: ... .:
CCDS35 NMDDLQSSACYSPHAAYAQSKLALVLFTYHLQRLLAAEGSHVTANVVDPGVVNTDVYKHV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KE6 --SSLLC---LLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRAR
.. : : : :: :: ::: ::.. :.. :: ..:.:. . :.: .
CCDS35 FWATRLAKKLLGWLLF----KTPDEGAWTSIYAAVTPELEGVGGHYLYNEKETKSLHVTY
260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 NNKTAERLWNVSCELLGIRWE
:.: ..::. :::. :.
CCDS35 NQKLQQQLWSKSCEMTGVLDVTL
310 320 330
>>CCDS35195.1 DHRSX gene_id:207063|Hs108|chrY (330 aa)
initn: 664 init1: 371 opt: 649 Z-score: 840.9 bits: 163.8 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 656; 43.4% identity (68.1% similar) in 288 aa overlap (38-313:42-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNVQLPGKVVVITGANTGIGKETARELASRGARVY
: .:...::.. ::: ::..:: : .:
CCDS35 RVYAVGAAVILAQLLRRCRGGFLEPVFPPRPDRVAIVTGGTDGIGYSTAKHLARLGMHVI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSIRAFAEGFLAEEKQLHILINNAG
:: . :.....:.:. .: :..: ::.. ::: :.. : .. ::.::::::
CCDS35 IAGNNDSKAKQVVSKIKEETLNDKVEFLYCDLASMTSIRQFVQKFKMKKIPLHVLINNAG
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVS-AP---ARVVNVSSVAHHIGKI
::: : :: :::: :.:.:.::::::: :::. :: : .: ::::.:::..:.....
CCDS35 VMMVPQRKTRDGFEEHFGLNYLGHFLLTNLLLDTLKESGSPGHSARVVTVSSATHYVAEL
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PFHDLQSEKRYSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKRL--QGTGVTTYAVHPGVVRSELVRH-
. :::: :: :: .:::: :::: .: . : .:. ::. .: :::: ... .:
CCDS35 NMDDLQSSACYSPHAAYAQSKLALVLFTYHLQRLLAAEGSHVTANVVDPGVVNTDVYKHV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KE6 --SSLLC---LLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEPLSGKYFSDCKRTWVSPRAR
.. : : : :: :: ::: ::.. :.. :: ..:.:. . :.: .
CCDS35 FWATRLAKKLLGWLLF----KTPDEGAWTSIYAAVTPELEGVGGHYLYNEKETKSLHVTY
260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 NNKTAERLWNVSCELLGIRWE
:.: ..::. :::. :.
CCDS35 NQKLQQQLWSKSCEMTGVLDVTL
310 320 330
>>CCDS42196.1 WWOX gene_id:51741|Hs108|chr16 (414 aa)
initn: 694 init1: 408 opt: 538 Z-score: 695.9 bits: 137.3 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 712; 41.6% identity (68.8% similar) in 308 aa overlap (20-314:101-408)
10 20 30 40
pF1KE6 MLVTLGLLTSFFSFLYMVAPSIRKFFAGGVCRTNV----QLPGKVVVIT
:. :. . :.. .. .. :::::.:
CCDS42 GQVFFVDHINKRTTYLDPRLAFTVDDNPTKPTTRQRYDGSTTAMEILQGRDFTGKVVVVT
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 GANTGIGKETARELASRGARVYIACRDVLKGESAASEIRVDTKNSQVLVRKLDLSDTKSI
:::.::: :::. .: .::.: .:::.. .. :.:.: . ....: . :::. .:.
CCDS42 GANSGIGFETAKSFALHGAHVILACRNMARASEAVSRILEEWHKAKVEAMTLDLALLRSV
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 RAFAEGFLAEEKQLHILINNAGVMMCPYSKTADGFETHLGVNHLGHFLLTYLLLEQLKVS
. :::.: :.. ::.:. ::... :.: : ::.:: . ::::::: :. :: . : :
CCDS42 QHFAEAFKAKNVPLHVLVCNAATFALPWSLTKDGLETTFQVNHLGHFYLVQLLQDVLCRS
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210
pF1KE6 APARVVNVSSVAHH-------IGKIPFHDLQSEKR-YSRGFAYCHSKLANVLFTRELAKR
:::::. ::: .:. .::. : :. : : .:: .::: :.::. :: .:
CCDS42 APARVIVVSSESHRFTDINDSLGKLDFSRLSPTKNDYWAMLAYNRSKLCNILFSNELHRR
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LQGTGVTTYAVHPG-VVRSELVRHSSLLCLLWRLFSPFVKTAREGAQTSLHCALAEGLEP
:. :::. ::::: .. :.. : . ::. : ::.:. ..:: :...:: . ::
CCDS42 LSPRGVTSNAVHPGNMMYSNIHRSWWVYTLLFTLARPFTKSMQQGAATTVYCAAVPELEG
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310
pF1KE6 LSGKYFSDCKRTWVSPRARNNKTAERLWNVSCELLGIRWE
:.: ::..: : ::.:....::. :: .: .:. :
CCDS42 LGGMYFNNCCRCMPSPEAQSEETARTLWALSERLIQERLGSQSG
380 390 400 410
316 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 14:57:42 2016 done: Tue Nov 8 14:57:42 2016
Total Scan time: 1.390 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]