Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6474
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6474, 470 aa
1>>>pF1KE6474 470 - 470 aa - 470 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4332+/-0.00128; mu= 17.1568+/- 0.076
mean_var=70.5416+/-14.808, 0's: 0 Z-trim(101.1): 39 B-trim: 484 in 1/46
Lambda= 0.152704
statistics sampled from 6347 (6372) to 6347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34917.1 SLC7A13 gene_id:157724|Hs108|chr8 ( 470) 3049 681.5 5e-196
CCDS32470.1 SLC7A6 gene_id:9057|Hs108|chr16 ( 515) 877 203.0 6e-52
CCDS12425.1 SLC7A9 gene_id:11136|Hs108|chr19 ( 487) 863 199.9 4.9e-51
CCDS12431.1 SLC7A10 gene_id:56301|Hs108|chr19 ( 523) 835 193.8 3.7e-49
CCDS9574.1 SLC7A7 gene_id:9056|Hs108|chr14 ( 511) 832 193.1 5.8e-49
CCDS9590.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 535) 808 187.8 2.3e-47
CCDS3742.1 SLC7A11 gene_id:23657|Hs108|chr4 ( 501) 780 181.6 1.6e-45
CCDS10964.1 SLC7A5 gene_id:8140|Hs108|chr16 ( 507) 772 179.9 5.5e-45
CCDS58305.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 430) 529 126.3 6.2e-29
CCDS41924.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 332) 495 118.8 9e-27
CCDS58304.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 311) 404 98.7 9.3e-21
>>CCDS34917.1 SLC7A13 gene_id:157724|Hs108|chr8 (470 aa)
initn: 3049 init1: 3049 opt: 3049 Z-score: 3632.7 bits: 681.5 E(32554): 5e-196
Smith-Waterman score: 3049; 99.8% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVSPKGVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILA
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CCDS34 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVSPKGVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAFLNLWTSLFLGSGVVAGQALLLAEYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAFLNLWTSLFLGSGVVAGQALLLAEYSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRGVKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRGVKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQAIFQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPK
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CCDS34 FLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQAIFQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREILSSDAVAITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLF
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CCDS34 CIFTALPLVTVVYLLVNISYLTVLTPREILSSDAVAITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLNSHSSPFTAVLLLVTLGSLAIILTSLIDLI
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CCDS34 SNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLNSHSSPFTAVLLLVTLGSLAIILTSLIDLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 NYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNLSIPYKVFLSFPLATIVIDVGLVVIPLVKSPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNLSIPYKVFLSFPLATIVIDVGLVVIPLVKSPNV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 HYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHFKIRLAWFEKMTCYLQLLFNICLPDVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHFKIRLAWFEKMTCYLQLLFNICLPDVSEE
430 440 450 460 470
>>CCDS32470.1 SLC7A6 gene_id:9057|Hs108|chr16 (515 aa)
initn: 505 init1: 390 opt: 877 Z-score: 1046.1 bits: 203.0 E(32554): 6e-52
Smith-Waterman score: 877; 35.2% identity (71.2% similar) in 437 aa overlap (5-436:37-465)
10 20 30
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVS
: .:::. .. :.:... :.::.:::::
CCDS32 GRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMIGSGIFVS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PKGVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAF
:::::... . :.:: ::: ........:: ::.. .. :::.: .. . ::. .::
CCDS32 PKGVLVHTA-SYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAFGGFIAF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 LNLWTSLFL----GSGVVAGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTS
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CCDS32 IRLWVSLLVVEPTGQAIIA---ITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTFVNC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RGVKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQA
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CCDS32 AYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEH---FQDAFEGSSWDMGNLSLA
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 IFQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREIL
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CCDS32 LYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SSDAVAITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLFSNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTL
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CCDS32 SSDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE6 NSHS-SPFTAVLLLVTLGSLAIILTSLIDLINYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNLS
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CCDS32 HIERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPKRP
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 IPYKVFLSFPLATIVIDVGLVVIPLVKSPNVHYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHFKIRLAWF
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CCDS32 RPLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLF-TDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPL
420 430 440 450 460 470
450 460 470
pF1KE6 EKMTCYLQLLFNICLPDVSEE
CCDS32 FIRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
480 490 500 510
>>CCDS12425.1 SLC7A9 gene_id:11136|Hs108|chr19 (487 aa)
initn: 649 init1: 274 opt: 863 Z-score: 1029.8 bits: 199.9 E(32554): 4.9e-51
Smith-Waterman score: 863; 32.1% identity (69.4% similar) in 468 aa overlap (9-470:26-487)
10 20 30 40
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVSPKGVLAYSC
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CCDS12 MGDTGLRKRREDEKSIQSQEPKTTSLQKELGLISGISIIVGTIIGSGIFVSPKSVLS-NT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 MNVGVSLCVWAGCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAFLNLWTSLFL
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CCDS12 EAVGPCLIIWAACGVLATLGALCFAELGTMITKSGGEYPYLMEAYGPIPAYLFSWASLIV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 GSGV-VAGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRGVKEVTWLQIA
. . : : ..:: ::. .:. :.. :::: : . ... ..: .:. ...:
CCDS12 IKPTSFAIICLSFSEYVCAPFYVGCKPPQIVVKCLAAAAILFISTVNSLSVRLGSYVQNI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQAIFQGYFAYSGGA
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CCDS12 FTAAKLVIVAIIIISGLVLLAQG---NTKNFDNSFEGAQLSVGAISLAFYNGLWAYDGWN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 CFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREILSSDAVAITWADR
.. :. ::..: ..: :. ..::.:. :.:.:.::.::.: :.:.:.:::.:..::
CCDS12 QLNYITEELRNPYRNLPLAIIIGIPLVTACYILMNVSYFTVMTATELLQSQAVAVTFGDR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 AFPSLAWIMPFAISTSLFSNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLNSHS-SPFTAVL
.. .::.:. .. : .. . : ..: ::.:..::.. ... .. . .: :..
CCDS12 VLYPASWIVPLFVAFSTIGAANGTCFTAGRLIYVAGREGHMLKVLSYISVRRLTPAPAII
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LLVTLGSLAIILTSLIDLINYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNLSIPYKVFLSFPLA
. .... :: .. .:.::. :.. :. : ..:.. :. . .: : :: . .:.
CCDS12 FYGIIATIYIIPGDINSLVNYFSFAAWLFYGLTILGLIVMRFTRKELERPIKVPVVIPVL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE6 TIVIDVGLVVIPLVKSPNVHYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHFKIRLAWFEKM----TCYLQ
.:.: ::. :....:. .:.: .:..:::::::. ..:.: ..: .:. : .::
CCDS12 MTLISVFLVLAPIISKPTWEYLYCVLFILSGLLFYFLFVHYK--FGWAQKISKPITMHLQ
420 430 440 450 460 470
460 470
pF1KE6 LLFNICLPDVSEE
.:... :. . :
CCDS12 MLMEVVPPEEDPE
480
>>CCDS12431.1 SLC7A10 gene_id:56301|Hs108|chr19 (523 aa)
initn: 509 init1: 509 opt: 835 Z-score: 996.0 bits: 193.8 E(32554): 3.7e-49
Smith-Waterman score: 835; 33.5% identity (67.2% similar) in 460 aa overlap (5-458:32-479)
10 20 30
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVS
:.. ::. .: . .... ::::.:::.:
CCDS12 AGHTQQPSGRGNPRPAPSPSPVPGTVPGASERVALKKEIGLLSACTIIIGNIIGSGIFIS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PKGVLAYSCMNVGVSLCVWA-GCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVA
::::: .: .::..: ::. : .. :. : :: ::.....: ::..: .. . ::. ..
CCDS12 PKGVLEHSG-SVGLALFVWVLGGGVTALGS-LCYAELGVAIPKSGGDYAYVTEIFGGLAG
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 FLNLWTS-LFLGSGVVAGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRG
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CCDS12 FLLLWSAVLIMYPTSLAVISMTFSNYVLQPVFPNCIPPTTASRVLSMACLMLLTWVNSSS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDAEL-PDISHLIQAI
:. .: .: . :. ::.: .:.. ...:. :.. : .::: . :...:: :.
CCDS12 VRWATRIQDMFTGGKLLALSLIIGVGLLQIFQGHFEEL-RPSNAFAFWMTPSVGHLALAF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREILS
.:: ::.:: .. .. :. : ..:. :: ..::.: :: ..::.:.:...:.:.::
CCDS12 LQGSFAFSGWNFLNYVTEEMVDARKNLPRAIFISIPLVTFVYTFTNIAYFTAMSPQELLS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SDAVAITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLFSNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLN
:.:::.:.... . ..:.:: ... : :... .: :: . ...::.:: :. ..
CCDS12 SNAVAVTFGEKLLGYFSWVMPVSVALSTFGGINGYLFTYSRLCFSGAREGHLPSLLAMIH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE6 -SHSSPFTAVLLLVTLGSLAIILT--SLIDLINYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNL
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CCDS12 VRHCTPIPA--LLVCCGATAVIMLVGDTYTLINYVSFINYLCYGVTILGLLLLRWRRPAL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SIPYKVFLSFPLATIVIDVGLVVIPLVKSPNVHYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHFKIRLAW
: :: : .:.: .:. . :.:. ... : : : :.. .:.: .:. : . . :
CCDS12 HRPIKVNLLIPVAYLVFWAFLLVFSFISEPMVCGVGVII-ILTG----VPI--FFLGVFW
420 430 440 450 460
450 460 470
pF1KE6 FEKMTCYLQLLFNICLPDVSEE
: : .:
CCDS12 RSKPKCVHRLTESMTHWGQELCFVVYPQDAPEEEENGPCPPSLLPATDKPSKPQ
470 480 490 500 510 520
>>CCDS9574.1 SLC7A7 gene_id:9056|Hs108|chr14 (511 aa)
initn: 601 init1: 324 opt: 832 Z-score: 992.6 bits: 193.1 E(32554): 5.8e-49
Smith-Waterman score: 832; 33.5% identity (65.5% similar) in 475 aa overlap (5-469:29-493)
10 20 30
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVSPK
:...::. .. :. ... :.::.:::::::
CCDS95 MVDSTEYEVASQPEVETSPLGDGASPGPEQVKLKKEISLLNGVCLIVGNMIGSGIFVSPK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 GVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAFLN
::: :: . :.:: .:: ..... ..:: ::.. .. :::.: .. . ::. .::.
CCDS95 GVLIYSA-SFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYILEAFGGFLAFIR
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 LWTSLFLGSGVV-AGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRGVKE
:::::.. . : :. .:.: .::.:::: .: .. :: : . .. ... ::
CCDS95 LWTSLLIIEPTSQAIIAITFANYMVQPLFPSCFAPYAASRLLAAACICLLTFINCAYVKW
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQAIFQGY
: .: . :: : . ..:.: : .: . . :.:.:.. .. . :....
CCDS95 GTLVQDIFTYAKVLALIAVIVAGIVRLGQGASTH---FENSFEGSSFAVGDIALALYSAL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREILSSDAV
:.::: .. .. :.:.:. ..: : ..:..:..:.:.:..: ::: :.::.::::
CCDS95 FSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLSIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMRDILASDAV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 AITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLFSNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLNSHSS
:.:.::. : . ::.:.... : :..: :: .:: ....:.::.:: . . :
CCDS95 AVTFADQIFGIFNWIIPLSVALSCFGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAICMI--HVE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 PFTAVLLLVTLGSLAIILTSLID---LINYIFFTGSLWSILLMIGILRRRYQEPNLSIPY
:: : :. : .:.: . : :::: :. .. : ..: : :..::. :
CCDS95 RFTPVPSLLFNGIMALIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEPDRPRPL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 KVFLSFPLATIVIDVGLVVIPLVKSPNVHYVYVLLLVLSGLLFYIPLIHF--KIRLAWFE
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CCDS95 KLSVFFPIVFCLCTIFLVAVPLY-SDTINSLIGIAIALSGLPFYFLIIRVPEHKRPLYLR
420 430 440 450 460 470
460 470
pF1KE6 KM----TCYLQLLFNICLPDVSEE
.. : :::.: :. ..:
CCDS95 RIVGSATRYLQVL---CMSVAAEMDLEDGGEMPKQRDPKSN
480 490 500 510
>>CCDS9590.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 (535 aa)
initn: 490 init1: 490 opt: 808 Z-score: 963.7 bits: 187.8 E(32554): 2.3e-47
Smith-Waterman score: 808; 32.2% identity (67.8% similar) in 456 aa overlap (4-455:31-476)
10 20 30
pF1KE6 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFV
: . ::. .: . .... ::::.::::
CCDS95 MEEGARHRNNTEKKHPGGGESDASPEAGSGGGGVALKKEIGLVSACGIIVGNIIGSGIFV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 SPKGVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVA
:::::: . .::..: :: ........:: ::.....: ::..: ..: ::. ..
CCDS95 SPKGVLE-NAGSVGLALIVWIVTGFITVVGALCYAELGVTIPKSGGDYSYVKDIFGGLAG
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 FLNLWTS-LFLGSGVVAGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTSRG
:: :: . : . : :: ...: .::.::.: :. . :: : .. .. .
CCDS95 FLRLWIAVLVIYPTNQAVIALTFSNYVLQPLFPTCFPPESGLRLLAAICLLLLTWVNCSS
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160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDA-ELPDISHLIQAI
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CCDS95 VRWATRVQDIFTAGKLLALALIIIMGIVQICKGEYFWLEP-KNAFENFQEPDIGLVALAF
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLMTVVYLLVNISYLTVLTPREILS
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CCDS95 LQGSFAYGGWNFLNYVTEELVDPYKNLPRAIFISIPLVTFVYVFANVAYVTAMSPQELLA
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280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SDAVAITWADRAFPSLAWIMPFAISTSLFSNLLISIFKSSRPIYLASQEGQLPLLFNTLN
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340 350 360 370 380
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390 400 410 420 430 440
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: :. : ::. ... . :.:. : . : : . : ..:.: .: ..: . . :
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450 460 470
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.: :.
CCDS95 HKPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYPEVERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDVA
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. . ..: : : ::
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:.
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CCDS41 GVYWQHKPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYPEVERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTK
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]