Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6470, 504 aa
1>>>pF1KE6470 504 - 504 aa - 504 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4923+/-0.00113; mu= 16.6630+/- 0.067
mean_var=64.8407+/-13.442, 0's: 0 Z-trim(101.9): 35 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.159276
statistics sampled from 6682 (6711) to 6682 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 504) 3285 764.2 0
CCDS66202.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 369) 2399 560.6 1.1e-159
CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 476) 1593 375.4 7.6e-104
CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 ( 483) 1542 363.7 2.6e-100
CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 470) 1405 332.2 7.6e-91
CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 386) 1335 316.1 4.4e-86
CCDS47316.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 511) 1053 251.4 1.8e-66
CCDS78073.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 243) 765 185.0 7.9e-47
>>CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 (504 aa)
initn: 3285 init1: 3285 opt: 3285 Z-score: 4078.7 bits: 764.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3285; 99.4% identity (99.8% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEAAATPAAAGAARREELDMDVMRPLINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQLDDQEGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEAAATPAAAGAARREELDMDVMRPLINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQLDDQEGIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FVQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FVQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VHEGFLESKVFISNSTNSSNPCERRSVDIRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLAN
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VHEGFLESKVFISNSTNSSNPCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 VTYSIQFYVPAEIIIHGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVISFVG
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VTYSIQFYVPAEIIIPGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVISFVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AVSSSTLAIILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEIIYPTP
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVSSSTLALILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEIIYPTP
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 KVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
490 500
>>CCDS66202.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 (369 aa)
initn: 2399 init1: 2399 opt: 2399 Z-score: 2980.5 bits: 560.6 E(32554): 1.1e-159
Smith-Waterman score: 2399; 99.2% identity (99.7% similar) in 369 aa overlap (136-504:1-369)
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 CMHILVRCSHFLCLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLG
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 FCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSSNPCERRSVDIRIYMLCFLPFIILLVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS66 FCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSSNPCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVF
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 IRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFE
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDV
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 WLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIHGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAG
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIPGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAG
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 AILIPRLDIVISFVGAVSSSTLAIILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFL
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AILIPRLDIVISFVGAVSSSTLALILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFL
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500
pF1KE6 LGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
340 350 360
>>CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (476 aa)
initn: 1579 init1: 602 opt: 1593 Z-score: 1977.9 bits: 375.4 E(32554): 7.6e-104
Smith-Waterman score: 1599; 55.0% identity (80.2% similar) in 449 aa overlap (51-498:38-473)
30 40 50 60 70
pF1KE6 DVMRPLINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQ-LDDQEGISFVQTLMHLLKGNIGTGLLG
:: . .... .. :::.:::::::::::::
CCDS43 NEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGNIGTGLLG
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 LPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVS
::::.::::::.:::::..:::..:::: :::.:.: .: :..:: . :.::: ...: :
CCDS43 LPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTVMYGLESS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 PWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSS
: : :...: ::: ::::::..:::::: ::.::::.: ::: :. .. .: :.
CCDS43 PCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEA---ANGTTNNCHNNE
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 NPCERRSVDIRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMP
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CCDS43 TVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLVMIYQFIVQRIP
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 DPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLYV
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CCDS43 DPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVTILYI
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIHGIT
.:. :::. : .:.:::::::: . :::::::.:::.::: ::..:::::::::: ..
CCDS43 SLGCLGYLQFGANIQGSITLNLP-NCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYVPAEIIIPFFV
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 SKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVISFVGAVSSSTLAIILPPLVEILT
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CCDS43 SRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPPLLEVTT
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 FSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCL
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CCDS43 FYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPS--------NAPIF-INSTCA
430 440 450 460 470
500
pF1KE6 TSGLK
CCDS43 FI
>>CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 (483 aa)
initn: 1544 init1: 598 opt: 1542 Z-score: 1914.4 bits: 363.7 E(32554): 2.6e-100
Smith-Waterman score: 1546; 50.5% identity (77.4% similar) in 477 aa overlap (4-476:2-467)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEAAATPAAAGAARREELDMDVMRPLINEQ---NFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQLDDQE
..: .. : . .:.: : . . : :.: .: .: ..: .
CCDS43 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKK------TK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GISFVQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFL
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CCDS43 GITVFQALIHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAEN
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CCDS43 CKRLNKPFMDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VKQVHEGF-LESKVFISNSTNSSNPCERRSVDIRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLS
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CCDS43 LKQVVEAVNSTTNNCYSNETVILTP----TMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQ
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CCDS43 MLANISMLVSLVIIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MKESKRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYS
::....:: :..::.:::.::. .:.:::. : :.::.::.:::: . :::::::.::
CCDS43 MKNARHFPAILSLGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLP-NCWLYQSVKLLYI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FGIFVTYSIQFYVPAEIIIHGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVI
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CCDS43 AGILCTYALQFYVPAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 SFVGAVSSSTLAIILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEII
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CCDS43 SLVGSVSGTALALIIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELL
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KE6 YPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
CCDS43 KSEDSHPFSNSTTFVR
470 480
>>CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 (470 aa)
initn: 1434 init1: 509 opt: 1405 Z-score: 1744.5 bits: 332.2 E(32554): 7.6e-91
Smith-Waterman score: 1405; 49.5% identity (79.5% similar) in 438 aa overlap (56-486:39-465)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 LINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQLDDQEGISFVQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIK
. :.:..:::.:::: ::::::::::::::
CCDS43 NSELNSLDNGPQSPSESSSSITSENVHPAGEAGLSMMQTLIHLLKCNIGTGLLGLPLAIK
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 NAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQ
:::...::.::. ::...:::: ::. :.. : :..:. ..:.... ...:. : . :.
CCDS43 NAGLLVGPVSLLAIGVLTVHCMVILLNCAQHLSQRLQKTFVNYGEATMYGLETCPNTWLR
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 KQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSSNPCERR
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CCDS43 AHAVWGRYTVSFLLVITQLGFCSVYFMFMADNLQQMVE-----KAHVT-----SNICQPR
130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KE6 SV-------DIRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNM
. :::.::: .:::.::::::..:: : :.: :::.. :...:..:.....
CCDS43 EILTLTPILDIRFYMLIILPFLILLVFIQNLKVLSVFSTLANITTLGSMALIFEYIMEGI
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 PDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLY
: : :::..:.:: . ::::::.:.:::.:.::::.::::. ..: .: .::.:: ::
CCDS43 PYPSNLPLMANWKTFLLFFGTAIFTFEGVGMVLPLKNQMKHPQQFSFVLYLGMSIVIILY
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 VTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIHGI
. :.::::: : .. ..::::::: . :::::::..::.::: ::..::.:::::::
CCDS43 ILLGTLGYMKFGSDTQASITLNLP-NCWLYQSVKLMYSIGIFFTYALQFHVPAEIIIPFA
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 TSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVISFVGAVSSSTLAIILPPLVEIL
:. .: . ....:: :: .::..::::::::.:::.::.::::.::.:.: :.::.
CCDS43 ISQVSESWALFVDLSVRSALVCLTCVSAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPALLEIV
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 TFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTC
: .: .. . :.: :...:..: ..::: .. :. : . .:..
CCDS43 IFYSEDMSCVTIAKDIMISIVGLLGCIFGTYQALYELPQPISHSMANSTGVHA
420 430 440 450 460 470
500
pF1KE6 LTSGLK
>>CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (386 aa)
initn: 1339 init1: 602 opt: 1335 Z-score: 1658.9 bits: 316.1 E(32554): 4.4e-86
Smith-Waterman score: 1335; 57.2% identity (81.6% similar) in 353 aa overlap (51-402:38-386)
30 40 50 60 70
pF1KE6 DVMRPLINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQ-LDDQEGISFVQTLMHLLKGNIGTGLLG
:: . .... .. :::.:::::::::::::
CCDS83 NEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLSSPGSYQRFGQSNSTTWFQTLIHLLKGNIGTGLLG
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 LPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFLCLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVS
::::.::::::.:::::..:::..:::: :::.:.: .: :..:: . :.::: ...: :
CCDS83 LPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSFVDYGDTVMYGLESS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 PWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAENVKQVHEGFLESKVFISNSTNSS
: : :...: ::: ::::::..:::::: ::.::::.: ::: :. .. .: :.
CCDS83 PCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEA---ANGTTNNCHNNE
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 NPCERRSVDIRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLSFLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMP
. ..: :.::: ::::..::::::.:. : ..:.:::..: ::::.:::..:. .:
CCDS83 TVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLVMIYQFIVQRIP
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 DPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQMKESKRFPQALNIGMGIVTTLYV
:: .::.:: :: ::::::::.:.:::::.::::::.::. ..:: : .:: ::: ::.
CCDS83 DPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILYLGMVIVTILYI
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIHGIT
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380 390 400 410 420 430
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CCDS83 SRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLT
370 380
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170 180 190 200 210
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CCDS47 LVCLTCVSAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPALLEIVIFYSEDMSCVTIAKDIMIS
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..:..: ..::: .. :. : . .:..
CCDS47 IVGLLGCIFGTYQALYELPQPISHSMANSTGVHA
480 490 500 510
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]