Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6464
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6464, 541 aa
1>>>pF1KE6464 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1790+/-0.000891; mu= 11.4972+/- 0.053
mean_var=141.8261+/-28.569, 0's: 0 Z-trim(111.0): 37 B-trim: 650 in 1/52
Lambda= 0.107695
statistics sampled from 12041 (12075) to 12041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13402.1 SLC2A10 gene_id:81031|Hs108|chr20 ( 541) 3563 565.2 6.8e-161
CCDS5169.1 SLC2A12 gene_id:154091|Hs108|chr6 ( 617) 536 94.9 2.9e-19
CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 411) 416 76.2 8.6e-14
CCDS8736.2 SLC2A13 gene_id:114134|Hs108|chr12 ( 648) 402 74.1 5.5e-13
>>CCDS13402.1 SLC2A10 gene_id:81031|Hs108|chr20 (541 aa)
initn: 3563 init1: 3563 opt: 3563 Z-score: 3002.0 bits: 565.2 E(32554): 6.8e-161
Smith-Waterman score: 3563; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALL
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CCDS13 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYALAGTPWGWRHMFGWATAPAVLQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYALAGTPWGWRHMFGWATAPAVLQSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SLLFLPAGTDETATHKDLIPLQGGEAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLLFLPAGTDETATHKDLIPLQGGEAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFHGGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFHGGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMDSGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMDSGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSAPPRLALSSALPGPPLPARGHALLRWTALLCLMVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSAPPRLALSSALPGPPLPARGHALLRWTALLCLMVFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SAFSFGFGPVTWLVLSEIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAFSFGFGPVTWLVLSEIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 LYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAA
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 S
:
CCDS13 S
>>CCDS5169.1 SLC2A12 gene_id:154091|Hs108|chr6 (617 aa)
initn: 1197 init1: 536 opt: 536 Z-score: 459.4 bits: 94.9 E(32554): 2.9e-19
Smith-Waterman score: 1188; 41.1% identity (68.9% similar) in 528 aa overlap (10-514:42-566)
10 20 30
pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLD
: . .. ..:: ::::..:::::: ..
CCDS51 LLNQKGTAVETEGSGSRHPPWARGCGMFTFLSSVTAAVSGLLVGYELGIISGALLQIKTL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 FGLSCLEQEFLVGSLLLGALLASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSLA
..::: :::..:.::..:::::::.:: ::: :::. ::. :. .: :::.: :. : .
CCDS51 LALSCHEQEMVVSSLVIGALLASLTGGVLIDRYGRRTAIILSSCLLGLGSLVLILSLSYT
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 WLVLGRAVVGFAISLSSMACCIYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYALAG
:..:: ..: .:::::.: :.:..:.. ..::.:::: : :..::: .: :::.:.
CCDS51 VLIVGRIAIGVSISLSSIATCVYIAEIAPQHRRGLLVSLNELMIVIGILSAYISNYAFAN
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 TPWGWRHMFGWATAPAVLQSLSLLFLPAGT-------DETATHKDLIPLQG--GEAPKLG
. ::..::: . .:::.... ::: . .: :. : : :.. . .:
CCDS51 VFHGWKYMFGLVIPLGVLQAIAMYFLPPSPRFLVMKGQEGAASKVLGRLRALSDTTEELT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE6 PGRP------RYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVLFQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFH
. .::: ::::..:::: : .:: ::.: :.:::::.: ::::...::::.
CCDS51 VIKSSLKDEYQYSFWDLFRSKDNMRTRIMIGLTLVFFVQITGQPNILFYASTVLKSVGFQ
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 GGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALLLAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMD
.. .: :::.:.:.::: .:. : :::..: ...: : ..:: :. .:.:.. . :.
CCDS51 SNEAASLASTGVGVVKVISTIPATLLVDHVGSKTFLCIGSSVMAASLVTMGIVNLNIHMN
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 SGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTNEDQREPILSTAKKT-KPHPRSGDP
: . :. .:. .: . ..: : .:. . : : .... : . :
CCDS51 FTHICRS-HNSINQS--LDESVIYGPGNLSTNNNTLRDHFKGISSHSRSSLMPLRNDVDK
380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KE6 SAPPRLA--LSSALPGPPL-----PARGHALLRWTALLCLMVFVSAFSFGFGPVTWLVLS
. : :...: :. :.:.: .: :.:.:.:::.:.::. :::::
CCDS51 RGETTSASLLNAGLSHTEYQIVTDPGDVPAFLKWLSLASLLVYVAAFSIGLGPMPWLVLS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 EIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFLLYGLTAVLGLGFIYLF
::.: :::::.:. .:.::. ::.:::.:: . ::: :. ..: . .. .: :. .:
CCDS51 EIFPGGIRGRAMALTSSMNWGINLLISLTFLTVTDLIGLPWVCFIYTIMSLASLLFVVMF
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540
pF1KE6 VPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAAS
.::::: :: .:.... :
CCDS51 IPETKGCSLEQISMELAKVNYVKNNICFMSHHQEELVPKQPQKRKPQEQLLECNKLCGRG
550 560 570 580 590 600
>>CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 (411 aa)
initn: 323 init1: 197 opt: 416 Z-score: 361.1 bits: 76.2 E(32554): 8.6e-14
Smith-Waterman score: 416; 32.2% identity (60.1% similar) in 323 aa overlap (10-315:28-337)
10 20 30 40
pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFG-
: : .. :: :.::. :. : :. ::
CCDS65 MTPEDPEETQPLLGPPGGSAPRGRRVFLAAFAAALGPLSFGFALGYSSPAIPSLQRAAPP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE6 ---LSCLEQEFLVGSLLLGALLASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSL
:. .. . . ::: ....::.:.: ::: ..: .. ..:: ... :..
CCDS65 APRLDDAAASWFGAVVTLGAAAGGVLGGWLVDRAGRKLSLLLCSVPFVAG-FAVITAAQD
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 AWLVLG-RAVVGFAISLSSMACCIYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYAL
.:..:: : ..:.: ...:.. .:.::.. : ::.: : . ..:::::.: ...:
CCDS65 VWMLLGGRLLTGLACGVASLVAPVYISEIAYPAVRGLLGSCVQLMVVVGILLAYLAGWVL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE6 AGTPWGWRHMFGWATAPAVLQSLSLLFLPAGTDETAT-HKDLIPL----------QGGEA
: : ..: .: :. : . :.: : :. . :: :
CCDS65 E---WRWLAVLG--CVPPSLMLLLMCFMPETPRFLLTQHRRQEAMAALRFLWGSEQGWED
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 PKLGPGRPRYSF-LDLFRARDNMRGRTTVGLGLVLFQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFHG
: .: . :: : :.: . .. .:..:. ::::.: :. :: ::: . :.
CCDS65 PPIGA---EQSFHLALLR-QPGIYKPFIIGVSLMAFQQLSGVNAVMFYAETIFEEAKFKD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 GSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALLLAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMDS
.: :::: .:...: : .: ..:::::: ::. . ..:..:.:..:
CCDS65 SS---LASVVVGVIQVLFTAVAALIMDRAGRRLLLVLSGVVMVFSTSAFGAYFKLTQGGP
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 GPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTNEDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSA
CCDS65 GNSSHVAISAPVSAQPVDASVGLAWLAVGSMCLFIAGGPQALWSLLACLRFLHLQCPFHF
350 360 370 380 390 400
>>CCDS8736.2 SLC2A13 gene_id:114134|Hs108|chr12 (648 aa)
initn: 779 init1: 315 opt: 402 Z-score: 346.6 bits: 74.1 E(32554): 5.5e-13
Smith-Waterman score: 704; 30.4% identity (58.1% similar) in 573 aa overlap (4-538:77-635)
10 20 30
pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGAL
.: . . : : :::. :::. .:.:::.
CCDS87 SSTSLQSAGAGGGGVGDLERAARRQFQQDETPAFVYVVAVFSALGGFLFGYDTGVVSGAM
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALLASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLG
: :. ...:. : ::.::.: . .: ...:.:: : .::. ::: .. .. ::: .:.
CCDS87 LLLKRQLSLDALWQELLVSSTVGAAAVSALAGGALNGVFGRRAAILLASALFTAGSAVLA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 LAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACCIYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYAL
:.. :. :: :::..:...::. .:..:. : :: ::.. :: : ... ..
CCDS87 AANNKETLLAGRLVVGLGIGIASMTVPVYIAEVSPPNLRGRLVTINTLFITGGQFFASVV
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200
pF1KE6 NYALAGTPW-GWRHMFGWATAPAVLQSLSLLFLPAGT----DETATHKD---LIPLQGG-
. :.. :::.:.: :..:::.: ...:::: . .. :.: : ..:.
CCDS87 DGAFSYLQKDGWRYMLGLAAVPAVIQFFGFLFLPESPRWLIQKGQTQKARRILSQMRGNQ
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240
pF1KE6 ---------------EAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVLFQQLTGQPN
: ..: . : . . : :: :: .::::.: .
CCDS87 TIDEEYDSIKNNIEEEEKEVGSAGPVICRM---LSYPPTRRALIVGCGLQMFQQLSGINT
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VLCYASTIFSSVGFHGGSSAV-LASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALL---LAGCA
.. :..::.. : . :. :::: . .. ::... ::...::: : ::: .
CCDS87 IMYYSATILQMSGVEDDRLAIWLASV-TAFTNFIFTLVGVWLVEKVGRRKLTFGSLAGTT
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350
pF1KE6 LMALSVSGIGLVSFAVPMDSGPSCLAVPNA-TGQTGLPGDSGLLQDSSLPP-------IP
. :: . ..: :.. . .: : : .::.. . .. : : .
CCDS87 V-ALIILALG---FVLSAQVSPRITFKPIAPSGQNATCTRYSYCNECMLDPDCGFCYKMN
410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RTN--EDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSAPPRLALSSALPGPPLPARGHALLRWTALLC
... ... :. ... . : . . . : : : :::::
CCDS87 KSTVIDSSCVPVNKASTNEAAWGRCENETKFKTEDIFWAYNFCPTP------YSWTALLG
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LMVFVSAFSFGFGPVTWLVLSEIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGL
:.... :. :.::. : : :::::. :. . : ...:: :...::.:: .
CCDS87 LILYLVFFAPGMGPMPWTVNSEIYPLWARSTGNACSSGINWIFNVLVSLTFLHTAEYLTY
520 530 540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SWTFLLYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRI
.:.::. :..:: ::: .:::::..: ::.. :..: : . . ... : : :.
CCDS87 YGAFFLYAGFAAVGLLFIYGCLPETKGKKLEEIESLFDNRLCTCGTSDSDEGRYIEYIRV
580 590 600 610 620 630
540
pF1KE6 EISAAS
. :
CCDS87 KGSNYHLSDNDASDVE
640
541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:33:02 2016 done: Tue Nov 8 13:33:03 2016
Total Scan time: 3.850 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]