Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6414, 478 aa
1>>>pF1KE6414 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6232+/-0.000734; mu= 17.3968+/- 0.045
mean_var=77.5769+/-15.423, 0's: 0 Z-trim(110.0): 31 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.145616
statistics sampled from 11271 (11301) to 11271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.347), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 ( 478) 3148 670.5 1e-192
CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 ( 504) 1364 295.8 7.2e-80
CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 ( 500) 1012 221.8 1.3e-57
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 ( 505) 1005 220.4 3.6e-57
CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 ( 516) 916 201.7 1.6e-51
CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 ( 465) 811 179.6 6.3e-45
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 ( 471) 564 127.7 2.7e-29
CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 ( 426) 557 126.2 6.8e-29
CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 ( 523) 486 111.3 2.5e-24
CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 ( 510) 462 106.3 8e-23
CCDS55623.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 439) 452 104.2 3e-22
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 ( 509) 434 100.4 4.7e-21
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs108|chr6 ( 515) 412 95.8 1.2e-19
CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 487) 411 95.6 1.3e-19
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs108|chrX ( 539) 363 85.5 1.5e-16
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 319) 353 83.3 4.3e-16
CCDS55622.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 425) 322 76.8 4.9e-14
>>CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 (478 aa)
initn: 3148 init1: 3148 opt: 3148 Z-score: 3573.2 bits: 670.5 E(32554): 1e-192
Smith-Waterman score: 3148; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
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CCDS89 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLDFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLFE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 LLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
430 440 450 460 470
>>CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 (504 aa)
initn: 1356 init1: 833 opt: 1364 Z-score: 1547.4 bits: 295.8 E(32554): 7.2e-80
Smith-Waterman score: 1364; 46.8% identity (76.2% similar) in 425 aa overlap (13-430:12-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
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CCDS13 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
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CCDS13 VSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
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CCDS13 GLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 LGSLLLNACVAGSLMRPL-GP------NQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKV
::.:::. :. :..::: :: ... ... . :..: :.. ... . .
CCDS13 LGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVD
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CCDS13 RRLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGS
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CCDS13 IVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAI
:... ::.:: :::::: ::.::: .:: . ::.::: ::.:::. .:. ... :.
CCDS13 VGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSE
:. :.:.. ... :
CCDS13 VALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEAL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 (500 aa)
initn: 1907 init1: 1002 opt: 1012 Z-score: 1147.8 bits: 221.8 E(32554): 1.3e-57
Smith-Waterman score: 1931; 61.5% identity (83.7% similar) in 465 aa overlap (1-449:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
::: ..: . :::::::: :: .:::::::::::::..:::::::. :::.: ::..:
CCDS85 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEVSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
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CCDS85 ISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGVIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
::::::::.::::.::::::..::.::::::::::::: .:::.:: .:. :::.:::::
CCDS85 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSFLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KE6 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTS---KSK---NKTGKT---ED--DSSPKKI-----K
::.:::: ::::.::::.::. : . ::: .:.::. .: :.. : .
CCDS85 LGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPKQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 TKKSTWEKVNKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAF
:.:... .:..::..:: :::::.:::::::::.:.:::..::. :.:.: . ..::
CCDS85 EKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSAF
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 LLSVMAFVDMFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYA
:::..::::: ::::.::.::.: :::::::::. ... :::::.: ::. :... .::
CCDS85 LLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCVYA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 VFFGLGFGSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYK
:::..:: .::::::::::::: :::::::::::::: :::::::: :.: :. :.::
CCDS85 GFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 YMYMSCGAIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKV
: : .::.... ....:.:: .:::::::::.: .. .....: :
CCDS85 YTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTKA
430 440 450 460 470 480
470
pF1KE6 SNAQSVTSERETNI
CCDS85 AESPDQKDTDGGPKEEESPV
490 500
>>CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 (505 aa)
initn: 950 init1: 588 opt: 1005 Z-score: 1139.8 bits: 220.4 E(32554): 3.6e-57
Smith-Waterman score: 1005; 34.0% identity (70.2% similar) in 450 aa overlap (8-455:2-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
: . ::.:.:.:. :.... :.. .:: . .:: :.: :... :: .:
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTELQWEFQASNSETSW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
. ::. ::.. .::. :.::...: : .:. ::.: :::: .::: .. :::.: ::::
CCDS11 FPSILTAVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFSHNLSQLYFTAGFIT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
:::. :..: ..:..: :: :.: .::.:: : . .. ...::....::.:.::.
CCDS11 GLGMCFSFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGITLWPLLSRYLLENLGWRGTFLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLDFS
.:...:. :. :...::.. :. ..: .: . . . ....: :.
CCDS11 FGGIFLHCCICGAIIRPVA---TSVAPETKECPPPPPETPA-LGCLAACGRTIQRHLAFD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 LFKHR-GFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPS
...: :. .:. : . ::: : .::.::: ...:: .::.:.:...: ..: ::
CCDS11 ILRHNTGYCVYILGVMWSVLGFPLPQVFLVPYAMWHSVDEQQAALLISIIGFSNIFLRPL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 VGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLF
.::.:. . . .:.::.:...::. .:.: . :. :: : . ............:
CCDS11 AGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVGYCLAYSVSMSGIGALIF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 ETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYM-YMSCGAIVVAAS
..:::.: .: :.:: :... :..::::: :.: :....:. ::: .. ::
CCDS11 QVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDATNNFSYVFYMSSFFLISAA-
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
:..:... : : ::. .. . . : . . ..:
CCDS11 --LFMGGSF-YALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPGKQRSPEIMCQSSRQPRPAG
410 420 430 440 450 460
CCDS11 VNKHLWGCPASSRTSHEWLLWPKAVLQAKQTALGWNSPT
470 480 490 500
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 (516 aa)
initn: 876 init1: 578 opt: 916 Z-score: 1038.6 bits: 201.7 E(32554): 1.6e-51
Smith-Waterman score: 916; 33.3% identity (65.8% similar) in 447 aa overlap (13-450:42-480)
10 20 30 40
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTV
::::::::..:.. :. . : . ...
CCDS74 SKIITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISI
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FFKEIQQIFHTTYSEIAWISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVL
:: :.: : :.. ::: ::. : . .:..::. :. . . .. :::: :..:
CCDS74 FFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLIL
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 ASFSSSVVQLYLTMGFITGLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLA
.::..:. .::::.: .::::.:. .::....:::: :.. .: :.::.:: . ::
CCDS74 SSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILA
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE6 PFNQYLFNTFGWKGSFLILGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQT-TSKSKNKTGKTEDDS---
: : :.. :.:.:..::::...:: :: :.::::. .. :. .:.. .:. ..
CCDS74 PVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKR
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 -SPKKIKTKKSTWEKVNK----YLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAK
:: . ::. : .. ..:.. :.. . ..: : ...:.:::
CCDS74 VSPYSSLTKE--WAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYAL
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPL
. :... .::::.:... .:... . : ... . .. . ::. ..:.:.: :.
CCDS74 SVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLA
:. :: .. :: :. ... . ..::. .:::.:.: ... : :..::.:
CCDS74 LQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 GKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSK
:.::: :: : .. :: .. .:: :.: : ::. . :: . . ..::.:
CCDS74 GRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSV--LLGFA---RLIKRMRKTQ-LQFIAKESDPKLQ
430 440 450 460 470 480
460 470
pF1KE6 SKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
CCDS74 LWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
490 500 510
>>CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 (465 aa)
initn: 1409 init1: 811 opt: 811 Z-score: 920.1 bits: 179.6 E(32554): 6.3e-45
Smith-Waterman score: 1378; 47.1% identity (72.4% similar) in 450 aa overlap (14-463:16-441)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEI
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CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKAPDGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKELIQEFGIGYSDT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 AWISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGF
::::::.::..:. ::. :: ::..: :::...:::. :::: ::: :..:.::: :
CCDS11 AWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFCRSIIQVYLTTGV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ITGLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSF
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CCDS11 ITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQLLQDRYGWRGGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LILGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLD
::::.:::: :: ..::::: . .. :.: . . . ::
CCDS11 LILGGLLLNCCVCAALMRPL------------VVTAQPGSGPPRPSRR---------LLD
190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARP
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CCDS11 LSVFRDRGFVLYAVAASVMVLGLFVPPVFVVSYAKDLGVPDTKAAFLLTILGFIDIFARP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVL
..:..:. .:: :.:::...:::. : : :: .::.. .:::...: :...
CCDS11 AAGFVAGLGKVRPYSVYLFSFSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVVFCIFFGISYGMVGALQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAAS
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CCDS11 FEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHVYMYVFILAGAEVLTSS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
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CCDS11 LILLLGNFFCIRKKPKEPQPEVA---AAEEEKLHKPPADSGVDLREVEHFLKAEPEKNGE
400 410 420 430 440 450
CCDS11 VVHTPETSV
460
>>CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 (471 aa)
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10 20 30
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAF
: :.:..: :::::::.:..::: :.::..
CCDS11 MPAPQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGP-----PDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGL
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAWISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLC
... . : .. . : . .. ::::.. :::. :..::.:.: ...:.::::..::.:
CCDS11 LRSLGLAFPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASPVGSALSTRWGARPVVMVGGVLA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 CLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFITGLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPV
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CCDS11 SLGFVFSAFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 FLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLILGSLLLNACVAGSLMRPLG-PNQTTSKSKNKTGKTE
::: : :..::::.:..:.::.. :. :.:. :: :.
CCDS11 SSLLLAPALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPLVLPG--------------
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 DDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQ
: .: . : .::: .:.: :. :.... :.:.: . :::.: :.
CCDS11 DPPAPPRSPLAA---------LGLSLFTRRAFSIFALGTALVGGGYFVPYVHLAPHALDR
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 GIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSVGLIANSKYIR-PRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLA
:. :.::....: :. : :: : .:.. .. ::. :. .. : :..
CCDS11 GLGGYGAALVVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVPLPRLLAVFGALTGLGLWVVGLVPVV
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 QDYTS----LVLYAVFFGLGFGSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGP
: :. :: .::. :: . ..: .: :::. .:.::: .. ::::
CCDS11 GGEESWGGPLLAAAVAYGLSAGSYAPLVFGVLPGLVGVGGVVQATGLVMMLMSLGGLLGP
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 PLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEP
::.: : : ::.. .. :......: .. ::
CCDS11 PLSGFLRDETGDFTASFLLSGSLILSGS-FIYIGLPRALPSCGPASPPATPPPETGELLP
400 410 420 430 440 450
460 470
pF1KE6 LSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
CCDS11 APQAVLLSPGGPGSTLDTTC
460 470
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Smith-Waterman score: 817; 34.9% identity (66.3% similar) in 410 aa overlap (13-422:7-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
::::::::.:: .::.. .. .. .. ::: :. :. ....:
CCDS11 MARRTEPPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEEQAARVSW
10 20 30 40 50
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pF1KE6 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
:.:: .::. :.::.:.: .:.: ::::..::.: :::.::::..:...:::..:...
CCDS11 IASIGIAVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
: : :... :.:. .. :: :.: .:.:::..: . ..::: :.:.. ..:.::.:.
CCDS11 GSGWALTFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFFQWLLSHYAWRGSLLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKVNKYLDFS
...: :. . :.:.:: :. . . . .: .:. : :
CCDS11 VSALSLHLVACGALLRP--PSLAEDPA---VG------GPRAQLT--------------S
180 190 200
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pF1KE6 LFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSV
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CCDS11 LLHHGPFLRYTVALTLINTGYFIPYLHLVAHLQDLDWDPLPAAFLLSVVAISDLVGRVVS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLFE
: .... . . .. . ..:: : :.:: :.:: :: .:. :... . :
CCDS11 GWLGDA--VPGPVTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVALAVAYGFTSGALAPLAFS
270 280 290 300 310 320
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pF1KE6 TLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVW
.: .:.:. :. ..::. ..: ::::::.: : :.::.: .. ::.....:
CCDS11 VLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNYTASFVVAGAFLLSGSGI
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KE6 LLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
::
CCDS11 LLTLPHFFCFSTTTSGPQDLVTEALDTKVPLPKEGLEED
390 400 410 420
>>CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 (523 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTY
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CCDS11 MTQNKLKLCSKANVYTEVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKTFGVFFNDLMDSFNESN
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 SEIAWISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLT
:.:.:: :: . :. ..:...:: :..: : ::. :::: ::: ::::. : ..:..
CCDS11 SRISWIISICVFVLTFSAPLATVLSNRFGHRLVVMLGGLLVSTGMVAASFSQEVSHMYVA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 MGFITGLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWK
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CCDS11 IGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFGKRRSIVTAVASTGECFAVFAFAPAIMALKERIGWR
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 GSFLILGSLLLNACVAGSLMRPL---GPN------QTTSKS-----KNKTGKTEDDS---
:.:..: : :: . :.:.::. :: : . : .:. .: ::
CCDS11 YSLLFVGLLQLNIVIFGALLRPIFIRGPASPKIVIQENRKEAQYMLENEKTRTSIDSIDS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KE6 ------SPKKI-------------------KTKKSTWEKVNKYLDFSLFKHRGFLIYLSG
:::.. ::. :: ::::..:...:. :
CCDS11 GVELTTSPKNVPTHTNLELEPKADMQQVLVKTSPRPSEKKAPLLDFSILKEKSFICYALF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 NVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVDMFARPSVGLIANSKYIRPRI
... :::::: ... : . . :::. ::::::.::....:.: ..:.. : . :: .:
CCDS11 GLFATLGFFAPSLYIIPLGISLGIDQDRAAFLLSTMAIAEVFGRIGAGFVLNREPIR-KI
310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 QYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGSVSSVLFETLM--DLVGAPRF
:. . ... : . .: .. .:. ..:::. :..... . : :.:: ..
CCDS11 -YIELICVILLTVSLFAFTFATEFWGLMSCSIFFGFMVGTIGGTHIPLLAEDDVVGIEKM
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380 390 400 410 420 430
pF1KE6 SSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAIVVAASVWLLIGNAINYRL
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CCDS11 SSAAGVYIFIQSIAGLAGPPLAGLLVDQSKIYSRAFYSCAAGMALAAVCLALVRPCKMGL
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440 450 460 470
pF1KE6 LAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSERETNI
CCDS11 CQHHHSGETKVVSHRGKTLQDIPEDFLEMDLAKNEHRVHVQMEPV
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Smith-Waterman score: 629; 27.2% identity (57.8% similar) in 486 aa overlap (11-438:25-503)
10 20 30 40
pF1KE6 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKE
:: ::::.:..: ..:. . .. :. :. :
CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
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pF1KE6 IQQIFHTTYSEIAWISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFS
. :: . . ::.::. ... :: ....: : : ..: :::. :: ::....
CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
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pF1KE6 SSVVQLYLTMGFITGLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQ
..: :..:.: .::: .. ::....:.:: ..: .:.::. .:. .. . .
CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200
pF1KE6 YLFNTFGWKGSFLILGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTS------------------KSK
:: .::....:: :.. :: :: :.:::::.:... . ::
CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
190 200 210 220 230 240
210 220 230
pF1KE6 NKTGKTEDDSS----------------PKKIKTKKS----------TW--EKVNK-YLDF
.. :.::. .. : . .:. .: .: : . :.
CCDS24 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 --------SLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAF-LLSVMA
::: .: :. .. .. . .: :.: : .. ...: . .: : :..:
CCDS24 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
310 320 330 340 350 360
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pF1KE6 FVDMFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGL-
.: .:.. .:.::. : . : .: . . .. :: . :..:.. ...:.
CCDS24 IVHIFGKVILGVIADLPCIS--VWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVICALIGFS
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pF1KE6 -GFGSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYM
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CCDS24 SGYFSLMPVVTE---DLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFY
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pF1KE6 SCGAIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQ
:: . . . ..::: : :.. . :..
CCDS24 ICGLLYMIGILFLLIQPCI--RIIEQSRRKYMDGAHV
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478 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:02:55 2016 done: Tue Nov 8 13:02:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]