Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6621, 331 aa
1>>>pF1KE6621 331 - 331 aa - 331 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6993+/-0.00104; mu= 12.9249+/- 0.062
mean_var=57.4069+/-11.666, 0's: 0 Z-trim(102.6): 22 B-trim: 204 in 1/49
Lambda= 0.169275
statistics sampled from 6998 (7017) to 6998 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 1.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3193.1 B3GALNT1 gene_id:8706|Hs108|chr3 ( 331) 2275 564.1 5.4e-161
CCDS13667.1 B3GALT5 gene_id:10317|Hs108|chr21 ( 310) 721 184.6 8.8e-47
CCDS74795.1 B3GALT5 gene_id:10317|Hs108|chr21 ( 314) 721 184.6 8.9e-47
CCDS2227.1 B3GALT1 gene_id:8708|Hs108|chr2 ( 326) 709 181.7 7e-46
CCDS1383.1 B3GALT2 gene_id:8707|Hs108|chr1 ( 422) 649 167.1 2.3e-41
CCDS3244.1 B3GNT5 gene_id:84002|Hs108|chr3 ( 378) 480 125.8 5.6e-29
CCDS46540.1 B3GNT7 gene_id:93010|Hs108|chr2 ( 401) 469 123.1 3.8e-28
CCDS12364.1 B3GNT3 gene_id:10331|Hs108|chr19 ( 372) 459 120.7 1.9e-27
CCDS81751.1 B3GNT4 gene_id:79369|Hs108|chr12 ( 353) 453 119.2 5e-27
CCDS9227.1 B3GNT4 gene_id:79369|Hs108|chr12 ( 378) 453 119.2 5.4e-27
CCDS53681.1 B3GNT6 gene_id:192134|Hs108|chr11 ( 384) 449 118.2 1.1e-26
CCDS1870.1 B3GNT2 gene_id:10678|Hs108|chr2 ( 397) 438 115.5 7.1e-26
CCDS45509.1 B3GNT9 gene_id:84752|Hs108|chr16 ( 402) 366 97.9 1.4e-20
CCDS12582.1 B3GNT8 gene_id:374907|Hs108|chr19 ( 397) 346 93.1 4.1e-19
CCDS34425.1 B3GALT4 gene_id:8705|Hs108|chr6 ( 378) 306 83.3 3.4e-16
>>CCDS3193.1 B3GALNT1 gene_id:8706|Hs108|chr3 (331 aa)
initn: 2275 init1: 2275 opt: 2275 Z-score: 3003.9 bits: 564.1 E(32554): 5.4e-161
Smith-Waterman score: 2275; 100.0% identity (100.0% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASALWTVLPSRMSLRSLKWSLLLLSLLSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MASALWTVLPSRMSLRSLKWSLLLLSLLSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EAEKEDKMLALSLEDEHLLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAEKEDKMLALSLEDEHLLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TDVFINTGNLVKYLLNLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDVFINTGNLVKYLLNLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGYIMSRDLVPRIYEMMGHVKPIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYRIHLDVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGYIMSRDLVPRIYEMMGHVKPIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYRIHLDVC
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE6 QLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY
310 320 330
>>CCDS13667.1 B3GALT5 gene_id:10317|Hs108|chr21 (310 aa)
initn: 719 init1: 559 opt: 721 Z-score: 953.4 bits: 184.6 E(32554): 8.8e-47
Smith-Waterman score: 721; 38.2% identity (69.6% similar) in 280 aa overlap (52-329:31-307)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 LLLLSLLSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLV
: : .:..: .: ..: . ::::
CCDS13 MAFPKMRLMYICLLVLGALCLYFSMYSLNPFKEQSFVYKKDGNFLKLPDTDCRQTPPFLV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 ILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQEAEKEDKMLALSLEDEHLLYG
.:::: ... :.::: :::... : .. :::::: . . ...: .:
CCDS13 LLVTSSHKQLAERMAIRQTWGKERMVKGKQLKTFFLLGTTSSAAETK---EVDQESQRHG
70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 DIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTDTDVFINTGNLVKYLLNLNHSE
:::..::::.: ::::::.:...:: .:::.: .:::::.:.:::. :.. ::. :..
CCDS13 DIIQKDFLDVYYNLTLKTMMGIEWVHRFCPQAAFVMKTDSDMFINVDYLTELLLKKNRTT
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 KFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIMSRDLVPRIYEMMGHVK
.::::. .... : ..: .: .:::. .::.::: ::..: :.. ..:.. :
CCDS13 RFFTGFLKLNEFPIRQPFSKWFVSKSEYPWDRYPPFCSGTGYVFSGDVASQVYNVSKSVP
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 PIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQ
::.:::.::.::. :.. .. .. :: ....:: .::..: : .. . .. .::
CCDS13 YIKLEDVFVGLCLERLNIRLEELHSQPTFFPGGLRFSVCLFRRIVACHFIKPRTLLDYWQ
240 250 260 270 280 290
330
pF1KE6 VML--RNTTCHY
.. :. :
CCDS13 ALENSRGEDCPPV
300 310
>>CCDS74795.1 B3GALT5 gene_id:10317|Hs108|chr21 (314 aa)
initn: 719 init1: 559 opt: 721 Z-score: 953.3 bits: 184.6 E(32554): 8.9e-47
Smith-Waterman score: 721; 38.2% identity (69.6% similar) in 280 aa overlap (52-329:35-311)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 LLLLSLLSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLV
: : .:..: .: ..: . ::::
CCDS74 MAFPKMRLMYICLLVLGALCLYFSMYSLNPFKEQSFVYKKDGNFLKLPDTDCRQTPPFLV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 ILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQEAEKEDKMLALSLEDEHLLYG
.:::: ... :.::: :::... : .. :::::: . . ...: .:
CCDS74 LLVTSSHKQLAERMAIRQTWGKERMVKGKQLKTFFLLGTTSSAAETK---EVDQESQRHG
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 DIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTDTDVFINTGNLVKYLLNLNHSE
:::..::::.: ::::::.:...:: .:::.: .:::::.:.:::. :.. ::. :..
CCDS74 DIIQKDFLDVYYNLTLKTMMGIEWVHRFCPQAAFVMKTDSDMFINVDYLTELLLKKNRTT
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 KFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIMSRDLVPRIYEMMGHVK
.::::. .... : ..: .: .:::. .::.::: ::..: :.. ..:.. :
CCDS74 RFFTGFLKLNEFPIRQPFSKWFVSKSEYPWDRYPPFCSGTGYVFSGDVASQVYNVSKSVP
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 PIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQ
::.:::.::.::. :.. .. .. :: ....:: .::..: : .. . .. .::
CCDS74 YIKLEDVFVGLCLERLNIRLEELHSQPTFFPGGLRFSVCLFRRIVACHFIKPRTLLDYWQ
250 260 270 280 290 300
330
pF1KE6 VML--RNTTCHY
.. :. :
CCDS74 ALENSRGEDCPPV
310
>>CCDS2227.1 B3GALT1 gene_id:8708|Hs108|chr2 (326 aa)
initn: 698 init1: 259 opt: 709 Z-score: 937.1 bits: 181.7 E(32554): 7e-46
Smith-Waterman score: 711; 38.6% identity (69.0% similar) in 306 aa overlap (33-323:20-318)
10 20 30 40 50
pF1KE6 SALWTVLPSRMSLRSLKWSLLLLSLLSFFVMWYLSL-----------PHYNV-IERVNWM
.::::. : .. . : :.
CCDS22 MASKVSCLYVLTVVCWASALWYLSITRPTSSYTGSKPFSHLTVARKNFT
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE6 YF-YEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWG
. . .:: ..:.: . : ..: .. ::::::... .. :::::: :::..... :
CCDS22 FGNIRTRPINPHSFEFLINEPNKCEKNIPFLVILISTTHKEFDARQAIRETWGDENNFKG
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 YEVLTFFLLGQEAEKEDKMLALSLEDEHLLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEF
.. :.::::..: : .: .:.: .. ::: .::.:.:.::::::.:..:::. :
CCDS22 IKIATLFLLGKNA---DPVLNQMVEQESQIFHDIIVEDFIDSYHNLTLKTLMGMRWVATF
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 CPNAKYVMKTDTDVFINTGNLVKYLL--NLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQ
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CCDS22 CSKAKYVMKTDSDIFVNMDNLIYKLLKPSTKPRRRYFTGY-VINGGPIRDVRSKWYMPRD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 EYPFKVFPPYCSGLGYIMSRDLVPRIYEMMGHVKPIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDT
:: . .::.::: :::.: :.. ::. :.. ...::::::.:: :..:: : ..
CCDS22 LYPDSNYPPFCSGTGYIFSADVAELIYKTSLHTRLLHLEDVYVGLCLR--KLGIH-PFQN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE6 NLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY
. : ... ..:. ::::..: .: .:. .:. :
CCDS22 SGFNHWKMAYSLCRYRRVITVHQISPEEMHRIWNDMSSKKHLRC
290 300 310 320
>>CCDS1383.1 B3GALT2 gene_id:8707|Hs108|chr1 (422 aa)
initn: 406 init1: 231 opt: 649 Z-score: 856.0 bits: 167.1 E(32554): 2.3e-41
Smith-Waterman score: 649; 36.7% identity (71.2% similar) in 267 aa overlap (63-326:136-400)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 MWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVK
:.. . : .:....:::..:....:....
CCDS13 PQGVTGLENTLSANGSIYNEKGTGHPNSYHFKYIINEPEKCQEKSPFLILLIAAEPGQIE
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 ARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLGQEAEKEDKMLALSLEDEHLLYGDIIRQDFLDTY
::.::: :::... : .. .:::: : . .: .. .: : :::.:..::::
CCDS13 ARRAIRQTWGNESLAPGIQITRIFLLGLSI-KLNGYLQRAILEESRQYHDIIQQEYLDTY
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 NNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTDTDVFINTGNLVKYLL--NLNHSEKFFTGYPLI
:::.::.:.. ::. .::. ::::::.:.:.:: :.. :: .: ...:::: :.
CCDS13 YNLTIKTLMGMNWVATYCPHIPYVMKTDSDMFVNTEYLINKLLKPDLPPRHNYFTGY-LM
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260
pF1KE6 DNYS-YRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIMSRDLVPRIYEMMGHVKPIKFEDVY
.:. :. .: .. . :: . .: .::: ::..: ::. .:... .. ...::::
CCDS13 RGYAPNRNKDSKWYMPPDLYPSERYPVFCSGTGYVFSGDLAEKIFKVSLGIRRLHLEDVY
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 VGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYRIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTC
::::: :... : . .: .:. . :. ..:..: :. .:.: .:. . .:
CCDS13 VGICLAKLRIDPVPPPNEFVFNHWRVSYSSCKYSHLITSHQFQPSELIKYWNHLQQNKHN
350 360 370 380 390 400
330
pF1KE6 HY
CCDS13 ACANAAKEKAGRYRHRKLH
410 420
>>CCDS3244.1 B3GNT5 gene_id:84002|Hs108|chr3 (378 aa)
initn: 244 init1: 244 opt: 480 Z-score: 633.8 bits: 125.8 E(32554): 5.6e-29
Smith-Waterman score: 480; 30.0% identity (63.3% similar) in 267 aa overlap (63-321:73-334)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 MWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHFTLREHSNCSHQNPFLVILVTSHPSDVK
... . .. .:. :. .:...: . : .
CCDS32 MKSYSYRYLINSYDFVNDTLSLKHTSAGPRYQYLINHKEKCQAQDVLLLLFVKTAPENYD
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KE6 ARQAIRVTWGEK---KSWWGYEVLTFFLLGQEAEKEDKMLALSLEDEHLLYGDIIRQDFL
:..:: :::.. .: . .. :.: :: : . : .: : :.:::.:::.
CCDS32 RRSGIRRTWGNENYVRSQLNANIKTLFALGTPNPLEGEELQRKLAWEDQRYNDIIQQDFV
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 DTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTDTDVFINTGNLVKYLLNLNH--SEKFFTGY
:.. ::::: .: : :.. .::.::..: .: :.::. ::..:: .:.. . :. :
CCDS32 DSFYNLTLKLLMQFSWANTYCPHAKFLMTADDDIFIHMPNLIEYLQSLEQIGVQDFWIGR
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 PLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIMSRDLVPRIYEMMGHVKP-IKFE
: .: ..::. : . ..: : .: .:..: :.. ..:: .. . ..
CCDS32 VHRGAPPIRDKSSKYYVSYEMYQWPAYPDYTAGAAYVISGDVAAKVYEASQTLNSSLYID
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 DVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLY--RIHLDVCQLRRVIAAHGFSSKEIITFWQVML
::..:.: : :..: .:.: ..:: . : ......:: ... .:.
CCDS32 DVFMGLCAN--KIGI-VPQD-HVFFSGEGKTPYHPCIYEKMMTSHGHL-EDLQDLWKNAT
290 300 310 320 330
330
pF1KE6 RNTTCHY
CCDS32 DPKVKTISKGFFGQIYCRLMKIILLCKISYVDTYPCRAAFI
340 350 360 370
>>CCDS46540.1 B3GNT7 gene_id:93010|Hs108|chr2 (401 aa)
initn: 381 init1: 324 opt: 469 Z-score: 618.8 bits: 123.1 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 473; 31.2% identity (60.1% similar) in 298 aa overlap (51-329:100-394)
30 40 50 60 70
pF1KE6 SLLLLSLLSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHF--------TLREHSN
.: :: .:: : : : .: .
CCDS46 APTPMASQGPQAWDVTTTNCSANINLTHQPWFQVLEPQFRQ-FLFYRHCRYFPMLLNHPE
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120
pF1KE6 CSHQNPFLVILVTSHPSDVKARQAIRVTWG-EKKSWWGYE--VLTFFLLGQEAEKEDK--
. . .:...: : .. :.::: ::: :..: : . : :.:::: ...:..
CCDS46 KCRGDVYLLVVVKSVITQHDRREAIRQTWGRERQSAGGGRGAVRTLFLLGTASKQEERTH
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 -MLALSLEDEHLLYGDIIRQDFLDTYNNLTLKTIMAFRWVTEFCPNAKYVMKTDTDVFIN
. :. ::. :::::.. ::::. ::::: : ..:. .::.. ...: : :::.:
CCDS46 YQQLLAYEDR--LYGDILQWGFLDTFFNLTLKEIHFLKWLDIYCPHVPFIFKGDDDVFVN
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TGNLVKYLLNLNHSEKFFTGYPLIDNYSYRGFYQKTHISYQEYPFKVFPPYCSGLGYIMS
::...: . . .:..:.: : : .: .: : .::: .: :..:.
CCDS46 PTNLLEFLADRQPQENLFVGDVLQHARPIRRKDNKYYIPGALYGKASYPPYAGGGGFLMA
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RDLVPRIYEMMGHVKPIKFEDVYVGICLNLLKVNIHIPEDTNLFFLYR-----IHLDVCQ
.:. :... .. ..::..:.::..: :. : . : . : .. . :
CCDS46 GSLARRLHHACDTLELYPIDDVFLGMCLEVLGVQPTAHEGFKTFGISRNRNSRMNKEPCF
310 320 330 340 350 360
310 320 330
pF1KE6 LRRVIAAHGFSSKEIITFWQVMLRNTTCHY
.: ....: . :....: .. : ::
CCDS46 FRAMLVVHKLLPPELLAMWGLVHSNLTCSRKLQVL
370 380 390 400
>>CCDS12364.1 B3GNT3 gene_id:10331|Hs108|chr19 (372 aa)
initn: 417 init1: 308 opt: 459 Z-score: 606.2 bits: 120.7 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 459; 32.3% identity (60.8% similar) in 288 aa overlap (58-329:85-365)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 LSFFVMWYLSLPHYNVIERVNWMYFYEYEPIYRQDFHFTLREH---SNCSHQNPFLVILV
.::. :: : . :.:. : ::....
CCDS12 RPAPAPCHANTSMVTHPDFATQPQHVQNFLLYRHCRHFPLLQDVPPSKCA-QPVFLLLVI
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KE6 TSHPSDVKARQAIRVTWGEKKSWWGYEVLTFFLLG-----QEAEKEDKMLALSLEDEHLL
: ::. :. .: :::.... : .. .::.: .::.: ...: : :
CCDS12 KSSPSNYVRRELLRRTWGRERKVRGLQLRLLFLVGTASNPHEARKVNRLLEL----EAQT
120 130 140 150 160
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