FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6426, 524 aa
1>>>pF1KE6426 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2789+/-0.000814; mu= 18.4045+/- 0.049
mean_var=65.4586+/-13.267, 0's: 0 Z-trim(107.3): 80 B-trim: 499 in 1/51
Lambda= 0.158523
statistics sampled from 9397 (9482) to 9397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 3608 834.1 0
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 3070 711.0 8.2e-205
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 3031 702.1 3.9e-202
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 2990 692.7 2.6e-199
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 2879 667.3 1.1e-191
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 2851 660.9 9.7e-190
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 2317 538.8 5.7e-153
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 1433 336.6 4.1e-92
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 1372 322.7 6.4e-88
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 1364 320.9 2.3e-87
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 1356 319.0 8e-87
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 1341 315.6 8.8e-86
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 1278 301.2 1.8e-81
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 1232 290.7 2.7e-78
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 1017 241.5 1.8e-63
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 576 140.6 4e-33
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 573 139.9 6.4e-33
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 571 139.5 8.8e-33
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 571 139.5 9.2e-33
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 568 138.8 1.4e-32
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 562 137.4 3.7e-32
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 515 126.6 5.1e-29
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 440 109.5 7.9e-24
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 410 102.6 1e-21
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 410 102.7 1.1e-21
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 410 102.7 1.2e-21
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 395 99.2 1.1e-20
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 391 98.3 2.2e-20
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 383 96.5 7.6e-20
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 375 94.7 2.9e-19
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 370 93.5 6.2e-19
CCDS76160.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 357) 358 90.7 3e-18
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 359 91.0 3.4e-18
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 349 88.7 1.7e-17
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 347 88.3 2.4e-17
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 404) 342 87.1 4.3e-17
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 343 87.4 4.6e-17
CCDS5623.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 509) 342 87.1 5.2e-17
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 339 86.4 7.4e-17
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 339 86.4 8.1e-17
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 338 86.2 9.7e-17
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 335 85.5 1.6e-16
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 333 85.1 2.1e-16
CCDS45303.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 363) 331 84.5 2.2e-16
CCDS32291.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 521) 331 84.6 3e-16
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 325 83.2 8.1e-16
CCDS7427.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 428) 323 82.7 9.1e-16
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 497) 323 82.8 1e-15
CCDS62934.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 437) 320 82.1 1.5e-15
CCDS1919.1 CYP26B1 gene_id:56603|Hs108|chr2 ( 512) 320 82.1 1.7e-15
>>CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 (524 aa)
initn: 3608 init1: 3608 opt: 3608 Z-score: 4455.5 bits: 834.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3608; 99.4% identity (99.6% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLLSLPWLGLRPVAMSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSLLSLPWLGLRPVATSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGHLGLITPTEEGLKNSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LASEGSSCLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSHCQERPSEYIATILELSALVEKRSQHIL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LASEGSSRLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSHCQERPSEYIATILELSALVEKRSQHIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKGITC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKGITC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE6 VLALMLLHFRFLPDHTEPRRKLELIMRAEGGLWLRVEPLNVSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLALMLLHFRFLPDHTEPRRKLELIMRAEGGLWLRVEPLNVSLQ
490 500 510 520
>>CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 (524 aa)
initn: 3114 init1: 3066 opt: 3070 Z-score: 3790.5 bits: 711.0 E(32554): 8.2e-205
Smith-Waterman score: 3070; 82.8% identity (92.9% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLLSLPWLGLRPVAMSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
: ::: :::: ::: ::::::::: :::::::.:::::.::.:::::::::::::.:::
CCDS12 MPQLSLSWLGLGPVAASPWLLLLLVGGSWLLARVLAWTYTFYDNCRRLQCFPQPPKQNWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
::: ::.::::::.: ::. .:: ::: .:::: .:...::::: :: ::.::::.:::
CCDS12 WGHQGLVTPTEEGMKTLTQLVTTYPQGFKLWLGPTFPLLILCHPDIIRPITSASAAVAPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
: .: :::::::.:.::::::::::::::::::::::::: :. :::::.::: ::::.
CCDS12 DMIFYGFLKPWLGDGLLLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNKSVNIMHDKWQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LASEGSSCLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSHCQERPSEYIATILELSALVEKRSQHIL
::::::. ::::::::::::::::::.:::.:.:::.::::::.::::::.::::.:.::
CCDS12 LASEGSARLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFESNCQEKPSEYIAAILELSAFVEKRNQQIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
: ::::::. ::.::.:::.::::::::::.::: ::::::::::.:.:::::::::::
CCDS12 LHTDFLYYLTPDGQRFRRACHLVHDFTDAVIQERRCTLPTQGIDDFLKNKAKSKTLDFID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::.::.::::::.:::::::
CCDS12 VLLLSKDEDGKELSDEDIRAEADTFMFEGHDTTASGLSWVLYHLAKHPEYQEQCRQEVQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKGITC
:::::.: ::::::::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::::::::::::.:
CCDS12 LLKDREPIEIEWDDLAQLPFLTMCIKESLRLHPPVPVISRCCTQDFVLPDGRVIPKGIVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
::.:::.:.::::::::::::::::: :: : ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LINIIGIHYNPTVWPDPEVYDPFRFDQENIKERSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE6 VLALMLLHFRFLPDHTEPRRKLELIMRAEGGLWLRVEPLNVSLQ
:::: :::::.:: ::::::: :::.:::::::::::::... :
CCDS12 VLALTLLHFRILPTHTEPRRKPELILRAEGGLWLRVEPLGANSQ
490 500 510 520
>>CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 (520 aa)
initn: 3055 init1: 3031 opt: 3031 Z-score: 3742.4 bits: 702.1 E(32554): 3.9e-202
Smith-Waterman score: 3031; 81.9% identity (92.7% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLLSLPWLGLRPVAMSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
:: ::: :::: ::: ::::::::: .:::::..::::::::.:::::.::::::.::::
CCDS12 MSQLSLSWLGLWPVAASPWLLLLLVGASWLLAHVLAWTYAFYDNCRRLRCFPQPPRRNWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
::: :...:::::.. ::. ::: ::: ::.::: :.. ::::: :::. :::::::::
CCDS12 WGHQGMVNPTEEGMRVLTQLVATYPQGFKVWMGPISPLLSLCHPDIIRSVINASAAIAPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
:..: ::.::::.:.:::.::::::::::::::::::::: :. :::.:.::: :::
CCDS12 DKFFYSFLEPWLGDGLLLSAGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESVNIMHAKWQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LASEGSSCLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSHCQERPSEYIATILELSALVEKRSQHIL
::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::: :: ..::
CCDS12 LASEGSACLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSEYIAAILELSALVSKRHHEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
:.::::::. ::.::.::::::::::::::.:::::::.::.:::.. :::::::::::
CCDS12 LHIDFLYYLTPDGQRFRRACRLVHDFTDAVIQERRRTLPSQGVDDFLQAKAKSKTLDFID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::.::.::::::::::::::
CCDS12 VLLLSKDEDGKKLSDEDIRAEADTFMFEGHDTTASGLSWVLYHLAKHPEYQERCRQEVQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKGITC
:::::.::::::::::.:::::::.:::::::::.: ::: :::::::::::::::: :
CCDS12 LLKDREPKEIEWDDLAHLPFLTMCMKESLRLHPPVPVISRHVTQDIVLPDGRVIPKGIIC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
::...:.::::.::::::::::::::::: : :::::::::::::::::::.::::::::
CCDS12 LISVFGTHHNPAVWPDPEVYDPFRFDPENIKERSPLAFIPFSAGPRNCIGQTFAMAEMKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE6 VLALMLLHFRFLPDHTEPRRKLELIMRAEGGLWLRVEPLNVSLQ
:::: ::.:: :::::::::: ::..:::::::::::::.
CCDS12 VLALTLLRFRVLPDHTEPRRKPELVLRAEGGLWLRVEPLS
490 500 510 520
>>CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 (520 aa)
initn: 3010 init1: 2986 opt: 2990 Z-score: 3691.7 bits: 692.7 E(32554): 2.6e-199
Smith-Waterman score: 2990; 81.3% identity (92.3% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLLSLPWLGLRPVAMSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWF
: ::: ::: :.: ::::::::: .::::::::::::.::.:: ::.:::::::::::
CCDS59 MPQLSLSSLGLWPMAASPWLLLLLVGASWLLARILAWTYTFYDNCCRLRCFPQPPKRNWF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 WGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
:::::.::::.:.. ::. ::: ::: ::.:::.: : .:::. :::. ::::::.::
CCDS59 LGHLGLVTPTEQGMRVLTQLVATYPQGFKVWMGPIFPVIRFCHPNIIRSVINASAAIVPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
:..: :::::::.:.:::.:.::::::::::::::::::: :. :::.:.::: :::
CCDS59 DKVFYSFLKPWLGDGLLLSAGEKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESVNIMHAKWQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LASEGSSCLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSHCQERPSEYIATILELSALVEKRSQHIL
::::::. ::::::::::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::: :: :.::
CCDS59 LASEGSARLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSEYIAAILELSALVTKRHQQIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
..::::::. ::.::.::::::::::::::.:::::::.::.:::.. :::::::::::
CCDS59 LYIDFLYYLTPDGQRFRRACRLVHDFTDAVIQERRRTLPSQGVDDFLQAKAKSKTLDFID
250 260 270 280 290 300
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CCDS59 VLLLSKDEDGKKLSDEDIRAEADTFMFEGHDTTASGLSWVLYHLAKHPEYQERCRQEVQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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:::::.::::::::::::::::::.:::::::::.: .:::::::::::::::::::: :
CCDS59 LLKDREPKEIEWDDLAQLPFLTMCIKESLRLHPPVPAVSRCCTQDIVLPDGRVIPKGIIC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
::...:.::::.:::::::::::::::.: : ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LISVFGTHHNPAVWPDPEVYDPFRFDPKNIKERSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
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490 500 510 520
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::.: ::.:: :::::::::: ::..:::::::::::::.
CCDS59 VLGLTLLRFRVLPDHTEPRRKPELVLRAEGGLWLRVEPLS
490 500 510 520
>>CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 (520 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:::::: :::::::: :::::::.: .:::::::::::::::.: :::.::::: :.:::
CCDS74 MSLLSLSWLGLRPVAASPWLLLLVVGASWLLARILAWTYAFYHNGRRLRCFPQPRKQNWF
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CCDS74 LGHLGLVTPTEEGLRVLTQLVATYPQGFVRWLGPITPIINLCHPDIVRSVINTSDAITDK
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: .: . ::::::.:.::: :::: .:::.::::::::::: :: ::.:::::: :::.
CCDS74 DIVFYKTLKPWLGDGLLLSVGDKWRHHRRLLTPAFHFNILKPYIKIFSKSANIMHAKWQR
130 140 150 160 170 180
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:: :::.:::.:::::::::::::::::::::.:::.:::::..:.:::::: ::.....
CCDS74 LAMEGSTCLDVFEHISLMTLDSLQKCIFSFDSNCQEKPSEYITAIMELSALVVKRNNQFF
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.. ::::.:. :::::::::::::::::::.:::::: .::.:::.. :::::::::::
CCDS74 RYKDFLYFLTPCGRRFHRACRLVHDFTDAVIQERRRTLTSQGVDDFLQAKAKSKTLDFID
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pF1KE6 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
:::::.:..:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VLLLSEDKNGKELSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
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:::::.::::::::::::::::::.::::::::: : ..: ::::.::::.:::::: .:
CCDS74 LLKDREPKEIEWDDLAQLPFLTMCLKESLRLHPPIPTFARGCTQDVVLPDSRVIPKGNVC
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:.:...::::.:::::::::::::::::.. :::.::::::::::::::: ::::::::
CCDS74 NINIFAIHHNPSVWPDPEVYDPFRFDPENAQKRSPMAFIPFSAGPRNCIGQKFAMAEMKV
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:::: ::.::.:::: :::: :...::: :::::::::
CCDS74 VLALTLLRFRILPDHREPRRTPEIVLRAEDGLWLRVEPLG
490 500 510 520
>>CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 (520 aa)
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Smith-Waterman score: 2851; 78.3% identity (90.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
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: ::: ::: :.: ::::::::: .::::::::::::.::.:: ::.:::::::::::
CCDS12 MPQLSLSSLGLWPMAASPWLLLLLVGASWLLARILAWTYTFYDNCCRLRCFPQPPKRNWF
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pF1KE6 WGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPK
:::::: .:::: . ... :... :.:: .. . :: :. . : :::.::
CCDS12 LGHLGLIHSSEEGLLYTQSLACTFGDMCCWWVGPWHAIVRIFHPTYIKPVLFAPAAIVPK
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pF1KE6 DNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQH
:..: :::::::.:.:::.:.::::::::::::::::::: :. :::.:.::: :::
CCDS12 DKVFYSFLKPWLGDGLLLSAGEKWSRHRRMLTPAFHFNILKPYMKIFNESVNIMHAKWQL
130 140 150 160 170 180
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::::::. ::::::::::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::: :: :.::
CCDS12 LASEGSARLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSFDSHCQEKPSEYIAAILELSALVTKRHQQIL
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pF1KE6 QHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLDFID
..::::::. ::.::.::::::::::::::.:::::::.::.:::.. :::::::::::
CCDS12 LYIDFLYYLTPDGQRFRRACRLVHDFTDAVIQERRRTLPSQGVDDFLQAKAKSKTLDFID
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310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQEVQE
::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::.::.::::::::::::::
CCDS12 VLLLSKDEDGKKLSDEDIRAEADTFMFEGHDTTASGLSWVLYHLAKHPEYQERCRQEVQE
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pF1KE6 LLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKGITC
:::::.::::::::::::::::::.:::::::::.: .:::::::::::::::::::: :
CCDS12 LLKDREPKEIEWDDLAQLPFLTMCIKESLRLHPPVPAVSRCCTQDIVLPDGRVIPKGIIC
370 380 390 400 410 420
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pF1KE6 LIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
::...:.::::.:::::::::::::::.: : ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LISVFGTHHNPAVWPDPEVYDPFRFDPKNIKERSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAEMKV
430 440 450 460 470 480
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::.: ::.:: :::::::::: ::..:::::::::::::.
CCDS12 VLGLTLLRFRVLPDHTEPRRKPELVLRAEGGLWLRVEPLS
490 500 510 520
>>CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 (531 aa)
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10 20 30 40 50
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. ::.: ..: :.: ::.:: :: :.: .:: .::::.:::
CCDS12 MLPITDRLLHLLGLEKTAFRIYAVSTLLLFLLFFLFRLLLRFLRLCRSFYITCRRLRCFP
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:::.:::. ::::. :.: ::.: .. .. . . ::.::..:..:: ::: :. . .
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:::::::::.:: :::::::.:.::: :::::::::.:::::::.::: :. :::.::.
CCDS12 ASAAIAPKDDLFYGFLKPWLGDGLLLSKGDKWSRHRRLLTPAFHFDILKPYMKIFNQSAD
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:: ::.::: :::. ::::::::::::::::::.::..:.:::. :.::..:.:::::
CCDS12 IMHAKWRHLA-EGSAVSLDMFEHISLMTLDSLQKCVFSYNSNCQEKMSDYISAIIELSAL
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.:. .. ...::.:: : :::::..:: .:: :: ::.::::.: :: . ..: :
CCDS12 SVRRQYRLHHYLDFIYYRSADGRRFRQACDMVHHFTTEVIQERRRALRQQGAEAWLKAK-
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..:::::::::::..::::: ::::::::::::::: :::::.::.::.:.:::..::::
CCDS12 QGKTLDFIDVLLLARDEDGKELSDEDIRAEADTFMFEGHDTTSSGISWMLFNLAKYPEYQ
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:.::.:.::..: :. .:.:::::.:::: :::.::::: .::. ..:: ::.:: ::::
CCDS12 EKCREEIQEVMKGRELEELEWDDLTQLPFTTMCIKESLRQYPPVTLVSRQCTEDIKLPDG
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:.::::: ::..: :.::::::::: .::.:.::::.: . :::::..::::::::::::
CCDS12 RIIPKGIICLVSIYGTHHNPTVWPDSKVYNPYRFDPDNPQQRSPLAYVPFSAGPRNCIGQ
420 430 440 450 460 470
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CCDS12 SFAMAELRVVVALTLLRFRLSVDRTRKVRRKPELILRTENGLWLKVEPLPPRA
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10 20 30 40 50
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: : .::::.. . : : . :: :: :
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:. .:..::. . .: :. . :. .. :: . : :: .. : . :
CCDS54 PS-HWLFGHIQELQQDQE-LQRIQKWVETFPSACPHWLWGGKVRVQLYDPDYMKVILGRS
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::.. ::: ::.: :.:: .:. : .::::::::::..::: :. .. :. .:
CCDS54 D---PKSHGSYRFLAPWIGYGLLLLNGQTWFQHRRMLTPAFHYDILKPYVGLMADSVRVM
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::::..: .. : :..:.:.::::::...:: :: .. : .: :. :: .: .:. ::
CCDS54 LDKWEELLGQDSP-LEVFQHVSLMTLDTIMKCAFSHQGSIQVDRNSQSYIQAISDLNNLV
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pF1KE6 EKRSQHILQHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAK
.: .. ... : .: :. :: ::::.:.:. :: ::. :. : .: .. : : :
CCDS54 FSRVRNAFHQNDTIYSLTSAGRWTHRACQLAHQHTDQVIQLRKAQLQKEG--ELEKIKRK
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 SKTLDFIDVLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQE
. :::.:.:::.: :.:. :::.:.:::.::::: ::::::::.::.:: :: ::..::
CCDS54 -RHLDFLDILLLAKMENGSILSDKDLRAEVDTFMFEGHDTTASGISWILYALATHPKHQE
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:::.:.. :: : : :. : :.:. :::.::.:::.::.: :.: . ...::::
CCDS54 RCREEIHSLLGD--GASITWNHLDQMPYTTMCIKEALRLYPPVPGIGRELSTPVTFPDGR
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.:::: :..: :.:::: :::.:::.::::: : ... ::.:::.: :::::.
CCDS54 SLPKGIMVLLSIYGLHHNPKVWPNPEVFDPFRFAPGSAQHSH--AFLPFSGGSRNCIGKQ
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::: :.::. :: ::.:..::: :. : .:......:. ::.. :
CCDS54 FAMNELKVATALTLLRFELLPDPTRIPIPIARLVLKSKNGIHLRLRRLPNPCEDKDQL
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MSLLSLPWLGLRPVAMSPWLL-LLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNW
.:.: ... : :.::.: : ..: .. . .. :: :: .:
CCDS41 MVPSFLSLSFSSLGLWASGLILVLGFLKLIHLLLRRQTL---AKAMDKFPGPPT-HW
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pF1KE6 FWGHLGLITPTEEGLKDSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAP
..:: : : .: .. . . . .:.: .: :. . .:: ... . . ::
CCDS41 LFGHALEIQETG-SLDKVVSWAHQFPYAHPLWFGQFIGFLNIYEPDYAKAVYSRGDPKAP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 KDNLFIRFLKPWLGEGILLSGGDKWSRHRRMLTPAFHFNILKSYITIFNKSANIMLDKWQ
... ::. :.:.:.:. : :: .::..:::.::...:: :...:..:. ::::::.
CCDS41 --DVYDFFLQ-WIGRGLLVLEGPKWLQHRKLLTPGFHYDVLKPYVAVFTESTRIMLDKWE
120 130 140 150 160
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pF1KE6 HLASEGSSCLDMFEHISLMTLDSLQKCIFSF-DSHC-QERPSEYIATILELSALVEKRSQ
. : ::.: .:.: .. :.:..:.:: :. :. . : : : .. .:. :...:
CCDS41 EKAREGKS-FDIFCDVGHMALNTLMKCTFGRGDTGLGHSRDSSYYLAVSDLTLLMQQRLV
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 HILQHMDFLYYLSHDGRRFHRACRLVHDFTDAVIRERRRTLPTQGIDDFFKDKAKSKTLD
. : ::.:.:. :::: :::...:: :: :::::. .: . . .... . ::
CCDS41 SFQYHNDFIYWLTPHGRRFLRACQVAHDHTDQVIRERKAALQDEKVRKKIQNR---RHLD
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 FIDVLLLSKDEDGKALSDEDIRAEADTFMFGGHDTTASGLSWVLYNLARHPEYQERCRQE
:.:.:: ..::: ::: :.:::.::::: :::::.::.:: :: .: .::.:.:::.:
CCDS41 FLDILLGARDEDDIKLSDADLRAEVDTFMFEGHDTTTSGISWFLYCMALYPEHQHRCREE
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 VQELLKDRDPKEIEWDDLAQLPFLTMCVKESLRLHPPAPFISRCCTQDIVLPDGRVIPKG
:.:.: :.: ..::::... .::::.:::.::.::.: . : .. ... ::: .: :
CCDS41 VREILGDQD--FFQWDDLGKMTYLTMCIKESFRLYPPVPQVYRQLSKPVTFVDGRSLPAG
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 ITCLIDIIGVHHNPTVWPDPEVYDPFRFDPENSKGRSPLAFIPFSAGPRNCIGQAFAMAE
. : ..:.: .:::::::.: .::. ::.. : :.::.:::::::::::: :::.:
CCDS41 SLISMHIYALHRNSAVWPDPEVFDSLRFSTENASKRHPFAFMPFSAGPRNCIGQQFAMSE
410 420 430 440 450 460
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pF1KE6 MKVVLALMLLHFRFLPDHTE-PRRKLELIMRAEGGLWLRVEPLNVSLQ
:::: :. ::.:.: : .. : . .:..:...:. :...::
CCDS41 MKVVTAMCLLRFEFSLDPSRLPIKMPQLVLRSKNGFHLHLKPLGPGSGK
470 480 490 500 510
>>CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 (509 aa)
initn: 1306 init1: 531 opt: 1364 Z-score: 1682.1 bits: 320.9 E(32554): 2.3e-87
Smith-Waterman score: 1383; 41.4% identity (73.2% similar) in 478 aa overlap (46-520:41-507)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 MSPWLLLLLVVGSWLLARILAWTYAFYNNCRRLQCFPQPPKRNWFWGHLGLITPTEEGLK
: :. :: :: .:: :: .: .....
CCDS54 ARPFYLAFVFCLALGLLQAIKLYLRRQRLLRDLRPFPAPPT-HWFLGHQKFIQ--DDNME
20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 DSTQMSATYSQGFTVWLGPIIPFIVLCHPDTIRSITNASAAIAPKDNLFIRFLKPWLGEG
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CCDS54 KLEEIIEKYPRAFPFWIGPFQAFFCIYDPDYAKTLLSRTD---PKSQYLQKFSPPLLGKG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]