FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6392, 418 aa
1>>>pF1KE6392 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3878+/-0.00107; mu= 16.6261+/- 0.064
mean_var=69.7931+/-14.363, 0's: 0 Z-trim(103.3): 170 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.153521
statistics sampled from 7184 (7357) to 7184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 1.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 2800 629.7 1.6e-180
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 2784 626.1 1.9e-179
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 1283 293.7 2.3e-79
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 1195 274.2 1.7e-73
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 1113 256.0 4.8e-68
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 970 224.4 1.7e-58
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 693 163.0 5.2e-40
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 681 160.4 3.3e-39
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 660 155.9 1.3e-37
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 660 155.9 1.3e-37
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 640 151.3 1.9e-36
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 640 151.3 2e-36
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 635 150.4 7.5e-36
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 627 148.4 1.5e-35
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 627 148.5 1.6e-35
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 627 148.5 1.6e-35
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 609 144.3 1.6e-34
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 612 145.2 1.7e-34
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 600 142.6 1.7e-33
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 591 140.3 2.3e-33
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 591 140.4 3e-33
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 591 140.4 3.2e-33
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 591 140.4 3.2e-33
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 591 140.4 3.2e-33
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 589 140.0 4.1e-33
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 589 140.0 4.4e-33
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 589 140.0 4.5e-33
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 589 140.2 8.2e-33
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 589 140.2 8.9e-33
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 583 138.7 1.4e-32
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 579 137.9 3.5e-32
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 561 133.9 4.4e-31
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 541 129.5 1e-29
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 534 127.7 1.6e-29
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 528 126.3 3.4e-29
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 521 125.1 2.5e-28
CCDS82945.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 576) 504 121.2 2.5e-27
CCDS34049.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 583) 504 121.2 2.6e-27
CCDS82946.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 591) 504 121.2 2.6e-27
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 499 120.0 4.2e-27
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 495 119.0 5.4e-27
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 489 117.8 1.7e-26
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 484 116.6 2.9e-26
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 479 115.6 7.8e-26
CCDS9530.1 F10 gene_id:2159|Hs108|chr13 ( 488) 473 114.3 2.6e-25
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 471 113.8 3.1e-25
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 468 113.0 3.3e-25
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 471 113.9 3.3e-25
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 446 108.4 1.8e-23
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22 ( 421) 443 107.6 2.3e-23
>>CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 2800 init1: 2800 opt: 2800 Z-score: 3354.4 bits: 629.7 E(32554): 1.6e-180
Smith-Waterman score: 2800; 99.8% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQWTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS47 SFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLPEASASF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 QPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE6 YDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
370 380 390 400 410
>>CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (421 aa)
initn: 2257 init1: 2257 opt: 2784 Z-score: 3335.2 bits: 626.1 E(32554): 1.9e-179
Smith-Waterman score: 2784; 99.0% identity (99.3% similar) in 421 aa overlap (1-418:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLV---DEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDV
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVSQVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 WTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS35 WTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLPEAS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 EGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTG
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 I
:
CCDS35 I
>>CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 1099 init1: 980 opt: 1283 Z-score: 1538.4 bits: 293.7 E(32554): 2.3e-79
Smith-Waterman score: 1283; 43.0% identity (75.4% similar) in 423 aa overlap (1-418:1-423)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSR-NLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEY-YHGSFKIL
:::: .:.: .::.:...: .:: :.:: ::: ::.. ..::: : :......
CCDS33 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVI
.. .::. . .. .. . :..: . : : .....:.::.... .. :: . ..
CCDS33 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALP-INASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG-
.. .: :::. . .: .: .:..:... . : .. ::... .... . .. ::
CCDS33 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KRVVPLNVN-RIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNP
.: :. . ::..:. . .. ::::::::.:. :.::::::. ::::.::::: ::::
CCDS33 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 HQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPE
.::.:::. :.: :::..::.:.::::. ...:::.....:: : ... ..:.:::.
CCDS33 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLPD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAG
:: :::. .. .:::::: : ::: ::.:.: .:. .:..::.:.. : : :.:::
CCDS33 ASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCAG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 YMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASK
.:: :::.::::::::. : .: ::: :::::::.:.. .::::::.:: :.::.::
CCDS33 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TGI
:::
CCDS33 TGI
>>CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 1195 init1: 869 opt: 1195 Z-score: 1433.2 bits: 274.2 E(32554): 1.7e-73
Smith-Waterman score: 1195; 40.3% identity (75.2% similar) in 419 aa overlap (2-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILDP
::: . . :: :.:... ..: .....::::.:::.::.::::. .:..::..:.
CCDS35 MYRPARVTSTSRFLNPYVVCFIVVAGVVILAVTIALLVYFLAFDQKSYFYRSSFQLLNV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIMV
. :..... : . . : :.:. . : .: ....:. .:..: . .::..::.:
CCDS35 EYNSQLNSPATQEYRTLSGRIESLITKTFKESNLRNQFIRAHVAKLRQDGSGVRADVVMK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 FQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCGK--R
::: ... : ...:.:.: : . : : :: :. .......... . ::
CCDS35 FQFTRNNNGASMKSRIESVLRQMLNNSGNLEINPST-EITSLTDQAAANWLINECGAGPD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNPHQW
.. :. .:: .:. : ...::::.::. .: :.::..::.: :..::::::.. .::..:
CCDS35 LITLSEQRILGGTEAEEGSWPWQVSLRLNNAHHCGGSLINNMWILTAAHCFRSNSNPRDW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASA
.. : . . : .. :: ..::..:.::..: :::.:.. . :::. ::. .::: :.
CCDS35 IATSGISTTFPKLRMRVRNILIHNNYKSATHENDIALVRLENSVTFTKDIHSVCLPAATQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYME
.. :. :...::.:: :.:.. .::...:.:::.:::. :. :.. : ::.::: .
CCDS35 NIPPGSTAYVTGWGAQEYAGHTVPELRQGQVRIISNDVCNAPHSYNGAILSGMLCAGVPQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASKTGI
: :::.:::::::: .: . :...:::::::.:: :::::::.:: : .:: ..:::
CCDS35 GGVDACQGDSGGPLVQEDSRRLWFIVGIVSWGDQCGLPDKPGVYTRVTAYLDWIRQQTGI
360 370 380 390 400 410
>>CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 (416 aa)
initn: 916 init1: 833 opt: 1113 Z-score: 1335.1 bits: 256.0 E(32554): 4.8e-68
Smith-Waterman score: 1113; 40.4% identity (72.6% similar) in 423 aa overlap (2-418:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLT-VVAVTIGLLVHFLVFDQKKEYYHGSFKILD
::: : :. : ...: :... ...::::::::::. . : ::.:.:.:
CCDS35 MYR---HGISSQRSWPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAVE-KTYYYQGDFHISG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVIM
:.: .. . .: . :. . . : .:. :.:.:..:..: :. .: .:.. .
CCDS35 VTYNDNCENAASQASTNLSKDIETKMLNAFQNSSIYKEYVKSEVIKLLPNANGSNVQLQL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VFQFPSTEQRAVREK---KIQSILNQKIRNLRALPINASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG
:.:: .: ..: : :....:.... . :.: .:... .:....:. .. ::
CCDS35 KFKFPPAEGVSMRTKIKAKLHQMLKNNMASWNAVP---ASIKLMEISKAASEMLTNNCCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KRVVPLNV--NRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKN
..:. . :.:..: . ..:::::::.:. . : :::.:::. ::..::::: : .:
CCDS35 RQVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNN
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 PHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLP
..:::.:: .: : : :.:. .:.::.: : . . :::.::.. .:.:.. ::.::::
CCDS35 SKDWTVNFGIVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHDDIALVQLAEEVSFTEYIRKICLP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCA
::. ... : .: .::.:.::..: :.: .:::.. .:. .:.. . :.::
CCDS35 EAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEDFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDTMLCA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE6 GYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIAS
:.: : :::..::::::. : .. :.:.:::::::.::.:.::::::.:: :::::.:
CCDS35 GFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITS
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KTGI
:::.
CCDS35 KTGL
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10 20 30 40 50
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CCDS35 MMYAPVEFSEAEFSRAEYQRKQQFWDSVRLALFTLAIVAIIGIAIGIVTHFVVEDDKSFY
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pF1KE6 YHGSFKILDPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEE
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CCDS35 YLASFKVTNIKYKENYGIRSSREFIERSHQIERMMSRIFRHSSVGGRFIKSHVIKLSPDE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE6 DGVKVDVIMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLR-ALPINASSVQVNAMSSSTGEL
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CCDS35 QGVDILIVLIFRYPSTDSAEQIKKKIEKALYQSLKTKQLSLTINKPSFRLTPIDSKKMRN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
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... :: :. .:: ...::..: : .. :::::::: . :::::.::::
CCDS35 LLNSRCGIRMTSSNMPLPASSSTQRIVQGRETAMEGEWPWQASLQLIGSGHQCGASLISN
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 TWLVTAAHCFQKYKNPHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVS
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CCDS35 TWLLTAAHCFWKNKDPTQWIATFGATITPPAVKRNVRKIILHENYHRETNENDIALVQLS
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280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQ
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CCDS35 TGVEFSNIVQRVCLPDSSIKLPPKTSVFVTGFGSIVDDGPIQNTLRQARVETISTDVCNR
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340 350 360 370 380 390
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.:: . : :::.:::.::: :::.:::::::: : .: ::..::::::..:. ::
CCDS35 KDVYDGLITPGMLCAGFMEGKIDACKGDSGGPLV-YDNHDIWYIVGIVSWGQSCALPKKP
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400 410
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CCDS35 GVYTRVTKYRDWIASKTGM
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330 340 350 360 370 380
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390 400 410
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CCDS58 TSFGIGCAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMERDLKT
420 430 440 450
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pF1KE6 MMYRTVGFGTRSRNLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVF
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CCDS13 RSLFGLDDLKISPVAPDADAVAAQILSLLPLKFFPIIVIGIIAL-ILALAIGLGIHF---
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50 60 70 80 90
pF1KE6 DQKKEYY-HGSFKILDPQINNNFGQSNTYQLKD----LRETTENLVDEIFIDSAWK----
: . .: ..::: .. : : :. . .: .: .: : ..: ..::
CCDS13 DCSGKYRCRSSFKCIE-LIARCDGVSDCKDGEDEYRCVRVGGQNAVLQVFTAASWKTMCS
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CCDS13 DDWKGHYANVACAQLGFPSYVSSDNLRV----SSLEGQFREEFVSIDHLLPDDKVTALH-
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CCDS13 -----HSVYVREGCASGHVVTLQCTACGHRR--GYSSRIVGGNMSLLSQWPWQASLQFQG
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CCDS13 YHLCGGSVITPLWIITAAHCVYDLYLPKSWTIQVGLVSLLDNPAPSHLVEKIVYHSKYKP
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:::...... .::.. :. .:::.. .: . . .:.:: : :... :
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CCDS74 SWGLGCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT
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Smith-Waterman score: 660; 42.1% identity (70.6% similar) in 235 aa overlap (185-412:575-806)
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pF1KE6 SSVQVNAMSSSTGELTVQASCGKRVVPLNVNRIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGA
.::..:... .. :::::::: . : ::.
CCDS13 KKPNPQCDGRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPSSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGRHICGG
550 560 570 580 590 600
220 230 240 250 260
pF1KE6 TLISNTWLVTAAHCFQK--YKNPHQWTVSFGTKI--N---PPLMKRNVRRFIIHEKYRSA
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CCDS13 ALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLG-KVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLHPYHEED
610 620 630 640 650 660
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pF1KE6 AREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRRICLPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREA
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CCDS13 SHDYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKV
670 680 690 700 710 720
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 RVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIV
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CCDS13 DVQLIPQDLCS--EVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLV
730 740 750 760 770 780
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CCDS13 SWGLGCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT
790 800 810
418 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:51:52 2016 done: Tue Nov 8 12:51:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]