Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6420, 507 aa
1>>>pF1KE6420 507 - 507 aa - 507 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2456+/-0.000697; mu= 19.1838+/- 0.042
mean_var=71.6687+/-15.173, 0's: 0 Z-trim(110.0): 63 B-trim: 612 in 1/49
Lambda= 0.151499
statistics sampled from 11234 (11299) to 11234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.347), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6975.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 ( 507) 3335 737.9 6.1e-213
CCDS48052.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 ( 445) 2255 501.8 6.3e-142
CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 411) 888 203.0 5.2e-52
CCDS6870.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 477) 885 202.4 9.2e-52
CCDS75903.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 314) 549 128.8 8.5e-30
CCDS11097.1 SLC2A4 gene_id:6517|Hs108|chr17 ( 509) 328 80.7 4.3e-15
CCDS66301.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 497) 323 79.6 9e-15
CCDS8585.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 520) 323 79.6 9.4e-15
CCDS66302.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 535) 323 79.6 9.6e-15
CCDS3215.1 SLC2A2 gene_id:6514|Hs108|chr3 ( 524) 319 78.7 1.7e-14
CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 ( 492) 310 76.7 6.4e-14
CCDS8586.1 SLC2A3 gene_id:6515|Hs108|chr12 ( 496) 305 75.7 1.4e-13
CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 511) 304 75.4 1.6e-13
CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 540) 304 75.5 1.7e-13
CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 501) 303 75.2 1.9e-13
CCDS66300.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 411) 289 72.1 1.3e-12
CCDS13402.1 SLC2A10 gene_id:81031|Hs108|chr20 ( 541) 271 68.2 2.5e-11
>>CCDS6975.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 (507 aa)
initn: 3335 init1: 3335 opt: 3335 Z-score: 3936.4 bits: 737.9 E(32554): 6.1e-213
Smith-Waterman score: 3335; 100.0% identity (100.0% similar) in 507 aa overlap (1-507:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPPSPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPPSPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAVPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAVPSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMAVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMAVFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWLRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWLRGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 IFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLGLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLGLYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 HFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQPLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGPITWLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQPLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGPITWLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 MSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLVFTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLVFTG
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 CCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSFLR
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 CCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSFLR
490 500
>>CCDS48052.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 (445 aa)
initn: 2255 init1: 2255 opt: 2255 Z-score: 2661.5 bits: 501.8 E(32554): 6.3e-142
Smith-Waterman score: 2797; 87.8% identity (87.8% similar) in 507 aa overlap (1-507:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPPSPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPPSPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAVPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAVPSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMAVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMAVFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWLRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWLRGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 IFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLGLYI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVS---------------
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 HFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQPLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGPITWLL
:::::::::::::
CCDS48 -----------------------------------------------GYAVGWGPITWLL
350
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 MSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLVFTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLVFTG
360 370 380 390 400 410
490 500
pF1KE6 CCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSFLR
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSFLR
420 430 440
>>CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 (411 aa)
initn: 794 init1: 709 opt: 888 Z-score: 1047.2 bits: 203.0 E(32554): 5.2e-52
Smith-Waterman score: 904; 41.0% identity (66.6% similar) in 410 aa overlap (17-422:6-394)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPP---SPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALV
::. : :: : : .:::::.:::.:: .:::.::
CCDS65 MTPEDPEETQPLLGPPGGSAPRG----RRVFLAAFAAALGPLSFGFALG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YTSPVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAV
:.::.::.:.:. : .: . :::::.: ::::::::. . : : :::::... .:
CCDS65 YSSPAIPSLQRAAPPAPRLDDAAASWFGAVVTLGAAAGGVLGGWLVDRAGRKLSLLLCSV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PSAAGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMA
: .::.:....:. .:::: :: :::.: :... :::.:::: :.::: ::. :::.
CCDS65 PFVAGFAVITAAQDVWMLLGGRLLTGLACGVASLVAPVYISEIAYPAVRGLLGSCVQLMV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VFGSLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWL
: : : : : .: :::::: : .: .:.::. :::..:::::.. : .::. :: .:
CCDS65 VVGILLAYLAGWVLEWRWLAVLGCVPPSLMLLLMCFMPETPRFLLTQHRRQEAMAALRFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RGTDVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVY
:.. :: : . :: .. : : : . .:. ... . .:::.:.. .. :
CCDS65 WGSEQG--WEDPPIGAE---QSFHL--ALLRQPGIYKPFIIGVSLMAFQQLSGVNAVMFY
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LQSIFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLG
..::. : . . ...::....: . .::: :: :::..:: .:...: .. ..:
CCDS65 AETIFEE-AKFKDSSLASVVVGVIQVLFTAVAALIMDRAGRRLLLVLSGVVMVFSTSAFG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 LYIHFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQPLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGP-I
: : .:.... . . : :::. : .: :. . . . ::: : ::
CCDS65 AY--FKLTQGGPGNSSHV-AISAPVSAQPVDASVG-LAWLAVGSMCLFIAG-----GPQA
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 TWLLMSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSL
: :..
CCDS65 LWSLLACLRFLHLQCPFHFVLCP
390 400 410
>>CCDS6870.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 (477 aa)
initn: 1150 init1: 709 opt: 885 Z-score: 1042.8 bits: 202.4 E(32554): 9.2e-52
Smith-Waterman score: 1247; 43.6% identity (70.1% similar) in 489 aa overlap (17-502:6-477)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPP---SPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALV
::. : :: : : .:::::.:::.:: .:::.::
CCDS68 MTPEDPEETQPLLGPPGGSAPRG----RRVFLAAFAAALGPLSFGFALG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YTSPVIPALERSLDPDLHLTKSQASWFGSVFTLGAAAGGLSAMILNDLLGRKLSIMFSAV
:.::.::.:.:. : .: . :::::.: ::::::::. . : : :::::... .:
CCDS68 YSSPAIPSLQRAAPPAPRLDDAAASWFGAVVTLGAAAGGVLGGWLVDRAGRKLSLLLCSV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PSAAGYALMAGAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMA
: .::.:....:. .:::: :: :::.: :... :::.:::: :.::: ::. :::.
CCDS68 PFVAGFAVITAAQDVWMLLGGRLLTGLACGVASLVAPVYISEIAYPAVRGLLGSCVQLMV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VFGSLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWL
: : : : : .: :::::: : .: .:.::. :::..:::::.. : .::. :: .:
CCDS68 VVGILLAYLAGWVLEWRWLAVLGCVPPSLMLLLMCFMPETPRFLLTQHRRQEAMAALRFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RGTDVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWAEARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVY
:.. :: : .:: .. : : : . .:. ... . .:::.:.. .. :
CCDS68 WGSEQG--WEDPPIG---AEQSFHL--ALLRQPGIYKPFIIGVSLMAFQQLSGVNAVMFY
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LQSIFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLG
..::. : . . ...::....: . .::: :: :::..:: .:...: .. ..:
CCDS68 AETIFEE-AKFKDSSLASVVVGVIQVLFTAVAALIMDRAGRRLLLVLSGVVMVFSTSAFG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 LYIHFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQPLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGPIT
: : .:.... . . : :::. : .: :. . . . ::: :.:::::::
CCDS68 AY--FKLTQGGPGNSSHV-AISAPVSAQPVDASVG-LAWLAVGSMCLFIAGFAVGWGPIP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 WLLMSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTAFVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLV
::::::..::...:::.:.:::..:: ::..:: : .. .. :.. .:.:. :..
CCDS68 WLLMSEIFPLHVKGVATGICVLTNWLMAFLVTKEFSSLMEVLRPYGAFWLASAFCIFSVL
400 410 420 430 440 450
480 490 500
pF1KE6 FTGCCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSFLR
:: :::::::..:::: . :. ::
CCDS68 FTLFCVPETKGKTLEQITAHFE-GR
460 470
>>CCDS75903.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 (314 aa)
initn: 643 init1: 370 opt: 549 Z-score: 648.5 bits: 128.8 E(32554): 8.5e-30
Smith-Waterman score: 744; 39.4% identity (68.5% similar) in 327 aa overlap (176-502:1-314)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 GGLTAACIPVYVSEIAPPGVRGALGATPQLMAVFGSLSLYALGLLLPWRWLAVAGEAPVL
:.: : : : : .: :::::: : .:
CCDS75 MVVVGILLAYLAGWVLEWRWLAVLGCVPPS
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 IMILLLSFMPNSPRFLLSRGRDEEALRALAWLRGTDVDVHWEFEQIQDNVRRQSSRVSWA
.:.::. :::..:::::.. : .::. :: .: :.. :: : .:: .. :
CCDS75 LMLLLMCFMPETPRFLLTQHRRQEAMAALRFLWGSEQG--WEDPPIGA---EQSFHL--A
40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 EARAPHVCRPITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQSIFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLS
: : . .:. ... . .:::.:.. .. : ..::. : . . ...::....:
CCDS75 LLRQPGIYKPFIIGVSLMAFQQLSGVNAVMFYAETIFEE-AKFKDSSLASVVVGVIQVLF
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 VLIAALTMDLAGRKVLLFVSAAIMFAANLTLGLYIHFGPRPLSPNSTAGLESESWGDLAQ
. .::: :: :::..:: .:...: .. ..: : : .:.... . . : ::
CCDS75 TAVAALIMDRAGRRLLLVLSGVVMVFSTSAFGAY--FKLTQGGPGNSSHV-AISAPVSAQ
150 160 170 180 190
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 PLAAPAGYLTLVPLLATMLFIMGYAVGWGPITWLLMSEVLPLRARGVASGLCVLASWLTA
:. : .: :. . . . ::: :.::::::: ::::::..::...:::.:.:::..:: :
CCDS75 PVDASVG-LAWLAVGSMCLFIAGFAVGWGPIPWLLMSEIFPLHVKGVATGICVLTNWLMA
200 210 220 230 240 250
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 FVLTKSFLPVVSTFGLQVPFFFFAAICLVSLVFTGCCVPETKGRSLEQIESFFRTGRRSF
:..:: : .. .. :.. .:.:. :..:: :::::::..:::: . :. ::
CCDS75 FLVTKEFSSLMEVLRPYGAFWLASAFCIFSVLFTLFCVPETKGKTLEQITAHFE-GR
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 LR
>>CCDS11097.1 SLC2A4 gene_id:6517|Hs108|chr17 (509 aa)
initn: 362 init1: 180 opt: 328 Z-score: 384.4 bits: 80.7 E(32554): 4.3e-15
Smith-Waterman score: 579; 29.3% identity (58.6% similar) in 505 aa overlap (24-500:15-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQEPLLGAEGPDYDTFPEKPPPSPGDRARVGTLQNKRVFLATFAAVLGNFSFGYALVYTS
: .. .::: ::.:.::::...::: . .
CCDS11 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTL-----VLAVFSAVLGSLQFGYNIGVIN
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KE6 PVIPALERSLD--------PDLHLTKSQAS----WFGSV--FTLGAAAGGLSAMILNDLL
..:.: . :. . .. : :: :..:. ... :... :
CCDS11 APQKVIEQSYNETWLGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 GRKLSIMFSAVPSAAGYALMA---GAHGLWMLLLGRTLTGFAGGLTAACIPVYVSEIAPP
::: ... . : .. : .::. .: . ::.::: : : .:::.. .:.::.::::
CCDS11 GRKRAMLVNNVLAVLGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KE6 GVRGALGATPQLMAVFGSLSLYALGL--LLP----WRWLAVAGEAPVLIMILLLSFMPNS
.:::::. :: :.: : .::: :: : : :.:....:: : :.:
CCDS11 HLRGALGTLNQLAIVIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPES
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 PRFL-LSRGRDEEALRALAWLRGTDVDVHWEFEQIQDNVRR-QSSR-VSWAEARAPHVCR
::.: . .. . : ..: : : .:: . ...:. :. . : .: . . .. :
CCDS11 PRYLYIIQNLEGPARKSLKRLTGW-ADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 -PITVALLMRLLQQLTGITPILVYLQSIFDSTAVLLPPKDDAAIVGAVRLLSVLIAALTM
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CCDS11 QPLIIAVVLQLSQQLSGINAVFYYSTSIFETAGVGQPAYATIG-AGVVNTVFTLVSVLLV
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340 350 360 370 380 390
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. :::..: ... : : . . . . . . : .::
CCDS11 ERAGRRTLHLLGLAGMCGCAILMTVALLLLER-----------------------VPA--
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CCDS11 MSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAMAVAGFSNWTSNFIIGMGFQ
380 390 400 410 420 430
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CCDS11 YVAEAMGPYV-FLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTFDQISAAFHRTPSLLEQEVKPST
440 450 460 470 480 490
CCDS11 ELEYLGPDEND
500
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...: .:..:.:.::: : ..: .:
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....: . :.. : :: :..:. :..:. .. . .::. :... .
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:.: : : : ::. :: ......:. : : ..:. : :. .:: ......:
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. . : : ..: :..: : : :. ..: . :
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..:. . .: ::: :....:.. : .: .. ..: . :.. : .. .:
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: :..:... .. :.:: ::::.::..:.: :
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CCDS66 KETTTNV
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10 20 30 40 50 60
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....: . :.. : :: :..:. :..:. .. . .::. :... .
CCDS85 EFINKTLTDKANAPPSEVLLTNLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLIVNL
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: :.: : ....: :.: . : .. : . :.... : :.:::::: .: ..
CCDS85 LGIVIGILVAQIFGLELILGSEELWPVLLGFTILPAILQSAALPCCPESPRFLLINRKKE
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230 240 250 260 270 280
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:.: : : : ::. :: ......:. : : ..:. : :. .:: ......:
CCDS85 ENATRILQRLWGTQ-DVSQDIQEMKDESARMSQEKQVTVLELFRVSSYRQPIIISIVLQL
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. . : : ..: :..: : : :. ..: . :
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..:. . .: ::: :....:.. : .: .. ..: . :.. : .. .:
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CCDS85 V-FIIFTGFLITFLAFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQAHGADRSGKDGVMGMNSIEPA
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CCDS85 KETTTNV
520
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..::.: ..:::.:. :: :.: : ....: :.: . : .. : . :....
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CCDS32 IKAMLVANILSLVG-ALLMGFSKLGPSHILIIAGRSISGLYCGLISGLVPMYIGEIAPTA
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CCDS32 RYLYIK-LDEEVKAKQSLKRLRGYD-DVTKDINEMRKEREEASSEQKVSIIQLFTNSSYR
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CCDS32 QPILVALMLHVAQQFSGINGIFYYSTSIFQTAGISKPVYATIG-VGAVNMVFTAVSVFLV
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CCDS32 EKAGRRSLFLIGMSGMFVCAIFMSVGLVL--------------LNKFSW-----------
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CCDS32 VEMKFLGATETV
520
507 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Tue Nov 8 13:07:11 2016 done: Tue Nov 8 13:07:12 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]