Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6480, 510 aa
1>>>pF1KE6480 510 - 510 aa - 510 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2428+/-0.000999; mu= 12.9728+/- 0.059
mean_var=75.5797+/-16.015, 0's: 0 Z-trim(105.0): 31 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.147527
statistics sampled from 8185 (8212) to 8185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 ( 510) 3454 744.9 4.9e-215
CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 487) 698 158.3 1.8e-38
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 ( 509) 584 134.1 3.7e-31
CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 ( 516) 554 127.7 3.2e-29
CCDS55622.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 425) 548 126.4 6.4e-29
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 ( 471) 504 117.0 4.6e-26
CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 ( 465) 491 114.3 3.1e-25
CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 ( 504) 472 110.2 5.5e-24
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 ( 505) 468 109.4 1e-23
CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 ( 426) 466 108.9 1.1e-23
CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 ( 478) 462 108.1 2.3e-23
CCDS55623.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 439) 451 105.7 1.1e-22
CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 ( 500) 424 100.0 6.5e-21
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs108|chr6 ( 515) 423 99.8 7.8e-21
CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 ( 523) 419 98.9 1.4e-20
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 319) 380 90.6 2.8e-18
CCDS55621.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 382) 348 83.8 3.8e-16
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs108|chrX ( 539) 336 81.3 3e-15
>>CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 (510 aa)
initn: 3454 init1: 3454 opt: 3454 Z-score: 3974.1 bits: 744.9 E(32554): 4.9e-215
Smith-Waterman score: 3454; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
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CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVICALIGFSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVICALIGFSSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 YFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYICGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 YFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYICGLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE6 YMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 YMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
490 500 510
>>CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 (487 aa)
initn: 564 init1: 339 opt: 698 Z-score: 804.3 bits: 158.3 E(32554): 1.8e-38
Smith-Waterman score: 698; 29.6% identity (62.1% similar) in 494 aa overlap (17-492:3-477)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPN-IDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNV
: . ..:. . .::::.::.:. :.:....:: ..... :
CCDS82 MLKREGKVQPYTKTLDGGWGWMIVIHFFLVNVFVMGMTKTFAIFFV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 EWLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAY
. :::. . .:..:. .. . .::..... . : . :.:.:..: . :...:..
CCDS82 VFQEEFEGTSEQIGWIGSIMSSLRFCAGPLVAIICDILGEKTTSILGAFVVTGGYLISSW
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLL
:... .: .:.:. ::::.. : :.:.. .::.:: ::. ... .: :. :::.. .
CCDS82 ATSIPFLCVTMGLLPGLGSAFLYQVAAVVTTKYFKKRLALSTAIARSGMGL-TFLLAPFT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KYLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRG--LPAHSTESV
:.: : : .:... ::..::: . :.::. :. :. : :: .: : ::. :.
CCDS82 KFLIDLYDWTGALILFGAIALNLVPSSMLLRPIHI-KSENNSGIKD-KGSSLSAHGPEAH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE6 KSTGQQGRTEE---KDG-----GLGNEE-TLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSW
. . .::: ::. :: ... :. . :..: . : .: :.: .
CCDS82 ATETHCHETEESTIKDSTTQKAGLPSKNLTVSQNQSEEFYN--GPNRN----RLLLKSDE
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 LTMRVRKGFEDWYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSE
. .: .: . ::: : .: : . :.. .. :: .:: .. .. .
CCDS82 ESDKVI----SWSCKQLFDISLFRNPFFYIFTWSFLLSQLAYFIPTFHLVARAKTLGI-D
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 QNDVFPLTSIIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNV----FLLANFTLVLSIFI--LPLM
:. :.:. .:.. ...: : .:: :. .. ..: ..: .:. . .::.
CCDS82 IMDASYLVSVAGILETVSQIISGWVADQNWIKKYHYHKSYLILCGITNLLAPLATTFPLL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 HTYAGLAVICALIGFSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGW
:: .:: : :..::..:. : :: . :. :...: :::.:::
CCDS82 MTY----TICFAI-FAGGYLALILPVLVDLCRNSTVNRFLGLASFFAGMAVLSGPPIAGW
400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KE6 IYDITQKYDFSFYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
.:: :: :. :::. :. :... . ... :
CCDS82 LYDYTQTYNGSFYFSGICYLLSSVSFFFVPLAERWKNSLT
450 460 470 480
>>CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 (509 aa)
initn: 918 init1: 566 opt: 584 Z-score: 672.8 bits: 134.1 E(32554): 3.7e-31
Smith-Waterman score: 975; 35.1% identity (69.4% similar) in 484 aa overlap (22-490:3-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
:: : ::::.:..:. ::....: .:: .:.::: .:
CCDS72 MELKKSP--DGGWGWVIVFVSFLTQFLCYGSPLAVGVLYIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
::. : ...: ::::.::. :. :...: .: ... : : ..:..:.. . : .::..:
CCDS72 WLDAFGEGKGKTAWVGSLASGVGLLASPVCSLCVSSFGARPVTIFSGFMVAGGLMLSSFA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
:...::...:...::: :. : .:... .::. ::.:: :: .::.. : :....: .
CCDS72 PNIYFLFFSYGIVVGLGCGLLYTATVTITCQYFDDRRGLALGLISTGSSVGLFIYAALQR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE6 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLS------PGK-NPND-PGEKDVRGLPAH
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CCDS72 MLVEFYGLDGCLLIVGALALNILACGSLMRPLQSSDCPLPKKIAPEDLPDKYSIYNEKGK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STE-SVKSTGQQGRTEEK-DGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLT
. : ... .. .::: :.: . : .. : . : :. . . : :. :
CCDS72 NLEENINILDKSYSSEEKCRITLANGDWKQDSLLHKNPT-VTHTKEPETYK--KKVAEQT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE6 MRVRK-GFEDW--YSGYFG-TASLFTNRMFVA-FIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYN
. .. . . : :..: : :..:: :..: : :: :: ..: : . . ... :
CCDS72 YFCKQLAKRKWQLYKNYCGETVALFKNKVFSALFIAILLFDIGGFP-PSLLMEDVARSSN
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LSEQNDVFPLTSIIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTY
..:.. ..:: :::.:. ::..::..::. :.. ... . . . :.. .:. ..:
CCDS72 VKEEEFIMPLISIIGIMTAVGKLLLGILADFKWINTLYLYVATLIIMGLALCAIPFAKSY
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 AGLAVICALIGFSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYD
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CCDS72 VTLALLSGILGFLTGNWSIFPYVTTKTVGIEKLAHAYGILMFFAGLGNSLGPPIVGWFYD
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE6 ITQKYDFSFYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
:: ::..::. :. ..: ..::.
CCDS72 WTQTYDIAFYFSGFCVLLGGFILLLAALPSWDTCNKQLPKPAPTTFLYKVASNV
460 470 480 490 500
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 (516 aa)
initn: 681 init1: 547 opt: 554 Z-score: 638.2 bits: 127.7 E(32554): 3.2e-29
Smith-Waterman score: 738; 28.7% identity (62.0% similar) in 481 aa overlap (29-505:44-474)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLN
::::.::.: . :.: : . ....
CCDS74 IITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFF
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VEWLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSA
::. : :. . :::. :. .:.. .:. .. : .:. ..:::. : : .::.
CCDS74 VEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YAANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVL
.:.....:..:.:: .::: .. : ::..:::.::..:.::: :.. .:.:.:::... .
CCDS74 FATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPV
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LKYLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVK
.. : ...::.:.:: :. ::::::::::::.. .. . : .. :
CCDS74 VQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHV------------
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STGQQGRTEEKD-GGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGF
::...: .. .: :: : .: . . :.: :
CCDS74 -----CRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTC---------LCCC-LQQEYSFLLMS-----
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EDWYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTS
:. . : .. .:.:. ::.: ..:. . ..:.:. .: : :
CCDS74 -DF-------VVLAVSVLFMAYGCSPLFVY---LVPY------ALSVGVSHQQAAF-LMS
290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 IIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNV--FLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVI-CAL
:.... :.:.. .: ..: :.. .. .:.: : . ::.... :. . :..
CCDS74 ILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTF
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 IGFSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSF
:...: .:.:::: ..:: :..: :.. ... :..::.:: . : : .: .:
CCDS74 GYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KE6 YICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
.::. .... ..: . :. ..... ...
CCDS74 LLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQKHG
450 460 470 480 490 500
CCDS74 EPVATAVPGYSLT
510
>>CCDS55622.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 355 init1: 161 opt: 548 Z-score: 632.7 bits: 126.4 E(32554): 6.4e-29
Smith-Waterman score: 554; 30.0% identity (61.0% similar) in 423 aa overlap (87-492:12-415)
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LNVEWLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVL
::..... . : . :.:.:..: . :...
CCDS55 MGMDDCDSFFPGPLVAIICDILGEKTTSILGAFVVTGGYLI
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SAYAANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMT
:..:... .: .:.:. ::::.. : :.:.. .::.:: ::. ... .: :. :::..
CCDS55 SSWATSIPFLCVTMGLLPGLGSAFLYQVAAVVTTKYFKKRLALSTAIARSGMGL-TFLLA
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VLLKYLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRG--LPAHST
. :.: : : .:... ::..::: . :.::. :. :. : :: .: : ::.
CCDS55 PFTKFLIDLYDWTGALILFGAIALNLVPSSMLLRPIHI-KSENNSGIKD-KGSSLSAHGP
110 120 130 140 150
240 250 260 270 280
pF1KE6 ESVKSTGQQGRTEE---KDG-----GLGNEE-TLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKT
:. . . .::: ::. :: ... :. . :..: . : .: :.:
CCDS55 EAHATETHCHETEESTIKDSTTQKAGLPSKNLTVSQNQSEEFYN--GPNRN----RLLLK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 VSWLTMRVRKGFEDWYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYN
. . .: . : . ::: : .: : . :.. .. :: .:: .. .
CCDS55 SDEESDKVIS----WSCKQLFDISLFRNPFFYIFTWSFLLSQLAYFIPTFHLVARAKTLG
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390
pF1KE6 LSEQNDVFPLTSIIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNV----FLLANFTLVLSIFI--L
. . :. :.:. .:.. ...: : .:: :. .. ..: ..: .:. . .
CCDS55 I-DIMDASYLVSVAGILETVSQIISGWVADQNWIKKYHYHKSYLILCGITNLLAPLATTF
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 PLMHTYAGLAVICALIGFSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPF
::. ::. :: : :..::..:. : :: . :. :...: :::.
CCDS55 PLLMTYT----ICFAI-FAGGYLALILPVLVDLCRNSTVNRFLGLASFFAGMAVLSGPPI
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 AGWIYDITQKYDFSFYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
:::.:: :: :. :::. :. :... . ... :
CCDS55 AGWLYDYTQTYNGSFYFSGICYLLSSVSFFFVPLAERWKNSLT
390 400 410 420
>>CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 (471 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPN--IDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALG
:. :.. . : . .. :.: ::::.:... ..: .. : .: .::
CCDS11 MPAPQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGPPDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGLLRSLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VLNVEWLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTC-GCRQTAIIGGLVNSLGW
. . :.: .: :::.:.:.... ..: .: ..: : : ....::.. :::.
CCDS11 LAFPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASP-VGSALSTRWGARPVVMVGGVLASLGF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VLSAYAANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFL
:.::.:... .:.. .:. ::.: .... ::. ..:::..::.:: ::. ::.: ...:
CCDS11 VFSAFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGASSLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 MTVLLKYLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLS-PGKNPNDPGEKDVRGLPAHS
.. :. : .:::.:.:. ::..:.: ::::. :: :: : :
CCDS11 LAPALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPLVLPGDPPAPP------------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TESVKSTGQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRV
:. . :: .
CCDS11 ----------------------------------------RSPLAALGL-----------
230
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RKGFEDWYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHL-PEIVNLYNLSEQNDV
:::: : : : . . .. ... .:..:: :. .. .:. . .
CCDS11 ---------------SLFTRRAFSIFALGTALVGGGYFVPYVHLAPHALD-RGLGGYGAA
240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KE6 FPLTSIIAIVHIFGKVILGVIAD---LPCISVWNVF-LLANFTLVLSIFILPLM---HTY
. .... :. .... : .:: .: . :: :... : . . ..:.. ...
CCDS11 L-VVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVPLPRLLAVFGALTGLGLWV-VGLVPVVGGEESW
290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 AGLAVICALI-GFSSG-YFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWI
.: . :. :.:.: : :. : :::. ...: :... ....:::::..:..
CCDS11 GGPLLAAAVAYGLSAGSYAPLVFGVLPGLVGVGGVVQATGLVMMLMSLGGLLGPPLSGFL
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510
pF1KE6 YDITQKYDFSFYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
: : . :: . : : . : .. . :
CCDS11 RDETGDFTASFLLSGSLILSGSFIYIGLPRALPSCGPASPPATPPPETGELLPAPQAVLL
400 410 420 430 440 450
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
: ..:: :. : ::::.: .... : . . .. :..:. :
CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKA--P----DGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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..:: . . :::.::. ... .::. .. .: ::: . ..::: ::: : ...
CCDS11 LIQEFGIGYSDTAWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
.. ...: :: .::: .. . :...:..:::.::: .:.::...:. .. : .
CCDS11 RSIIQVYLTTGVITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE6 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPL----SPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTES
: .::::...:: :.. :: :::.:::::: .::..: :...
CCDS11 LLQDRYGWRGGFLILGGLLLNCCVCAALMRPLVVTAQPGSGPPRPSRR------------
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 VKSTGQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKG
: ::
CCDS11 ----------------------LLDL----------------------------------
220
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FEDWYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLT
:.: .: :: . : .. .: . . .. .. . . .: :
CCDS11 ------------SVFRDRGFVLYAVAASVMVLGLFVPPVFVVSYAKDLGVPDTKAAF-LL
230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 SIIAIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLV---LSIFILPLMHTYAGLAVICA
.:.... ::.. : .: : . ..:.:.. :.. :. . :.::.:.:
CCDS11 TILGFIDIFARPAAGFVAGLGKVRPYSVYLFS-FSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVVFCI
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LIGFSSGYFSLMPV-VTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDF
..:.: :. . . : .:: .....: :... .....:.::: .: . : :. : .
CCDS11 FFGISYGMVGALQFEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHVYMY
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510
pF1KE6 SFYICGLLYMIGILFLLIQP--CIRIIEQSRRKYMDGAHV
: . : . . :.::. :::
CCDS11 VFILAGAEVLTSSLILLLGNFFCIRKKPKEPQPEVAAAEEEKLHKPPADSGVDLREVEHF
390 400 410 420 430 440
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
::::.:... . : : . .: :..:.
CCDS13 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
...: . . ::::::. ... .:: ..... ::: . . :::. : : .:...:
CCDS13 LMRDFDAGYSDTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
. . :..: :: .::: .. . :...:.: ::..:: ::.::...:. .. : .
CCDS13 TRLLELYLTAGVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
: ..:::...:. :.. :. :.:::.::: :: :: . : ... . ..
CCDS13 QLLERFGWRGGFLLLGGLLLHCCACGAVMRP-PPG-----PGPR-----PRRDSAGDRAG
170 180 190 200 210
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pF1KE6 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
:..: .: :: .: :. : .: :. . :
CCDS13 DAPGEAEADGAG---------LQLRE----ASPR----------------VRPRRRLLDL
220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
.. :.: :... .. .. .: : : . .. .. . . .: : ::..
CCDS13 --------AVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAF-LLSIVG
250 260 270 280 290
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pF1KE6 IVHIFGKVILGVIADLPCIS--VWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVICALIGFS
.: : .. :..: : . : .: :: .. :. . ..:..:...:. .:.:
CCDS13 FVDIVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLS
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 SGYFSLMPV-VTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYIC
:. . . : :: .. .: :... ... ..:.::: :: . :. ..:.. ::.
CCDS13 YGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLA
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510
pF1KE6 GLLYMIGILFLLIQP--CIRIIEQSRRKYMDGAHV
: .. .:. . :.:
CCDS13 GSEVALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNL
420 430 440 450 460 470
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
::.:::...:... .. : .: .:.. .:
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
::. : . :.: :. .. ..::. ..... ::: :...::.. ::: : :...
CCDS11 LQWEFQASNSETSWFPSILTAVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFS
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
:. :..: : .::: ... .....: :: .::.::..:.. :...: : .: .
CCDS11 HNLSQLYFTAGFITGLGMCFSFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGITLWPLLSR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
:: . :::...:. :.. :. :.:::..::.. . : ... : :.
CCDS11 YLLENLGWRGTFLVFGGIFLHCCICGAIIRPVATSVAP------ETKECPPPPPET----
170 180 190 200 210
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.:: : : : :. : . ... .: :.
CCDS11 ----------PALG-----C-LAA-------------CGRTIQRHLAFDILRHNTGYC--
220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
... ..:.... : .: . : . ....::. .. : :::.
CCDS11 --------------VYILGVMWSVLG---FPLPQVFLVPYAMWHSVDEQQAAL-LISIIG
240 250 260 270 280
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pF1KE6 IVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLV--LSIFILPLMHTYAGLAVICALIGFS
. .:: . . :..: : .. .:.. :. :. .. . :. : . :
CCDS11 FSNIFLRPLAGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVGYCLAYSVS
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 -SGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYIC
:: .:. : :.: .... : :.. .:.. :..::.:: . : :..... ::.
CCDS11 MSGIGALIFQVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDATNNFSYVFYMS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 GLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
... . . ::.
CCDS11 SFFLISAALFMGGSFYALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPGKQRSPEIMCQSSRQ
410 420 430 440 450 460
>>CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 (426 aa)
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::::.:..:::.:: :..: ..::. ::
CCDS11 MARRTEPPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVE
10 20 30 40
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.. :... . ..:..:..... . .: .: ..: : : ... ::.. .:: .:...
CCDS11 FVAAFEEQAARVSWIASIGIAVQQFGSP-VGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASF
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CCDS11 ATSLTHLYLSIGLLSGSGWALTFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFF
100 110 120 130 140 150
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pF1KE6 KYLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKS
..: ..:.::...:. .:.::.: .::::.:: : ...: : : . :.
CCDS11 QWLLSHYAWRGSLLLVSALSLHLVACGALLRPPSLAEDPAVGG-------PRAQLTSLLH
160 170 180 190 200 210
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pF1KE6 TGQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFED
: : . :: ...:
CCDS11 HG--------------------------P----FLRYTVALTLINT--------------
220
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 WYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFP---LT
::: ::..:: ...: .:. : .: :
CCDS11 ---GYF--------------------------IPYLHL--VAHLQDLDW--DPLPAAFLL
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:..:: . :.:. : ..: : ...: . .:. ..:. .. ..:... . :
CCDS11 SVVAISDLVGRVVSGWLGDAVPGPVTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVALAVAYG
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pF1KE6 FSSGYFSLMPV---VTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFS
:.:: .: :. : .:.: ... . :.. ..:..:::::..:.. :.: .: :
CCDS11 FTSG--ALAPLAFSVLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNYTAS
320 330 340 350 360 370
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pF1KE6 FYICGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
: . : . . : .:: :
CCDS11 FVVAGAFLLSGSGILLTLPHFFCFSTTTSGPQDLVTEALDTKVPLPKEGLEED
380 390 400 410 420
510 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:42:34 2016 done: Tue Nov 8 13:42:34 2016
Total Scan time: 3.010 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]