Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6341
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6341, 424 aa
1>>>pF1KE6341 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6432+/-0.000849; mu= 12.8338+/- 0.051
mean_var=121.9180+/-23.874, 0's: 0 Z-trim(111.3): 12 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.116156
statistics sampled from 12277 (12288) to 12277 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 2.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs108|chr19 ( 424) 2898 496.4 2.1e-140
CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs108|chr18 ( 443) 1304 229.3 5.6e-60
CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 ( 347) 737 134.2 1.9e-31
CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 ( 352) 737 134.3 1.9e-31
CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs108|chr3 ( 341) 627 115.8 6.5e-26
CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs108|chr15 ( 376) 571 106.5 4.7e-23
CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs108|chr2 ( 356) 562 104.9 1.3e-22
CCDS5333.1 CHST12 gene_id:55501|Hs108|chr7 ( 414) 476 90.6 3.1e-18
>>CCDS12433.1 CHST8 gene_id:64377|Hs108|chr19 (424 aa)
initn: 2898 init1: 2898 opt: 2898 Z-score: 2634.2 bits: 496.4 E(32554): 2.1e-140
Smith-Waterman score: 2898; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLRPGTMRLACMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPP
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CCDS12 MTLRPGTMRLACMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVTPRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVTPRH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RTGSGVRFPEFVQYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RTGSGVRFPEFVQYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPF
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ADLY
::::
CCDS12 ADLY
>>CCDS42422.1 CHST9 gene_id:83539|Hs108|chr18 (443 aa)
initn: 1368 init1: 1296 opt: 1304 Z-score: 1190.3 bits: 229.3 E(32554): 5.6e-60
Smith-Waterman score: 1331; 48.1% identity (71.3% similar) in 449 aa overlap (3-420:1-442)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTLRPGTMRLA--CMFSSILLFGAAGLLLFISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDL
..:. : . .: :.:.::.::::::. :: : .: : .. :. ..
CCDS42 MQPSEMVMNPKQVFLSVLIFGVAGLLLFMYLQVWIE---EQHTG---RVEKRREQKVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE6 PPGGSQDGDLKEP----TERVTRDLSSGAPRGRNLPAP--DQPQPPL---QRGTRLRLRQ
: : ::.. . ... :. ..: .. . : .:.::: .
CCDS42 SGWGPVKYLRPVPRIMSTEKIQEHITNQNPK-FHMPEDVREKKENLLLNSERSTRLLTKT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KE6 RRRR---------------LLIKKMPAAATIPANSSDAPF---IRPGPGTL--DGRWVSL
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CCDS42 SHSQGGDQALSKSTGSPTEKLIEKRQGAKTVFNKFSNMNWPVDIHPLNKSLVKDNKWKKT
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 HRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVTPRHVSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVL
...:..:. .:: : :: . : ... . ::::.:::.:..:::::::::::::::.:
CCDS42 EETQEKRRSFLQEFCKKYGGVSHHQSHLFHTVSRIYVEDKHKILYCEVPKAGCSNWKRIL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 MVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFDRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFR
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CCDS42 MVLNGLASSAYNISHNAVHYGKHLKKLDSFDLKGIYTRLNTYTKAVFVRDPMERLVSAFR
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 DKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREALRTGSGVRFPEFVQYLLDVHRPVGMDIHWD
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CCDS42 DKFEHPNSYYHPVFGKAIIKKYRPNACEEALINGSGVKFKEFIHYLLDSHRPVGMDIHWE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 HVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAH
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CCDS42 KVSKLCYPCLINYDFVGKFETLEEDANYFLQMIGAPKELKFPNFKDRHSSDERTNAQVVR
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420
pF1KE6 QYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPFADLY
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CCDS42 QYLKDLTRTERQLIYDFYYLDYLMFNYTTPFL
420 430 440
>>CCDS55878.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 (347 aa)
initn: 682 init1: 181 opt: 737 Z-score: 678.3 bits: 134.2 E(32554): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 737; 41.8% identity (70.0% similar) in 273 aa overlap (153-419:73-341)
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHV
.: :. . ..: :.: .::..:: .
CCDS55 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230
pF1KE6 SRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLA--SSTADIQHNTVHYGSALKRLDTF
... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. .: : .: .. :: :. .
CCDS55 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHP-NSYYHPVFGKAILARYRANASRE
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CCDS55 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ALRTGSGVRFPEFVQYLLDVH--RPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDAN
::: :. :.: ::: ::.: : : .. ::. : :: :: : ::.:::.:..:.:.:
CCDS55 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNY
. :.: . : :: . .. .::: ... ..: ..:. .. . :. : .:.:::::
CCDS55 YVLQLAGVGSYLKFPTY----AKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNY
290 300 310 320 330
420
pF1KE6 SKPFADLY
: :
CCDS55 SVPSYLKLE
340
>>CCDS9099.1 CHST11 gene_id:50515|Hs108|chr12 (352 aa)
initn: 682 init1: 181 opt: 737 Z-score: 678.2 bits: 134.3 E(32554): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 737; 41.8% identity (70.0% similar) in 273 aa overlap (153-419:78-346)
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHV
.: :. . ..: :.: .::..:: .
CCDS90 VDICCRKGSRSPLQELYNPIQLELSNTAVLHQMRRDQVTDTCRANSATSRKRRVLTPNDL
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230
pF1KE6 SRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLA--SSTADIQHNTVHYGSALKRLDTF
... :.. :...:: :::..:.::::..:::.: . :. .: : .: .. :: :. .
CCDS90 KHLVVDEDHELIYCYVPKVACTNWKRLMMVLTGRGKYSDPMEIPANEAHVSANLKTLNQY
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHP-NSYYHPVFGKAILARYRANASRE
. : :::..: :.:::::::::::::.:.:: . : .: .: :. : : ::..:
CCDS90 SIPEINHRLKSYMKFLFVREPFERLVSAYRNKFTQKYNISFHKRYGTKIIKRQRKNATQE
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ALRTGSGVRFPEFVQYLLDVH--RPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDAN
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CCDS90 ALRKGDDVKFEEFVAYLIDPHTQREEPFNEHWQTVYSLCHPCHIHYDLVGKYETLEEDSN
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNY
. :.: . : :: . .. .::: ... ..: ..:. .. . :. : .:.:::::
CCDS90 YVLQLAGVGSYLKFPTY----AKSTRTTDEMTTEFFQNISSEHQTQLYEVYKLDFLMFNY
290 300 310 320 330 340
420
pF1KE6 SKPFADLY
: :
CCDS90 SVPSYLKLE
350
>>CCDS3039.1 CHST13 gene_id:166012|Hs108|chr3 (341 aa)
initn: 445 init1: 145 opt: 627 Z-score: 578.7 bits: 115.8 E(32554): 6.5e-26
Smith-Waterman score: 627; 38.4% identity (65.2% similar) in 276 aa overlap (148-419:65-335)
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KMPAAATIPANSSDAPFIRPGPGTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASSSRRAVT
.: . ...:. ... ::. : : .: .
CCDS30 GNRALGSSWLGGEKRSPLQKLYDLDQDPRSTLAKVHRQRRDLLNSACS--RHSRRQRLLQ
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PRHVSRIFVEDRHRVLYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTAD-IQHNTVHYGSALKRL
:. . ...:.: : .::: :::..:.::::::..:.: : . :. . .: . : :
CCDS30 PEDLRHVLVDDAHGLLYCYVPKVACTNWKRVLLALSGQARGDPRAISAQEAHAPGRLPSL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DTFDRQGILHRLSTYTKMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSY-YHPVFGKAILARYRANA
:. : .:: .: .::::::::::.::.:.:. .: : .. .: :. : : :
CCDS30 ADFSPAEINRRLRAYLAFLFVREPFERLASAYRNKLARPYSAAFQRRYGARIVQRLRPRA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SREALRTGSGVRFPEFVQYLLD--VHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMED
.: : ::: ::. :::: ..: .. ::... :: :: . :: :::::.. .
CCDS30 LPDARARGHDVRFAEFLAYLLDPRTRREEPFNEHWERAHALCHPCRLRYDVVGKFETLAE
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 DANFFLSLIRAPRNLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLM
:: : :.: : .:.:: . . : .. .: . : ..: . ..: .:.: ::.:.
CCDS30 DAAFVLGLAGAS-DLSFP--GPPRPRGAAASRDLAARLFRDISPFYQRRLFDLYKMDFLL
280 290 300 310 320
420
pF1KE6 FNYSKPFADLY
:::: :
CCDS30 FNYSAPSYLRLL
330 340
>>CCDS10059.1 CHST14 gene_id:113189|Hs108|chr15 (376 aa)
initn: 494 init1: 181 opt: 571 Z-score: 527.4 bits: 106.5 E(32554): 4.7e-23
Smith-Waterman score: 578; 34.0% identity (57.0% similar) in 377 aa overlap (58-419:6-367)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 FISLQDPTELAPQQVPGIKFNIRPRQPHHDLPPGGSQDGDLKEPTERVTRDLSSGAPRGR
: : .. .: :: :. : : :.
CCDS10 MFPRPLTPLAAPNG--AEPLGRALRRAPLGRARA-
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 NLPAPDQPQPPLQR-----GTRLRLRQRRRRLLIKKMPAAATIPANSSDAPFIR-PGPGT
.: .: : . .. : . .: .: . : :. . : . : ::
CCDS10 GLGGPPLLLPSMLMFAVIVASSGLLLMIERGILAEMKPLPLHPPGREGTAWRGKAPKPGG
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE6 LDGRW--VSLHRSQQERKRVMQEACAK-------YRASSSRRAVTPRHVSRIFVEDRHRV
:. : ..:. :. :.:... .:.. . ..: . :: :.: ::.:
CCDS10 LSLRAGDADLQVRQDVRNRTLRAVCGQPGMPRDPWDLPVGQRRTLLRH---ILVSDRYRF
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LYCEVPKAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVHYGSALKRLDTFDRQGILHRLSTYT
::: :::..:::::::. ::::. .:. :.. . : : : : . . : .::. :
CCDS10 LYCYVPKVACSNWKRVMKVLAGVLDSV-DVRLKMDHR-SDLVFLADLRPEEIRYRLQHYF
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 KMLFVREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVFGKAILARYRANASREALRTGSGVRFPEFV
:.::::::.:::.::.:.:: . : . .: :. ::::.:. .:. : ::::.
CCDS10 KFLFVREPLERLLSAYRNKFGEIREYQQR-YGAEIVRRYRAGAGPSP--AGDDVTFPEFL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 QYLLDVHRPVGMDIHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLSLIRAPRNLTFPR
.::.: . : :. :: : .::.:: . :::::..: .: ::: : .::: .. ::
CCDS10 RYLVD-EDPERMNEHWMPVYHLCQPCAVHYDFVGSYERLEADANQVLEWVRAPPHVRFPA
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KE6 FKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPFADLY
:.. .. . : .. . : . : .:. .: : :
CCDS10 ---RQAWYRPASPESLHYHLCSAPRALLQDVLPKYILDFSLFAYPLPNVTKEACQQ
330 340 350 360 370
>>CCDS2047.1 CHST10 gene_id:9486|Hs108|chr2 (356 aa)
initn: 466 init1: 183 opt: 562 Z-score: 519.6 bits: 104.9 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 562; 32.8% identity (61.3% similar) in 323 aa overlap (110-419:38-351)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SSGAPRGRNLPAPDQPQPPLQRGTRLRLRQRRRRLLIKKMPAAATIPANSSDAPFIRPGP
... :.. :: . .: .. ..:
CCDS20 LAACFWVIFMFMVASKFITLTFKDPDVYSAKQEFLFLTTMPEVRKLPEEKHIPEELKPTG
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 GTLDGRWVSLHRSQQERKRVMQEACAKYRASS-SRRAVTPRHVSRIFVEDRHRVLYCEVP
: . .:: ......: .. :. :. ..:::: :.:..:.:..:
CCDS20 KELPDSQLVQPLVYMERLELIRNVCRDDALKNLSHTPVSKFVLDRIFVCDKHKILFCQTP
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 KAGCSNWKRVLMVLAGLASSTADIQHNTVH--YGSALKRLDTFDRQGILHRLSTYTKMLF
:.: ..::.::.:: : :: .: .:.:: ..: ::..:. : .::.:: :...
CCDS20 KVGNTQWKKVLIVLNGAFSSIEEIPENVVHDHEKNGLPRLSSFSDAEIQKRLKTYFKFFI
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 VREPFERLVSAFRDKFEHPNSYYHPVF----GKAILARYRANASREALRTGSGVRFPEFV
::.:::::.:::.::: : : ..: . . .:. .:: : : : :..: .::
CCDS20 VRDPFERLISAFKDKFVH-NPRFEPWYRHEIAPGIIRKYRRN--RTETR---GIQFEDFV
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360
pF1KE6 QYLLDV-HRPVGMD-----IHWDHVSRLCSPCLIDYDFVGKFESMEDDANFFLSLIRAPR
.:: : :: . .. ::: .::.:: : :. .:. :..:::: ..:. .
CCDS20 RYLGDPNHRWLDLQFGDHIIHWVTYVELCAPCEIMYSVIGHHETLEDDAPYILKEAGIDH
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 NLTFPRFKDRHSQEARTTARIAHQYFAQLSALQRQRTYDFYYMDYLMFNYSKPFADLY
...: . . :: .. : :: .: . .: : . :. .:.:.::
CCDS20 LVSYPTIPPGITVYNRT--KVEH-YFLGISKRDIRRLYARFEGDFKLFGYQKPDFLLN
310 320 330 340 350
>>CCDS5333.1 CHST12 gene_id:55501|Hs108|chr7 (414 aa)
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