Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6412, 602 aa
1>>>pF1KE6412 602 - 602 aa - 602 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5030+/-0.00092; mu= 24.1798+/- 0.055
mean_var=71.9916+/-14.788, 0's: 0 Z-trim(105.7): 39 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.151159
statistics sampled from 8529 (8565) to 8529 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 4191 923.6 0
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 3088 683.0 2.5e-196
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 2994 662.6 4.2e-190
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 2961 655.4 6.2e-188
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 2602 577.1 2.3e-164
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 2602 577.2 2.5e-164
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 2271 504.9 1.2e-142
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 2163 481.4 1.5e-135
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1974 440.1 3.4e-123
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1832 409.2 8.2e-114
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1766 394.8 1.7e-109
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1766 394.8 1.7e-109
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1739 388.9 1e-107
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1733 387.6 2.6e-107
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1408 316.6 4.8e-86
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1306 294.6 3.2e-79
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1240 280.1 5.9e-75
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1240 280.1 6.1e-75
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1240 280.2 6.4e-75
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1146 259.6 8.9e-69
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 887 202.6 4.1e-52
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 777 178.6 6.7e-45
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 710 164.5 3.4e-40
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 556 130.9 4.5e-30
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 548 129.2 1.6e-29
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 540 127.5 5.3e-29
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 509 120.8 6.3e-27
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 478 113.6 3.7e-25
CCDS58198.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 97) 473 112.0 3.7e-25
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 480 114.4 4.6e-25
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 480 114.4 5.1e-25
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 376 91.8 3.4e-18
>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (602 aa)
initn: 4191 init1: 4191 opt: 4191 Z-score: 4937.4 bits: 923.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4191; 100.0% identity (100.0% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 PYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 SMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLTELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLTELES
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 HC
::
CCDS85 HC
>>CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (510 aa)
initn: 3532 init1: 3081 opt: 3088 Z-score: 3638.3 bits: 683.0 E(32554): 2.5e-196
Smith-Waterman score: 3352; 84.7% identity (84.7% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
:::::::
CCDS53 LCYKNGG-----------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT
:::::::::::::::::::::
CCDS53 ---------------------------------------EHCMEFQKTNGSLNGTSENAT
70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATF
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFI
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLI
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNI
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 EDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALS
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 SMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLTELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRLTELES
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 HC
::
CCDS53 HC
510
>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa)
initn: 2990 init1: 2192 opt: 2994 Z-score: 3526.5 bits: 662.6 E(32554): 4.2e-190
Smith-Waterman score: 2994; 71.5% identity (87.4% similar) in 589 aa overlap (21-601:25-613)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
.....:: . .::.:.::::::::::::::::::::
CCDS85 MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGY
::::::::::::::::::..:.:.::::::.::.:::::::::.:::::::::.:.:::
CCDS85 RFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTS
:: .: :::::::.::::::::::::: .::: : . :::::: .: . .:. . :
CCDS85 ASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 -ENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
:: ::::.:::::::: :..::. ::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLG
:::::::::::.::::::::::: ::: .:: :.: :: ::::::::::::::::::: :
CCDS85 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 CLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNR
::::::.:.::.:.:.: ::.: ::.:...::::::::::: :::: .::.:. .::..:
CCDS85 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 REVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKR
::.::: ..:. .:.::...::::::.::::::::.::.::::...:: .:..::::: :
CCDS85 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 FYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGW
::::::::::::::::.: ::::::..: ::::::: ::::: ::. :.:: :: ..::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KE6 LLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQ--RNP-----AGPSAPATP
.::::::::.: . . : .::::.:.:::. : .::: ..: :: . .:
CCDS85 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
550 560 570 580 590 600
590 600
pF1KE6 RTSLLRLTELESHC
: : :.:
CCDS85 TREGLIAGEKETHL
610
>>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 (632 aa)
initn: 2976 init1: 2148 opt: 2961 Z-score: 3487.5 bits: 655.4 E(32554): 6.2e-188
Smith-Waterman score: 2961; 70.8% identity (88.4% similar) in 579 aa overlap (7-583:27-603)
10 20 30 40
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKME
: .:.: . .: . :.. .. ::::::::.:
CCDS26 MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRV--KRDKAVHERGHWNNKVE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGG
::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.. ::::::.:::::::.::.::
CCDS26 FVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 VTAWRKICPIFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTE
.: :::.::.:::::::.:.: :::::::.::::.::: . :: .:::. : ::::::
CCDS26 ITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE6 HCMEFQKTNGSLNG--TSENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVI
.:.:::: : : . . .::::::.::::.::: :::::.:.: :::::::::: ::.:
CCDS26 NCVEFQKLNVSNYSHVSLQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 CYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQV
::::::::.:::::::: ::::::.::..:::::::::::..::.:::::.:.:: ::::
CCDS26 CYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 WMDAGTQIFFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGF
:.:::::::::.::::::::::::::.:.:::::::: :: :::::::::::::::.:::
CCDS26 WVDAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGF
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 MSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESL
:. ::::::.:::::::::::::::.::.:.:.::::: ::.:...:::::::::::::
CCDS26 MAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 VTALVDMYPHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLF
:::.:::::.:::. :::.:::..::.:...::.::::::::.::::: ::::::::::
CCDS26 VTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 VAIFESLCVAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPL
::::: .:..::::..:::::::::::::: :::.::...::..:.. :.: :::: ::
CCDS26 VAIFECICIGWVYGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE6 TYNKKYTYPWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRN
::. :::: :: ..:::.:::::.::: : . .: . :....: :. :: .:.
CCDS26 KYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRG
540 550 560 570 580 590
580 590 600
pF1KE6 PAGPSAPATPRTSLLRLTELESHC
: :
CCDS26 KLGVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
600 610 620 630
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
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10 20 30 40
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEI
: :.. . : : . : .: .:..:..::::::: .
CCDS33 MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRP--EDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 IGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICP
.::::::::::::::::::::.:::..::: :.:::.:: .:::::.::.: :.::::
CCDS33 VGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCME-FQKT
.: :::::: .:: :::::::..:::: .:::.:: .:::. : : ::: :::: ..
CCDS33 LFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 NGS--LNGTSENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKG
: : .. .: : :::::::::: ::..: ::.: :.:.:.:::::::.:..:.::::::
CCDS33 NKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQI
:.:::::::::::::. ::.:::.::.:::::. ::.:::::..::: :::::.::::::
CCDS33 VRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 FFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVP
:::.::::: .:.:::::::. : ::::. : ::::::::.:::::::::::.:::::
CCDS33 FFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 ISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMY
:..::::::::::::::.::.:.:. .:. ::.:..::::::::: ::. .:.:::.:
CCDS33 IADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 PHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLC
: .:: :::..: : .:.:.:: :.::::::::::::::::::.:::.::.:: .
CCDS33 PSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 VAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTY
.::.::. .::.::::::::: : .:: : .::..:.. :.:::.::.:::::: :.:
CCDS33 IAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVY
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 PWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPA
: :. .::: ::::::.:.: . :: .::: :.. :. : : :.: : :
CCDS33 PNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPRE--PNRW-AVEREGA
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KE6 TPRTSLLRLTELESHC
:: .:
CCDS33 TPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
600 610 620
>>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (721 aa)
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Smith-Waterman score: 2602; 63.2% identity (82.6% similar) in 585 aa overlap (10-591:122-701)
10 20 30
pF1KE6 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKM
: :.. . : : . : .: .:..:.
CCDS77 ALLRSSQTKEMATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRP--EDEAEGKPPQREKWSSKI
100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 EFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQG
.::::::: ..::::::::::::::::::::.:::..::: :.:::.:: .:::::.:
CCDS77 DFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEG
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GVTAWRKICPIFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNT
:.: :.::::.: :::::: .:: :::::::..:::: .:::.:: .:::. : : :::
CCDS77 GITCWEKICPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNT
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 EHCME-FQKTNGS--LNGTSENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAW
:::: .. : : .. .: : :::::::::: ::..: ::.: :.:.:.:::::::.:
CCDS77 PHCMEDTMRKNKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVW
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDP
..:.:::::::.:::::::::::::. ::.:::.::.:::::. ::.:::::..::: ::
CCDS77 LVCFFCIWKGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDP
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 QVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSIL
:::.:::::::::.::::: .:.:::::::. : ::::. : ::::::::.::::::::
CCDS77 QVWIDAGTQIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSIL
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 GFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVE
:::.::::: :..::::::::::::::.::.:.:. .:. ::.:..::::::::: ::
CCDS77 GFMAQEQGVDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVE
450 460 470 480 490 500
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pF1KE6 SLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCL
. .:.:::.:: .:: :::..: : .:.:.:: :.::::::::::::::::::.::
CCDS77 GQITSLVDLYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCL
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 LFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYT
:.::.:: . .::.::. .::.::::::::: : .:: : .::..:.. :.:::.::.
CCDS77 LWVAFFECFVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYV
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
pF1KE6 PLTYNKKYTYPWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQ
:::::: :.:: :. .::: ::::::.:.: . :: .::: :.. :. : : :.
CCDS77 PLTYNKTYVYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPRE--PN
630 640 650 660 670 680
580 590 600
pF1KE6 RNPAGPSAPATPRTSLLRLTELESHC
: : ::: .:
CCDS77 RW-AVEREGATPYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
690 700 710 720
>>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (635 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 DSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYL
: :. .:.:..: .: .:::::::::::
CCDS14 LIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPYL
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 CYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQMI
:::::::.:.:::... .. :::.:.:: .:::. . :....: .:::.:.:.::::..:
CCDS14 CYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVW-NICPLFKGLGYASMVI
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT-
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CCDS14 VFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTC
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KE6 -------SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKV
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CCDS14 DQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKI
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 VYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAIC
:::::::::..:::::.::: :::: .:: .:: :. ..: .::::.:::::::::.::
CCDS14 VYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIG
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAES
:: ::::::::...::::.: : : ..:::::: :::..:::::::. :::: ::.::::
CCDS14 LGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAES
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKK
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CCDS14 GPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFR
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 NRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGA
.::. . .. :.. : :.:.::::::::::::.::: ::. :..: . :::::::
CCDS14 FQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYGA
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 KRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDAL
::.:.: :::::: : .:.:: :.:: :: . :.:... : ::.::. :.:::::.:.
CCDS14 DRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEAM
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTL---KGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRT
:: .:::::.:.: :. :: : :: . :: ..: : : . . . .: . :
CCDS14 GWAFALSSMLCVP---LHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGLT
570 580 590 600 610
600
pF1KE6 SLLRLTELESHC
.: ..:
CCDS14 TLTPVSESSKVVVVESVM
620 630
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10 20 30 40
pF1KE6 MDSRVS-GTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAG
....:: . ..: . : . ..:: : .: :.....:..: .:
CCDS26 MATNGSKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLP-DRDTWKGRFDFLMSCVG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 EIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKI
::::::::::::: :::::::.:::.. :. :.:.:::: .:::::: ::. .: :.
CCDS26 YAIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 CPIFEGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQK
:.:.:.: :. .. . ::.:::....::..::..::: ::: : . :::..:.
CCDS26 APMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRCF----
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 TNGSLNGTSENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGV
.: :. .:. : :: :.::::: . ...::... : .:: ::. : .::.. ::::::::
CCDS26 SNYSMVNTT-NMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 KSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIF
:::::::.::.::.::..:..:::::::: .:: ::. ::. .: : .::.::.::::
CCDS26 GWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 FSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPI
::... :: : ::::::..::: ::: : .: .:: ::. :::.::::.:::.. :
CCDS26 FSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYP
..:: :::::::.:::.::..::.::::: :: :...::.:::: ::...::::: ::
CCDS26 ADVAASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 HVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCV
...: ::::..: .: ..:.:.:: .:.::.:::.:::::.:::: :::...:: . .
CCDS26 RLLR--NRRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 AWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYP
.: ::..::::::..:.: :: : :: :.:: . ...:.:: ...::::... :..:
CCDS26 SWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTPLTMGN-YVFP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 WWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDL--PQRNPAGPSAP
::...:::.:::::: ::.. : . :::: ...::. .. :.::. :. .: :.:
CCDS26 KWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAG
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KE6 ATPRTSLLRLTELESHC
..
CCDS26 SSTSKEAYI
>>CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 1989 init1: 1703 opt: 1974 Z-score: 2325.2 bits: 440.1 E(32554): 3.4e-123
Smith-Waterman score: 1974; 55.9% identity (78.0% similar) in 510 aa overlap (99-597:4-509)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQMIVILLNVY
:....: .:::.:.:.::::..::. :.:
CCDS48 MKAGSINVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTY
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTSENAT--------
::.::::...:: .::: :::. : : ::: :.:. . . :.. : :
CCDS48 YIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCDQLADRR
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATF
:::::::: .::..: :.. ::: ::..:::: ::. :::.:::::::::.:::::::
CCDS48 SPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTATF
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLGCLTAL
::..:::::.::: :::: .:: .:: :. ..: .::::.:::::::::.:: :: ::::
CCDS48 PYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTAL
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFI
::::...::::.: : : ..:::::: :::..:::::::. :::: ::.:::::::::::
CCDS48 GSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAFI
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNRREVLI
::::::...: .:::: ::::..::::::::: ::...:.:.:. : . . .::. .
CCDS48 AYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREISV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 LGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKRFYDNI
.. :.. : :.:.::::::::::::.::: ::. :..: . ::::::: ::.:.:
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