Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6357
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6357, 325 aa
1>>>pF1KE6357 325 - 325 aa - 325 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6915+/-0.000401; mu= 19.1511+/- 0.025
mean_var=64.5206+/-12.961, 0's: 0 Z-trim(111.4): 80 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.159671
statistics sampled from 19908 (19993) to 19908 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 4.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_112233 (OMIM: 615571) sideroflexin-3 [Homo sapi ( 325) 2167 508.1 9.8e-144
NP_073591 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 1 ( 322) 1729 407.2 2.3e-113
NP_001309906 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 322) 1729 407.2 2.3e-113
NP_001309911 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 261) 1420 336.0 5.2e-92
NP_001309907 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 261) 1420 336.0 5.2e-92
NP_001309912 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 242) 1311 310.8 1.8e-84
XP_011537563 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexi ( 331) 1166 277.6 2.6e-74
XP_011537564 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexi ( 322) 1164 277.1 3.5e-74
NP_849189 (OMIM: 615570) sideroflexin-2 [Homo sapi ( 322) 1164 277.1 3.5e-74
NP_001309909 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 261) 1124 267.8 1.8e-71
NP_001309910 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform ( 261) 1124 267.8 1.8e-71
NP_653180 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform 2 ( 340) 776 187.7 2.9e-47
XP_011537566 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexi ( 210) 760 183.9 2.6e-46
XP_011537565 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexi ( 210) 760 183.9 2.6e-46
XP_016860829 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 350) 750 181.7 1.9e-45
NP_001317329 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 357) 724 175.8 1.2e-43
XP_011531490 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 367) 698 169.8 7.9e-42
NP_001317335 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 321) 672 163.7 4.5e-40
XP_011531489 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 397) 672 163.8 5.3e-40
NP_001317331 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 281) 643 157.0 4.2e-38
XP_011531494 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 338) 620 151.8 1.9e-36
XP_011531492 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 355) 620 151.8 2e-36
XP_011531488 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 414) 620 151.9 2.2e-36
XP_016860830 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 291) 617 151.0 2.7e-36
XP_016871152 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexi ( 186) 578 141.9 9.9e-34
NP_001317333 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 236) 538 132.8 7.1e-31
NP_001317339 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 236) 538 132.8 7.1e-31
NP_001317334 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 262) 537 132.6 9e-31
XP_011531496 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 338) 537 132.7 1.1e-30
XP_011531498 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 253) 486 120.8 3e-27
NP_001317336 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 253) 486 120.8 3e-27
NP_001317330 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 253) 479 119.2 9.2e-27
NP_001317337 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 177) 403 101.6 1.3e-21
NP_001317332 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 234) 373 94.8 1.9e-19
XP_011531497 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 310) 373 94.9 2.4e-19
XP_005264705 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 189) 322 82.9 5.7e-16
NP_001317340 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 189) 322 82.9 5.7e-16
NP_001317341 (OMIM: 615572) sideroflexin-5 isoform ( 189) 322 82.9 5.7e-16
NP_998814 (OMIM: 615564,615578) sideroflexin-4 [Ho ( 337) 280 73.5 7.2e-13
XP_016860834 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 210) 275 72.1 1.1e-12
XP_011531499 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 206) 270 71.0 2.4e-12
XP_016860835 (OMIM: 615572) PREDICTED: sideroflexi ( 206) 270 71.0 2.4e-12
XP_005269582 (OMIM: 615564,615578) PREDICTED: side ( 328) 267 70.5 5.6e-12
XP_005269584 (OMIM: 615564,615578) PREDICTED: side ( 221) 201 55.1 1.6e-07
XP_011537584 (OMIM: 615564,615578) PREDICTED: side ( 221) 201 55.1 1.6e-07
XP_005269583 (OMIM: 615564,615578) PREDICTED: side ( 221) 201 55.1 1.6e-07
>>NP_112233 (OMIM: 615571) sideroflexin-3 [Homo sapiens] (325 aa)
initn: 2167 init1: 2167 opt: 2167 Z-score: 2701.5 bits: 508.1 E(85289): 9.8e-144
Smith-Waterman score: 2167; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
:::::::::::::::::::::::::
NP_112 LEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
310 320
>>NP_073591 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 1 [Hom (322 aa)
initn: 1729 init1: 1729 opt: 1729 Z-score: 2156.3 bits: 407.2 E(85289): 2.3e-113
Smith-Waterman score: 1729; 76.6% identity (94.1% similar) in 320 aa overlap (6-325:3-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
:::: .:::.:::::::::.::: ::::::::::.::.. :::..:.::..:: :
NP_073 MSGELPPNINIKEPRWDQSTFIGRANHFFTVTDPRNILLTNEQLESARKIVHDYRQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
.: ::.::..::::::.::::::::::::..:::::::::::::::::::.:::: ::.:
NP_073 IVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
.::::.::::::.:::.:::::.:.:: .:::::::::::::::::::..::::. ::.:
NP_073 LFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
::::::::::::::::::::::::.:::::.:: :.::: :..::::.: :::.::: ::
NP_073 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVVSRILMA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
:.:::::.::.::::: :::: ::..::.:::::::::::::::::::::::::. ...
NP_073 APGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPIQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
:: ::.:.:.:..: .. ::.::::
NP_073 LEAELQAKIQESHPELRRVYFNKGL
300 310 320
>>NP_001309906 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 1 [ (322 aa)
initn: 1729 init1: 1729 opt: 1729 Z-score: 2156.3 bits: 407.2 E(85289): 2.3e-113
Smith-Waterman score: 1729; 76.6% identity (94.1% similar) in 320 aa overlap (6-325:3-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
:::: .:::.:::::::::.::: ::::::::::.::.. :::..:.::..:: :
NP_001 MSGELPPNINIKEPRWDQSTFIGRANHFFTVTDPRNILLTNEQLESARKIVHDYRQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
.: ::.::..::::::.::::::::::::..:::::::::::::::::::.:::: ::.:
NP_001 IVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
.::::.::::::.:::.:::::.:.:: .:::::::::::::::::::..::::. ::.:
NP_001 LFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
::::::::::::::::::::::::.:::::.:: :.::: :..::::.: :::.::: ::
NP_001 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVVSRILMA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
:.:::::.::.::::: :::: ::..::.:::::::::::::::::::::::::. ...
NP_001 APGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPIQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
:: ::.:.:.:..: .. ::.::::
NP_001 LEAELQAKIQESHPELRRVYFNKGL
300 310 320
>>NP_001309911 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 2 [ (261 aa)
initn: 1420 init1: 1420 opt: 1420 Z-score: 1772.8 bits: 336.0 E(85289): 5.2e-92
Smith-Waterman score: 1420; 78.1% identity (94.6% similar) in 260 aa overlap (66-325:2-261)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 DPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAGVVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGR
:::..::::::.::::::::::::..::::
NP_001 MITENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGR
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 MSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTVVFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYV
:::::::::::::::.:::: ::.:.::::.::::::.:::.:::::.:.:: .::::::
NP_001 MSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAVLFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAG
:::::::::::::..::::. ::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:: :
NP_001 SATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 QRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMAIPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLV
.::: :..::::.: :::.::: :: :.:::::.::.::::: :::: ::..::.:::::
NP_001 NRLGESANAAKQAITQVVVSRILMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPIQVGLV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KE6 GFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISNLEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
::::::::::::::::::::. ...:: ::.:.:.:..: .. ::.::::
NP_001 GFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEAELQAKIQESHPELRRVYFNKGL
220 230 240 250 260
>>NP_001309907 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 2 [ (261 aa)
initn: 1420 init1: 1420 opt: 1420 Z-score: 1772.8 bits: 336.0 E(85289): 5.2e-92
Smith-Waterman score: 1420; 78.1% identity (94.6% similar) in 260 aa overlap (66-325:2-261)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 DPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAGVVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGR
:::..::::::.::::::::::::..::::
NP_001 MITENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGR
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 MSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTVVFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYV
:::::::::::::::.:::: ::.:.::::.::::::.:::.:::::.:.:: .::::::
NP_001 MSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAVLFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAG
:::::::::::::..::::. ::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:: :
NP_001 SATTGAVATALGLNALTKHVSPLIGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 QRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMAIPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLV
.::: :..::::.: :::.::: :: :.:::::.::.::::: :::: ::..::.:::::
NP_001 NRLGESANAAKQAITQVVVSRILMAAPGMAIPPFIMNTLEKKAFLKRFPWMSAPIQVGLV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KE6 GFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISNLEPELRAQIHEQNPSVEVVYYNKGL
::::::::::::::::::::. ...:: ::.:.:.:..: .. ::.::::
NP_001 GFCLVFATPLCCALFPQKSSMSVTSLEAELQAKIQESHPELRRVYFNKGL
220 230 240 250 260
>>NP_001309912 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 3 [ (242 aa)
initn: 1311 init1: 1311 opt: 1311 Z-score: 1637.5 bits: 310.8 E(85289): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 1311; 78.2% identity (94.6% similar) in 239 aa overlap (6-244:3-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
:::: .:::.:::::::::.::: ::::::::::.::.. :::..:.::..:: :
NP_001 MSGELPPNINIKEPRWDQSTFIGRANHFFTVTDPRNILLTNEQLESARKIVHDYRQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
.: ::.::..::::::.::::::::::::..:::::::::::::::::::.:::: ::.:
NP_001 IVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
.::::.::::::.:::.:::::.:.:: .:::::::::::::::::::..::::. ::.:
NP_001 LFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
::::::::::::::::::::::::.:::::.:: :.::: :..::::.: :::.::: ::
NP_001 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELKVGIPVTDENGNRLGESANAAKQAITQVVVSRILMA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
:.:
NP_001 APGMG
240
>>XP_011537563 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexin-2 (331 aa)
initn: 1163 init1: 1134 opt: 1166 Z-score: 1455.2 bits: 277.6 E(85289): 2.6e-74
Smith-Waterman score: 1166; 55.7% identity (77.2% similar) in 325 aa overlap (3-325:8-331)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESKMGELPLD-INIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIV
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XP_011 MSTVLCVSKM-EADLSGFNIDAPRWDQRTFLGRVKHFLNITDPRTVFVSERELDWAKVMV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 QNYRAGVVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFY
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XP_011 EKSRMGVVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNVIGRMSFQLPGGMIITGFMLQFY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RKTPTVVFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKH
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XP_011 RTMPAVIFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNMLTKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LPPLVGRFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVI
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XP_011 APPLVGRWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIKGICVKDRNENEIGHSRRAAAIGITQVVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SRICMAIPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKS
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XP_011 SRITMSAPGMILLPVIMERLEKLHFMQKVKVLHAPLQVMLSGCFLIFMVPVACGLFPQKC
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 SIHISNLEPELRAQIHEQNPSVE-VVYYNKGL
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XP_011 ELPVSYLEPKLQDTIKAKYGELEPYVYFNKGL
300 310 320 330
>>XP_011537564 (OMIM: 615570) PREDICTED: sideroflexin-2 (322 aa)
initn: 1161 init1: 1132 opt: 1164 Z-score: 1452.9 bits: 277.1 E(85289): 3.5e-74
Smith-Waterman score: 1164; 56.1% identity (77.7% similar) in 314 aa overlap (13-325:9-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
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XP_011 MEADLSGFNIDAPRWDQRTFLGRVKHFLNITDPRTVFVSERELDWAKVMVEKSRMG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
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XP_011 VVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNVIGRMSFQLPGGMIITGFMLQFYRTMPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
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XP_011 IFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNMLTKKAPPLVG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
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XP_011 RWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIKGICVKDRNENEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
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XP_011 APGMILLPVIMERLEKLHFMQKVKVLHAPLQVMLSGCFLIFMVPVACGLFPQKCELPVSY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LEPELRAQIHEQNPSVE-VVYYNKGL
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XP_011 LEPKLQDTIKAKYGELEPYVYFNKGL
300 310 320
>>NP_849189 (OMIM: 615570) sideroflexin-2 [Homo sapiens] (322 aa)
initn: 1161 init1: 1132 opt: 1164 Z-score: 1452.9 bits: 277.1 E(85289): 3.5e-74
Smith-Waterman score: 1164; 56.1% identity (77.7% similar) in 314 aa overlap (13-325:9-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
::. ::::: :::::..::...::::....: .:. .. .:.. : :
NP_849 MEADLSGFNIDAPRWDQRTFLGRVKHFLNITDPRTVFVSERELDWAKVMVEKSRMG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
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NP_849 VVPPGTQVEQLLYAKKLYDSAFHPDTGEKMNVIGRMSFQLPGGMIITGFMLQFYRTMPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
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NP_849 IFWQWVNQSFNALVNYTNRNAASPTSVRQMALSYFTATTTAVATAVGMNMLTKKAPPLVG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
:.:::::::::::.:::.:::.:: :: : :. ...:.: :: :: ::::::: :.
NP_849 RWVPFAAVAAANCVNIPMMRQQELIKGICVKDRNENEIGHSRRAAAIGITQVVISRITMS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IPAMAIPPLIMDTLEKKDFLKRRPWLGAPLQVGLVGFCLVFATPLCCALFPQKSSIHISN
:.: . :.::. ::: :... : ::::: : : :.: .:. :.::::: . .:
NP_849 APGMILLPVIMERLEKLHFMQKVKVLHAPLQVMLSGCFLIFMVPVACGLFPQKCELPVSY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LEPELRAQIHEQNPSVE-VVYYNKGL
:::.:. :. . .: ::.::::
NP_849 LEPKLQDTIKAKYGELEPYVYFNKGL
300 310 320
>>NP_001309909 (OMIM: 615569) sideroflexin-1 isoform 4 [ (261 aa)
initn: 1124 init1: 1124 opt: 1124 Z-score: 1404.3 bits: 267.8 E(85289): 1.8e-71
Smith-Waterman score: 1124; 80.1% identity (95.9% similar) in 196 aa overlap (6-201:3-198)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESKMGELPLDINIQEPRWDQSTFLGRARHFFTVTDPRNLLLSGAQLEASRNIVQNYRAG
:::: .:::.:::::::::.::: ::::::::::.::.. :::..:.::..:: :
NP_001 MSGELPPNINIKEPRWDQSTFIGRANHFFTVTDPRNILLTNEQLESARKIVHDYRQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VVTPGITEDQLWRAKYVYDSAFHPDTGEKVVLIGRMSAQVPMNMTITGCMLTFYRKTPTV
.: ::.::..::::::.::::::::::::..:::::::::::::::::::.:::: ::.:
NP_001 IVPPGLTENELWRAKYIYDSAFHPDTGEKMILIGRMSAQVPMNMTITGCMMTFYRTTPAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFWQWVNQSFNAIVNYSNRSGDTPITVRQLGTAYVSATTGAVATALGLKSLTKHLPPLVG
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NP_001 LFWQWINQSFNAVVNYTNRSGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTKHVSPLIG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQRELQVGIPVADEAGQRLGYSVTAAKQGIFQVVISRICMA
:::::::::::::::::::::
NP_001 RFVPFAAVAAANCINIPLMRQSHPSIHYEHFGKESLFEEVPMDECTHSSWVSWLLFGVCY
180 190 200 210 220 230
325 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:25:35 2016 done: Tue Nov 8 12:25:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]