Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6409
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6409, 471 aa
1>>>pF1KE6409 471 - 471 aa - 471 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9941+/-0.00107; mu= 13.7120+/- 0.063
mean_var=68.0997+/-13.844, 0's: 0 Z-trim(103.3): 20 B-trim: 368 in 1/48
Lambda= 0.155418
statistics sampled from 7339 (7349) to 7339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 ( 535) 3182 722.9 2e-208
CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 532) 2011 460.3 2.2e-129
CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 533) 1995 456.7 2.7e-128
CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 ( 532) 1990 455.6 5.8e-128
CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 464) 1832 420.2 2.3e-117
CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 ( 558) 1832 420.2 2.8e-117
CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 469) 1462 337.2 2.2e-92
CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 285) 1271 294.3 1.1e-79
>>CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 (535 aa)
initn: 3182 init1: 3182 opt: 3182 Z-score: 3855.3 bits: 722.9 E(32554): 2e-208
Smith-Waterman score: 3182; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSYQYRLVGPGQ
430 440 450 460 470 480
CCDS12 WEGARNAIFTQKQRILKPLKTRALKDSSNFSVSFLLKILGLLAVVVAFFCQLQWS
490 500 510 520 530
>>CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 2082 init1: 2011 opt: 2011 Z-score: 2436.3 bits: 460.3 E(32554): 2.2e-129
Smith-Waterman score: 2011; 58.4% identity (84.7% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
:::.::..::::::: :.:::..::::::::::..:.::.::: :.::.::::.:.:::.
CCDS12 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
:. :::::.::::.:::.::.. ::..:::....:..:::::.:::.: : :: :: : .
CCDS12 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
::::.:::. . :..::.:::::::.: :..:: ::::.. :::::::::::::::
CCDS12 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
:. ::.:::::::::.::::: :. : .::.:: : ::.::: ..::::: :: :::.
CCDS12 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
.:::: :: : :..:...: :.:: :::: :... .:: ::::..:.:.. : . ..
CCDS12 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
..::. :.:.::.. . :: ::.:.:::::.:.::::..:.::::....::::::::::
CCDS12 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
:.: ::: ::::.::::..::.: ::::..::.::. .:: .:. .: :.:.. . :
CCDS12 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
: ..::..:. :.::: :.:::.. :.:. ::.::. ..::::. :
CCDS12 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
430 440 450 460 470 480
CCDS12 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
490 500 510 520 530
>>CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (533 aa)
initn: 1584 init1: 1549 opt: 1995 Z-score: 2416.9 bits: 456.7 E(32554): 2.7e-128
Smith-Waterman score: 1995; 58.4% identity (87.1% similar) in 466 aa overlap (3-468:4-468)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV
:..::::.::::: :.::::.:::::.:::::.::::.:::.:: :.::::::.::.
CCDS92 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TNTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDF
:::::: ::::.:.:. .:::.::...:::::..::.:::::::.:.::: ::.: :::
CCDS92 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SSSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHP
..::::.:::.:.::.. :::.::::.::: :.::.::::.:.:::::::::.::.:
CCDS92 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DGFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRF
.:: :::...::.::::.:.:::.:..: :::.:::.:.:...:... ::: : .: .:.
CCDS92 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV
.. .. .. .. ..:...:. :.:: .::.:... . ..:.::::.:.:.. : .::
CCDS92 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA
:..:::.:::.::::::. :..::..::::::::.::::::: ::: .: .:::: .::
CCDS92 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDS-VKVVKNKISLYKKVFPP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 HLDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDL
.:.. ::: ::::::::.:.: .:::.::.:.::::: .:::. :: .: : .:.
CCDS92 NLERPTLAIIGLIQPLGAIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEMMAEISKAQEEIDKR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FGESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
. ::: .:.: .:.: ..::: .:..:.. :: : :::::..: .:::
CCDS92 YVESQRHTIQGDYIDTMEELADLVGVRPNLLSLAFTDPKLALHLLLGPCTPIHYRVQGPG
420 430 440 450 460 470
CCDS92 KWDGARKAILTTDDRIRKPLMTRVVERSSSMTSTMTIGKFMLALAFFAIIIAYF
480 490 500 510 520 530
>>CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 2039 init1: 1819 opt: 1990 Z-score: 2410.9 bits: 455.6 E(32554): 5.8e-128
Smith-Waterman score: 1990; 58.4% identity (84.5% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
:.::::.:::::::: :.. :..:::::::::...::::.:.:....:.::::::.:: .
CCDS12 MGKKVAIIGAGVSGLASIRSCLEEGLEPTCFEKSNDIGGLWKFSDHAEEGRASIYKSVFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
:.:::: :: :::.:.:::::.::::. ::. :::. .:::::::.: : :: : :::.
CCDS12 NSSKEMMCFPDFPFPDDFPNFMHNSKIQEYIIAFAKEKNLLKYIQFKTFVSSVNKHPDFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
..::: :.:. .::..::::::::::::::. :..: .::::...:::. ::::.::.:
CCDS12 TTGQWDVTTERDGKKESAVFDAVMVCSGHHVYPNLPKESFPGLNHFKGKCFHSRDYKEPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
:.:::.::.:.:::: :::.:::..: ::.::.: :.:::::. ..::::: .. :::
CCDS12 VFNGKRVLVVGLGNSGCDIATELSRTAEQVMISSRSGSWVMSRVWDNGYPWDMLLVTRFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
..:.: :: . :. .::: :.:::::: : : . ::::.::..:. .::: ..::
CCDS12 TFLKNNLPTAISDWLYVKQMNARFKHENYGLMPLNGVLRKEPVFNDELPASILCGIVSVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
.:::.:::::::::::. :.:: .::::::::..:::..:..: .:: . :.: .::
CCDS12 PNVKEFTETSAIFEDGTIFEGIDCVIFATGYSFAYPFLDESIIKSRNNEIILFKGVFPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
:.:::.: ::..: ::. .::..::.::...:.:: :.::: . :: :: .. ::. :
CCDS12 LEKSTIAVIGFVQSLGAAIPTVDLQSRWAAQVIKGTCTLPSMEDMMNDINEKMEKKRKWF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
: .:.:.::.:. :.:::. :::::.. :.. :::::...:::::. :
CCDS12 G--KSETIQTDYIVYMDELSSFIGAKPNIPWLFLTDPKLAMEVYFGPCSPYQFRLVGPGQ
430 440 450 460 470
CCDS12 WPGARNAILTQWDRSLKPMQTRVVGRLQKPCFFFHWLKLFAIPILLIAVFLVLT
480 490 500 510 520 530
>>CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (464 aa)
initn: 1852 init1: 1549 opt: 1832 Z-score: 2220.4 bits: 420.2 E(32554): 2.3e-117
Smith-Waterman score: 1832; 60.1% identity (88.7% similar) in 416 aa overlap (3-418:4-417)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV
:..::::.::::: :.::::.:::::.:::::.::::.:::.:: :.::::::.::.
CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TNTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDF
:::::: ::::.:.:. .:::.::...:::::..::.:::::::.:.::: ::.: :::
CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SSSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHP
..::::.:::.:.::.. :::.::::.::: :.::.::::.:.:::::::::.::.:
CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DGFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRF
.:: :::...::.::::.:.:::.:..: :::.:::.:.:...:... ::: : .: .:.
CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV
.. .. .. .. ..:...:. :.:: .::.:... . ..:.::::.:.:.. : .::
CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA
:..:::.:::.::::::. :..::..::::::::.::::::: ::: .: .:::: .::
CCDS44 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDS-VKVVKNKISLYKKVFPP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 HLDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDL
.:.. ::: ::::::::.:.: .:::.::.:.::::: .:::. :: .: : .:. ::
CCDS44 NLERPTLAIIGLIQPLGAIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEMMAEISKAQEE-IDK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FGESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
CCDS44 SLTMRKTSDKPKLKNILQIPDYLKTVKIINKESLRNCPGIKGPKET
420 430 440 450 460
>>CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 (558 aa)
initn: 1803 init1: 1209 opt: 1832 Z-score: 2219.1 bits: 420.2 E(32554): 2.8e-117
Smith-Waterman score: 1832; 55.4% identity (83.1% similar) in 473 aa overlap (1-471:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
::::::::::::::: :.:::::: ::::::::..::::.:.: :. .:: . .:.:.::
CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLSSIKCCVDEDLEPTCFERSDDIGGLWKFTESSKDGMTRVYKSLVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
:. :::::.::::. ::.:::... :. .:.. ::..:::::::::.::: :. : ::::
CCDS12 NVCKEMSCYSDFPFHEDYPNFMNHEKFWDYLQEFAEHFDLLKYIQFKTTVCSITKRPDFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
.::: :::...::.. :::::::::.:: . ::.::..:::...:::: .::..:: :.
CCDS12 ETGQWDVVTETEGKQNRAVFDAVMVCTGHFLNPHLPLEAFPGIHKFKGQILHSQEYKIPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
::.:::.::::.::.:.:::::::..::::..::: ::::..: :. :::.. . :
CCDS12 GFQGKRVLVIGLGNTGGDIAVELSRTAAQVLLSTRTGTWVLGRSSDWGYPYNMMVTRRCC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
:.. .::: ..:. :...:. ::::.::: .: . ..::..:. .::::: .:
CCDS12 SFIAQVLPSRFLNWIQERKLNKRFNHEDYGLSI-TKGKKAKFIVNDELPNCILCGAITMK
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
..: :.:::::.::::::::::::.::.:::.:::::.:. : .. .. . ::: .:: .
CCDS12 TSVIEFTETSAVFEDGTVEENIDVVIFTTGYTFSFPFFEEPLKSLCTKKIFLYKQVFPLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNE--KRID
:...::: :::: :::. .:::::::::::::::..: . .::. .... ::
CCDS12 LERATLAIIGLIGLKGSILSGTELQARWVTRVFKGLCKIPPSQKLMMEATEKEQLIKR-G
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LFGESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
.: ..... . .:. :.:..: ::.::.. :..:::.:: ...::::. :
CCDS12 VFKDTSKD--KFDYIAYMDDIAACIGTKPSIPLLFLKDPRLAWEVFFGPCTPYQYRLMGP
420 430 440 450 460 470
CCDS12 GKWDGARNAILTQWDRTLKPLKTRIVPDSSKPASMSHYLKAWGAPVLLASLLLICKSSLF
480 490 500 510 520 530
>>CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (469 aa)
initn: 1743 init1: 1457 opt: 1462 Z-score: 1772.0 bits: 337.2 E(32554): 2.2e-92
Smith-Waterman score: 1568; 49.9% identity (72.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
:::.::..::::::: :.:::..::::::::::..:.::.::: .:
CCDS60 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTTKV-------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
: :: :: : .
CCDS60 -------C-------------------------------------------SVTKCSDSA
50
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
::::.:::. . :..::.:::::::.: :..:: ::::.. :::::::::::::::
CCDS60 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
:. ::.:::::::::.::::: :. : .::.:: : ::.::: ..::::: :: :::.
CCDS60 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
.:::: :: : :..:...: :.:: :::: :... .:: ::::..:.:.. : . ..
CCDS60 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
..::. :.:.::.. . :: ::.:.:::::.:.::::..:.::::....::::::::::
CCDS60 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
:.: ::: ::::.::::..::.: ::::..::.::. .:: .:. .: :.:.. . :
CCDS60 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470
pF1KE6 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSY
: ..::..:. :.::: :.:::.. :.:. ::.::. ..::::. :
CCDS60 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
360 370 380 390 400 410
CCDS60 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
420 430 440 450 460
>>CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (285 aa)
initn: 1293 init1: 1258 opt: 1271 Z-score: 1544.1 bits: 294.3 E(32554): 1.1e-79
Smith-Waterman score: 1271; 59.9% identity (90.1% similar) in 274 aa overlap (3-276:4-277)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVV
:..::::.::::: :.::::.:::::.:::::.::::.:::.:: :.::::::.::.
CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TNTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDF
:::::: ::::.:.:. .:::.::...:::::..::.:::::::.:.::: ::.: :::
CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SSSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHP
..::::.:::.:.::.. :::.::::.::: :.::.::::.:.:::::::::.::.:
CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DGFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRF
.:: :::...::.::::.:.:::.:..: :::.:::.:.:...:... ::: : .: .:.
CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV
.. .. .. .. ..:...:. :.:: .::.:...
CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA
471 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:59:50 2016 done: Tue Nov 8 12:59:51 2016
Total Scan time: 2.750 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]