FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6489, 593 aa
1>>>pF1KE6489 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3994+/-0.00102; mu= 18.0570+/- 0.062
mean_var=70.5065+/-14.127, 0's: 0 Z-trim(103.4): 182 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.152742
statistics sampled from 7219 (7406) to 7219 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 3.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 3960 882.4 0
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 3895 868.1 0
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 3339 745.6 3.6e-215
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 3117 696.6 1.9e-200
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 3068 685.9 3.8e-197
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 3020 675.3 5.6e-194
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 2828 632.9 2.5e-181
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 2748 615.3 5.7e-176
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1785 403.2 5.3e-112
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 1600 362.4 9.5e-100
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1485 337.0 3.8e-92
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1484 336.8 4.4e-92
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1484 336.9 5.3e-92
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1484 336.9 5.6e-92
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1453 330.0 5.1e-90
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 1416 321.9 1.8e-87
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 1399 318.1 2.3e-86
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 1373 312.4 1.2e-84
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1359 309.3 1.1e-83
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 1344 306.0 1e-82
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 1323 301.3 2.1e-81
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 1323 301.4 2.2e-81
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1277 291.2 2.6e-78
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1249 285.1 1.9e-76
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 1066 244.7 2.4e-64
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1060 243.4 5.7e-64
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 999 230.0 6.9e-60
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 998 229.7 7.4e-60
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 946 218.4 3.1e-56
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 919 212.3 1.4e-54
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 919 212.3 1.5e-54
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 919 212.4 1.5e-54
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 919 212.4 1.5e-54
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 910 210.4 5.7e-54
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 898 207.7 3.4e-53
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 895 207.1 5.6e-53
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 888 205.5 1.6e-52
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 836 194.0 4.5e-49
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 815 189.4 1.1e-47
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 796 185.2 2e-46
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 787 183.2 7.8e-46
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 777 181.0 3.8e-45
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 776 180.8 3.8e-45
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 770 179.5 1.1e-44
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 722 168.9 1.7e-41
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 692 162.3 1.5e-39
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 640 150.8 4.4e-36
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 621 146.7 8.3e-35
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 619 146.2 1.1e-34
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 610 144.2 4.3e-34
>>CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 3960 init1: 3960 opt: 3960 Z-score: 4715.1 bits: 882.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3960; 99.8% identity (99.8% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS34 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE6 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (597 aa)
initn: 3892 init1: 3892 opt: 3895 Z-score: 4637.6 bits: 868.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3895; 99.0% identity (99.3% similar) in 590 aa overlap (4-593:8-597)
10 20 30 40 50
pF1KE6 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
: . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS54 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
550 560 570 580 590
>>CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (505 aa)
initn: 3339 init1: 3339 opt: 3339 Z-score: 3976.5 bits: 745.6 E(32554): 3.6e-215
Smith-Waterman score: 3339; 99.8% identity (99.8% similar) in 505 aa overlap (89-593:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
460 470 480 490 500
>>CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (496 aa)
initn: 3114 init1: 3114 opt: 3117 Z-score: 3712.3 bits: 696.6 E(32554): 1.9e-200
Smith-Waterman score: 3117; 95.9% identity (97.5% similar) in 489 aa overlap (105-593:9-496)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 AACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAG
: . .::.. . . . .::::::::
CCDS82 MSQLWQKTWKF-LLIEWCWPPVVLIFMPCLQVLLPAAG
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 LLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEF
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREY
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 LVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGG
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 QAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYD
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 PVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMN
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 TRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVL
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 NNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGS
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590
pF1KE6 CNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
460 470 480 490
>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (587 aa)
initn: 3449 init1: 3054 opt: 3068 Z-score: 3652.8 bits: 685.9 E(32554): 3.8e-197
Smith-Waterman score: 3068; 77.5% identity (92.8% similar) in 582 aa overlap (12-593:7-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
: . : ... ::. ... .:::: :: :::::::::::..::::: :
CCDS41 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.
CCDS41 VAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:
CCDS41 VTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.
CCDS41 AEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :
CCDS41 LMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGG
::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::::
CCDS41 TPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS41 FNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAY
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:
CCDS41 SYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::
CCDS41 DMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KE6 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS41 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
540 550 560 570 580
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 3410 init1: 3015 opt: 3020 Z-score: 3596.0 bits: 675.3 E(32554): 5.6e-194
Smith-Waterman score: 3020; 79.6% identity (94.1% similar) in 555 aa overlap (39-593:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEIS
: :::::::::::..::::: :::::.::
CCDS58 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQV
::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: :: ::::.:::::.::::::::
CCDS58 AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADV
:::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:::::: .:
CCDS58 LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLP
.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::
CCDS58 MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKL
::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.
CCDS58 LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 MVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVR
:.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::::::::::::
CCDS58 MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWF
::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.::::
CCDS58 TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 HVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSG
:::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::
CCDS58 FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 AGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590
pF1KE6 GGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS58 GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
520 530 540 550
>>CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (427 aa)
initn: 2828 init1: 2828 opt: 2828 Z-score: 3369.0 bits: 632.9 E(32554): 2.5e-181
Smith-Waterman score: 2828; 99.8% identity (99.8% similar) in 427 aa overlap (167-593:1-427)
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 QLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLN
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLV
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 QRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQA
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 PKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTR
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 RSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNN
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 LLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590
pF1KE6 LASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
400 410 420
>>CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (505 aa)
initn: 3143 init1: 2748 opt: 2748 Z-score: 3272.7 bits: 615.3 E(32554): 5.7e-176
Smith-Waterman score: 2748; 79.2% identity (94.3% similar) in 505 aa overlap (89-593:1-505)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
::::.::...::.::: :: ::::.::::
CCDS58 MSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
:.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::
CCDS58 IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
.:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : :
CCDS58 AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
:.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::.
CCDS58 AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAV
:::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::
CCDS58 PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS58 GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :
CCDS58 AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
.:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::
CCDS58 VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS58 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
460 470 480 490 500
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
initn: 2404 init1: 1354 opt: 1785 Z-score: 2124.3 bits: 403.2 E(32554): 5.3e-112
Smith-Waterman score: 1787; 47.6% identity (74.7% similar) in 597 aa overlap (4-590:31-623)
10 20
pF1KE6 METPPLPPAC----TKQGHQKPLDSKDD-----
:: ::: :. . .: .
CCDS30 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 NTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAM
. : : . . :.. :: .:...:...::::... . :: ::.::::.::::::::
CCDS30 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 FTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKT
::.:::::: .: ....: .: .:....::::: : : :::.:::::.::::. :. .
CCDS30 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 CCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCS
::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::. :. :. :::.::. .:::. : ..::
CCDS30 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEAL
:.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:.. . :::. :::::: :..:. .:. :.:
CCDS30 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 VKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-V
:.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: : . .. .::: . ::..
CCDS30 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDC
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSV
: :: . .::: :: . . : :.:.. ... ..::::..:. . ::.::::: . :
CCDS30 EAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPE
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 ANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVG
..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :. .. : :: :.::: : :.
CCDS30 VSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVA
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 VVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGG
.. : ::::::::..:. :.::: :. .: :. .: : .:::.:::.::.. ::..::
CCDS30 TLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGG
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 HDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYY
.:: .::: :.: ..::..:: ::. : . . :..: ::.:::.::: .: :.: :
CCDS30 NDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKY
540 550 560 570 580 590
570 580 590
pF1KE6 NPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
:: :.:: :..::: : :: .::.:..
CCDS30 NPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
600 610 620 630 640
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 1836 init1: 997 opt: 1600 Z-score: 1904.3 bits: 362.4 E(32554): 9.5e-100
Smith-Waterman score: 1600; 45.7% identity (73.5% similar) in 558 aa overlap (34-589:46-599)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 PPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAE
.. : .....:.: ::.. ::::..:.
CCDS13 ETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVG
20 30 40 50 60 70
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pF1KE6 DMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTE
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