Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6428
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6428, 460 aa
1>>>pF1KE6428 460 - 460 aa - 460 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1695+/-0.000954; mu= 18.4730+/- 0.057
mean_var=65.2362+/-13.346, 0's: 0 Z-trim(104.7): 23 B-trim: 45 in 1/48
Lambda= 0.158792
statistics sampled from 8025 (8046) to 8025 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3656.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 460) 3039 705.2 3.4e-203
CCDS47117.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 444) 2815 653.9 9.4e-188
CCDS6030.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 1281 302.5 6.3e-82
CCDS47823.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 1265 298.9 8e-81
CCDS47822.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 481) 1129 267.7 1.9e-71
CCDS60493.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 690) 607 148.2 2.5e-35
CCDS60494.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 557) 605 147.7 2.9e-35
CCDS44362.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 691) 605 147.8 3.4e-35
CCDS43782.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 622) 596 145.7 1.3e-34
CCDS6424.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 647) 596 145.7 1.4e-34
CCDS42428.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 755) 522 128.8 2e-29
CCDS33353.1 SLC39A10 gene_id:57181|Hs108|chr2 ( 831) 506 125.1 2.7e-28
CCDS8912.2 SLC39A5 gene_id:283375|Hs108|chr12 ( 540) 479 118.8 1.4e-26
CCDS7124.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 654) 437 109.3 1.3e-23
CCDS45854.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 433) 433 108.2 1.7e-23
>>CCDS3656.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 (460 aa)
initn: 3039 init1: 3039 opt: 3039 Z-score: 3761.4 bits: 705.2 E(32554): 3.4e-203
Smith-Waterman score: 3039; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASR
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CCDS36 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VGVPEPGQLHFNQCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VGVPEPGQLHFNQCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTHQPKALPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KTHQPKALPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 STRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 STRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE6 EKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
430 440 450 460
>>CCDS47117.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 (444 aa)
initn: 2815 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 3484.3 bits: 653.9 E(32554): 9.4e-188
Smith-Waterman score: 2815; 98.8% identity (99.1% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VGVPEPGQLHFNQCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGVPEPGQLHFNQCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTHQPKALPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KTHQPKALPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 STRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE6 EKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
::. ::
CCDS47 EKIIKWATDDIKSQLHLLWIYTAR
430 440
>>CCDS6030.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (492 aa)
initn: 1354 init1: 711 opt: 1281 Z-score: 1584.4 bits: 302.5 E(32554): 6.3e-82
Smith-Waterman score: 1433; 49.8% identity (77.5% similar) in 466 aa overlap (15-459:30-491)
10 20 30 40
pF1KE6 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSA
:..::. : . . .: .:.. .: . ::.
CCDS60 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAA-SFLQDLIHRYGEGDSLTL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 AQLQHLLEQMGAA-SRVGVPEPGQLHFN--QCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICP
::. ::... .. .: .: . : : : :... ..:. :.::. ..: ::... .::
CCDS60 QQLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE6 AVLQQLNFHPC--------EDRPKHKTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK
..::::. . : :.. .. ::: ::::.:::::..::::::::... : .
CCDS60 TILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGFGFLSVSLINLASLLGVLVLPCTE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFER
:..: ..::.:..:.::::.:::.::::::::::.: : :: :...:::::::.:: :.
CCDS60 KAFFSRVLTYFIALSIGTLLSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE6 MLKMLLKTYGQN--GHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAI-NGVTCYANPA--VTEANGHI
.::.::: ... ::.:...... :..: .. .. . :: . : .: .:.
CCDS60 ILKILLKQKNEHHHGHSHYASESL-PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 HFDNVSVV----SLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGAS
. . .:. :.:: . :.: ::: . :.:::.:::::: :.:::::::::::::
CCDS60 PMVDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGAS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 CTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGIL
:.:..::.:::.::::::::::::::::::::::: .:::.::::::: ::.:::::::
CCDS60 FTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGIL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 VGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTF-FMIQNAGMLTGF
.:..:. : ::::::::::::::::::::::.. .: :: .. . :.::: :.::::
CCDS60 AGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQED--ERKGSILIPFIIQNLGLLTGF
420 430 440 450 460 470
450 460
pF1KE6 TAILLITLYAGEIELE
: ....:.:.:.:..
CCDS60 TIMVVLTMYSGQIQIG
480 490
>>CCDS47823.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (492 aa)
initn: 1386 init1: 711 opt: 1265 Z-score: 1564.6 bits: 298.9 E(32554): 8e-81
Smith-Waterman score: 1417; 49.4% identity (77.0% similar) in 466 aa overlap (15-459:30-491)
10 20 30 40
pF1KE6 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSA
:..::. : . . .: .:.. .: . ::.
CCDS47 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAA-SFLQDLIHRYGEGDSLTL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 AQLQHLLEQMGAA-SRVGVPEPGQLHFN--QCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICP
::. ::... .. .: .: . : : : :... ..:. :.::. ..: ::... .::
CCDS47 QQLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE6 AVLQQLNFHPC--------EDRPKHKTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK
..::::. . : :.. .. ::: ::::::.: ::.:.: :::: ..:..:
CCDS47 TILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFER
:... ..: .:..::::::.:::.::::::::::.: : :: :...:::::::.:: :.
CCDS47 KTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE6 MLKMLLKTYGQN--GHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAI-NGVTCYANPA--VTEANGHI
.::.::: ... ::.:...... :..: .. .. . :: . : .: .:.
CCDS47 ILKILLKQKNEHHHGHSHYASESL-PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 HFDNVSVV----SLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGAS
. . .:. :.:: . :.: ::: . :.:::.:::::: :.:::::::::::::
CCDS47 PMVDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGAS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 CTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGIL
:.:..::.:::.::::::::::::::::::::::: .:::.::::::: ::.:::::::
CCDS47 FTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGIL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 VGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTF-FMIQNAGMLTGF
.:..:. : ::::::::::::::::::::::.. .: :: .. . :.::: :.::::
CCDS47 AGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMFPEMNEVCQED--ERKGSILIPFIIQNLGLLTGF
420 430 440 450 460 470
450 460
pF1KE6 TAILLITLYAGEIELE
: ....:.:.:.:..
CCDS47 TIMVVLTMYSGQIQIG
480 490
>>CCDS47822.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 (481 aa)
initn: 1264 init1: 675 opt: 1129 Z-score: 1396.3 bits: 267.7 E(32554): 1.9e-71
Smith-Waterman score: 1281; 49.9% identity (76.7% similar) in 417 aa overlap (15-411:30-444)
10 20 30 40
pF1KE6 MAPGRAVAGLLLLAAAGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSA
:..::. : . . .: .:.. .: . ::.
CCDS47 MKLLLLHPAFQSCLLLTLLGLWRTTPEAHASSLGAPAISAA-SFLQDLIHRYGEGDSLTL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 AQLQHLLEQMGAA-SRVGVPEPGQLHFN--QCLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICP
::. ::... .. .: .: . : : : :... ..:. :.::. ..: ::... .::
CCDS47 QQLKALLNHLDVGVGRGNVTQHVQGHRNLSTCFSSGDLFTAHNFSEQSRIGSSELQEFCP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE6 AVLQQLNFHPC--------EDRPKHKTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK
..::::. . : :.. .. ::: ::::::.: ::.:.: :::: ..:..:
CCDS47 TILQQLDSRACTSENQENEENEQTEEGRPSAVEVWGYGLLCVTVISLCSLLGASVVPFMK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFDPKVDSYVEKAVAVFGGFYLLFFFER
:... ..: .:..::::::.:::.::::::::::.: : :: :...:::::::.:: :.
CCDS47 KTFYKRLLLYFIALAIGTLYSNALFQLIPEAFGFNPLEDYYVSKSAVVFGGFYLFFFTEK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE6 MLKMLLKTYGQN--GHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAI-NGVTCYANPA--VTEANGHI
.::.::: ... ::.:...... :..: .. .. . :: . : .: .:.
CCDS47 ILKILLKQKNEHHHGHSHYASESL-PSKKDQEEGVMEKLQNGDLDHMIPQHCSSELDGKA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 HFDNVSVV----SLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGAS
. . .:. :.:: . :.: ::: . :.:::.:::::: :.:::::::::::::
CCDS47 PMVDEKVIVGSLSVQDLQASQSACYWLKGVRYSDIGTLAWMITLSDGLHNFIDGLAIGAS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 CTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLSACSCYVGLAFGIL
:.:..::.:::.::::::::::::::::::::::: .:::.::::::: ::.:::::::
CCDS47 FTVSVFQGISTSVAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSIQQALFFNFLSACCCYLGLAFGIL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 VGNNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFT
.:..:. : :::::::::::::::::
CCDS47 AGSHFSANWIFALAGGMFLYISLADMMEFCSVAQAGVQWCHLSSLQPLPLGLKRLSCLSL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS60493.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 (690 aa)
initn: 522 init1: 305 opt: 607 Z-score: 747.7 bits: 148.2 E(32554): 2.5e-35
Smith-Waterman score: 625; 31.7% identity (63.6% similar) in 423 aa overlap (65-459:300-690)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 SVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASRVGVPEPGQLHFNQ-CLTAE---EIFSLHGFSNAT
: : . ..: :..:. ::: .:.:
CCDS60 KIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLS---
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140
pF1KE6 QITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKH---KTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLG-
:.. :. . :...::: :. :: : :. : .::. ..::...:.:.::
CCDS60 LISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCH-LPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGT
330 340 350 360 370 380
150 160 170 180 190
pF1KE6 -LILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFD----PKVDSYVE----
:.: ...: :: .:::::.::: ..:...:::...:. :. . :
CCDS60 ALVLFHSCEENYR-LILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGH
390 400 410 420 430 440
200 210 220 230 240
pF1KE6 --KAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLK--------TYGQNGHTHFGNDNFGPQEKTHQPKA
: ....::.. .:..:. . .:.. . :. ::.: : .... . :.
CCDS60 IWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKS
450 460 470 480 490 500
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMI
.:. .: ..: . . :. :. : . :. .: ::
CCDS60 ASTIQ----LKSPEDSQA-----------AEMPIGSMTASNRKC------KAISLLAIMI
510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALL
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CCDS60 LVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMKTAIL
550 560 570 580 590 600
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 FNFLSACSCYVGLAFGILVGNN-FAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGR
.::.:. . ..:: .:. :. . . . ::....:::::.::..:.:::. . ..
CCDS60 MNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR----
610 620 630 640 650
430 440 450 460
pF1KE6 KTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
. .:..:: :.. :. ..::...: .:..
CCDS60 --PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
660 670 680 690
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40 50 60 70 80 90
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: : . ..: :..:. ::: .:.:
CCDS60 KIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLS---
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100 110 120 130 140
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:.. :. . :...::: :. :: : :. : .::. ..::...:.:.::
CCDS60 LISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCH-LPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGT
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150 160 170 180 190
pF1KE6 -LILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFD----PKVDSYVE----
:.: ...: :: .:::::.::: ..:...:::...:. :. . :
CCDS60 ALVLFHSCEENYR-LILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGH
260 270 280 290 300 310
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 --KAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAINGVT
: ....::.. .:..:. . .:.. ..: . . : . : ..:. ::
CCDS60 IWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLS-LVNGHVG---HSHH-LAL-------
320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 CYANPAVTEANGHIHF-DNVSVVSLQDGK--KEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDA
: ... :. . ..... : .:.. . : . .. : . :. .: :: . :.
CCDS60 ---NSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDS
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 LHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLS
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CCDS60 LHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMKTAILMNFIS
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380 390 400 410 420 430
pF1KE6 ACSCYVGLAFGILVGNN-FAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFT
. . ..:: .:. :. . . . ::....:::::.::..:.:::. . .. .
CCDS60 SLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR------PWM
480 490 500 510 520
440 450 460
pF1KE6 FFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
.:..:: :.. :. ..::...: .:..
CCDS60 MFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
530 540 550
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Smith-Waterman score: 630; 32.1% identity (66.0% similar) in 418 aa overlap (65-459:300-691)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 SVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASRVGVPEPGQLHFNQ-CLTAE---EIFSLHGFSNAT
: : . ..: :..:. ::: .:.:
CCDS44 KIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLS---
270 280 290 300 310 320
100 110 120 130 140
pF1KE6 QITSSKFSVICPAVLQQLNFHPCEDRPKH---KTRPSHSEVWGYGFLSVTIINLASLLG-
:.. :. . :...::: :. :: : :. : .::. ..::...:.:.::
CCDS44 LISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCH-LPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGT
330 340 350 360 370 380
150 160 170 180 190
pF1KE6 -LILTPLIKKSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFGFD----PKVDSYVE----
:.: ...: :: .:::::.::: ..:...:::...:. :. . :
CCDS44 ALVLFHSCEENYR-LILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGH
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pF1KE6 --KAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQEKTHQPKALPAINGVT
: ....::.. .:..:. . .:.. ..: . . : . : ..:. ::
CCDS44 IWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLS-LVNGHVG---HSHH-LAL-------
450 460 470 480 490
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 CYANPAVTEANGHIHF-DNVSVVSLQDGK--KEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDA
: ... :. . ..... : .:.. . : . .. : . :. .: :: . :.
CCDS44 ---NSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDS
500 510 520 530 540
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 LHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGMSTRQALLFNFLS
:::: :::::::. . : .:..:.:::::.:.:::.:::..::..:.: . :.:.::.:
CCDS44 LHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMKTAILMNFIS
550 560 570 580 590 600
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 ACSCYVGLAFGILVGNN-FAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKVTGRKTDFT
. . ..:: .:. :. . . . ::....:::::.::..:.:::. . .. .
CCDS44 SLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR------PWM
610 620 630 640 650 660
440 450 460
pF1KE6 FFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
.:..:: :.. :. ..::...: .:..
CCDS44 MFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
670 680 690
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CCDS43 DTVCLSARDVMAAYGLSEQAGVTPEAWAQLSPALLQQQLSGACTSQSRPPVQDQLSQSER
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CCDS43 YLYGSLATLLICLCAVFGLLLLTCTGCRGVTHYILQTFLSLAVGAVTGDAVLHLTPKVLG
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FDPKVDSYVE-----KAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQEKT
. . . . . .:...:.: .:.:: ....:: .. . . : . ..
CCDS43 LHTHSEEGLSPQPTWRLLAMLAGLYAFFLFENLFNLLLPRDPED----LEDGPCGHSSHS
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: .. .::. :. . : : : : : :. :: :.
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420 430 440 450 460
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pF1KE6 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
. .:::: ::.::: ::::.::. . : ::.::.:..:.:.:::::::. ::.::.
CCDS43 RLLPYMITLGDAVHNFADGLAVGAAFASSWKTGLATSLAVFCHELPHELGDFAALLHAGL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE6 STRQALLFNFLSACSCYVGLAFGILVG-NNFAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDML
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CCDS43 SVRQALLLNLASALTAFAGLYVALAVGVSEESEAWILAVATGLFLYVALCDMLPAM----
530 540 550 560 570 580
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pF1KE6 REKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
:: . . .:...:.:.: :.:..::..:: .:
CCDS43 -LKVRDPRP-WLLFLLHNVGLLGGWTVLLLLSLYEDDITF
590 600 610 620
>>CCDS6424.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 (647 aa)
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Smith-Waterman score: 647; 32.0% identity (62.4% similar) in 428 aa overlap (46-457:237-645)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 AGLGGVAEGPGLAFSEDVLSVFGANLSLSAAQLQHLLEQMGAASRVGVPEPGQLHFNQ--
:. .: .. ::.:: :: .. . ..
CCDS64 DFVFQQHSSEVPMTLAELSALMQRLGVGREAHSDHSHRHRGASSRDPVPLISSSNSSSVW
210 220 230 240 250 260
80 90 100 110 120
pF1KE6 ---CLTAEEIFSLHGFSNATQITSSKFSVICPAVLQQLNFHPC--EDRPKHKTRPSHSEV
::.:..... .:.:. . .: .. . ::.::: : ..:: . . :.::
CCDS64 DTVCLSARDVMAAYGLSEQAGVTPEAWAQLSPALLQQQLSGACTSQSRPPVQDQLSQSER
270 280 290 300 310 320
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 WGYGFLSVTIINLASLLGLILTPLIK-KSYFPKILTFFVGLAIGTLFSNAIFQLIPEAFG
. :: :.. .: : ...::.: .. :: :..::.:.. ..:...: :...:
CCDS64 YLYGSLATLLICLCAVFGLLLLTCTGCRGVTHYILQTFLSLAVGAVTGDAVLHLTPKVLG
330 340 350 360 370 380
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FDPKVDSYVE-----KAVAVFGGFYLLFFFERMLKMLLKTYGQNGHTHFGNDNFGPQEKT
. . . . . .:...:.: .:.:: ....:: .. . . : . ..
CCDS64 LHTHSEEGLSPQPTWRLLAMLAGLYAFFLFENLFNLLLPRDPED----LEDGPCGHSSHS
390 400 410 420 430 440
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HQPKALPAINGVTCYANPAVTEANGHIHFDNVSVVSLQDGKKEPSSCTCLKGPK-LS-EI
: .. .::. :. . : : : : : :. :: :.
CCDS64 HGGHS----HGVSLQLAPSELRQPKPPHEG-----SRADLVAEESPELLNPEPRRLSPEL
450 460 470 480 490
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pF1KE6 GTIAWMITLCDALHNFIDGLAIGASCTLSLLQGLSTSIAILCEEFPHELGDFVILLNAGM
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CCDS64 RLLPYMITLGDAVHNFADGLAVGAAFASSWKTGLATSLAVFCHELPHELGDFAALLHAGL
500 510 520 530 540 550
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CCDS64 SVRQALLLNLASALTAFAGLYVALAVGVSEESEAWILAVATGLFLYVALCDMLPAM----
560 570 580 590 600
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pF1KE6 REKVTGRKTDFTFFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
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CCDS64 -LKVRDPRP-WLLFLLHNVGLLGGWTVLLLLSLYEDDITF
610 620 630 640
460 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:11:54 2016 done: Tue Nov 8 13:11:54 2016
Total Scan time: 2.410 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]