Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6631
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6631, 316 aa
1>>>pF1KE6631 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8419+/-0.00138; mu= 8.3068+/- 0.081
mean_var=194.4008+/-40.128, 0's: 0 Z-trim(104.7): 180 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.091987
statistics sampled from 7812 (8024) to 7812 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 316) 2111 293.3 1.7e-79
CCDS8491.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 2090 290.5 1.2e-78
CCDS44777.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 355) 2082 289.5 2.6e-78
CCDS41733.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 1900 265.3 4.8e-71
CCDS8492.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 345) 1711 240.2 1.7e-63
CCDS31722.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 338) 1533 216.6 2.2e-56
CCDS81649.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 304) 1425 202.2 4.2e-52
CCDS2982.1 LSAMP gene_id:4045|Hs108|chr3 ( 338) 1189 171.0 1.2e-42
CCDS661.1 NEGR1 gene_id:257194|Hs108|chr1 ( 354) 1068 154.9 8.4e-38
CCDS46158.1 IGLON5 gene_id:402665|Hs108|chr19 ( 336) 955 139.9 2.7e-33
>>CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 2111 init1: 2111 opt: 2111 Z-score: 1540.8 bits: 293.3 E(32554): 1.7e-79
Smith-Waterman score: 2111; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGHTNASIMLFGETVL
::::::::::::::::
CCDS44 LGHTNASIMLFGETVL
310
>>CCDS8491.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 2090 init1: 2090 opt: 2090 Z-score: 1525.3 bits: 290.5 E(32554): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 2090; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGHTNASIMLFGETVL
::::::::::::
CCDS84 LGHTNASIMLFGPGAVSEVSNGTSRRAGCVWLLPLLVLHLLLKF
310 320 330 340
>>CCDS44777.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (355 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 1519.4 bits: 289.5 E(32554): 2.6e-78
Smith-Waterman score: 2082; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGHTNASIMLFGETVL
:::::::::::
CCDS44 LGHTNASIMLFEVKTTALTPWKGPGAVSEVSNGTSRRAGCVWLLPLLVLHLLLKF
310 320 330 340 350
>>CCDS41733.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1899 init1: 1899 opt: 1900 Z-score: 1389.0 bits: 265.3 E(32554): 4.8e-71
Smith-Waterman score: 1900; 94.7% identity (96.4% similar) in 304 aa overlap (9-312:12-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRC
. : .. .. :: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKTIQPKMHNSISWAIFTGLAALCLF---QGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TIDNRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TIDNRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QTDNHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFVSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KGTLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 SNKLGHTNASIMLFGETVL
:::::::::::::::
CCDS41 SNKLGHTNASIMLFGPGAVSEVSNGTSRRAGCVWLLPLLVLHLLLKF
300 310 320 330 340
>>CCDS8492.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (345 aa)
initn: 1712 init1: 1061 opt: 1711 Z-score: 1253.4 bits: 240.2 E(32554): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1711; 79.9% identity (91.4% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
.::::::::::::::::::::: .::::..: :: ::::: :::::::::::::::::::
CCDS84 DRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWSIDPRVIILVNTPTQYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPK-AVGF
:::::::::::::: :.:..:::::..:::....: :.: :::::::::::.: : . ::
CCDS84 NHPKTSRVHLIVQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLLCLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKG
:::::::::. : :.:::.::::: :::::: ::.::.:::::::::.::.::: :::::
CCDS84 VSEDEYLEISDIKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKVKITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASN
:.::::::: :::::.:.. :: : :...::. .: : ::::::.:::::::::.:
CCDS84 ILSCEASAVPMAEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKGRMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KLGHTNASIMLFGETVL
:::.::::: :.:
CCDS84 KLGNTNASITLYGPGAVIDGVNSASRALACLWLSGTLLAHFFIKF
310 320 330 340
>>CCDS31722.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (338 aa)
initn: 1530 init1: 879 opt: 1533 Z-score: 1125.9 bits: 216.6 E(32554): 2.2e-56
Smith-Waterman score: 1533; 73.9% identity (87.9% similar) in 307 aa overlap (7-312:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
.. : .: . :...: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYHPAYWVVFSATTALLFIP-GVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
.::::::::::::::::::::: .::::..: :: ::::: :::::::::::::::::::
CCDS31 DRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWSIDPRVIILVNTPTQYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPK-AVGF
:::::::::::::: :.:..:::::..:::....: :.: :::::::::::.: : . ::
CCDS31 NHPKTSRVHLIVQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLLCLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VSEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKG
:::::::::. : :.:::.::::: :::::: ::.::.:::::::::.::.::: :::::
CCDS31 VSEDEYLEISDIKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKVKITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASN
:.::::::: :::::.:.. :: : :...::. .: : ::::::.:::::::::.:
CCDS31 ILSCEASAVPMAEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKGRMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KLGHTNASIMLFGETVL
:::.::::: :.:
CCDS31 KLGNTNASITLYGPGAVIDGVNSASRALACLWLSGTLLAHFFIKF
300 310 320 330
>>CCDS81649.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 (304 aa)
initn: 1426 init1: 775 opt: 1425 Z-score: 1048.9 bits: 202.2 E(32554): 4.2e-52
Smith-Waterman score: 1425; 76.8% identity (90.1% similar) in 272 aa overlap (42-312:1-272)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 KCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTIDNRVTRVAWLNR
:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS81 MDNVTVRQGESATLRCTIDDRVTRVAWLNR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 STILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLI
::::::::::: .::::..: :: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 STILYAGNDKWSIDPRVIILVNTPTQYSIMIQNVDVYDEGPYTCSVQTDNHPKTSRVHLI
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 VQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPK-AVGFVSEDEYLEIQG
::: :.:..:::::..:::....: :.: :::::::::::.: : . :::::::::::.
CCDS81 VQVPPQIMNISSDITVNEGSSVTLLCLAIGRPEPTVTWRHLSVKEGQGFVSEDEYLEISD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 ITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGTLQCEASAVPS
: :.:::.::::: :::::: ::.::.:::::::::.::.::: ::::: :.:::::::
CCDS81 IKRDQSGEYECSALNDVAAPDVRKVKITVNYPPYISKAKNTGVSVGQKGILSCEASAVPM
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 AEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNKLGHTNASIML
:::::.:.. :: : :...::. .: : ::::::.:::::::::.::::.::::: :
CCDS81 AEFQWFKEETRLATGLDGMRIENKGRMSTLTFFNVSEKDYGNYTCVATNKLGNTNASITL
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FGETVL
.:
CCDS81 YGPGAVIDGVNSASRALACLWLSGTLLAHFFIKF
280 290 300
>>CCDS2982.1 LSAMP gene_id:4045|Hs108|chr3 (338 aa)
initn: 1169 init1: 971 opt: 1189 Z-score: 879.2 bits: 171.0 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 1189; 57.7% identity (85.0% similar) in 300 aa overlap (12-311:10-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFPKAMDNVTVRQGESATLRCTID
: : .: :::: :.:::.:::: : : .. ::.:::::..: :::...
CCDS29 MVRRVQPDRKQLPLVLLRLLCLLPTGLPVRSVD--FNRGTDNITVRQGDTAILRCVVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NRVTRVAWLNRSTILYAGNDKWCLDPRVVLLSNTQTQYSIEIQNVDVYDEGPYTCSVQTD
.. ..::::::: :..::.::: ::::: : . . .::..::.::::::: :::::::.
CCDS29 DKNSKVAWLNRSGIIFAGHDKWSLDPRVELEKRHSLEYSLRIQKVDVYDEGSYTCSVQTQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NHPKTSRVHLIVQVSPKIVEISSDISINEGNNISLTCIATGRPEPTVTWRHISPKAVGFV
..::::.:.::::: ::: .::::...:::.:..:.:.:.:::::..::::..: . :
CCDS29 HEPKTSQVYLIVQVPPKISNISSDVTVNEGSNVTLVCMANGRPEPVITWRHLTPTGREFE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDVAAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKGT
.:.::::: :::::::: :::.:.:.:.. :..::::::::: :.:.:.. . .:....
CCDS29 GEEEYLEILGITREQSGKYECKAANEVSSADVKQVKVTVNYPPTITESKSNEATTGRQAS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK
:.:::::::. .:.::.:: : :.. .:..... :.: ::.:. ::::::::.::
CCDS29 LKCEASAVPAPDFEWYRDDTR-INSANGLEIKSTEGQSSLTVTNVTEEHYGNYTCVAANK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LGHTNASIMLFGETVL
:: ::::..::
CCDS29 LGVTNASLVLFRPGSVRGINGSISLAVPLWLLAASLLCLLSKC
300 310 320 330
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]