Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6476, 479 aa
1>>>pF1KE6476 479 - 479 aa - 479 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1021+/-0.000431; mu= 19.9228+/- 0.027
mean_var=79.5391+/-15.767, 0's: 0 Z-trim(112.3): 41 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.143808
statistics sampled from 21111 (21152) to 21111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 8.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh t ( 479) 3235 681.2 1.8e-195
NP_001307970 (OMIM: 605381) ammonium transporter R ( 479) 3235 681.2 1.8e-195
NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh t ( 458) 1728 368.5 2.2e-101
XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 428) 1643 350.8 4.3e-96
XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 414) 1635 349.1 1.3e-95
NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 428) 1549 331.3 3.2e-90
NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 389) 1501 321.3 3e-87
NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium tr ( 409) 1357 291.5 3e-78
XP_016857348 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 291) 1032 223.9 4.7e-58
XP_011508101 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 400) 1032 224.0 5.9e-58
XP_011508102 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 296) 767 168.9 1.7e-41
XP_011513090 (OMIM: 180297,185000,268150) PREDICTE ( 217) 736 162.4 1.2e-39
NP_001269798 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 396) 618 138.1 4.2e-32
NP_057208 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) polypep ( 417) 617 137.9 5.1e-32
XP_016857504 (OMIM: 111680) PREDICTED: blood group ( 425) 617 137.9 5.2e-32
NP_001269801 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 431) 617 138.0 5.2e-32
NP_001269799 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 463) 617 138.0 5.5e-32
NP_001269800 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 493) 617 138.0 5.8e-32
NP_001121163 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 321) 611 136.6 1e-31
NP_001269797 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 378) 609 136.2 1.5e-31
NP_001317359 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh( ( 372) 587 131.7 3.5e-30
XP_005246014 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 396) 587 131.7 3.7e-30
NP_065231 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 417) 587 131.7 3.8e-30
XP_006710873 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 425) 587 131.7 3.9e-30
XP_011540191 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 374) 584 131.1 5.4e-30
XP_011540190 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 377) 584 131.1 5.4e-30
NP_619524 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 354) 572 128.5 2.9e-29
XP_016857503 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 378) 572 128.6 3.1e-29
XP_011540193 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 361) 565 127.1 8.1e-29
NP_001269796 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 251) 387 90.0 8.1e-18
NP_619522 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 266) 252 62.0 2.3e-09
NP_619523 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 267) 247 61.0 4.7e-09
>>NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh type (479 aa)
initn: 3235 init1: 3235 opt: 3235 Z-score: 3630.5 bits: 681.2 E(85289): 1.8e-195
Smith-Waterman score: 3235; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
430 440 450 460 470
>>NP_001307970 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh ty (479 aa)
initn: 3235 init1: 3235 opt: 3235 Z-score: 3630.5 bits: 681.2 E(85289): 1.8e-195
Smith-Waterman score: 3235; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
430 440 450 460 470
>>NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh type (458 aa)
initn: 1580 init1: 1445 opt: 1728 Z-score: 1941.0 bits: 368.5 E(85289): 2.2e-101
Smith-Waterman score: 1728; 57.4% identity (85.6% similar) in 432 aa overlap (8-439:12-438)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEF
: .::: ::.:: ..::.:::::. ..:: : . .:.: .:::
NP_065 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN---ADNEF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDR
:.:::::::::.::::::::::.::::::::.:::.::::::..::. :.::..: ..
NP_065 YFRYPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVK
.: ::::..::::::...: ..:::::::..: :::.:....:.::..:::.::.:: :.
NP_065 HIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFN
:::::::::::::::::...:.::: .::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::
NP_065 DAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTA
.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:. . . :.:::::::::.:::::.:::.
NP_065 AALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGA
.:::: :.::: ::. : .::::. ..::.:::....:::::..::::.::..:...:.
NP_065 SEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLIL
..:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:. :..::.::: .: .:: . ::.:
NP_065 LVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVP
.::: .: : . .:: :.:..:
NP_065 KLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA
420 430 440 450
>>XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (428 aa)
initn: 1495 init1: 1445 opt: 1643 Z-score: 1846.1 bits: 350.8 E(85289): 4.3e-96
Smith-Waterman score: 1643; 58.2% identity (86.1% similar) in 411 aa overlap (8-418:12-417)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEF
: .::: ::.:: ..::.:::::. ..:: : . .:.: .:::
XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN---ADNEF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDR
:.:::::::::.::::::::::.::::::::.:::.::::::..::. :.::..: ..
XP_016 YFRYPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVK
.: ::::..::::::...: ..:::::::..: :::.:....:.::..:::.::.:: :.
XP_016 HIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFN
:::::::::::::::::...:.::: .::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::
XP_016 DAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTA
.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:. . . :.:::::::::.:::::.:::.
XP_016 AALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGA
.:::: :.::: ::. : .::::. ..::.:::....:::::..::::.::..:...:.
XP_016 SEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLIL
..:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:. :..::.::: .: .:: . :.::
XP_016 LVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGIIL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVP
:
XP_016 ALQGCCDYSGKQD
420
>>XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (414 aa)
initn: 1487 init1: 1445 opt: 1635 Z-score: 1837.3 bits: 349.1 E(85289): 1.3e-95
Smith-Waterman score: 1635; 58.1% identity (86.3% similar) in 408 aa overlap (8-415:12-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEF
: .::: ::.:: ..::.:::::. ..:: : . .:.: .:::
XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN---ADNEF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDR
:.:::::::::.::::::::::.::::::::.:::.::::::..::. :.::..: ..
XP_016 YFRYPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVK
.: ::::..::::::...: ..:::::::..: :::.:....:.::..:::.::.:: :.
XP_016 HIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFN
:::::::::::::::::...:.::: .::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::
XP_016 DAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTA
.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:. . . :.:::::::::.:::::.:::.
XP_016 AALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGA
.:::: :.::: ::. : .::::. ..::.:::....:::::..::::.::..:...:.
XP_016 SEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLIL
..:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:. :..::.::: .: .:: . ::.
XP_016 LVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVP
>>NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (428 aa)
initn: 1515 init1: 1380 opt: 1549 Z-score: 1740.7 bits: 331.3 E(85289): 3.2e-90
Smith-Waterman score: 1549; 58.3% identity (87.3% similar) in 379 aa overlap (61-439:32-408)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 RYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVG
:.:::::.::::::::::.::::::::.::
NP_001 NFTFATQKSLTLLPRLECNGAISAHCNLHLPGFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVG
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 FNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQ
:.::::::..::. :.::..: .. .: ::::..::::::...: ..:::::::..: :
NP_001 FTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQ
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKER
::.:....:.::..:::.::.:: :.:::::::::::::::::...:.::: .::.::.:
NP_001 LLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHR
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 QNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSA
:.:::.:::::::::.:::..:::::.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:.
NP_001 QGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSAL
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 LHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLES
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NP_001 VGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILES
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 RLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQ
....:::::..::::.::..:...:...:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:
NP_001 KFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQ
310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 GKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPED
. :..::.::: .: .:: . ::.:.::: .: : . .:: :.:..:
NP_001 AMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPL
360 370 380 390 400 410
460 470
pF1KE6 PTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
NP_001 RVEEADTQA
420
>>NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (389 aa)
initn: 1467 init1: 1332 opt: 1501 Z-score: 1687.4 bits: 321.3 E(85289): 3e-87
Smith-Waterman score: 1501; 58.0% identity (87.1% similar) in 371 aa overlap (69-439:1-369)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 HWWSERTHKNLSDMENEFYYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAF
::::::::::.::::::::.:::.::::::
NP_001 MVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAF
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GIQWALLMQGWFHFLQDRYIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQ
..::. :.::..: .. .: ::::..::::::...: ..:::::::..: :::.:....
NP_001 ALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLE
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VTLFAVNEFILLNLLKVKDAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSD
:.::..:::.::.:: :.:::::::::::::::::...:.::: .::.::.::.:::.::
NP_001 VVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSD
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LFAMIGTLFLWMYWPSFNSAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLD
:::::::.:::..:::::.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:. . . :.::
NP_001 LFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 MVHIQNATLAGGVAVGTAAEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTC
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NP_001 MVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTC
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 GINNLHGIPGIIGGIVGAVTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGL
:..::::.::..:...:...:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:. :..::
NP_001 GVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQAMHQLFGL
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 LVTLAMALMGGIIVGLILRLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGP
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NP_001 FVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQ
330 340 350 360 370 380
460 470
pF1KE6 SVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
NP_001 A
>>NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium transp (409 aa)
initn: 1497 init1: 994 opt: 1357 Z-score: 1525.7 bits: 291.5 E(85289): 3e-78
Smith-Waterman score: 1507; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (7-440:1-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
.:. .:: ..:.. :..:::.::.: :.: . . . .:: . :. :
NP_000 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
: :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . .
NP_000 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQS-QGQKFNI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
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NP_000 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
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NP_000 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
::.: :: .::: ::::::::. :.:: ....:::.::::::::::::::::: :.:
NP_000 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
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NP_000 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
.. . :. .: .: ... :..::...::::.::.
NP_000 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL
360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KE6 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
::::::.::..:.:::..:.
NP_000 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
390 400
>>XP_016857348 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (291 aa)
initn: 998 init1: 863 opt: 1032 Z-score: 1163.2 bits: 223.9 E(85289): 4.7e-58
Smith-Waterman score: 1032; 55.6% identity (85.0% similar) in 266 aa overlap (174-439:8-271)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 GKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRN
.:.:::::::::::::::::...:.::: .
XP_016 MNFTFATQVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQ
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLT
::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::.:.. : .:::.:.::: :::: .:
XP_016 LEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLG
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 SVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVY
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XP_016 TFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKF
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 LTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNG
.::.:::....:::::..::::.::..:...:...:. :. :.:: .:: : . . .:
XP_016 FTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EG
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 DWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNS
. .: .:. :..::.::: .: .:: . ::.:.::: .: : . .:: :.:..:
XP_016 QRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHE
220 230 240 250 260 270
450 460 470
pF1KE6 TVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
XP_016 DKAQRPLRVEEADTQA
280 290
>>XP_011508101 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (400 aa)
initn: 998 init1: 863 opt: 1032 Z-score: 1161.4 bits: 224.0 E(85289): 5.9e-58
Smith-Waterman score: 1032; 55.6% identity (85.0% similar) in 266 aa overlap (174-439:117-380)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 GKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRN
.:.:::::::::::::::::...:.::: .
XP_011 SLSATTTKPTLPSGTGATTVTRTMNFTFATQVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQ
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLT
::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::.:.. : .:::.:.::: :::: .:
XP_011 LEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLG
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 SVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVY
. :.:. . . :.:::::::::.:::::.:::..:::: :.::: ::. : .::::. .
XP_011 TFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKF
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 LTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNG
.::.:::....:::::..::::.::..:...:...:. :. :.:: .:: : . . .:
XP_011 FTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EG
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 DWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNS
. .: .:. :..::.::: .: .:: . ::.:.::: .: : . .:: :.:..:
XP_011 QRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHE
330 340 350 360 370 380
450 460 470
pF1KE6 TVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
XP_011 DKAQRPLRVEEADTQA
390 400
479 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:40:20 2016 done: Tue Nov 8 13:40:21 2016
Total Scan time: 8.290 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]