Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6448, 541 aa
1>>>pF1KE6448 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4625+/-0.000787; mu= 12.7538+/- 0.048
mean_var=233.8446+/-46.540, 0's: 0 Z-trim(117.6): 892 B-trim: 14 in 1/52
Lambda= 0.083871
statistics sampled from 17370 (18341) to 17370 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.827), E-opt: 0.2 (0.563), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1751.1 ZNF513 gene_id:130557|Hs108|chr2 ( 541) 4004 497.1 2.2e-140
CCDS56114.1 ZNF513 gene_id:130557|Hs108|chr2 ( 479) 3587 446.6 3.2e-125
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 574 82.2 2.3e-15
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 574 82.2 2.3e-15
CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 571 81.7 2.5e-15
CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 571 81.7 2.6e-15
CCDS13439.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20 ( 645) 546 78.8 2.2e-14
CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7 ( 839) 547 79.0 2.4e-14
CCDS77335.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 859) 540 78.2 4.4e-14
CCDS33077.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 871) 540 78.2 4.4e-14
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 522 75.8 1.5e-13
CCDS61814.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 643) 519 75.5 2.1e-13
CCDS10493.2 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 780) 519 75.6 2.4e-13
CCDS33132.2 ZNF749 gene_id:388567|Hs108|chr19 ( 778) 508 74.3 6.1e-13
CCDS43678.1 ZNF775 gene_id:285971|Hs108|chr7 ( 537) 483 71.0 3.9e-12
CCDS1638.1 ZNF672 gene_id:79894|Hs108|chr1 ( 452) 478 70.3 5.3e-12
CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs108|chr8 ( 376) 474 69.8 6.7e-12
CCDS5895.1 ZNF282 gene_id:8427|Hs108|chr7 ( 671) 477 70.4 7.4e-12
CCDS32890.2 ZNF358 gene_id:140467|Hs108|chr19 ( 568) 473 69.9 9.4e-12
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 476 70.7 1.2e-11
CCDS33116.3 ZNF628 gene_id:89887|Hs108|chr19 (1059) 468 69.6 2.1e-11
CCDS32462.1 ZNF319 gene_id:57567|Hs108|chr16 ( 582) 463 68.7 2.2e-11
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8 ( 504) 459 68.1 2.8e-11
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 457 67.8 3.2e-11
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 455 67.4 3.2e-11
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 457 67.8 3.3e-11
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 457 67.9 3.4e-11
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 457 67.9 3.4e-11
CCDS61813.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 386) 453 67.2 3.9e-11
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 454 67.5 4.4e-11
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 452 67.3 5.1e-11
CCDS12963.1 ZNF552 gene_id:79818|Hs108|chr19 ( 407) 450 66.9 5.2e-11
CCDS13441.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20 ( 627) 453 67.5 5.3e-11
CCDS13442.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20 ( 679) 453 67.5 5.6e-11
CCDS13440.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20 ( 681) 453 67.5 5.6e-11
CCDS2011.1 ZNF514 gene_id:84874|Hs108|chr2 ( 400) 449 66.8 5.6e-11
CCDS45460.1 ZNF771 gene_id:51333|Hs108|chr16 ( 317) 447 66.4 5.8e-11
CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 480) 450 67.0 5.8e-11
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 ( 458) 448 66.7 6.7e-11
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 449 66.9 6.7e-11
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 450 67.1 6.7e-11
CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 ( 561) 448 66.8 7.6e-11
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 450 67.2 7.6e-11
CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 448 66.8 7.8e-11
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 448 66.9 8e-11
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 449 67.1 8.3e-11
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 446 66.5 8.3e-11
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 448 66.9 8.4e-11
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 448 66.9 8.5e-11
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 448 66.9 8.6e-11
>>CCDS1751.1 ZNF513 gene_id:130557|Hs108|chr2 (541 aa)
initn: 4004 init1: 4004 opt: 4004 Z-score: 2633.8 bits: 497.1 E(32554): 2.2e-140
Smith-Waterman score: 4004; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPRRKQSHPQPVKCEGVKVDTEDSLDEGPGALVLESDLLLGQDLEFEEEEEEEEGDGNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MPRRKQSHPQPVKCEGVKVDTEDSLDEGPGALVLESDLLLGQDLEFEEEEEEEEGDGNSD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QLMGFERDSEGDSLGARPGLPYGLSDDESGGGRALSAESEVEEPARGPGEARGERPGPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QLMGFERDSEGDSLGARPGLPYGLSDDESGGGRALSAESEVEEPARGPGEARGERPGPAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSCRLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSCRLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFRC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCPFACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCPFACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FRCCTPRPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLPDLSLHVPPGGASFLPDCGQLRGEGEGLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FRCCTPRPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLPDLSLHVPPGGASFLPDCGQLRGEGEGLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GTGSEPLPELLFPWTCRGCGQELEEGEGSRLGAAMCGRCMRGEAGGGASGGPQGPSDKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GTGSEPLPELLFPWTCRGCGQELEEGEGSRLGAAMCGRCMRGEAGGGASGGPQGPSDKGF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCARCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCARCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 CPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYSCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 CPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYSCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 TGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAPPHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAPPHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDS
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 S
:
CCDS17 S
>>CCDS56114.1 ZNF513 gene_id:130557|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 3587 init1: 3587 opt: 3587 Z-score: 2361.7 bits: 446.6 E(32554): 3.2e-125
Smith-Waterman score: 3587; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (63-541:1-479)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VLESDLLLGQDLEFEEEEEEEEGDGNSDQLMGFERDSEGDSLGARPGLPYGLSDDESGGG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MGFERDSEGDSLGARPGLPYGLSDDESGGG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 RALSAESEVEEPARGPGEARGERPGPACQLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RALSAESEVEEPARGPGEARGERPGPACQLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSC
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFRCGRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFRCGRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCP
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTCGFRCCTPRPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTCGFRCCTPRPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLP
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DLSLHVPPGGASFLPDCGQLRGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRGCGQELEEGEGSRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DLSLHVPPGGASFLPDCGQLRGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRGCGQELEEGEGSRLG
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AAMCGRCMRGEAGGGASGGPQGPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AAMCGRCMRGEAGGGASGGPQGPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCAR
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 CPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYS
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 CNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAP
400 410 420 430 440 450
520 530 540
pF1KE6 PHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDSS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDSS
460 470
>>CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (742 aa)
initn: 407 init1: 407 opt: 574 Z-score: 389.2 bits: 82.2 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 633; 29.2% identity (53.4% similar) in 373 aa overlap (150-494:306-670)
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CQLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSCRLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFR
:.:. : . :.: :.:: .::::.::..
CCDS32 KPYECSKCDKAFHSSSSYHRHERSHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYE
280 290 300 310 320 330
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CGRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCPFACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTC
: . . . :... : : ..::.::.: : . : ... :..::.: : :
CCDS32 CKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSGERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQC
340 350 360 370 380 390
240 250 260 270 280
pF1KE6 G--FRCCTP-------RPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLPDLSLH--VPPGGASF-LP
: : . . .. : .: : . : . : .: . : .
CCDS32 GKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPYECKQCGKAFRSASQ------LRVHGGTHTGEKPYECK
400 410 420 430 440
290 300 310 320 330
pF1KE6 DCGQLRGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRGCGQ------ELEEGEGSRLGAAM------
.::. : : : :. :. ::. .:. : .. :
CCDS32 ECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEK--PYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERP
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 --CGRCMRG--EAGGGASGGPQGPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCA
:. : .: : . . ..: . :. : : . : : : .::.::::..:
CCDS32 YKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECK
510 520 530 540 550 560
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 RCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNY
.: : ..:. :.:.:::::::.: : : . .::..::: :.:.::..:. :.
CCDS32 QCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGK
570 580 590 600 610 620
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 SCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWA
. .. ::. : ::::::..: : . ...... :.. :
CCDS32 AFRSASNLQMHERTHTGEKPYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTS
630 640 650 660 670 680
520 530 540
pF1KE6 PPHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDSS
CCDS32 AKILQIHARTHIGEKHYECKECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
690 700 710 720 730 740
>>CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (745 aa)
initn: 407 init1: 407 opt: 574 Z-score: 389.2 bits: 82.2 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 633; 29.2% identity (53.4% similar) in 373 aa overlap (150-494:309-673)
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CQLCGGPTGEGPCCGAGGPGGGPLLPPRLLYSCRLCTFVSHYSSHLKRHMQTHSGEKPFR
:.:. : . :.: :.:: .::::.::..
CCDS74 KPYECSKCDKAFHSSSSYHRHERSHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYE
280 290 300 310 320 330
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CGRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCPFACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTC
: . . . :... : : ..::.::.: : . : ... :..::.: : :
CCDS74 CKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSGERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQC
340 350 360 370 380 390
240 250 260 270 280
pF1KE6 G--FRCCTP-------RPARPPSPTEQEGAVPRRPEDALLLPDLSLH--VPPGGASF-LP
: : . . .. : .: : . : . : .: . : .
CCDS74 GKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPYECKQCGKAFRSASQ------LRVHGGTHTGEKPYECK
400 410 420 430 440 450
290 300 310 320 330
pF1KE6 DCGQLRGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRGCGQ------ELEEGEGSRLGAAM------
.::. : : : :. :. ::. .:. : .. :
CCDS74 ECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEK--PYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERP
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 --CGRCMRG--EAGGGASGGPQGPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCA
:. : .: : . . ..: . :. : : . : : : .::.::::..:
CCDS74 YKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECK
520 530 540 550 560 570
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 RCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNY
.: : ..:. :.:.:::::::.: : : . .::..::: :.:.::..:. :.
CCDS74 QCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGK
580 590 600 610 620 630
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 SCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWA
. .. ::. : ::::::..: : . ...... :.. :
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520 530 540
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CCDS74 AKILQIHARTHIGEKHYECKECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
700 710 720 730 740
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180 190 200 210 220 230
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.: .: : .: .: : :::::::::.: .: . . ..: .:::::.: :
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: .:. . . .: . . :. . .: .: :.:..
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: .:. : : : .: . : :. ::. .::.. .. . .
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360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
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.: . ::.: . .::. : .::.::::..: :: : .. ..: :::.:::::::
CCDS55 EKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPY
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420 430 440 450 460 470
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480 490 500 510 520 530
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:. . . .. :...:
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530 540 550 560 570
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CCDS48 ERFFDPNQRGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPY
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.: .: : .: .: : :::::::::.: .: . . ..: .:::::.: :
CCDS48 ECCECAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDK
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240 250 260 270 280 290
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: .:. . . .: . . :. . .: .: :.:..
CCDS48 CPKAFKSSYHLIRHEKTHIRQAFYKGIKCTTSSLIYQ-RIH-----TSEKPQCSE-----
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: .:. : : : .: . : :. ::. .::.. .. . .
CCDS48 ---HGKASDEKPSPTKHW--RTHTKE-NIYECSK-----CGKSFRGKSHLSVHQRIH-TG
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360 370 380 390 400 410
pF1KE6 DKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGEKPFRCARCPYASAHLDNLKRHQRVHTGEKPY
.: . ::.: . .::. : .::.::::..: :: : .. ..: :::.:::::::
CCDS48 EKPYECSICGKTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPY
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420 430 440 450 460 470
pF1KE6 KCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYSCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCAT
:: : : .. . : .: :::.:..:..:. :. . ... .: .:. ::::::..:.
CCDS48 KCNECGKAFSEKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSE
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480 490 500 510 520 530
pF1KE6 CAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAPPHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAV
:. . . .. :...:
CCDS48 CGKAFSVKSTLIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
530 540 550 560 570 580
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CCDS13 HLKIHTGDKPHKCEVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRI
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CCDS13 HSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTASELDDDVPK----ANCLSTESTDTPKAPV
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.: :: : .: ..:. ::. :.. :: .: : ::.. ..:
CCDS13 TG-----------DKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSVKPHKCHLCDYAAVDSSSL
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CCDS13 KKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTGDTPFQCWLCSAKFKISSDLKRHM
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. :.:::::.: : : : : ..
CCDS13 IVHSGEKPFKCEFCDVRCTMKANLKSHIRIKHTFKCLHCAFQGRDRADLLEHSRLHQADH
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::.: . : :.::.: :.:::::::.: : : ..: .:. .:.: : :
CCDS56 CGECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYKCQVCGKAFRVSSHLVQHHSVHSGERPYGCNEC
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. . .:.. ::: :. : : ..: :: : .:
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. . . : .. :. : . :: .:.. :.::::::: .: . . .:
CCDS56 VPYVHKKSSTG--ERPHKCNECGKSFIQSAHLIQHQRIHTGEKPFRCEECGKSYNQRVHL
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pF1KE6 KRHQRVHTGEKPYKCPLCPYACGNLANLKRHGRIHSGDKPFRCSLCNYSCNQSMNLKRHM
.::::::::::: :::: : ..: .: .:::..::.:. :. . .. .: :.
CCDS56 TQHQRVHTGEKPYTCPLCGKAFRVRSHLVQHQSVHSGERPFKCNECGKGFGRRSHLAGHL
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pF1KE6 LRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLSASEGWAPPHSPPSVLSSR
:. :: .: :. .. . .:: .:
CCDS56 RLHSREKSHQCRECGEIFFQYVSLIEHQVLHMGQKNEKNGICEEAYSWNLTVIEDKKIEL
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pF1KE6 GPPALGTAGSRAVHTDSS
CCDS56 QEQPYQCDICGKAFGYSSDLIQHYRTHTAEKPYQCDICRENVGQCSHTKQHQKIYSSTKS
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CCDS77 ERIHTR-GVKPFECDQCGKAFGQSTRLIHHQRIHSRVRLYKWGEQGKAISSASLIKLQSF
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CCDS77 HTKEHPFKCNECGKTFSHSAHLSKHQLIHAGENPFKCSKCDRVFTQRNYLVQHERTHARK
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CCDS77 CQECGKAFTQSSCLSIHRRVHTGEKPYRCGECGKAFAQKANLTQHQRIHTGEKPYSCNVC
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CCDS77 GKAFVLSAHLNQHLRVHTQETLYQCQRCQKAFRCHSSLSRHQRVHNKQQYCL
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CCDS33 EPYKCNERGKSFRHNSTLKIHQRVHSGEKPYKCSECGKAFHRHTHLNEHRRIHTGYRPHK
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pF1KE6 CGRCPYASAQLVNLTRHTRTHTGEKPYRCPHCPFACSSLGNLRRHQRTHAGPPTPPCPTC
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CCDS33 CQECVRSFSRPSHLMRHQAIHTAEKPYSCAECKETFSDNNRLVQHQKMHTVKTPYECQEC
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pF1KE6 GFR--------CCTPRPARPPSPTEQEGAV----PRRPEDAL--------------LLPD
: : : :: . : . :.. : . :
CCDS33 GERFICGSTLKCHESVHAREKQGFFVSGKILDQNPEQKEKCFKCNKCEKTFSCSKYLTQH
530 540 550 560 570 580
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pF1KE6 LSLHVPPGGASFLPD-CGQLRGEGEGLCGTGSEPLPELLFPWTCRG---CGQELEEGEG-
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CCDS33 ERIHTR-GVKPFECDQCGKAFGQSTRLIHHQRIHSRVRLYKWGEQGKAISSASLIKLQSF
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pF1KE6 -SRLGAAMCGRCMRGEAGGGASGGPQ--GPSDKGFACSLCPFATHYPNHLARHMKTHSGE
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CCDS33 HTKEHPFKCNECGKTFSHSAHLSKHQLIHAGENPFKCSKCDRVFTQRNYLVQHERTHARK
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CCDS33 KPLVCNECGKTFRQSSCLSKHQRIHSGEKPYVCDYCGKAFGLSAELVRHQRIHTGEKPYV
700 710 720 730 740 750
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pF1KE6 CSLCNYSCNQSMNLKRHMLRHTGEKPFRCATCAYTTGHWDNYKRHQKVHGHGGAGGPGLS
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CCDS33 CQECGKAFTQSSCLSIHRRVHTGEKPYRCGECGKAFAQKANLTQHQRIHTGEKPYSCNVC
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pF1KE6 ASEGWAPPHSPPSVLSSRGPPALGTAGSRAVHTDSS
CCDS33 GKAFVLSAHLNQHLRVHTQETLYQCQRCQKAFRCHSSLSRHQRVHNKQQYCL
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541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]